專利名稱：質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法和質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
本發(fā)明涉及一種用于處理通過質(zhì)量分析所收集到的數(shù)據(jù)的方法，尤其涉及一種適于能夠獲取示出試樣上的二維區(qū)域內(nèi)的特定質(zhì)荷比的信號強(qiáng)度的分布的圖像(以下將將這一圖像稱為“質(zhì)量分析結(jié)果圖像”)的成像質(zhì)譜儀的數(shù)據(jù)處理方法。本發(fā)明還涉及使用這一方法的質(zhì)譜儀。
背景技術(shù)：
質(zhì)譜成像是一種通過對諸如一塊生物組織等的試樣的二維區(qū)域內(nèi)的多個微小區(qū)域分別進(jìn)行質(zhì)量分析來研究具有指定質(zhì)荷比(m/z)的物質(zhì)的分布的技術(shù)。該技術(shù)可望用于例如藥物發(fā)現(xiàn)、生物標(biāo)志物尋找和各種疾病的病因探究。通常將針對質(zhì)譜成像所設(shè)計的質(zhì)譜儀稱為成像質(zhì)譜儀。由于這種類型的裝置的操作通常包括用于對試樣上的任意區(qū)域進(jìn)行顯微觀察、基于觀察圖像選擇感興趣的區(qū)域并且對所選擇的區(qū)域進(jìn)行成像質(zhì)量分析的步 驟，所以還可以將其稱為質(zhì)量顯微鏡。在下面的說明中，將使用術(shù)語“成像質(zhì)譜儀”。非專利文獻(xiàn)I和2公開了公知的成像質(zhì)譜儀的結(jié)構(gòu)和利用這些成像質(zhì)譜儀進(jìn)行的分析的例子。圖9示意性示出通過利用成像質(zhì)譜儀進(jìn)行分析所獲得的數(shù)據(jù)和基于該數(shù)據(jù)的圖像顯示處理。如圖所示，在成像質(zhì)譜儀中，對于試樣100上的二維區(qū)域101內(nèi)的大量測量點(diǎn)(微小區(qū)域)102中的每一個，獲得許多質(zhì)量分析數(shù)據(jù)。在非專利文獻(xiàn)I和2所公開的成像質(zhì)譜儀中，根據(jù)來自試樣的離子的質(zhì)荷比，通過飛行時間質(zhì)譜儀來分離這些離子。在具有這一結(jié)構(gòu)的系統(tǒng)中，在每一測量點(diǎn)可以獲得示出離子強(qiáng)度的時間變化的飛行時間譜數(shù)據(jù)，并且將飛行時間值轉(zhuǎn)換成質(zhì)荷比來創(chuàng)建質(zhì)譜。成像質(zhì)譜儀的空間分辯能力依賴于試樣100上的測量點(diǎn)102的間隔。為增大空間分辯能力以獲得更高分辨率的圖像，需要增加測量點(diǎn)102的數(shù)量。當(dāng)設(shè)置大量測量點(diǎn)102時，在對于測量所選擇的二維區(qū)域101內(nèi)將獲得巨大量的飛行時間譜數(shù)據(jù)。例如，考慮以采樣頻率IGHz對約20ms的時間范圍的飛行時間譜信號進(jìn)行采樣，并且將該信號的每一樣本轉(zhuǎn)換成16位數(shù)字信號的情況。在飛行時間譜中，在各測量點(diǎn)收集的樣本的數(shù)量約為20000。由于每一樣本都是2字節(jié)數(shù)據(jù)，所以一個樣本的總數(shù)據(jù)量約為40KB。如果在測量區(qū)域內(nèi)以250X250像素的網(wǎng)格模式二維配置測量點(diǎn)，則測量點(diǎn)的數(shù)量為62500，并且從該測量區(qū)域所獲得的總數(shù)據(jù)量大約2. 32GB。如果縮小測量點(diǎn)的間隔以增大測量點(diǎn)的數(shù)量來增強(qiáng)空間分辯能力，或者如果擴(kuò)大作為測量的對象的二維區(qū)域，總數(shù)據(jù)量將進(jìn)一步增大。當(dāng)增大飛行時間譜信號的采樣頻率以提高質(zhì)量精度或質(zhì)量分辯能力時，發(fā)生總數(shù)據(jù)量的進(jìn)一步增大。因此，以高分辨率和/或高質(zhì)量分辯能力獲得的質(zhì)譜成像數(shù)據(jù)具有大的數(shù)據(jù)大小。為從以上述方式所收集的質(zhì)量分析數(shù)據(jù)提取有意義的信息，必須在視覺上呈現(xiàn)與質(zhì)譜上的各峰值相對應(yīng)的質(zhì)荷比的空間分布，以讓分析操作者解釋數(shù)據(jù)的意義或者使用計算機(jī)進(jìn)行估計處理。為有效進(jìn)行這類工作，如圖9所示，需要從各測量點(diǎn)102的質(zhì)譜提取與指定質(zhì)荷比(在圖9的例子中，m/z = M1)相對應(yīng)的強(qiáng)度值，并且高速在視覺上呈現(xiàn)該強(qiáng)度值的二維分布。為此，必須將構(gòu)成質(zhì)譜或飛行時間譜的質(zhì)量分析數(shù)據(jù)裝載進(jìn)計算機(jī)的主存儲器(通常為隨機(jī)存取存儲器)。然而，當(dāng)使用一般類型的個人計算機(jī)時，由于主存儲器僅存在有限的實(shí)際可用空間，所以難以將高分辨率質(zhì)量分析數(shù)據(jù)整個裝載進(jìn)主存儲器。一種用于處理不能被整個裝載進(jìn)主存儲器的大規(guī)模的質(zhì)量分析數(shù)據(jù)的技術(shù)是，將數(shù)據(jù)的一部分分割成可被裝載進(jìn)主存儲器的小規(guī)模，并且使用該部分?jǐn)?shù)據(jù)創(chuàng)建圖像。然而，在這種情況下，不可能同時顯示和分析大空間范圍和寬質(zhì)量范圍的數(shù)據(jù)。用于顯示和分析大空間范圍和寬質(zhì)量范圍的數(shù)據(jù)的一個可能方法是使用外部存儲器裝置(例如，硬盤)的一部分作為虛擬主存儲器，然而，這不可避免地導(dǎo)致處理速度的明顯下降。此外，當(dāng)分析旨在比較兩個以上試樣的數(shù)據(jù)、以及處理各試樣的數(shù)據(jù)時，甚至必須在主存儲器上裝載和處理更大量的數(shù)據(jù)。實(shí)際上，不可能利用常用的個人計算機(jī)來處理這么大量的數(shù)據(jù)。對于在計算機(jī)上處理大量的數(shù)據(jù)，通常使用的技術(shù)是通過數(shù)據(jù)壓縮來降低數(shù)據(jù)的大小。該技術(shù)也可應(yīng)用于上述大的大小的質(zhì)量分析數(shù)據(jù)來降低數(shù)據(jù)大小，從而使得可以在 計算機(jī)的主存儲器上處理整個數(shù)據(jù)量。然而，為了創(chuàng)建質(zhì)量分析結(jié)果或者其它目的，使用數(shù)據(jù)壓縮技術(shù)將整個質(zhì)量分析數(shù)據(jù)裝載進(jìn)主存儲器，這樣導(dǎo)致下面的問題。作為用于壓縮構(gòu)成質(zhì)譜或飛行時間譜的質(zhì)量分析數(shù)據(jù)的方法，通常采用使用鄰近數(shù)據(jù)點(diǎn)之間的相互關(guān)系的方法。例如，根據(jù)專利文獻(xiàn)I所述技術(shù)，對于圖9所示的各質(zhì)譜，可以使用質(zhì)荷比軸上相互鄰近的多個數(shù)據(jù)點(diǎn)的相互關(guān)系，進(jìn)行基于行程編碼或熵編碼的數(shù)據(jù)壓縮。該操作降低了各質(zhì)譜的，即各測量點(diǎn)102的質(zhì)量分析數(shù)據(jù)的大小，從而使得可以同時將試樣100的二維區(qū)域101內(nèi)的所有測量點(diǎn)102的質(zhì)量分析數(shù)據(jù)裝載進(jìn)主存儲器。當(dāng)分析操作者想要觀察指定質(zhì)荷比的質(zhì)量分析結(jié)果圖像時，必須利用計算機(jī)從各測量點(diǎn)的質(zhì)譜數(shù)據(jù)提取指定質(zhì)荷比的信號強(qiáng)度信息、并使所提取的信息經(jīng)過圖像創(chuàng)建處理。如果存儲在主存儲器中的質(zhì)量分析數(shù)據(jù)是非壓縮數(shù)據(jù)，則通過從與正考慮的質(zhì)荷比相對應(yīng)的存儲地址讀取強(qiáng)度值、并將讀取值重建成圖像，可以容易地創(chuàng)建圖像。另一方面，如果質(zhì)量分析數(shù)據(jù)是編碼壓縮數(shù)據(jù)，則不可能馬上知道與指定質(zhì)荷比相對應(yīng)的存儲地址。因此，在讀取與指定質(zhì)荷比相對應(yīng)的強(qiáng)度值之前，需要臨時解壓縮質(zhì)譜數(shù)據(jù)。必須對在測量點(diǎn)所獲得的各質(zhì)譜重復(fù)上述用于收集與指定質(zhì)荷比相對應(yīng)的強(qiáng)度值的處理，這使用長的時間段。因此，顯示一個質(zhì)量分析結(jié)果圖像需要相當(dāng)長的時間。如上所述，對于成像質(zhì)量分析，搜索各種質(zhì)荷比的大量的質(zhì)量分析數(shù)據(jù)以找到具有有意義的空間分布的質(zhì)荷比的工作是根本。如果質(zhì)量分析結(jié)果圖像的顯示需要長的時間，則該搜索的吞吐量將明顯下降。通常已知，數(shù)據(jù)壓縮技術(shù)歷史最久且使用范圍最廣的技術(shù)領(lǐng)域是圖像處理。這是因?yàn)?，圖像常常包含相對大量的數(shù)據(jù)，并且常常需要通過具有有限傳輸速率的信道或者經(jīng)由具有有限容量的其它類型的介質(zhì)來發(fā)送和接收具有大量數(shù)據(jù)的圖像。例如，在處理黑白二值圖像的傳真中使用上述行程編碼。在這種圖像相關(guān)的領(lǐng)域中，也非常需要用于快速找到壓縮數(shù)據(jù)數(shù)組中的哪一位置對應(yīng)于原始(非壓縮)數(shù)據(jù)數(shù)組中的期望位置的方法。例如，在專利文獻(xiàn)2提出的用于利用行程編碼壓縮位像數(shù)據(jù)的方法中，使用用于示出原始(非壓縮)數(shù)據(jù)數(shù)組中的位置和行程編碼數(shù)據(jù)數(shù)組中的位置之間的對應(yīng)關(guān)系的索引來提高找到期望位置的速度。更具體地，對于壓縮圖像數(shù)據(jù)數(shù)組中以一定間隔所定義的每一位置，嵌入用于表示原始數(shù)據(jù)中的哪一位置對應(yīng)于該位置的索引信息。這一使用索引信息的加速技術(shù)也可適用于質(zhì)量分析數(shù)據(jù)的壓縮。然而，在用于在壓縮數(shù)據(jù)中以一定間隔嵌入索引信息的方法中，必須對通過索引分開的各部分都完成行程編碼(或者類似壓縮處理)，這導(dǎo)致數(shù)據(jù)壓縮效率下降。此外，通過在沒有預(yù)期到數(shù)據(jù)中存在索引信息的情況下被設(shè)計用于讀取壓縮數(shù)據(jù)的系統(tǒng)，不能正確讀取嵌入了索引信息的壓縮數(shù)據(jù)。也就是說，索引信息的嵌入使一些現(xiàn)有系統(tǒng)對于壓縮質(zhì)量分析數(shù)據(jù)不能保持向后兼容性。
