新品種、植物品種的鑒別方法以及使水稻個體早熟的方法
【專利摘要】本發(fā)明的目的在于，提供一種比原品種早熟的水稻新品種，以及一種使水稻個體早熟的方法。本發(fā)明涉及品種權(quán)申請?zhí)枮榈?5586號的水稻品種越光籽5號（Koshihikari-kazusa5gou），由所述品種的個體與其后代個體所組成的組中選擇兩個個體雜交得到的后代個體，以及使水稻個體早熟的方法，所述使水稻個體早熟的方法的特征在于，將水稻個體的第3染色體中的相當(dāng)于水稻品種日本晴的第3染色體中包含第31,720,064號堿基～第31,724,043號堿基區(qū)域的區(qū)域置換為由水稻品種越光籽5號或水稻品種哈巴達(dá)克（Habataki）的該區(qū)域構(gòu)成的染色體片段。
【專利說明】新品種、植物品種的鑒別方法以及使水稻個體早熟的方法
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001]本發(fā)明涉及一種利用非基因重組法培育出的新品種、該新品種的鑒別方法，以及使水稻個體早熟的方法。
【背景技術(shù)】
[0002]將屬于同一生物種，但因遺傳結(jié)構(gòu)不同而在某種性狀上與其他群體不同的群體稱為品種。也就是說，即使是同種的植物，根據(jù)品種不同，其栽培的難易性、對病蟲害的抗性、產(chǎn)量、品質(zhì)等也會不同。因此，對于農(nóng)作物，特別是水稻、麥類等主要作物，為了得到更優(yōu)良的品種，自古以來在不斷進行品種改良，近年來，不僅是種苗公司等，國家、縣等的官方機構(gòu)也在積極地進行。
[0003]隨著近年來核酸分析技術(shù)等的進步，擬南芥、水稻、小麥等各種植物的基因已被破譯，公開了所得到的基因信息。利用這些公開的基因信息，還廣泛進行了基于基因重組法的導(dǎo)入外源種基因的品種改良。但是，基于基因重組法的品種改良，雖然具有能夠?qū)胪ǔ２豢赡茈s交的遠(yuǎn)緣種所具有的性狀的優(yōu)點，但存在對于其安全性的驗證尚不夠充分的問題。
[0004]因此，以水稻為首的食用植物，大多通過非基因重組法進行新品種培育。例如，專利文獻I已公開一種方法，其在基于非基因重組法用外源的有用染色體片段進行置換的情況下，通過控制導(dǎo)入的源自外源品種的染色體片段置換區(qū)，不改變原品種具有的優(yōu)良性狀，用來選育出具有目標(biāo)性狀的新品種。
[0005]特別是水稻，期待著培育出既要具備與以往品種相同的品質(zhì)、產(chǎn)量，又比以往品種稍早熟或稍晚熟的品種。在日本大部分的水田中，栽培著消費者喜愛的水稻品種越光，但是在只大規(guī)模栽培越光的情況下，收獲相關(guān)作業(yè)集中在短時間內(nèi)，需要非常多的勞力。尤其是收獲大量水稻的情況下，不一定能在各個體最合適的時期收獲，但是不論早收獲還是晚收獲，都會對大米的味道、產(chǎn)量產(chǎn)生影響，對于農(nóng)家來說成為很大的問題。作為錯開收獲期的方法，可以想到錯開播種期的 方法。但是因越光具有很強的感光性，就算將播種期錯開2?3天，也會在相同時期迎來收獲期。另一方面，通過將播種期錯開10天或10天以上，能夠分散收獲期。但是，在大幅錯開播種期的情況下，生長期間變短，存在無法得到足夠產(chǎn)量的問題。如果能夠與以往的品種同時栽培稍早熟或稍晚熟的品種，因收獲期能夠錯開，可以期待根據(jù)品種分別錯開時期來進行收獲作業(yè)。
[0006]但是，比以往的品種稍早熟或稍晚熟的品種，即培育施以稍微錯開出穗期、收獲期的微妙調(diào)整的越光品種，在技術(shù)上非常困難。這是因為，檢測出出穗期微小的差，確定與其關(guān)聯(lián)的基因很困難。為了遺傳性地檢測出這種微妙的出穗期的差，不僅需要水田的土壤、月巴料、水、空氣的流動等田地環(huán)境極其一致的精確田地，還需要播種用種子狀態(tài)一致，但現(xiàn)實中非常困難。實際上，通常，在日本的水田中，即使是遺傳性上相同的品種，即使在同一天播種，同一天插秧，也會產(chǎn)生7天左右的偏差。也就是說，最初出穗的那天與最后出穗的那天相差7天。在農(nóng)業(yè)試驗場等的情況下，即使使用比例精度非常高的田地，產(chǎn)生3?5天的偏差也很普遍。[0007]現(xiàn)有技術(shù)文獻
