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一種基于醫(yī)療體檢數(shù)據(jù)的糖尿病預(yù)測方法與流程

文檔序號:11919920閱讀:1050來源:國知局
一種基于醫(yī)療體檢數(shù)據(jù)的糖尿病預(yù)測方法與流程

本發(fā)明屬于大數(shù)據(jù)醫(yī)療領(lǐng)域,具體涉及一種醫(yī)療體檢數(shù)據(jù)的糖尿病預(yù)測方法。



背景技術(shù):

隨著人們生活水平的提高、保健意識的增強,健康體檢逐漸成為一種社會時尚,人們已經(jīng)改變了只有在得病時才去醫(yī)院的傳統(tǒng)觀念,定期體檢已經(jīng)被大多數(shù)人所接受。因此,醫(yī)院積累了海量的電子體檢數(shù)據(jù),使大數(shù)據(jù)有了用武之地。

大數(shù)據(jù)醫(yī)療是當(dāng)前的一個熱點,是指通過大數(shù)據(jù)相關(guān)技術(shù),分析醫(yī)療領(lǐng)域的數(shù)據(jù)并挖掘其中的知識從而大幅度提高醫(yī)療服務(wù)。在過去的幾十年中,大數(shù)據(jù)已經(jīng)深深地影響了每一個企業(yè),包括醫(yī)療保健行業(yè)。如今,大量的數(shù)據(jù)可以讓醫(yī)療保健更加高效,更加個性化。

今年,世界衛(wèi)生組織(WHO)發(fā)出警告,我國約有1.1億名糖尿病患者,約占中國成年人總數(shù)的1/10。若不盡快采取行動,減少不健康飲食和缺乏運動等生活方式中的危險因素,預(yù)計該數(shù)字將在2040年增至1.5億人,給民眾健康和社會經(jīng)濟帶來嚴(yán)重影響。糖尿病除了對患者及其家人朋友造成身心的傷害,也帶來巨大的經(jīng)濟損失。我國每年投入近1734億人民幣(250億美元)用于糖尿病管理;用于糖尿病的直接醫(yī)療支出占中國醫(yī)療支出的13%。這些數(shù)據(jù)還未包括糖尿病相關(guān)疾病給患者家庭和公司帶來的經(jīng)濟損失。將大數(shù)據(jù)引入糖尿病醫(yī)療領(lǐng)域,不但能減小醫(yī)生壓力,還能讓病人平時過得更舒服。



技術(shù)實現(xiàn)要素:

鑒于上述,本發(fā)明提供了一種基于醫(yī)療體檢數(shù)據(jù)的糖尿病預(yù)測方法,該方法是通過分析體檢數(shù)據(jù)中病人的各項數(shù)據(jù)指標(biāo)和醫(yī)生對病人體檢數(shù)據(jù)的診斷,建立體檢數(shù)據(jù)和體檢診斷之間的關(guān)聯(lián),預(yù)測病人是否可能患糖尿病,從而輔助醫(yī)生進行更好的判斷,令病人更好的了解自身患病的風(fēng)險。

一種基于醫(yī)療體檢數(shù)據(jù)的糖尿病預(yù)測方法,包括以下步驟:

(1)對每個用戶的體檢數(shù)據(jù)進行處理,得到完整的體檢數(shù)據(jù);

(2)將完整的患糖尿病的體檢數(shù)據(jù)作為正訓(xùn)練樣本,將完整的未患糖尿病的體檢數(shù)據(jù)作為負訓(xùn)練樣本;采用GBDT+LR模型進行訓(xùn)練,并根據(jù)模型的效果進行模型調(diào)整融合,得到最終預(yù)測模型;

(3)將處理后的新用戶的體檢數(shù)據(jù)作為預(yù)測樣本輸入到最終預(yù)測模型,得到新用戶的患糖尿病概率。

步驟1的具體步驟為:

(1-1)對每個用戶的體檢數(shù)據(jù)進行預(yù)處理,得到同一格式的體檢數(shù)據(jù);

(1-2)對同一格式的體檢數(shù)據(jù)進行均衡化,得到均衡化的體檢數(shù)據(jù);

(1-3)對均衡化的體檢數(shù)據(jù)進行數(shù)據(jù)缺失值填充,得到完整的體檢數(shù)據(jù)。

在步驟(1-1)中,進行體檢數(shù)據(jù)預(yù)處理的過程為:首先,對體檢數(shù)據(jù)中原生的診斷結(jié)果、體檢項目名稱以及體檢項目結(jié)果,采用自然語言處理方法進行分析,得到分析結(jié)果;然后,對分析結(jié)果進一步地清洗和標(biāo)準(zhǔn)化,轉(zhuǎn)換為同一格式的體檢數(shù)據(jù),使更多資料可用。