背景技術(shù)：
文獻(xiàn)專利文獻(xiàn)專利文獻(xiàn)I :W0-A 12009-069225
專利文獻(xiàn)2 JP-A 2OO7-IO39M非專利文獻(xiàn)非專利文獻(xiàn)I :Kiyoshi Ogawa et al. ,“Kenbi Shitsuryou Bunse ki Souchi NoKaihatsu,，，( “Research and Development of Mass Microscope”)Shimadzu Review,Mar. 31,2006，vol. 62，nos. 3*4, pp. 125-135非專利文獻(xiàn)2 :Takahiro Harada et al., “Kenbi Shitsuryou Bunseki SouchiNi Yoru Seitai Soshiki Bunseki,，，( “Biological Tissue Analysis Using MassMicroscope”)Shimadzu Review, Apr. 24,2008，vol. 64，no s. 3 4，pp.139-14
發(fā)明內(nèi)容
發(fā)明要解決的問題考慮到上述問題開發(fā)了本發(fā)明，并且本發(fā)明的一個目的是提供一種質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法，其中，該質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法能夠壓縮以高空間分辯能力和高質(zhì)量分辯能力所獲得的質(zhì)量分析結(jié)果圖像的數(shù)據(jù)，以利用最小的信息損失來降低圖像的數(shù)據(jù)大小，而且還能夠從壓縮數(shù)據(jù)高速讀取與任意質(zhì)荷比或飛行時間相對應(yīng)的強(qiáng)度信息。本發(fā)明的另一目的是提供一種質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法，其中，該質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法能夠在不會影響數(shù)據(jù)壓縮效率的情況下壓縮質(zhì)量分析結(jié)果圖像的數(shù)據(jù)，通過該質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法，可以高速讀取與任意質(zhì)荷比或飛行時間相對應(yīng)的強(qiáng)度信息，并且即使通過不支持高速讀取的系統(tǒng)，也可以正確讀取所需信息。本發(fā)明還提供使用這些方法的質(zhì)譜儀。用于解決問題的方案旨在解決上述問題的本發(fā)明的第一方面是一種質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法，用于處理通過質(zhì)量分析所收集的強(qiáng)度信息的一維數(shù)組形式的原始譜數(shù)據(jù)，并包括a)壓縮步驟，根據(jù)預(yù)定的算法對所述原始譜數(shù)據(jù)進(jìn)行壓縮處理，并且將由此獲得的一維數(shù)組形式的壓縮數(shù)據(jù)存儲在第一存儲區(qū)域中；b)索引信息創(chuàng)建步驟，創(chuàng)建用于將所述原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中某一強(qiáng)度信息的存在位置與所述壓縮數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中同所述強(qiáng)度信息相對應(yīng)的壓縮信息的存在位置相關(guān)聯(lián)的索引信息，并且將所述索引信息存儲在與所述第一存儲區(qū)域分開的第二存儲區(qū)域中；以及c)信息恢復(fù)步驟，當(dāng)給出用于輸出所述原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中特定位置處的強(qiáng)度信息的命令時，通過參考所述第二存儲區(qū)域中的所述索引信息識別與所述特定位置相對應(yīng)的所需壓縮信息的存儲位置，從所述第一存儲區(qū)域讀取所需壓縮信息，并且解壓縮所讀取的信息以獲得所述特定位置處的強(qiáng)度信息。本發(fā)明的第二方面是一種用于處理質(zhì)量分析成像數(shù)據(jù)的質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法，在所述質(zhì)量分析成像數(shù)據(jù)中，通過對試樣上的多個測量部位分別進(jìn)行質(zhì)量分析所收集的強(qiáng)度信息的一維數(shù)組形式的原始譜數(shù)據(jù)與所述測量部位的空間位置信息相關(guān)聯(lián)，所述質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法包括a)壓縮步驟，根據(jù)預(yù)定算法壓縮所述原始譜數(shù)據(jù)，并且將一維數(shù)組形式的壓縮數(shù)據(jù)存儲在第一存儲區(qū)域中；b)索引信息創(chuàng)建步驟，創(chuàng)建用于將所述原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中某一強(qiáng)度信息的存在位置與所述壓縮數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中同所述強(qiáng)度信息相對應(yīng)的壓縮信息的存在位置 相關(guān)聯(lián)的索引信息，并且將所述索引信息存儲在與所述第一存儲區(qū)域分開的第二存儲區(qū)域中；c)位置計算步驟，當(dāng)指定用于創(chuàng)建質(zhì)量分析結(jié)果圖像的質(zhì)荷比時，計算所述原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中與所指定的質(zhì)荷比相對應(yīng)的位置； d)信息恢復(fù)步驟，對于所有的測量部位或者特定范圍內(nèi)的測量部位組中的各測量部位，通過參考存儲在所述第二存儲區(qū)域中的所述索引信息，識別與在所述位置計算步驟中所計算出的位置相對應(yīng)的所需壓縮信息的存儲位置，從所述第一存儲區(qū)域讀取所需壓縮信息，并且解壓縮所讀取的信息以獲得所計算出的位置處的強(qiáng)度信息；以及e)圖像創(chuàng)建步驟，使用在所述信息恢復(fù)步驟中所獲得的各測量部位的強(qiáng)度信息和這些測量部位的空間位置信息，創(chuàng)建示出期望質(zhì)荷比的強(qiáng)度信息的二維分布的質(zhì)量分析結(jié)果圖像。在根據(jù)本發(fā)明的第二方面的所述質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法的一個模式下，所述質(zhì)量分析成像數(shù)據(jù)是利用具有用于拍攝試樣的光學(xué)顯微圖像的攝像裝置的成像質(zhì)譜儀所收集的大量數(shù)據(jù)，并且在所述圖像創(chuàng)建步驟中，通過將期望質(zhì)荷比的強(qiáng)度信息顯示在利用所述攝像裝置所拍攝的試樣的光學(xué)顯微圖像上的相應(yīng)位置處來創(chuàng)建所述質(zhì)量分析結(jié)果圖像。在根據(jù)本發(fā)明第一或第二方面的所述質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法中，在所述壓縮步驟中，通過行程編碼、熵編碼或者這兩種編碼的組合以無損方式壓縮所述原始譜數(shù)據(jù)的至少一部分?！八鲈甲V數(shù)據(jù)的一維數(shù)組”通常包括分別與不同質(zhì)荷比相對應(yīng)的、按照質(zhì)荷比順序排列的強(qiáng)度值。然而，根據(jù)質(zhì)譜儀的類型或其它因素，可針對值與質(zhì)荷比一一對應(yīng)的其它參數(shù)的各值獲得強(qiáng)度值，在這一情況下，可以按照該參數(shù)的值的順序來排列強(qiáng)度值。例如，如果質(zhì)譜儀是飛行時間質(zhì)譜儀，則原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組可以是分別在不同飛行時間值時所獲得的、按照飛行時間值的順序排列的強(qiáng)度值。作為根據(jù)本發(fā)明第一或第二方面的所述質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法的一個具體模式，可以如下進(jìn)行上述步驟在所述壓縮步驟中進(jìn)行所述壓縮處理，以使得所述原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中等于或小于預(yù)定水平的各強(qiáng)度值被替換為特定值，所述特定值按照所述數(shù)組的順序連續(xù)出現(xiàn)兩次以上的各部分被替換為表示所述特定值的連續(xù)出現(xiàn)次數(shù)的值，而對于由除所述特定值以外的強(qiáng)度值構(gòu)成的各序列，緊挨在各序列之前插入表示構(gòu)成該序列的強(qiáng)度值的個數(shù)的值；在所述索引信息創(chuàng)建步驟中，創(chuàng)建由分別包括如下數(shù)值對的多個項構(gòu)成的列表作為所述索引信息，其中，所述數(shù)值對中的一個數(shù)值用于保持所述原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中與連續(xù)出現(xiàn)所述特定值的開始位置有關(guān)的位置信息或與由除所述特定值以外的強(qiáng)度值構(gòu)成的序列的開始位置有關(guān)的位置信息，并且所述數(shù)值對中的另一數(shù)值用于保持所述壓縮數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中與連續(xù)出現(xiàn)所述特定值的開始位置相對應(yīng)的位置信息或與由除所述特定值以外的強(qiáng)度值構(gòu)成的序列的開始位置相對應(yīng)的位置信息；以及在所述信息恢復(fù)步驟中，當(dāng)要獲得特定位置的強(qiáng)度值時，搜索所述列表以找到包括所述特定位置的強(qiáng)度值的序列的開始位置，并且從所述壓縮數(shù)據(jù)的數(shù)組中的相應(yīng)位置處讀取所需強(qiáng)度值。