[0008]專利文獻
[0009]專利文獻1:日本特許4409610號公報
【發(fā)明內(nèi)容】

[0010](一)發(fā)明要解決的技術(shù)問題
[0011]本發(fā)明的目的在于提供一種比原品種早熟的水稻新品種，以及一種使水稻個體早熟的方法。
[0012](二)解決技術(shù)問題的手段
[0013]本發(fā)明人為了解決上述問題進行了深入研究，結(jié)果發(fā)現(xiàn)通過將水稻品種哈巴達(dá)克的第3染色體上存在的特定區(qū)域的染色體片段置換到水稻品種越光上，能夠使收獲期比越光提前，從而完成了本發(fā)明。
[0014]也就是說，本發(fā)明提供:
[0015](I)水稻品種越光桿5 號(Oryza sativa L.cultivar Koshihikar1-kazusa5gou),其品種權(quán)申請?zhí)枮榈?5586號；
[0016](2)—種后代個體，該后代個體是由上述(I)所述品種的個體及上述(I)所述品種的個體的后代個體所組成的組中選擇的兩個個體雜交得到的；
[0017](3) —種水稻品種鑒別方法，該方法用于鑒別某種水稻個體是否為特定品種，其特征在于，
`[0018]將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第3染色體中的第31，521，442號SNP(單核苷酸多態(tài)性)的SNP (水稻品種越光中為A，水稻品種哈巴達(dá)克中為C)作為DNA標(biāo)記M1，
[0019]將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第3染色體中的第31，689，690號SNP的SNP(水稻品種越光中為C，水稻品種哈巴達(dá)克中為T)作為DNA標(biāo)記M2，
[0020]將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第3染色體中的第32，208, 924號SNP的SNP(水稻品種越光中為A，水稻品種哈巴達(dá)克中為G)作為DNA標(biāo)記M3，
[0021]將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第3染色體中的第32，363，157號SNP的SNP(水稻品種越光中為A，水稻品種哈巴達(dá)克中為T)作為DNA標(biāo)記M4，
[0022]將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第3染色體中的第32，384，799號SNP的SNP(水稻品種越光中為T，水稻品種哈巴達(dá)克中為G)作為DNA標(biāo)記M5，
[0023]通過對該水稻個體的基因組分析，將選自所述DNA標(biāo)記Ml?M5所組成的組中的一種以上的DNA標(biāo)記進行分型，
[0024]當(dāng)?shù)玫降姆中徒Y(jié)果與水稻品種越光籽5號(Oryza sativa L.cultivarKoshihikar1-kazusa5gou)的結(jié)果一致時,鑒定該水稻個體為水稻品種越光籽5號；
[0025](4) 一種使水稻個體早熟的方法，其特征在于，將水稻個體的第3染色體中的與水稻品種日本晴的第3染色體中包含第31，720，064號堿基?第31，724，043號堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域置換為由水稻品種越光籽5號或水稻品種哈巴達(dá)克的該區(qū)域構(gòu)成的染色體片段；
