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一種物種間基因家族親緣關(guān)系計算方法與流程

文檔序號:11677915閱讀:來源:國知局

技術(shù)特征:

技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明公開了一種物種間基因家族親緣關(guān)系計算方法,包括確定一個基因家族為指定基因家族,計算兩個考察物種誰與參考物的指定基因家族親緣關(guān)系更近,計算方法為將參考物種指定基因家族的基因分別與兩個考察物種指定基因家族的基因進行兩兩序列比對,分別獲取多個閾值條件下的考察物種的參考物種非冗余基因數(shù)量,確定相同閾值條件下考察物種間的參考物種非冗余基因數(shù)量的差值的絕對值最大且參考物種非冗余基因數(shù)量較多所對應(yīng)的考察物種為與參考物種指定基因家族親緣關(guān)系更近,可認為該考察物種與參考物種具有更相似的相應(yīng)形態(tài)發(fā)育特征,而應(yīng)用于優(yōu)勢物種或目的物種的篩選,還可反映不同物種間基因家族的進化關(guān)系。

技術(shù)研發(fā)人員:向瀏欣;吳朝鋒;鄧聿杉;蔡應(yīng)繁;汪露;廖華東;何琳
受保護的技術(shù)使用者:重慶郵電大學
技術(shù)研發(fā)日:2017.04.10
技術(shù)公布日:2017.07.25
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