技術(shù)特征:
技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明公開(kāi)了一種基于相似基因比例的基因家族關(guān)系判定方法,包括確定一個(gè)基因家族為指定基因家族,計(jì)算兩個(gè)考察物種誰(shuí)與參考物的指定基因家族親緣關(guān)系更近,計(jì)算方法為將參考物種指定基因家族的基因分別與兩個(gè)考察物種指定基因家族的基因進(jìn)行兩兩序列比對(duì),分別獲取多個(gè)閾值條件下的參考物種的考察物種非冗余基因比例,確定相同閾值條件下參考物種的考察物種非冗余基因比例間的差值的絕對(duì)值最大且非冗余基因比例較大的考察物種為與參考物種指定基因家族關(guān)系更密切,可認(rèn)為該考察物種與參考物種具有更相似的相應(yīng)形態(tài)發(fā)育特征而應(yīng)用于優(yōu)勢(shì)物種或目的物種的篩選,還可反映不同物種間基因家族的進(jìn)化關(guān)系。
技術(shù)研發(fā)人員:向?yàn)g欣;吳朝鋒;蔡應(yīng)繁;汪露;鄧聿杉;何琳
受保護(hù)的技術(shù)使用者:重慶郵電大學(xué)
技術(shù)研發(fā)日:2017.04.10
技術(shù)公布日:2017.07.25