[0026](5) 一種使水稻個體早熟的方法，其特征在于，將水稻個體的第3染色體中的與水稻品種日本晴的第3染色體中包含第31，720，064號堿基?第32，314，677號堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域置換為由水稻品種越光籽5號或水稻品種哈巴達(dá)克的該區(qū)域構(gòu)成的染色體片段；[0027](6)根據(jù)上述(5)所述的使水稻個體早熟的方法，其特征在于，置換所述染色體片段，使該染色體片段的上游端存在于與水稻品種日本晴的第3染色體中包含第31，689，691號堿基?第31，720，064號堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域，并且使該染色體片段的下游端存在于與水稻品種日本晴的第3染色體中包含第32，314，677號堿基?第32，363，156號堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域；
[0028](7) 一種使水稻個體早熟的方法，其特征在于，將水稻個體的第3染色體中的與水稻品種日本晴的第3染色體中包含第31，689，690號堿基?第32，363，157號堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域置換為由水稻品種越光籽5號或水稻品種哈巴達(dá)克的該區(qū)域構(gòu)成的染色體片段；
[0029](8)根據(jù)上述(7)所述的水稻個體早熟的方法，其特征在于，置換所述染色體片段，使該染色體片段的上游端存在于與水稻品種日本晴的第3染色體中包含第31，521，443號堿基?第31，689，690號堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域，并且使該染色體片段的下游端存在于與水稻品種日本晴的第3染色體中包含第32，363，157號堿基?第32，384，798號堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域；
[0030](9) 一種水稻品種，該水稻品種是根據(jù)上述(4)?(8)中任意一項所述的使水稻個體早熟的方法培育得到的；
[0031](10) 一種后代個體，該后代個體是由上述(9)所述品種的個體及上述(9)所述品種的個體的后代個體所組成的組中選擇的兩個個體雜交得到的；
[0032](11) 一種使水稻個體晚熟的方法，其特征在于，將水稻個體的第3染色體中的與水稻品種日本晴的第3染色體中包含第32，309，502號堿基?第32，314，677號堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域置換為由水稻品種越光籽5號或水稻品種哈巴達(dá)克的該區(qū)域構(gòu)成的染色體片段；
[0033](12)—種水稻品種，該水稻品種是`根據(jù)上述(11)所述的使水稻個體晚熟的方法培育得到的；
[0034](13) 一種后代個體，該后代個體是由上述(12)所述品種的個體及上述(12)所述品種的個體的后代個體所組成的組中選擇的兩個個體雜交得到的。
[0035](三)發(fā)明效果
[0036]本發(fā)明的新品種即水稻品種越光籽5號是一種比越光早熟，但是品質(zhì)、產(chǎn)量等收獲期以外的特性與越光基本相同的新品種。
[0037]并且，根據(jù)本發(fā)明的使水稻個體早熟的方法，能夠使水稻個體比原品種早熟。
【專利附圖】

【附圖說明】
[0038]圖1為示意性地表示越光、QTS4異型和QTS4同型的基因組的圖。
[0039]圖2為表示越光、QTS4異型和QTS4同型的出穗期的調(diào)查結(jié)果的圖。
[0040]圖3為示意性地表示越光和QTS14同型的基因組的圖。
[0041]圖4為表示調(diào)查越光和QTS14同型的出穗期的調(diào)查結(jié)果的圖。
[0042]圖5為示意性地表示越光的第3染色體上的QTS4區(qū)、QTS14區(qū)和DNA標(biāo)記位置的圖。
[0043]圖6為不意性地表不越光籽5號的基因組的圖。
[0044]圖7為表示調(diào)查越光籽5號、越光、QTS4同型和QTS14同型的出穗期的調(diào)查結(jié)果的圖。
【具體實施方式】