在質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法的該模式下，在壓縮步驟中，將原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組 中等于或小于預(yù)定水平的各強(qiáng)度值(即，可被認(rèn)為無意義的各強(qiáng)度值)替換為特定值(例如，0)。隨后，將強(qiáng)度值0按照數(shù)組的順序連續(xù)出現(xiàn)兩次以上的部分替換為表示0的連續(xù)出現(xiàn)次數(shù)的值，而對于由有意義的強(qiáng)度值構(gòu)成的序列，緊挨在該序列之前插入表示構(gòu)成該序列的強(qiáng)度值的個數(shù)的值。然后，在索引信息創(chuàng)建步驟中，將原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中強(qiáng)度值0連續(xù)出現(xiàn)兩次以上的各部分的開始位置與壓縮數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中同該開始位置相對應(yīng)的位置配對，并且類似地，將原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中包括有意義的強(qiáng)度值的各數(shù)據(jù)序列的開始位置與壓縮數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中同該開始位置相對應(yīng)的位置配對。將這樣所創(chuàng)建的位置對組合成索引信息，并且將索引信息與壓縮數(shù)據(jù)分開地存儲在不同的存儲區(qū)域中。在任何一維數(shù)組中都不是以根據(jù)數(shù)據(jù)內(nèi)容而變化的一定間隔來創(chuàng)建示出原始譜數(shù)據(jù)和壓縮數(shù)據(jù)之間位置關(guān)系的信息。換句話說，位置關(guān)系信息的創(chuàng)建對要壓縮的數(shù)據(jù)的單位(或長度)沒有限制，因此不會對壓縮效果產(chǎn)生不利影響。由于不將索引信息嵌入壓縮數(shù)據(jù)，而是將其與壓縮數(shù)據(jù)分開地存儲在不同的存儲區(qū)域中，所以可以通過僅使用壓縮數(shù)據(jù)而不參考索引信息的普通解壓縮技術(shù)來恢復(fù)原始譜數(shù)據(jù)。例如，在信息恢復(fù)步驟中，可以以下面的方式從壓縮數(shù)據(jù)讀取所需信息在原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中，假定X表示需要獲得強(qiáng)度值的質(zhì)荷比值或者與質(zhì)荷比值相對應(yīng)的其它參數(shù)(例如，飛行時間)的值的位置；在信息恢復(fù)步驟中，訪問保持索引信息的第二存儲區(qū)域，以從原始譜數(shù)據(jù)的位置信息的列表中選擇值小于X的位置中的具有最大值的位置；隨后，假定T表示索引信息中與所選擇的位置值S配對的壓縮數(shù)據(jù)的位置，訪問保持在第一存儲區(qū)域中的壓縮數(shù)據(jù)以讀取位置T處的值。例如，考慮下面的情況以二值形式表示數(shù)據(jù)值，并且根據(jù)各數(shù)據(jù)的最高有效位的值(0或I)來判斷該數(shù)據(jù)是對應(yīng)于強(qiáng)度值0的序列還是對應(yīng)于有意義強(qiáng)度值的序列。如果所讀取的數(shù)據(jù)值的最高有效位是“0”，則意味著從該點(diǎn)開始連續(xù)出現(xiàn)0，并且由所讀取的數(shù)據(jù)的值表示出現(xiàn)次數(shù)。因此，對于由所表示的數(shù)量的0組成的后續(xù)部分，由于已推導(dǎo)出該部分內(nèi)的強(qiáng)度值都是0，所以不必重建原始譜。另一方面，如果在位置T處所讀取的數(shù)據(jù)的最高有效位是“1”，則意味著從該點(diǎn)開始連續(xù)出現(xiàn)有意義(非零)強(qiáng)度值，并且所讀取的數(shù)據(jù)的除最高有效位以外的值表示出現(xiàn)次數(shù)。因此，可以在壓縮數(shù)據(jù)中從位置T正前X-S的位置處檢索到指定位置的強(qiáng)度值。作為與指定質(zhì)荷比相對應(yīng)的位置X，必須搜索索引信息的列表中具有最接近值的位置。這通常可以這樣實(shí)現(xiàn)從索引信息中原始譜數(shù)據(jù)的位置的列表的第一項開始搜索，直到找到具有大于X的值的第一個位置為止，并且選擇緊挨在所找到的位置之前的位置。當(dāng)原始譜數(shù)據(jù)包括寬的質(zhì)荷比范圍時，或者當(dāng)質(zhì)量分辯能力高時，由于一維數(shù)組中存在非常大量的元素，所以對于大于X的值的搜索處理可能需要相當(dāng)大量的時間。為應(yīng)對該問題，可以使用二級索引作為輔助索引，其中，利用二級索引，可以通過簡單數(shù)學(xué)運(yùn)算定位索引信息的列表中最接近與指定質(zhì)荷比相對應(yīng)的位置X的數(shù)值。二級索引的一個例子是表，其中，該表針對原始質(zhì)譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中位于預(yù)定數(shù)據(jù)位置間隔處的多個數(shù)據(jù)中的每一個數(shù)據(jù)，示出索引信息的列表中用于保持在關(guān)注數(shù)據(jù)的位置之前的數(shù)據(jù)中值與關(guān)注位置的值最接近的數(shù)據(jù)的行號(由原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中的位置信息和壓縮數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中的位置信息構(gòu)成的對的序號)。在這種情況下，根據(jù)本發(fā)明第一或第二方面的所述質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法還包括二級索引創(chuàng)建步驟，其中，在所述二級索引創(chuàng)建步驟中，任意設(shè)置所述原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù) 組中的數(shù)據(jù)位置間隔D，并且通過重復(fù)下面的處理直到DX X的值超過所述原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組的元素的數(shù)量為止來創(chuàng)建所述二級索引從所述索引信息中的保持所述原始譜數(shù)據(jù)的位置的一維數(shù)組的第一個元素開始，順次將該一維數(shù)組中的各元素的值P與DX X的值進(jìn)行比較，并且當(dāng)P第一次超過DX X時，將所述索引信息的緊挨著的上一元素中所包括的原始譜數(shù)據(jù)存儲位置的值寫入所述二級索引的第X個元素。如果與索引信息分開地保持二級索引，則在信息恢復(fù)步驟中，用于獲得所述原始譜數(shù)據(jù)中預(yù)定位置X處的強(qiáng)度值的處理可以包括以下步驟將預(yù)定位置X除以數(shù)據(jù)位置間隔D以獲得商M ;參考所述二級索引的第M個元素以獲得所述索引信息中最接近所述預(yù)定位置X的位置；從所獲得的所述索引信息中的位置讀取原始譜數(shù)據(jù)存儲位置的值W ;按照原始譜數(shù)據(jù)存儲位置的升序繼續(xù)所述讀取處理，直到所讀取的值W超過所述預(yù)定位置X的值為止；一旦所讀取的值W超過所述預(yù)定位置X的值，讀取所述索引信息中所述原始譜數(shù)據(jù)的存儲位置的緊挨著當(dāng)前讀取元素的上一位置處的值；將所讀取的值設(shè)置為所述壓縮數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中包括所述預(yù)定位置X的強(qiáng)度值的序列的開始位置；以及讀取所述預(yù)定位置X處的強(qiáng)度值。當(dāng)原始譜數(shù)據(jù)具有大量元素并且譜相對復(fù)雜時，索引信息的列表將具有大量的行。即使在這一情況下，在二級索引的幫助下，也可以快速獲得所需的位置對應(yīng)關(guān)系信息、確定正確的與期望的原始譜數(shù)據(jù)部分相對應(yīng)的壓縮數(shù)據(jù)部分、并且獲得原始譜數(shù)據(jù)的強(qiáng)度值。例如，該技術(shù)有效縮短了獲得期望質(zhì)量分析數(shù)據(jù)或創(chuàng)建期望質(zhì)荷比處的質(zhì)量分析結(jié)果圖像的處理時間。