技術(shù)特征：

技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明涉及一種優(yōu)化的16S?rDNA高通量測(cè)序物種比對(duì)方法，按照以下步驟進(jìn)行：建立Greengenes數(shù)據(jù)庫、RDP數(shù)據(jù)庫、Silva數(shù)據(jù)庫和NCBI?16S?rDNA數(shù)據(jù)庫；將Greengenes數(shù)據(jù)庫中taxonomy信息轉(zhuǎn)化為字符串信息；分別將NCBI?16S?rDNA數(shù)據(jù)庫，RDP數(shù)據(jù)庫，Silva數(shù)據(jù)庫中taxonomy信息轉(zhuǎn)化為字符串信息；分別將得到的字符串信息與步驟2)中得到的字符串信息進(jìn)行對(duì)比，如步驟3)中得到的字符串信息與步驟2)得到的字符串信息完全一致，則將數(shù)據(jù)庫中的taxonomy信息去除，如步驟3)中得到的字符串信息與步驟步驟2)得到的字符串信息不一致，則將taxonomy信息導(dǎo)入到Greengenes數(shù)據(jù)庫中。利用改良的序列比對(duì)方法和信息全面的比對(duì)數(shù)據(jù)庫，能夠從高通量數(shù)據(jù)中獲得更加詳實(shí)的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。分析者能夠根據(jù)結(jié)果找到與更多實(shí)驗(yàn)密切相關(guān)的菌種，有利于推進(jìn)醫(yī)療、衛(wèi)生、環(huán)境科學(xué)的發(fā)展。

技術(shù)研發(fā)人員：陸敏;朱永亮
受保護(hù)的技術(shù)使用者：蘇州普瑞森基因科技有限公司
技術(shù)研發(fā)日：2017.02.21
技術(shù)公布日：2017.07.14