[0045]本發(fā)明中，所謂染色體片段置換系是指僅將原品種染色體的一部分置換成源自外源品種的染色體片段的體系。這里，外源品種為原品種以外的品種即可，沒有特別限定，可以是與原品種同種的植物品種，也可以是與原品種不同種的植物品種，還可以是動物等除植物以外的品種。另外，本發(fā)明中品種是指，屬于同種植物，但由于基因結(jié)構(gòu)不同而在某種性狀上明顯區(qū)別于同種內(nèi)的其他品種的群體。
[0046]在本發(fā)明中，DNA標(biāo)記只要能識別出源自原品種的染色體與源自外源品種的染色體，能檢測出染色體上的DNA序列差異即可，沒有特別限制，可以使用在基因分析領(lǐng)域中常用的DNA標(biāo)記。作為該DNA標(biāo)記，例如可以是能檢測出SNP (Single NucleotidePolymorphism,單 核苷酸多態(tài)性)、SSR (Simple Sequence Repeats,簡單重復(fù)序列)的不同重復(fù)數(shù)等的基因多態(tài)性的標(biāo)記，也可以是RFLP (Restriction Fragment LengthPolymorphism,限制酶片段長度多態(tài)性)標(biāo)記。另外，使用這些DNA標(biāo)記對源自原品種的等位基因與源自外源品種的等位基因進行識別時，可以通過常規(guī)方法進行。例如，以從各個體中提取的DNA為模型，使用能與特定的SNP或SSR進行特異性雜交的引物等進行PCR，然后，使用電泳方法等檢測是否有PCR產(chǎn)物，從而能夠識別各多態(tài)性。并且，將從各個體中提取的DNA經(jīng)限制酶處理后，用電泳方法等檢測DNA片段的圖案，能夠識別各多態(tài)性。另外，能與特定的SNP或SSR進行特異性雜交的引物等可以根據(jù)SNP或SSR的堿基序列，采用通用的引物設(shè)計工具等，以常規(guī)方法來設(shè)計。此外，可以使用在本【技術(shù)領(lǐng)域】中已知的任意方法合成設(shè)計出的引物等。
[0047]這些DNA標(biāo)記可以適當(dāng)使用公知的DNA標(biāo)記。此外，也可以為新制備的DNA標(biāo)記。作為公知的DNA標(biāo)記，例如，關(guān)于水稻，可以使用國際公開第2003/070934號小冊子等中公開的 SNP 標(biāo)記，由水稻基因組(Rice Genome Research Program (RGP):http://rgp.dna.affrc.g0.jp/publicdata.Html)公開的 DNA 標(biāo)記。
[0048]這里，各品種的基因彳目息等，例如可以在國際喊基序列數(shù)據(jù)庫NCBI (Nationalcenter for Biotechnology Information)和 DDBJ (DNA Data Bank of Japan,日本 DNA數(shù)據(jù)庫)等中獲得。特別是水稻各品種的基因信息，可以在KOME (Knowledge-based OryzaMolecular biological Encyclopedia,水稻的生物分子數(shù)據(jù)庫,http://cdna01.dna.affrc.g0.jp/cDNA/)等中獲得。
[0049]本發(fā)明以及本申請說明書中的“水稻品種日本晴的染色體的第X號的堿基?第Y號的堿基的區(qū)域”，是根據(jù)RGB中公開的水稻品種日本晴的基因組DNA的堿基序列(版本4 ；IRGSP-build4-06/04/21)決定的區(qū)域。
[0050]此外，本發(fā)明以及本申請說明書中的“與水稻品種日本晴的染色體的第X號堿基?第Y號堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域”，是指水稻個體的染色體中與水稻品種日本晴的染色體中的該區(qū)域同源性高的區(qū)域，可以通過對水稻品種日本晴的公知的基因組DNA和該水稻個體的基因組DNA的堿基序列進行對位排列使同源性達(dá)到最高來確定。此外，水稻品種日本晴以外的水稻個體中的“相當(dāng)于水稻品種日本晴的SNP的SNP”，是指在含有該SNP的區(qū)域中，在對水稻品種日本晴的公知的基因組DNA和該水稻個體的基因組DNA的喊基序列進打?qū)ξ慌帕惺雇葱赃_(dá)到最高的情況下，位于與該SNP對應(yīng)位置上的堿基。
