動。 再者,活動所列的順序不一定是執(zhí)行它們的順序。
[0094] 在前文說明書中,已經(jīng)參考具體實(shí)施例來描述所述概念。然而,本領(lǐng)域的技術(shù)人員 認(rèn)為,在不脫離如權(quán)利要求書中所闡述的本發(fā)明范圍的情況下,可以做出各種修改和變化。 因此,所述說明書和附圖應(yīng)以說明性而不是限制性意義來看待,并且所有這些修改都旨在 包括在本發(fā)明的范圍內(nèi)。
[0095] 如本文中所用,術(shù)語"包含(comp rises) "、"包含(comprising) "、"包括 (includes)"、"包括(including)"、"具有(has)"、"具有(having)"或其任何其它變型旨在 涵蓋非排它性的包含。舉例來說,包含一列特征的工藝、方法、制品或設(shè)備不一定僅限于那 些特征,而是可包括沒有明確列出的其它特征或所述工藝、方法、制品或設(shè)備所固有的其它 特征。此外,除非明確指出例外,否則"或"是指包容性的或,而非排他性的或。舉例來說,條 件A或條件B通過以下中的任一項(xiàng)來得到滿足:A是真的(或存在的)并且B是假的(或不存在 的)、A是假的(或不存在的)并且B是真的(或存在的),以及A和B都是真的(或存在的)。
[0096]另外,使用"一(a/an)"是用來描述本文中所述的要素和部件。這樣做只是為了方 便起見且給出本發(fā)明范圍的一般性意義。除非明顯意指其它情況,否則這一描述應(yīng)該被理 解為包括一個(gè)或至少一個(gè),且單數(shù)也包括復(fù)數(shù)。
[0097] 上文關(guān)于具體實(shí)施例已描述了益處、其它優(yōu)勢和對問題的解決方案。然而,這些益 處、優(yōu)勢、問題解決方案以及任何可能使任何益處、優(yōu)勢或解決方案發(fā)生或變得更顯著的 (一個(gè)或多個(gè))特征不應(yīng)被解釋為任何或所有權(quán)利要求的重要的、必要的或必需的特征。 [0098]閱讀本說明書之后,本領(lǐng)域技術(shù)人員將了解,為了清楚起見,在獨(dú)立實(shí)施例的情況 下本文所描述的某些特征也可以按在單個(gè)實(shí)施例中以組合形式提供。相反,為了簡潔起見, 在單個(gè)實(shí)施例的情況下所描述的多種特征也可以單獨(dú)地或以任何亞組合形式提供。此外, 以范圍表示的數(shù)值包括在所述范圍內(nèi)的各個(gè)值或每個(gè)值。
【主權(quán)項(xiàng)】
1. 一種對核酸鏈進(jìn)行測序的方法,所述方法包含: 接收具有結(jié)合到核酸鏈的聚合物基質(zhì)的顆粒; 將所述顆粒暴露于包括凝聚劑的溶液;以及 將所述顆粒施加到表面,所述顆粒沉積在所述表面上。2. 根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其中所述凝聚劑包括具有3+電荷的金屬絡(luò)合物。3. 根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法,其中所述金屬絡(luò)合物包含鈷。4. 根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法,其中所述金屬絡(luò)合物為金屬-胺絡(luò)合物。5. 根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法,其中所述金屬絡(luò)合物包括六氨合鈷。6. 根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法,其中所述金屬絡(luò)合物包括三(乙二胺)鈷。7. 根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法,其中所述金屬絡(luò)合物包括1,3,6,8,10,13,16,19-八氮 雜二環(huán)-[6.6.6]二十燒鉆(cobalt sepulchrate)。8. 根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法,其中所述金屬絡(luò)合物來源于氯化物鹽。9. 根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法,其中所述溶液包括濃度為至少ΙμΜ的所述金屬絡(luò)合物。10. 根據(jù)權(quán)利要求9所述的方法,其中所述濃度為至少ΙΟμΜ。11. 根據(jù)權(quán)利要求10所述的方法,其中所述濃度為至少ImM。12. 根據(jù)權(quán)利要求11所述的方法,其中所述濃度為至少4.7mM。13. 根據(jù)權(quán)利要求12所述的方法,其中所述濃度為至少14.9mM。14. 根據(jù)權(quán)利要求9所述的方法,其中所述濃度不大于100mM。15. 根據(jù)權(quán)利要求14所述的方法,其中所述濃度不大于50mM。16. 根據(jù)權(quán)利要求1至15中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述凝聚劑包括非離子聚合物。17. 根據(jù)權(quán)利要求16所述的方法,其中所述非離子聚合物包括聚乙二醇類聚合物。18. 根據(jù)權(quán)利要求17所述的方法,其中所述聚乙二醇類聚合物的分子量在2000至20000 的范圍內(nèi)。19. 根據(jù)權(quán)利要求16所述的方法,其中所述非離子聚合物以0.1重量%至10.0重量%的 濃度包括在內(nèi)。