旨在解決上述問題的本發(fā)明的第三方面是一種質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)，其中，所述質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)使用根據(jù)本發(fā)明第一方面的質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法來處理通過質(zhì)量分析所收集的強(qiáng)度信息的一維數(shù)組形式的原始譜數(shù)據(jù)、存儲處理后的數(shù)據(jù)、并且基于所存儲的數(shù)據(jù)恢復(fù)原始譜數(shù)據(jù)或者響應(yīng)于來自用戶的指示輸出所恢復(fù)的數(shù)據(jù)或基于所恢復(fù)的數(shù)據(jù)的分析結(jié)果；所述質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)包括a)數(shù)據(jù)壓縮器，用于根據(jù)預(yù)定算法壓縮所述原始譜數(shù)據(jù)，并且將一維數(shù)組形式的壓縮數(shù)據(jù)存儲在第一存儲區(qū)域中；b)索引信息創(chuàng)建器，用于創(chuàng)建用于將所述原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中某一強(qiáng)度信息的存在位置與所述壓縮數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中同所述強(qiáng)度信息相對應(yīng)的壓縮信息的存在位置相關(guān)聯(lián)的索引信息，并且將所述索引信息存儲在與所述第一存儲區(qū)域分開的第二存儲區(qū)域中；以及c)信息恢復(fù)器，用于響應(yīng)于輸出所述原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中特定位置處的強(qiáng)度信息的命令，通過參考所述第二存儲區(qū)域中的所述索引信息識別與所述特定位置相對應(yīng)的所需壓縮信息的存儲位置，從所述第一存儲區(qū)域讀取所需壓縮信息，并且解壓縮所讀取的信息以獲得所述特定位置處的強(qiáng)度信息。旨在解決上述問題的本發(fā)明的第四方面是一種質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)，其中，所述質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)使用根據(jù)本發(fā)明第二方面的質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法來處理質(zhì)量分析成像數(shù)據(jù)、存儲處理后的數(shù)據(jù)、并且基于所存儲的數(shù)據(jù)恢復(fù)原始譜數(shù)據(jù)或者響應(yīng)于來 自用戶的指示輸出所恢復(fù)的數(shù)據(jù)或基于所恢復(fù)的數(shù)據(jù)的分析結(jié)果，其中，在所述質(zhì)量分析成像數(shù)據(jù)中，通過對試樣上的多個測量部位分別進(jìn)行質(zhì)量分析所收集的強(qiáng)度信息的一維數(shù)組形式的原始譜數(shù)據(jù)與所述測量部位的空間位置信息相關(guān)聯(lián)，所述質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)包括a)數(shù)據(jù)壓縮器，用于根據(jù)預(yù)定算法壓縮所述原始譜數(shù)據(jù)，并且將一維數(shù)組形式的壓縮數(shù)據(jù)存儲在第一存儲區(qū)域中；b)索引信息創(chuàng)建器，用于創(chuàng)建用于將所述原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中某一強(qiáng)度信息的存在位置與所述壓縮數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中同所述強(qiáng)度信息相對應(yīng)的壓縮信息的存在位置相關(guān)聯(lián)的索引信息，并且將所述索引信息存儲在與所述第一存儲區(qū)域分開的第二存儲區(qū)域中；c)位置計算器，用于響應(yīng)于對質(zhì)量分析結(jié)果圖像的質(zhì)荷比的指定，計算所述原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中與所指定的質(zhì)荷比相對應(yīng)的位置；d)信息恢復(fù)器，用于對所有的測量部位或者特定范圍內(nèi)的測量部位組中的各測量部位，通過參考存儲在所述第二存儲區(qū)域中的所述索引信息，識別與所述位置計算器所計算出的位置相對應(yīng)的所需壓縮信息的存儲位置，從所述第一存儲區(qū)域讀取所需壓縮信息，并且解壓縮所讀取的信息以獲得所計算出的位置處的強(qiáng)度信息；以及e)圖像創(chuàng)建器，用于使用通過所述信息恢復(fù)器所獲得的各測量部位的強(qiáng)度信息和這些測量部位的空間位置信息，創(chuàng)建示出期望質(zhì)荷比的強(qiáng)度信息的二維分布的質(zhì)量分析結(jié)果圖像。發(fā)明的效果在根據(jù)本發(fā)明的第一和第二方面的質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法、以及根據(jù)本發(fā)明的第三和第四方面的質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)中，不必為了創(chuàng)建索引信息而限制要壓縮的數(shù)據(jù)的長度。因此，例如，當(dāng)使用行程編碼時，可以在一維數(shù)組的同一值的各序列的整個行程上不中斷地連續(xù)進(jìn)行編碼處理。因此，可以獲得高水平的數(shù)據(jù)壓縮效率。在不對壓縮數(shù)據(jù)作任何改變的情況下創(chuàng)建用于示出原始數(shù)據(jù)和壓縮數(shù)據(jù)之間的對應(yīng)關(guān)系的索引信息。因此，無需考慮是否存在索引信息，即使通過僅壓縮或解壓縮數(shù)據(jù)的簡單處理也可以正確地恢復(fù)譜數(shù)據(jù)。也就是說，根據(jù)本發(fā)明的第一 第四方面，可以在保持對譜數(shù)據(jù)的處理的向后兼容性的同時，通過使用索引信息來提高數(shù)據(jù)讀取速度。


圖I是示出根據(jù)本發(fā)明用于進(jìn)行質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法的質(zhì)譜儀的一個實(shí)施例的示意性結(jié)構(gòu)圖。圖2是示出根據(jù)本發(fā)明一個實(shí)施例的質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法中的數(shù)據(jù)壓縮處理的一個例子的圖。圖3是示出根據(jù)本實(shí)施例的質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法中的索引創(chuàng)建處理的一個例子的圖。圖4是示出在根據(jù)本實(shí)施例的質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法中用于創(chuàng)建索引的程序的流程圖。圖5是示出在根據(jù)本實(shí)施例的質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法中用于使用索引恢復(fù)原始 數(shù)據(jù)的程序的流程圖。圖6是示出在根據(jù)本發(fā)明的另一(第二)實(shí)施例的質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法中用于創(chuàng)建二級索引的程序的流程圖。圖7是示出根據(jù)第二實(shí)施例的質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法中的二級索引的例子的流程圖。圖8是示出在根據(jù)第二實(shí)施例的質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法中使用二級索引恢復(fù)原始數(shù)據(jù)的程序的流程圖。圖9是示出利用成像質(zhì)譜儀所獲得的數(shù)據(jù)的內(nèi)容和使用所獲得的數(shù)據(jù)的顯示處理的示意圖。附圖標(biāo)記說明I...成像質(zhì)譜儀單元2.數(shù)據(jù)處理器20...譜數(shù)據(jù)收集器21...主存儲器22...數(shù)據(jù)壓縮器23...數(shù)據(jù)解壓縮器24...索引創(chuàng)建器25...數(shù)據(jù)讀取器26…圖像創(chuàng)建器3...數(shù)據(jù)存儲器30...壓縮數(shù)據(jù)存儲區(qū)域31. 索引存儲區(qū)域4...操作單元5...顯示單元
具體實(shí)施例方式下面將參考

根據(jù)本發(fā)明的質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法的一個實(shí)施例和使用該方法的質(zhì)譜儀。首先參考圖2 圖5說明根據(jù)本發(fā)明的一個實(shí)施例的質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法。圖2是示出根據(jù)本實(shí)施例的質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法中的數(shù)據(jù)壓縮處理的一個例子的圖，并且圖3是示出根據(jù)本實(shí)施例的質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法中的索引創(chuàng)建處理的一個例子的圖。下面說明用于壓縮構(gòu)成質(zhì)譜的一組數(shù)據(jù)的情況，其中，橫坐標(biāo)軸表示質(zhì)荷比m/z，并且縱坐標(biāo)軸表示信號強(qiáng)度，如圖2上部所示。與一個質(zhì)荷比相對應(yīng)的每一譜數(shù)據(jù)都是2字節(jié)數(shù)據(jù)。(下面使用十六進(jìn)制來示出數(shù)據(jù)值。當(dāng)本說明書中出現(xiàn)這些值時，將其括在大括號{}中。)“原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組”是按照質(zhì)荷比的升序排列的數(shù)據(jù)值序列。