[0051]為了培育比以往的品種稍早熟或稍晚熟的新品種，本發(fā)明的發(fā)明人首先關(guān)于出穗期，將水稻品種哈巴達(dá)克與水稻品種越光雜交，在分離群體中進行了 QTL (QuantitativeTrait Locus，數(shù)量性狀基因座)分析。結(jié)果表明，在第3染色體長臂的QTS4區(qū)中，存在延遲出穗期、使得晚熟的QTL。推測出通過將越光的該區(qū)域所包含的基因置換成源自哈巴達(dá)克的基因，可以得到比原品種越光晚熟的水稻。
[0052]于是，用越光進行回交，制得了將越光的QTS4區(qū)(與水稻品種日本晴的第3染色體的第32，309，502號堿基?第32，314，677號堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域)置換為源自哈巴達(dá)克的染色體片段的染色體片段置換系。此時，得到了僅同源染色體中一個QTS4區(qū)置換為源自哈巴達(dá)克的染色體片段的QTS4異型和同源染色體中兩者的QTS4區(qū)均置換為源自哈巴達(dá)克的染色體片段的QTS4同型的兩種個體。圖1為示意性地表示越光、QTS4異型和QTS4同型的基因組的圖。并且，在位于千葉縣的田地測定了各水稻的出穗期(播種日:2010年5月6日，移植日:2010年6月I日)，結(jié)果，如圖2所示，越光的出穗期為7月31日?8月5日，與此相對，QTS4異型為8月9日?8月12日，QTS4同型為8月11日?8月16日。也就是說表明，與原品種的越光相比，QTS4異型和QTS4同型的任意一種都明顯晚熟，與QTS4異型相比，QTS4同型的該傾向更明顯。
[0053]并且，關(guān)于出穗期的QTL分析結(jié)果表明，在水稻品種哈巴達(dá)克的第3染色體長臂的QTS14區(qū)(與水稻品種日本晴的第3染色體的第31，720，064號堿基?第31，724，043號堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域)上，存在提前出穗期、使得早熟的QTL。推測出通過將越光的該區(qū)域所包含的基因置換成源自哈巴達(dá)克的基因，可以得到比原品種越光早熟的水稻。
[0054]于是，用越光進行回交，制得了將越光的QTS14區(qū)置換為源自哈巴達(dá)克的基因片段的染色體片段置換系。圖3為示意性地表示越光和QTS14同型的基因組的圖。并且，在位于千葉縣的田地測定了各水稻的出穗期(播種日:2010年5月6日，移植日:2010年6月I日)，結(jié)果，如圖4所示，越光的出穗期為8月5日?8月8日，與此相對，QTS14同型為7月24日?7月26日。也就 是說表明，與原品種的越光相比，QTS14同型明顯早熟。
[0055]根據(jù)以上結(jié)果，本發(fā)明的發(fā)明人想到，將源自哈巴達(dá)克的QTS4區(qū)所含有的表現(xiàn)出晚熟性狀的染色體片段(以下，稱為晚熟原因染色體片段)和源自哈巴達(dá)克的QTS14區(qū)所含有的表現(xiàn)出早熟性狀的染色體片段(以下，稱為早熟原因染色體片段)雙方，通過與越光的對應(yīng)染色體片段置換而導(dǎo)入，是否能夠培育出與越光相比出穗期出現(xiàn)微妙的差異的新品種。
[0056]QTS4區(qū)與QTS14區(qū)彼此相鄰。因此，本發(fā)明人嘗試，通過將源自哈巴達(dá)克的包含兩區(qū)域和其中間區(qū)域的區(qū)域的染色體片段置換到越光中而導(dǎo)入，培育比越光稍早熟或稍晚熟的水稻。
[0057]在基于非基因重組法進行植物品種改良的情況下，被導(dǎo)入的源自外源品種的染色體片段過大時，存在目的性狀基因以外的作用不明的其他基因大量導(dǎo)入的危險，也存在損害原品種具有的優(yōu)良性狀的危險。因此，本發(fā)明人為了控制導(dǎo)入的源自外源品種的染色體片段置換區(qū)，不改變原品種具有的優(yōu)良性狀，選育出具有目標(biāo)性狀的新品種，通過專利文獻I所記載的方法進行新品種的培育。