20. 根據(jù)權(quán)利要求1至19中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述凝聚劑包括堿金屬鹽或堿土金 屬鹽。21. 根據(jù)權(quán)利要求20所述的方法,其中所述凝聚劑包括濃度為50mM至1.0M的鎂鹽。22. 根據(jù)權(quán)利要求1至21中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述凝聚劑包括堿金屬鹽或堿土金 屬鹽和非離子聚合物。23. 根據(jù)權(quán)利要求1至22中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述表面包括限定凹孔的層并且其 中將所述顆粒施加到所述表面包括將所述顆粒施加到所述凹孔中。24. 根據(jù)權(quán)利要求1至23中任一項(xiàng)所述的方法,其中響應(yīng)于所述暴露,所述顆粒的直徑 減小至少1 %。25. 根據(jù)權(quán)利要求24所述的方法,其中所述直徑減小至少5 %。26. 根據(jù)權(quán)利要求25所述的方法,其中所述直徑減小至少10 %。27. 根據(jù)權(quán)利要求26所述的方法,其中所述直徑減小至少15 %。28. 根據(jù)權(quán)利要求27所述的方法,其中所述直徑減小至少19 %。29. 根據(jù)權(quán)利要求24所述的方法,其中所述直徑減小不超過75 %。30. 根據(jù)權(quán)利要求1至29中任一項(xiàng)所述的方法,其中響應(yīng)于所述暴露,所述顆粒的密度 增大至少2 %。31. 根據(jù)權(quán)利要求30所述的方法,其中所述密度增大至少8%。32. 根據(jù)權(quán)利要求31所述的方法,其中所述密度增大至少14%。33. 根據(jù)權(quán)利要求32所述的方法,其中所述密度增大至少21 %。34. 根據(jù)權(quán)利要求30所述的方法,其中所述密度增大不超過75 %。35. 根據(jù)權(quán)利要求1至34中任一項(xiàng)所述的方法,其中暴露之后所述核酸鏈呈現(xiàn)出類似于 所述核酸鏈在暴露之前的離解。36. 根據(jù)權(quán)利要求1至35中任一項(xiàng)所述的方法,其中所述聚合物基質(zhì)包含聚合物,所述 聚合物包含瓊脂糖、聚氧丁烯、二甲基丙烯酰胺、聚氧乙烯或聚乙二醇、聚丙烯酰胺、聚氧丙 烯、N,N-聚二甲基丙烯酰胺、聚(N-異丙基丙烯酰胺)、聚乙烯吡咯啶酮、聚-N-羥基丙烯酰 胺、聚-N-羥基烷基丙烯酰胺、聚苯乙烯、其共聚物或衍生物,或其任何組合。37. 根據(jù)權(quán)利要求1至36中任一項(xiàng)所述的方法,還包含: 洗滌所述表面以去除所述凝聚劑。38. 根據(jù)權(quán)利要求1至37中任一項(xiàng)所述的方法,還包含: 對所述核酸鏈進(jìn)行測序。39. 根據(jù)權(quán)利要求38所述的方法,其中測序包含測定響應(yīng)于核苷酸添加的離子濃度。40. 根據(jù)權(quán)利要求38所述的方法,其中測序包含測定響應(yīng)于核苷酸添加的輻射發(fā)射。41. 一種制備表面的方法,所述方法包含: 將溶液施加到表面,所述溶液包括顆粒和凝聚劑,所述顆粒沉積到所述表面上;以及 用無所述金屬絡(luò)合物的溶液洗滌所述表面。42. -種裝置,其包含: 包括含凝聚劑的溶液的溶液容器; 用以接收包括核酸鏈的顆粒的樣品接收口;以及 與所述溶液容器和所述樣品接收口流體連通的混合器。43. 根據(jù)權(quán)利要求42所述的裝置,還包含表面制備單元,用以制備測序裝置的表面部件 以及用以接收來自所述混合器的已處理的顆粒。44. 一種含水試劑溶液,其包含: 在30mM至500mM范圍內(nèi)的鎂鹽; 在0.8M至1.0M范圍內(nèi)的鉀鹽; 在150mM至500mM范圍內(nèi)的緩沖劑;以及 在0.05 %至0.5 %范圍內(nèi)的表面活性劑。45. 根據(jù)權(quán)利要求44所述的含水試劑溶液,其中所述pH處于7至9的范圍。46. 根據(jù)權(quán)利要求44或權(quán)利要求45所述的含水試劑溶液,其中所述緩沖劑包括三(羥基 甲基)氨基甲烷。47. 根據(jù)權(quán)利要求44至46中任一項(xiàng)所述的含水試劑溶液,其中所述表面活性劑包括聚 乙二醇類表面活性劑。48. -種含水試劑溶液,其包含: 在30mM至500mM范圍內(nèi)的鎂鹽; 在0.5wt%至lO.Owt%范圍內(nèi)的聚乙二醇; 在0.8M至1.0M范圍內(nèi)的鉀鹽;以及 在150mM至500mM范圍內(nèi)的緩沖劑。49. 根據(jù)權(quán)利要求48所述的含水試劑溶液,其中所述pH處于7至9的范圍。50. 根據(jù)權(quán)利要求48或權(quán)利要求49所述的含水試劑溶液,其中所述緩沖劑包括三(羥基 甲基)氨基甲烷。
【專利摘要】一種對核酸鏈進(jìn)行測序的方法包括接收具有耦聯(lián)到聚合物基質(zhì)的核酸鏈的顆粒,將所述顆粒暴露于包括凝聚劑的溶液,以及將所述顆粒施加到表面,所述顆粒沉積在所述表面上。
【IPC分類】C12Q1/68
【公開號】CN105658817
【申請?zhí)枴?br>【發(fā)明人】G.羅, M.塞多瓦, D.萊特, R.瓊斯, M.阿蘭賈里
【申請人】生命技術(shù)公司
【公開日】2016年6月8日
【申請日】2014年9月12日