在飛行時間質(zhì)譜儀的情況下，在將飛行時間值轉(zhuǎn)換成質(zhì)荷比之前，同樣可以以上述方式組織通過飛行時間質(zhì)量分析所獲得的構(gòu)成飛行時間譜的一組數(shù)據(jù)。原始譜數(shù)據(jù)的壓縮在壓縮通過質(zhì)量分析所獲得的質(zhì)譜數(shù)據(jù)之前，將譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中的各強(qiáng)度值與預(yù)定噪聲水平進(jìn)行比較。以0替換小于該噪聲水平的任何強(qiáng)度值，而保持等于或高于該噪聲水平的其它強(qiáng)度值。由于檢測器中的噪聲或其它因素，質(zhì)譜或飛行時間譜通常包含相 當(dāng)大量的微小的無意義信號，并且通過前面所述的處理可以有效清除這類無意義信號。在作為結(jié)果的譜中，除有意義峰值以外的部分中的每一個極有可能由強(qiáng)度值“0”的序列構(gòu)成。隨后，按照質(zhì)荷比的升序，分別檢查通過上述處理所獲得的原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中的強(qiáng)度值。每當(dāng)強(qiáng)度值“0”連續(xù)出現(xiàn)兩次以上(如圖2和3中的{0000}所示)，以表示0的連續(xù)出現(xiàn)次數(shù)的值替換0序列。在本系統(tǒng)中，一次可處理的最大連續(xù)出現(xiàn)次數(shù)為32767。如果0序列超過該長度，以{7FFF}替換前述的32767個0，并且將剩余0的數(shù)量儲存在壓縮數(shù)據(jù)數(shù)組的下一行中。當(dāng)在原始譜數(shù)據(jù)數(shù)組中發(fā)現(xiàn)了一個以上的具有意義的非零強(qiáng)度值的數(shù)據(jù)時，在壓縮數(shù)據(jù)數(shù)組中將表示非零值出現(xiàn)次數(shù)的值儲存在緊挨在該非零部分之前的位置處，在該位置之后，順次儲存強(qiáng)度值。出現(xiàn)次數(shù)的上限32767也適用于該情況。對于超過該長度的序列，重復(fù)使用相同算法以儲存該序列中剩余強(qiáng)度值的數(shù)量。應(yīng)該注意，將緊挨在非零部分之前要插入的表示非零強(qiáng)度值的連續(xù)出現(xiàn)次數(shù)的值的最高有效位(MSB)設(shè)置成“I”。這意味著，實(shí)際上以2字節(jié)(16比特)數(shù)據(jù)的除MSB以外的15比特表示用于表示連續(xù)出現(xiàn)次數(shù)的數(shù)值。如果表示連續(xù)出現(xiàn)次數(shù)的2字節(jié)數(shù)據(jù)具有等于或大于32768( = 215)的標(biāo)稱值，則可以馬上明白，2字節(jié)數(shù)據(jù)表示非零強(qiáng)度值的連續(xù)出現(xiàn)次數(shù)，并且在二進(jìn)制的情況下，通過從16比特值去除MSB,或者在十六進(jìn)制的情況下，從2字節(jié)數(shù)據(jù)的值減去{8000}，就可以計算實(shí)際出現(xiàn)次數(shù)。例如，圖2所示的原始譜數(shù)據(jù)數(shù)組以5個有意義的非零數(shù)據(jù)值開始。因此，將具有被設(shè)置成“I”的MSB且其它位表示出現(xiàn)次數(shù)即5的值{8005}儲存為壓縮數(shù)據(jù)數(shù)組的第一個元素，此后，將原始譜數(shù)據(jù)數(shù)組中的上述5個值復(fù)制到壓縮數(shù)據(jù)數(shù)組。因此，原始譜數(shù)據(jù)數(shù)組中的5個連續(xù)數(shù)據(jù)對應(yīng)于壓縮數(shù)據(jù)數(shù)組中的6個連續(xù)數(shù)據(jù)。隨后，在原始譜數(shù)據(jù)數(shù)組中，連續(xù)出現(xiàn)強(qiáng)度值為0的4個數(shù)據(jù)。在壓縮數(shù)據(jù)數(shù)組中，以值為{0004}的一個數(shù)據(jù)來表示該零數(shù)據(jù)序列。根據(jù)這類編碼規(guī)則，將原始譜數(shù)據(jù)數(shù)組轉(zhuǎn)換成壓縮數(shù)據(jù)數(shù)組。通過上述說明，顯然原始譜數(shù)據(jù)數(shù)組包含的零強(qiáng)度數(shù)據(jù)的連續(xù)出現(xiàn)次數(shù)越大，本壓縮算法的壓縮效率越聞。用于將原始譜數(shù)據(jù)與壓縮數(shù)據(jù)相關(guān)聯(lián)的索引的創(chuàng)建“索引”是表示原始譜數(shù)據(jù)數(shù)組中的位置和壓縮數(shù)據(jù)數(shù)組中的位置之間的對應(yīng)關(guān)系的一組信息。索引的具體例子可為如下的項的列表，其中，每一個項將原始譜數(shù)據(jù)數(shù)組中連續(xù)兩次以上出現(xiàn)零強(qiáng)度值的部分的開始位置或者原始譜數(shù)據(jù)數(shù)組中具有有意義強(qiáng)度值的數(shù)據(jù)的序列的開始位置與壓縮數(shù)據(jù)數(shù)組中的相應(yīng)位置相關(guān)聯(lián)。例如，將圖3的原始譜數(shù)據(jù)數(shù)組的第6個元素與壓縮數(shù)據(jù)數(shù)組的第7個元素相關(guān)聯(lián)，同時，將原始譜數(shù)據(jù)數(shù)組的第10個元素與壓縮數(shù)據(jù)數(shù)組的第8個元素相關(guān)聯(lián)。通過圖4的流程圖示出用于創(chuàng)建索引的程序。圖4的左部分的圖示出讀出點(diǎn)如何根據(jù)該流程圖中的具體步驟在壓縮數(shù)據(jù)數(shù)組中移動。在圖4中，i是原始譜數(shù)據(jù)數(shù)組中的位置，j是壓縮數(shù)據(jù)數(shù)組中的位置，并且intensity (強(qiáng)度)是從壓縮數(shù)據(jù)數(shù)組讀取的一個數(shù)據(jù)值。當(dāng)給出原始譜數(shù)據(jù)數(shù)組和壓縮數(shù)據(jù)數(shù)組并且啟動索引創(chuàng)建處理時，將參數(shù)i和j 初始化成i = I和j = 1，并且將這些值寫入索引的第一行(步驟SI)。隨后，將儲存在壓縮數(shù)據(jù)數(shù)組中的j = I (即第一行)處的數(shù)據(jù)值設(shè)置在參數(shù)intensity中(步驟S2)。在圖3的例子中，從該數(shù)組讀取{8005}，并且將其設(shè)置在intensity中。接著,判斷intensity的MSB是否是“0”(步驟S3)。根據(jù)上述壓縮算法,如果MSB為“0”，則該數(shù)據(jù)表示零強(qiáng)度數(shù)據(jù)的連續(xù)出現(xiàn)次數(shù)，并且如果MSB為“ 1”，則該數(shù)據(jù)表示有意義數(shù)據(jù)的連續(xù)出現(xiàn)次數(shù)。在圖3的例子中，此時設(shè)置在intensity中的{8005}的MSB不是“O”。因此，操作從步驟S3進(jìn)入步驟S4，在步驟S4，以“0”替換intensity的MSB。結(jié)果，將intensity的值從{8005}校正成{0005}。隨后,將參數(shù)i和j更新為i — i+intensity和j — j+intensity+1,并且將i和j的新的值寫入索引的下一行(步驟S5)。在圖3的例子中，新的值為i = 1+5 = 6且j = 1+5+1 = 7，并且將這些值寫入索引的第二行。隨后，壓縮數(shù)據(jù)數(shù)組中的讀取點(diǎn)從當(dāng)前位置正向移動intensity+1，并且將新讀取點(diǎn)處的數(shù)據(jù)值設(shè)置為intensity的新值(步驟S6)。在本例子中，由于intensity = 5,所以讀取點(diǎn)從第I個元素(j = I)正向移動6( = intensity+1),并且讀取第7個元素(j = 7)處的數(shù)據(jù)值。如果在新讀取點(diǎn)沒有找到數(shù)據(jù)值(步驟S9為“否”)，則停止該處理，否則，操作返回到步驟S3。在上述例子中，在從第7個數(shù)據(jù)讀取{0004}并且將其設(shè)置在intensity中之后，操作返回到步驟S3，并且由于{0004}的MSB為“0”而進(jìn)一步進(jìn)入步驟S7。在步驟S7,將參數(shù)i和j更新為i — i+intensity和j — j+1，并且將i和j的新值寫入索引的下一行。在本例子中，新值為i = 6+4 = 10且j = 7+1 = 8，并且將該一對值寫入索引的第三行。隨后，壓縮數(shù)據(jù)數(shù)組中的讀取點(diǎn)從當(dāng)前位置正向移動1，將新讀取點(diǎn)處的數(shù)據(jù)值設(shè)置在intensity中(步驟S 8)，并且操作進(jìn)入步驟S9。在本例子中，將壓縮數(shù)據(jù)數(shù)組中的讀取點(diǎn)從第7個元素正向移動1，并且將第8個元素的數(shù)據(jù)值{8006}設(shè)置為intensity的新值。在步驟S9之后，操作返回到步驟S3，并且以上述方式通過步驟S4和S5進(jìn)一步進(jìn)入步驟S6。結(jié)果，將i = 16( = 10+6)且j = 15( = 8+6+1)寫入索引的第四行。通過上述處理，獲得列表形式的對應(yīng)位置信息，其中，列表的每一項將原始譜數(shù)據(jù)數(shù)組中連續(xù)出現(xiàn)零強(qiáng)度的部分的開始位置或者有意義的非零強(qiáng)度值的序列的開始位置與壓縮數(shù)據(jù)數(shù)組中與該開始位置相對應(yīng)的位置相關(guān)聯(lián)。該索引不一定是根據(jù)壓縮數(shù)據(jù)來恢復(fù)原始譜數(shù)據(jù)所必需。然而，如下所述，該索引有助于快速計算任意質(zhì)荷比的強(qiáng)度值。使用索引獲得指定質(zhì)荷比的強(qiáng)度值