[0058]具體來說，首先，根據(jù)公知的水稻基因信息，設(shè)定圖5所示位置關(guān)系的5種DNA標(biāo)記。即，在包含QTS4區(qū)和QTS14區(qū)的區(qū)域(以下，稱為“(QTS4+QTS14)區(qū)”)的上游側(cè)末端或其上游設(shè)定DNA標(biāo)記M2，在DNA標(biāo)記M2的上游設(shè)定DNA標(biāo)記M1，在(QTS4+QTS14)區(qū)的下游側(cè)末端或其下游設(shè)定DNA標(biāo)記M4，在DNA標(biāo)記M4的下游設(shè)定DNA標(biāo)記M5，在(QTS4+QTS14)區(qū)中設(shè)定DNA標(biāo)記M3。隨后，在越光染色體中，對僅包含(QTS4+QTS14)區(qū)的一部分置換為源自哈巴達(dá)克的染色體片段的染色體片段置換系進行回交，根據(jù)所述5種DNA標(biāo)記Ml?M5，從所得到的雜交群體中篩選優(yōu)良的個體。然后，對該個體適當(dāng)?shù)剡M行自交或回交，同樣根據(jù)DNA標(biāo)記Ml?M5篩選優(yōu)良的個體，如此適當(dāng)?shù)刂貜?fù)，從而得到源自哈巴達(dá)克的染色體片段所置換的區(qū)域(圖5中“L”)的上游側(cè)末端位于DNA標(biāo)記Ml與M2之間，該區(qū)域的下游側(cè)末端位于DNA標(biāo)記M4與M5之間的后代個體。如圖5所示，該后代個體的DNA標(biāo)記Ml和M5與原品種的越光是相同類型，DNA標(biāo)記M2、M3和M4與哈巴達(dá)克是相同類型。
[0059]這里，通過專利文獻2所記載的新品種培育方法，若DNA標(biāo)記Ml與M2之間的距離dl延長，則源自外源品種的染色體片段(本申請中，為源自哈巴達(dá)克的染色體片段)L的上游側(cè)末端可存在的范圍擴大，被導(dǎo)入的源自哈巴達(dá)克的染色體片段L的長度難以確定。另一方面，若距離dl縮短，則源自哈巴達(dá)克的染色體片段L的上游側(cè)末端可存在的范圍縮小，被導(dǎo)入的源自哈巴達(dá)克的染色體片段L的長度變得容易確定。同樣地，若DNA標(biāo)記M4與M5之間的距離d3延長，則源自哈巴達(dá)克的染色體片段L的下游側(cè)末端可存在的范圍擴大，難以確定被導(dǎo)入的源自哈巴達(dá)克的染色體片段L的長度，若距離d3縮短，則源自哈巴達(dá)克的染色體片段L的下游側(cè)末端可存在的范圍縮小，容易確定被導(dǎo)入的源自哈巴達(dá)克的染色體片段L的長度。
[0060]源自哈巴達(dá)克的染色體片段L的長度越長，則存在于QTS4區(qū)和QTS14區(qū)以外的區(qū)域的基因也與存在于QTS4區(qū)或QTS14區(qū)的靶基因一同被導(dǎo)入原品種越光的可能性越高。靶基因以外的基因也被導(dǎo)入將導(dǎo)致存在于原品種中的靶基因以外的基因也被置換，可能會導(dǎo)致無意中損害原品種所具有的優(yōu)異性狀。因此，源自哈巴達(dá)克的染色體片段L的長度與包含QTS4區(qū)和QTS14區(qū)的最短區(qū)域(從QTS14區(qū)的上游端至QTS4區(qū)的下游端的區(qū)域，以下有時稱為“(QTS4+QTS14)區(qū)”)相比，優(yōu)選為不要不必要地長。
[0061]本發(fā)明人設(shè)定多組DN A標(biāo)記Ml?M5組，培育出多個導(dǎo)入了包含(QTS4+QTS14)區(qū)的長度不同的染色體片段的個體，調(diào)查了各個體的出穗期。其結(jié)果為，全都是比越光的出穗期早的早熟個體。進而，將各個體出穗期以外的性狀(例如，味道、產(chǎn)量等)與越光進行了比較，結(jié)果表明，如后述實施例1所示，表I所示DNA標(biāo)記Ml?M5組，即，將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第3染色體的第31，521，442號SNP (單核苷酸多態(tài)性)的SNP (水稻品種越光中為A，水稻品種哈巴達(dá)克中為C)設(shè)定為DNA標(biāo)記Ml (DNA標(biāo)記Ml_Ac)，將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第3染色體的第31，689，690號SNP的SNP (水稻品種越光中為C，水稻品種哈巴達(dá)克中為T)設(shè)定為DNA標(biāo)記M2 (DNA標(biāo)記M2-Ct)，將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第3染色體的第32，208，924號SNP的SNP (水稻品種越光中為A，水稻品種哈巴達(dá)克中為G)設(shè)定為DNA標(biāo)記M3 (DNA標(biāo)記M3_Ag)，將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第3染色體的第32，363，157號SNP的SNP (水稻品種越光中為A，水稻品種哈巴達(dá)克中為T)設(shè)定為DNA標(biāo)記M4 (DNA標(biāo)記M4-Gc)，將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第3染色體中的第32，384，799號SNP的SNP(水稻品種越光中為T，水稻品種哈巴達(dá)克中為G)設(shè)定為DNA標(biāo)記M5(DNA標(biāo)記M5-Tg)，分別使用其培育出個體(水稻品種越光桿 5 號(Oryza sativa L.cultivar Koshihikari_kazusa5gou)),該個體除出穗期以外的其他性狀與越光同等(參照表2?5)。并且，水稻品種越光籽5號是使用用于新品種育種的DNA標(biāo)記組中，所導(dǎo)入的源自哈巴達(dá)克染色體片段長度最短的DNA標(biāo)記組培育出的個體。
[0062]表I
【權(quán)利要求】
1.水稻品種越光桿5 號(Oryza sativa L.cultivar Koshihikari_kazusa5gou),其品種權(quán)申請?zhí)枮榈?5586號。
2.一種后代個體，該后代個體是由權(quán)利要求1所述品種的個體與權(quán)利要求1所述品種的個體的后代個體所組成的組中選擇的兩個個體雜交得到的。
3.—種水稻品種鑒別方法，該方法用于鑒別某種水稻個體是否為特定品種，其特征在于， 將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第3染色體中的第31，521，442號SNP (單核苷酸多態(tài)性)的SNP (水稻品種越光中為A，水稻品種哈巴達(dá)克中為C)作為DNA標(biāo)記M1， 將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第3染色體中的第31，689，690號SNP的SNP(水稻品種越光中為C，水稻品種哈巴達(dá)克中為T)作為DNA標(biāo)記M2， 將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第3染色體中的第32，208，924號SNP的SNP(水稻品種越光中為A，水稻品種哈巴達(dá)克中為G)作為DNA標(biāo)記M3， 將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第3染色體中的第32，363，157號SNP的SNP(水稻品種越光中為A，水稻品種哈巴達(dá)克中為T)作為DNA標(biāo)記M4， 將相當(dāng)于水稻品種日本晴的第3染色體中的第32，384，799號SNP的SNP(水稻品種越光中為T，水稻品種哈巴達(dá)克中為G)作為DNA標(biāo)記M5， 通過該水稻個體的基因組分析，將選自所述DNA標(biāo)記Ml?M5所組成的組中的一種以上的DNA標(biāo)記進行分型， 當(dāng)?shù)玫降姆中徒Y(jié)果與水稻品種越光籽5號的結(jié)果一致時，鑒定該水稻個體為水稻品種越光籽5號。