當(dāng)將壓縮數(shù)據(jù)和索引存儲在存儲器中時，可以通過進(jìn)行下面的處理來獲得任意質(zhì)荷比的強(qiáng)度值。通過圖5所示的流程圖詳細(xì)示出用于使用索引讀取強(qiáng)度值的程序。當(dāng)指定任意質(zhì)荷比時，計算原始譜數(shù)據(jù)數(shù)組中與指定質(zhì)荷比相對應(yīng)的位置X(步驟Sll)。實(shí)際需要的是在原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組的元素中定位與指定質(zhì)荷比最接近的位置?？蛇x地，在用于最終計算強(qiáng)度值的處理中，可以確定在指定質(zhì)荷比兩側(cè)的兩個以上的位置，計算所確定的位置處的強(qiáng)度值的加權(quán)平均值，并且輸出計算出的平均值作為指定質(zhì)荷比處的強(qiáng)度值。如果原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組的元素不是質(zhì)荷比而是飛行時間值，則最初應(yīng)該利用質(zhì)譜儀特有的質(zhì)荷比-飛行時間轉(zhuǎn)換表將指定質(zhì)荷比轉(zhuǎn)換成飛行時間值，并且應(yīng)該定位最 接近所獲得的飛行時間值的位置。在以上述方式計算出位置X之后，訪問索引以在索引中的原始數(shù)據(jù)位置信息的列表中選擇小于X的值中的最大值。以S表示所選擇的值存在的位置。然后，確定索引中與所選擇的值配對的壓縮數(shù)據(jù)數(shù)組中位置T (步驟S12)。隨后，訪問壓縮數(shù)據(jù)以讀取第T行處的數(shù)據(jù)值，并且將其設(shè)置在intensity中(步驟S13)。如上所述，根據(jù)本實(shí)施例采用的壓縮算法的規(guī)則，如果讀取的壓縮數(shù)據(jù)的值的MSB是“0”，則意味著在該位置之后連續(xù)出現(xiàn)了通過所讀取的數(shù)據(jù)的值表示的多次零強(qiáng)度。另一方面，如果讀取的壓縮數(shù)據(jù)的值的MSB為“1”，則意味著在該位置之后連續(xù)出現(xiàn)了以除MSB以外的值所表示的多次有意義的強(qiáng)度數(shù)據(jù)。因此，判斷intensity的MSB是否為“0”(步驟S 14)。如果發(fā)現(xiàn)MSB為“0”，則以零數(shù)據(jù)替換intensity的值(步驟S15)，并且輸出該數(shù)據(jù)作為原始譜數(shù)據(jù)數(shù)組中與指定質(zhì)荷比m/z相對應(yīng)的位置X處的強(qiáng)度值(步驟S17)。另一方面，如果在步驟S14發(fā)現(xiàn)intensity的MSB不是“0”，則將壓縮數(shù)據(jù)數(shù)組中在第T行之后(X-S)行的行處的數(shù)據(jù)值設(shè)置在intensity中(步驟S16)，并且操作進(jìn)入步驟S17。因此，獲得原始質(zhì)譜數(shù)據(jù)數(shù)組中的位置X處的強(qiáng)度值。質(zhì)譜儀的結(jié)構(gòu)和操作圖I是示出用于進(jìn)行上述質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法的成像質(zhì)譜儀的一個實(shí)施例的框圖。該質(zhì)譜儀包括用于如以上參考圖9所述對試樣進(jìn)行二維質(zhì)量分析以獲得各測量點(diǎn)的質(zhì)譜數(shù)據(jù)的成像質(zhì)譜儀單元I、用于進(jìn)行上述質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法的數(shù)據(jù)處理器2、用于存儲通過數(shù)據(jù)處理器2壓縮后的數(shù)據(jù)和索引的數(shù)據(jù)存儲器3、由用戶操作的操作單元4、以及用于顯示分析結(jié)果或其它信息的顯示單元5。數(shù)據(jù)處理器2實(shí)際上是包括中央處理單元(CPU)、隨機(jī)存取存儲器(RAM)、只讀存儲器(ROM)和其它組件的個人計算機(jī)，并且從功能角度看，數(shù)據(jù)處理器2包括譜數(shù)據(jù)收集器20、主存儲器21、數(shù)據(jù)壓縮器22、數(shù)據(jù)解壓縮器23、索引創(chuàng)建器24、數(shù)據(jù)讀取器25、圖像創(chuàng)建器26和其它功能塊。數(shù)據(jù)存儲器3具有兩個分開的存儲區(qū)域，即用于存儲壓縮數(shù)據(jù)的壓縮數(shù)據(jù)存儲區(qū)域30和用于存儲索引的索引存儲區(qū)域31。譜數(shù)據(jù)收集器20讀取通過成像質(zhì)譜儀單元I中的質(zhì)量分析所獲得的質(zhì)譜數(shù)據(jù)，并且將該數(shù)據(jù)臨時存儲在外部輔助存儲裝置(諸如硬盤等，未示出)或者數(shù)據(jù)存儲器3的除上述存儲區(qū)域30和31以外的區(qū)域中。數(shù)據(jù)壓縮器22根據(jù)上述算法，壓縮與測量點(diǎn)相對應(yīng)的各質(zhì)譜數(shù)據(jù)，并且將壓縮后的數(shù)據(jù)存儲在壓縮數(shù)據(jù)存儲區(qū)域30中。索引創(chuàng)建器24使用質(zhì)譜數(shù)據(jù)(原始譜數(shù)據(jù))和壓縮數(shù)據(jù)，根據(jù)上述處理步驟創(chuàng)建各測量點(diǎn)的索引，并且將該索引存儲在數(shù)據(jù)存儲器3的索引存儲區(qū)域31中。對于每一對質(zhì)譜數(shù)據(jù)(原始譜數(shù)據(jù))數(shù)組和壓縮譜數(shù)據(jù)數(shù)組創(chuàng)建索引。因此，將創(chuàng)建與測量點(diǎn)相同數(shù)量的索引。在將通過質(zhì)量分析所收集的整個質(zhì)譜數(shù)據(jù)組的壓縮數(shù)據(jù)和索引存儲在數(shù)據(jù)存儲器3中之后，原始質(zhì)譜數(shù)據(jù)由于不再需要而被丟棄。當(dāng)用戶想要使用存儲在數(shù)據(jù)存儲器3中的數(shù)據(jù)顯示質(zhì)量分析結(jié)果圖像時，用戶通過操作單元4指定與質(zhì)譜有關(guān)的期望質(zhì)荷比的值、并且輸入命令。在接收到該命令時，數(shù)據(jù)讀取器25將所需的壓縮數(shù)據(jù)和索引從數(shù)據(jù)存儲器3讀入主存儲器21。對于各測量點(diǎn)，數(shù)據(jù)解壓縮器23根據(jù)上述處理步驟，計算與指定質(zhì)荷比相對應(yīng)的強(qiáng)度值。在本實(shí)施例中，由于對于數(shù)據(jù)壓縮使用無損行程編碼，所以可以根據(jù)壓縮數(shù)據(jù)恢復(fù)與原始譜數(shù)據(jù)相同的強(qiáng)度值。圖像創(chuàng)建器26通過二維配置分別針對測量點(diǎn)獲得的強(qiáng)度值，創(chuàng)建指定質(zhì)荷比的質(zhì)量分 析結(jié)果圖像。將創(chuàng)建的圖像顯示在顯示單元5的屏幕上。如上所述，索引的使用使得系統(tǒng)能夠快速地獲得期望質(zhì)荷比的強(qiáng)度值，從而快速顯示質(zhì)量分析結(jié)果圖像。將索引存儲在與壓縮數(shù)據(jù)存儲區(qū)域30完全分開的索引存儲區(qū)域31中。因此，盡管這需要較長處理時間，但是可以在不使用索引的情況下通過傳統(tǒng)數(shù)據(jù)解壓縮方法來獨(dú)立地讀取和解壓縮壓縮數(shù)據(jù)，以確定與期望質(zhì)荷比相對應(yīng)的強(qiáng)度值、創(chuàng)建質(zhì)量分析結(jié)果圖像并顯示所創(chuàng)建的圖像。因此，即使在數(shù)據(jù)恢復(fù)處理中不使用索引的系統(tǒng)也可以使用存儲在數(shù)據(jù)存儲器3中的數(shù)據(jù)來顯示質(zhì)量分析結(jié)果圖像。質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法的另一實(shí)施例當(dāng)以寬質(zhì)荷比范圍或者高質(zhì)量分辯能力收集質(zhì)譜數(shù)據(jù)時,原始譜數(shù)據(jù)數(shù)組的元素的數(shù)量將增大。此外，當(dāng)獲得的譜復(fù)雜時，索引也復(fù)雜(具有大量的行)，這可能導(dǎo)致使用索引的搜索需要長的時間段。在這種情況下，使用有助于參考主索引的二級索引能有效縮短搜索時間。下面將參考圖6 圖8說明除使用主索引以外還使用二級索引的一個實(shí)施例。圖6是示出用于創(chuàng)建二級索引的程序的流程圖，圖7是示出根據(jù)圖3所示的數(shù)據(jù)創(chuàng)建的索引的二級索引的例子的流程圖，并且圖8是示出用于使用二級索引讀取強(qiáng)度值的程序的流程圖。參考圖6和圖7，下面說明在主索引的創(chuàng)建之后所進(jìn)行的、用于創(chuàng)建二級索引的程序。在圖6中，參數(shù)i表示二級索引的位置(行)，并且參數(shù)j表示原始譜數(shù)據(jù)數(shù)組中的位置。在用于創(chuàng)建二級索引的處理中，應(yīng)該預(yù)先設(shè)置適當(dāng)?shù)臄?shù)據(jù)位置間隔D。在下面的例子中，D = 10。當(dāng)啟動二級索引創(chuàng)建處理時，將主索引的第一行處的原始譜數(shù)據(jù)位置值設(shè)置在參數(shù)P中(步驟S21)。在圖7的例子中，P = I。接著，將參數(shù)i和j初始化成i = I和j =1，并且將j的值寫入二級索引的第i行(步驟S22)。在該情況下，如圖7所示，將值I寫入二級索引的第一行。隨后，判斷iXD的值(即本例子中的iX10)是否等于或大于P(步驟S23)。當(dāng)i=I且P = I時，步驟S23的判斷結(jié)果為“是”，并且操作進(jìn)入步驟S26，在步驟S26，將主索引的下一行處的原始譜數(shù)據(jù)位置值設(shè)置在P中。隨后，將j加I(步驟S27)。在圖7的例子中，主索引的第二行處的原始譜數(shù)據(jù)位置值是6，因而P = 6且j = 2。如果主索引沒有剩余未讀取的值，則步驟S28的判斷結(jié)果為“否”，并且將停止該處理。如果在主索引中保留一個以上的數(shù)據(jù)未讀取，則操作返回到步驟S23。