4.一種使水稻個體早熟的方法，其特征在于，將水稻個體的第3染色體中的與水稻品種日本晴的第3染色體中包含第31，720，064號堿基?第31，724，043號堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域置換為由水稻品種越光籽5號或水稻品種哈巴達(dá)克的該區(qū)域構(gòu)成的染色體片段。
5.一種使水稻個體早熟的方法，其特征在于，將水稻個體的第3染色體中的與水稻品種日本晴的第3染色體中包含第31，720，064號堿基?第32，314，677號堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域置換為由水稻品種越光籽5號或水稻品種哈巴達(dá)克的該區(qū)域構(gòu)成的染色體片段。
6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的使水稻個體早熟的方法，其特征在于，置換所述染色體片段，使該染色體片段的上游端存在于與水稻品種日本晴的第3染色體中包含第31，689，691號堿基?第31，720，064號堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域，并且該染色體片段的下游端存在于與水稻品種日本晴的第3染色體中包含第32，314，677號堿基?第32，363，156號堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域。
7.一種使水稻個體早熟的方法，其特征在于，將水稻個體的第3染色體中的與水稻品種日本晴的第3染色體中包含第31，689，690號堿基?第32，363，157號堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域置換為水稻品種越光籽5號或水稻品種哈巴達(dá)克的該區(qū)域構(gòu)成的染色體片段。
8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的使水稻個體早熟的方法，其特征在于，置換所述染色體片段，使該染色體片段的上游端存在于與水稻品種日本晴的第3染色體中包含第31，521，443號堿基?第31，689，690號堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域，并且該染色體片段的下游端存在于與水稻品種日本晴的第3染色體中包含第32，363，157號堿基?第32，384，798號堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域。
9.一種水稻品種,該水稻品種是根據(jù)權(quán)利要求4?8中任意一項所述的使水稻個體早熟的方法培育得到的。
10.一種后代個體，該后代個體是由權(quán)利要求9所述品種的個體與權(quán)利要求9所述品種的個體的后代個體所組成的組中選擇的兩個個體雜交得到的。
11.一種使水稻個體晚熟的方法，其特征在于，將水稻個體的第3染色體中的與水稻品種日本晴的第3染色體中包含第32，309，502號堿基?第32，314，677號堿基的區(qū)域相當(dāng)?shù)膮^(qū)域置換為由水稻品種越光籽5號或水稻品種哈巴達(dá)克的該區(qū)域構(gòu)成的染色體片段。
12.—種水稻品種，該水稻品種是根據(jù)權(quán)利要求11所述的使水稻個體晚熟的方法培育得到的。
13.一種后代個體，該后代個體是由權(quán)利要求12所述品種的個體與權(quán)利要求12所述品種的個體的后代個體所 組 成的組中選擇的兩個個體雜交得到的。
【文檔編號】A01H5/00GK103429074SQ201180069337
【公開日】2013年12月4日 申請日期:2011年3月18日 優(yōu)先權(quán)日:2011年3月18日
【發(fā)明者】林少揚 申請人:本田技研工業(yè)株式會社