當(dāng)i = I且P = 6時，步驟S23的判斷結(jié)果再次為“是”，因而以上述方式，操作通過步驟S26和S27進(jìn)入S28。在圖7的例子中，在步驟S26讀取主索引的第三行處的原始譜數(shù)據(jù)位置值，得出P = 10且j = 3。在步驟S28之后，操作返回到步驟S23。當(dāng)i = I且P = 10時，步驟S23的判斷結(jié)果再次為“是”，因而操作通過步驟S26和S27進(jìn)入S28。在圖7的例子中，在步驟S26讀取主索引的第四行處的原始譜數(shù)據(jù)位置值，得出P= 16且j = 4。在步驟S28之后，操作返回到步驟S23。此時，由于i = I且P= 16，所以步驟S23的判斷結(jié)果為“否”，因而將j-1寫入二級索引的第i+1行(步驟S24)。在i=I且j = 4的情況下，將j-1 = 3寫入二級索引的第二行。隨后，將i加I (步驟S25)并且操作返回到步驟S23。因此，在圖6所示的處理中，從主索引的第一行開始順次讀取原始譜數(shù)據(jù)位置值 的每一個，并且將其與iXD，即作為二級索引中的寫入點(diǎn)所選擇的行的順序編號(i)和數(shù)據(jù)位置間隔D的乘積進(jìn)行比較。當(dāng)從主索引讀取的值第一次超過iXD時，將主索引的當(dāng)前讀取點(diǎn)的上一行處的位置信息寫入二級索引的第i+1行中。通過進(jìn)行這些操作直到主索引的最后一行為止，完成二級索引?？梢匀我庠O(shè)置D的值。D的值越大，二級索引越粗，從而導(dǎo)致索引搜索需要越長時間。然而，由于包括索引的總數(shù)據(jù)量降低，所以壓縮效率更高。下面將參考圖8說明用于使用二級索引恢復(fù)數(shù)據(jù)的處理。當(dāng)指定感興趣的質(zhì)荷比(或飛行時間等)并且確定原始譜數(shù)據(jù)數(shù)組中的相應(yīng)位置X時，將X除以數(shù)據(jù)位置間隔D以獲得商M(步驟S31)。隨后，訪問二級索引以讀取存儲在第M+1行的數(shù)值，并且將該值設(shè)置在參數(shù)V中(步驟S32)。參考圖3和圖7，考慮需要獲得原始譜數(shù)據(jù)數(shù)組的第12行處的強(qiáng)度值，即{0800}，的情況。將X = 12除以D = 10得出M=1。因此，將二級索引的第二行處的值讀取為V = 3。接著，將儲存在主索弓丨的第U = V+1行中的原始譜數(shù)據(jù)位置值設(shè)置在參數(shù)W中(步驟S33)，并且將W與X進(jìn)行比較(步驟S34)。如果X小于W，則將儲存在主索引的第U-I行的壓縮數(shù)據(jù)位置設(shè)置在I中(步驟S35)。然后，讀取壓縮數(shù)據(jù)數(shù)組的第W行處的數(shù)據(jù)值，并且以上述方式進(jìn)行使用第W行及其隨后行的數(shù)據(jù)值的數(shù)據(jù)恢復(fù)處理。例如，在V = 3的情況下，儲存在主索引的第四行中的原始譜數(shù)據(jù)位置值為16，因而評二“且乂=^。利用這些值，步驟S34的判斷結(jié)果為“否”。因此，讀取儲存在主索引的第U-I行(即第三行)中的壓縮數(shù)據(jù)位置值，即8，并且將該值設(shè)置為T = 8。然后，在壓縮數(shù)據(jù)數(shù)組中，讀取第八個值{8006}，并且進(jìn)行上述數(shù)據(jù)恢復(fù)處理以獲得{0800}的強(qiáng)度值。另一方面，如果X等于或大于W，則讀取主索引的下一行的原始譜數(shù)據(jù)位置值作為W的值(步驟S36)，并且在將U加I (步驟S37)之后，操作返回到步驟S34。重復(fù)步驟S34、S36和S37的處理直到原始譜數(shù)據(jù)位置值超過X為止。當(dāng)原始譜數(shù)據(jù)位置值超過X時，讀取與儲存在當(dāng)前原始譜數(shù)據(jù)位置的上一行中的值配對的壓縮數(shù)據(jù)位置數(shù)值，此后以上述方式進(jìn)行數(shù)據(jù)恢復(fù)處理。因此，二級索引的使用使得能夠快速訪問主索引中的所需信息，從而可以高速進(jìn)行使用主索引的數(shù)據(jù)恢復(fù)。將每一二級索引與一個特定主索引相關(guān)聯(lián)。因此，在實(shí)際系統(tǒng)中，可以在同一存儲區(qū)域中存儲這兩個索引。
盡管上述實(shí)施例都使用行程編碼進(jìn)行數(shù)據(jù)壓縮，但是上述說明也適用于使用熵編碼進(jìn)行數(shù)據(jù)壓縮的系統(tǒng)。

應(yīng)該注意，上述實(shí)施例僅是本發(fā)明的例子。在任何觀點(diǎn)來看，除上述實(shí)施例以外在本發(fā)明的精神內(nèi)適當(dāng)進(jìn)行的任何改變、修改或添加自然落在本專利申請書的權(quán)利要求的范圍內(nèi)。
權(quán)利要求
1.一種質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法，用于處理通過質(zhì)量分析所收集的強(qiáng)度信息的一維數(shù)組形式的原始譜數(shù)據(jù)，包括 a)壓縮步驟，根據(jù)預(yù)定的算法對所述原始譜數(shù)據(jù)進(jìn)行壓縮處理，并且將所獲得的ー維數(shù)組形式的壓縮數(shù)據(jù)存儲在第一存儲區(qū)域中； b)索引信息創(chuàng)建步驟，創(chuàng)建用于將所述原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中某一強(qiáng)度信息的存在位置與所述壓縮數(shù)據(jù)的ー維數(shù)組中同該強(qiáng)度信息相對應(yīng)的壓縮信息的存在位置相關(guān)聯(lián)的索引信息，并且將所述索引信息存儲在與所述第一存儲區(qū)域分開的第二存儲區(qū)域中；以及 c)信息恢復(fù)步驟，當(dāng)給出用于輸出所述原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中特定位置處的強(qiáng)度信息的命令時，通過參考所述第二存儲區(qū)域中的所述索引信息識別與所述特定位置相對應(yīng)的所需壓縮信息的存儲位置，從所述第一存儲區(qū)域讀取所需壓縮信息，并且解壓縮所讀取的信息以獲得所述特定位置處的強(qiáng)度信息。
2.一種質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法，用于處理質(zhì)量分析成像數(shù)據(jù)，在所述質(zhì)量分析成像數(shù)據(jù)中，通過對試樣上的多個測量部位分別進(jìn)行質(zhì)量分析所收集的強(qiáng)度信息的一維數(shù)組形式的原始譜數(shù)據(jù)與所述測量部位的空間位置信息相關(guān)聯(lián)，所述質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法包括 a)壓縮步驟，根據(jù)預(yù)定的算法壓縮所述原始譜數(shù)據(jù)，并且將所獲得的一維數(shù)組形式的壓縮數(shù)據(jù)存儲在第一存儲區(qū)域中； b)索引信息創(chuàng)建步驟，創(chuàng)建用于將所述原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中某一強(qiáng)度信息的存在位置與所述壓縮數(shù)據(jù)的ー維數(shù)組中同該強(qiáng)度信息相對應(yīng)的壓縮信息的存在位置相關(guān)聯(lián)的索引信息，并且將所述索引信息存儲在與所述第一存儲區(qū)域分開的第二存儲區(qū)域中； c)位置計算步驟，當(dāng)指定用于創(chuàng)建質(zhì)量分析結(jié)果圖像的質(zhì)荷比時，計算所述原始譜數(shù)據(jù)的ー維數(shù)組中與所指定的質(zhì)荷比相對應(yīng)的位置； d)信息恢復(fù)步驟，對于所有的測量部位或者特定范圍內(nèi)的測量部位組中的各測量部位，通過參考存儲在所述第二存儲區(qū)域中的所述索引信息，識別與在所述位置計算步驟中所計算出的位置相對應(yīng)的所需壓縮信息的存儲位置，從所述第一存儲區(qū)域讀取所需壓縮信息，并且解壓縮所讀取的信息以獲得所計算出的位置處的強(qiáng)度信息；以及 e)圖像創(chuàng)建步驟，使用在所述信息恢復(fù)步驟中所獲得的各測量部位的強(qiáng)度信息和這些測量部位的空間位置信息，創(chuàng)建示出期望質(zhì)荷比的強(qiáng)度信息的ニ維分布的質(zhì)量分析結(jié)果圖像。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法，其特征在干， 所述質(zhì)量分析成像數(shù)據(jù)是利用具有用于拍攝試樣的光學(xué)顯微圖像的攝像裝置的成像質(zhì)譜儀所收集的大量數(shù)據(jù)；以及 在所述圖像創(chuàng)建步驟中，通過將期望質(zhì)荷比的強(qiáng)度信息顯示在利用所述攝像裝置所拍攝的試樣的光學(xué)顯微圖像上的相應(yīng)位置處，來創(chuàng)建所述質(zhì)量分析結(jié)果圖像。
4.根據(jù)權(quán)利要求I 3中任一項所述的質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法，其特征在于，在所述壓縮步驟中，通過行程編碼、熵編碼或者這兩種編碼的組合以無損方式壓縮所述原始譜數(shù)據(jù)的至少一部分。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法，其特征在干， 在所述壓縮步驟中進(jìn)行壓縮處理以使得 所述原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中等于或小于預(yù)定水平的各強(qiáng)度值被替換為特定值，所述特定值按照數(shù)組的順序連續(xù)出現(xiàn)兩次以上的各部分被替換為表示所述特定值的連續(xù)出現(xiàn)次數(shù)的值，而 對于由除所述特定值以外的強(qiáng)度值構(gòu)成的各序列，緊挨在該序列之前插入表示構(gòu)成該序列的強(qiáng)度值的個數(shù)的值； 在所述索引信息創(chuàng)建步驟中，創(chuàng)建由分別包括如下的數(shù)值對的多個項構(gòu)成的列表作為所述索引信息，其中 所述數(shù)值對中的ー個數(shù)值用于保持所述原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中與連續(xù)出現(xiàn)所述特定值的開始位置有關(guān)的位置信息或與由除所述特定值以外的強(qiáng)度值構(gòu)成的序列的開始位置有關(guān)的位置信息，并且 所述數(shù)值對中的另ー數(shù)值用于保持所述壓縮數(shù)據(jù)的ー維數(shù)組中與連續(xù)出現(xiàn)所述特定值的開始位置相對應(yīng)的位置信息或與由除所述特定值以外的強(qiáng)度值構(gòu)成的序列的開始位置相對應(yīng)的位置信息；以及 在所述信息恢復(fù)步驟中，當(dāng)要獲得給定位置處的強(qiáng)度值時，捜索所述列表以找到包括所述給定位置的強(qiáng)度值的序列的開始位置，并且從所述壓縮數(shù)據(jù)的ー維數(shù)組中的相應(yīng)位置處讀取所需的強(qiáng)度值。
6.根據(jù)權(quán)利要求I 3中任一項所述的質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法，其特征在于，還包括用于創(chuàng)建ニ級索引的ニ級索引創(chuàng)建步驟，其中，所述ニ級索引用于針對所述原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中位于預(yù)定數(shù)據(jù)位置間隔處的多個數(shù)據(jù)中的每ー個數(shù)據(jù)，示出所述索引信息的列表中用于保持在關(guān)注數(shù)據(jù)的位置之前的數(shù)據(jù)中值與關(guān)注位置的值最接近的數(shù)據(jù)的行號。
7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法，其特征在于，進(jìn)行所述ニ級索引創(chuàng)建步驟，以 根據(jù)需要設(shè)置所述原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中的數(shù)據(jù)位置間隔D，并且在DX X的值超過所述原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組的元素的數(shù)量之前，通過重復(fù)以下處理來創(chuàng)建所述ニ級索引 從所述索引信息中的保持所述原始譜數(shù)據(jù)的位置的一維數(shù)組的第一個元素開始，順次將該ー維數(shù)組中的各元素的值P與DX X的值進(jìn)行比較，并且 當(dāng)P第一次超過DX X時，將包括在所述索引信息的緊挨著的上一元素中的原始譜數(shù)據(jù)的存儲位置的值寫入所述ニ級索引的第X個元素。
8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法，其特征在干，在所述信息恢復(fù)步驟中，用于獲得所述原始譜數(shù)據(jù)中預(yù)定位置X處的強(qiáng)度值的處理包括以下步驟 將所述預(yù)定位置X除以數(shù)據(jù)位置間隔D以獲得商M ； 參考所述ニ級索引的第M個元素以獲得所述索引信息中最接近所述預(yù)定位置X的位置； 從所述索引信息中所獲得的位置處讀取所述原始譜數(shù)據(jù)的存儲位置的值W ; 按照所述原始譜數(shù)據(jù)的存儲位置的升序繼續(xù)所述讀取處理，直到所讀取的值W超過所述預(yù)定位置X的值為止； 一旦所讀取的值W超過所述預(yù)定位置X的值，讀取所述索引信息中所述原始譜數(shù)據(jù)的存儲位置的緊挨著當(dāng)前所讀取元素的上一位置處的值； 將所讀取的值設(shè)置為所述壓縮數(shù)據(jù)的ー維數(shù)組中包括所述預(yù)定位置X的強(qiáng)度值的序列的開始位置；以及 讀取所述預(yù)定位置X處的強(qiáng)度值。
9.一種質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)，用于處理通過質(zhì)量分析所收集的強(qiáng)度信息的一維數(shù)組形式的原始譜數(shù)據(jù)、存儲處理后的數(shù)據(jù)、并且基于所存儲的數(shù)據(jù)恢復(fù)原始譜數(shù)據(jù)或者響應(yīng)于來自用戶的指示輸出所恢復(fù)的數(shù)據(jù)或基于所恢復(fù)的數(shù)據(jù)的分析結(jié)果，所述質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)包括 a)數(shù)據(jù)壓縮器，用于根據(jù)預(yù)定的算法壓縮所述原始譜數(shù)據(jù)，并且將ー維數(shù)組形式的壓縮數(shù)據(jù)存儲在第一存儲區(qū)域中； b)索引信息創(chuàng)建器，用于創(chuàng)建用于將所述原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中某一強(qiáng)度信息的存在位置與所述壓縮數(shù)據(jù)的ー維數(shù)組中同該強(qiáng)度信息相對應(yīng)的壓縮信息的存在位置相關(guān)聯(lián)的索引信息，并且將所述索引信息存儲在與所述第一存儲區(qū)域分開的第二存儲區(qū)域中；以及 c)信息恢復(fù)器，用于響應(yīng)于輸出所述原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中特定位置處的強(qiáng)度信息的命令，通過參考所述第二存儲區(qū)域中的所述索引信息識別與所述特定位置相對應(yīng)的所需壓縮信息的存儲位置，從所述第一存儲區(qū)域讀取所需壓縮信息，并且解壓縮所讀取的信息以獲得所述特定位置處的強(qiáng)度信息。
10.一種質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)，用于處理質(zhì)量分析成像數(shù)據(jù)、存儲處理后的數(shù)據(jù)、并且基于所存儲的數(shù)據(jù)恢復(fù)原始譜數(shù)據(jù)或者響應(yīng)于來自用戶的指示輸出所恢復(fù)的數(shù)據(jù)或基于所恢復(fù)的數(shù)據(jù)的分析結(jié)果，其中，在所述質(zhì)量分析成像數(shù)據(jù)中，通過對試樣上的多個測量部位分別進(jìn)行質(zhì)量分析所收集的強(qiáng)度信息的一維數(shù)組形式的原始譜數(shù)據(jù)與所述測量部位的空間位置信息相關(guān)聯(lián)，所述質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)包括 a)數(shù)據(jù)壓縮器，用于根據(jù)預(yù)定的算法壓縮所述原始譜數(shù)據(jù)，并且將ー維數(shù)組形式的壓縮數(shù)據(jù)存儲在第一存儲區(qū)域中； b)索引信息創(chuàng)建器，用于創(chuàng)建用于將所述原始譜數(shù)據(jù)的一維數(shù)組中某一強(qiáng)度信息的存在位置與所述壓縮數(shù)據(jù)的ー維數(shù)組中同該強(qiáng)度信息相對應(yīng)的壓縮信息的存在位置相關(guān)聯(lián)的索引信息，并且將所述索引信息存儲在與所述第一存儲區(qū)域分開的第二存儲區(qū)域中； c)位置計算器，用于響應(yīng)于對質(zhì)量分析結(jié)果圖像的質(zhì)荷比的指定，計算所述原始譜數(shù)據(jù)的ー維數(shù)組中與所指定的質(zhì)荷比相對應(yīng)的位置； d)信息恢復(fù)器，用于針對所有的測量部位或者特定范圍內(nèi)的測量部位組中的各測量部位，通過參考存儲在所述第二存儲區(qū)域中的所述索引信息，識別與所述位置計算器所計算出的位置相對應(yīng)的所需壓縮信息的存儲位置，從所述第一存儲區(qū)域讀取所需壓縮信息，并且解壓縮所讀取的信息以獲得所計算出的位置處的強(qiáng)度信息；以及 e)圖像創(chuàng)建器，用于使用通過所述信息恢復(fù)器所獲得的各測量部位的強(qiáng)度信息和這些測量部位的空間位置信息，創(chuàng)建示出期望質(zhì)荷比的強(qiáng)度信息的ニ維分布的質(zhì)量分析結(jié)果圖像。
全文摘要
本發(fā)明涉及質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理方法和質(zhì)量分析數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)，能夠在保持原始的通過對質(zhì)量分析數(shù)據(jù)進(jìn)行行程編碼所獲得的壓縮數(shù)據(jù)的數(shù)組的同時，快速獲得壓縮數(shù)據(jù)中的期望m/z值處的強(qiáng)度值。通過將原始譜數(shù)據(jù)數(shù)組中零強(qiáng)度連續(xù)出現(xiàn)兩次以上的部分的開始位置或原始譜數(shù)據(jù)數(shù)組中強(qiáng)度值有意義的數(shù)據(jù)的序列的開始位置與壓縮數(shù)據(jù)數(shù)組中的相應(yīng)位置配對來創(chuàng)建索引。將該索引與壓縮數(shù)據(jù)分開地存儲在存儲區(qū)域中。索引的創(chuàng)建不會影響壓縮數(shù)據(jù)數(shù)組。因此，即使通過不使用該索引的數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)也可以解壓縮該數(shù)據(jù)。索引有助于快速定位與期望m/z相對應(yīng)的壓縮數(shù)據(jù)并獲得所需的強(qiáng)度值。
文檔編號G06F19/00GK102683149SQ20121003554
公開日2012年9月19日 申請日期2012年2月16日 優(yōu)先權(quán)日2011年2月16日
發(fā)明者池上將弘 申請人:株式會社島津制作所