在步驟(1-2)中,由于在體檢數(shù)據(jù)中,患糖尿病的用戶只占據(jù)其中的一部分,因此,通過擴大患糖尿病的體檢數(shù)據(jù)(小樣本),縮小未患糖尿病的體檢數(shù)據(jù)(大樣本)的方法,得到數(shù)量相等的正負例訓(xùn)練樣本,以達到正負例樣本的均衡化,便于后續(xù)的模型使用。

數(shù)據(jù)樣本均衡化:在分類問題中,經(jīng)常會遇到正負例樣本數(shù)據(jù)量不等的情況,比如正例樣本為10w條數(shù)據(jù),負例樣本只有1w條數(shù)據(jù),此時需要進行樣本的均衡化,使得正負例樣本達到平衡。

對體檢數(shù)據(jù)進行均衡化的方法有三種,分別為:

(a)重采樣法:通過重復(fù)采樣患糖尿病的體檢數(shù)據(jù)以擴大患糖尿病的體檢數(shù)據(jù)的數(shù)量;以達到正負例訓(xùn)練樣本的均衡。

(b)欠采樣法:通過少量采樣未患糖尿病的體檢數(shù)據(jù)以縮小未患糖尿病的體檢數(shù)據(jù)的數(shù)量,以達到正負例訓(xùn)練樣本的均衡。

(c)權(quán)值調(diào)整法:通過改變患糖尿病的體檢數(shù)據(jù)與未患糖尿病的體檢數(shù)據(jù)的權(quán)值比例以使得正負例訓(xùn)練樣本的總權(quán)值一致,以達到正負例訓(xùn)練樣本的均衡。

作為優(yōu)選,采用重采樣法與欠采樣法結(jié)合的方式,即隨機采樣正例患糖尿病的體檢數(shù)據(jù),并排序抽取缺失數(shù)據(jù)較少的負例未患糖尿病的體檢數(shù)據(jù)。這樣既擴大了正例樣本數(shù)據(jù)量,又篩選了較差的負例樣本。

在步驟(1-3)中,數(shù)據(jù)值缺失是指在數(shù)據(jù)獲取過程中因為自然原因和人為原因?qū)е聰?shù)據(jù)不完整,體檢數(shù)據(jù)中同樣也存在數(shù)據(jù)值缺失的情形,因此,需要對體檢數(shù)據(jù)進行缺失值填充。進行缺失值填充的方法包括三種,分別為:

(a)直接刪除法:直接刪除有缺失數(shù)據(jù)的體檢數(shù)據(jù)。

(b)計算樣本數(shù)據(jù)填充法:通過計算體檢數(shù)據(jù)的中位數(shù)、眾數(shù)、平均數(shù)以及隨機分布值等,填充體檢數(shù)據(jù)中的缺失值。

(c)綜合整個樣本數(shù)據(jù)填充法:找到最相似的體檢數(shù)據(jù),利用其進行體檢數(shù)據(jù)的缺失值填充,或?qū)⑷笔卣髦涤成涓呔S空間。

作為優(yōu)選,本發(fā)明采用綜合整個樣本數(shù)據(jù)填充法進行數(shù)據(jù)缺失值填充,具體為:采用K最近鄰(k-Nearest Neighbor,kNN)算法對體檢數(shù)據(jù)缺失值進行預(yù)測,利用用戶自身其他特征尋找最相似的k個用戶,綜合k個用戶的相似性加權(quán)平均值進行體檢數(shù)據(jù)的缺失值填充,k為用戶的個數(shù)。

在步驟(2)中,采用GBDT(Gradient Boosting Decision Tree)與LR(Logistic Regression)模型進行訓(xùn)練,并根據(jù)模型的效果進行模型調(diào)整融合,得到最終的模型。

在步驟(3)中,首先,采用步驟(1-1)~步驟(1-3)對每個新用戶的體檢數(shù)據(jù)進行處理,然后,將處理后的新用戶的體檢數(shù)據(jù)作為預(yù)測樣本輸入到最終預(yù)測模型,得到新用戶的患糖尿病概率。

本發(fā)明基于醫(yī)療體檢數(shù)據(jù)的糖尿病預(yù)測方法是通過分析用戶的體檢數(shù)據(jù),利用大數(shù)據(jù)分析的手段,判斷用戶的患糖尿病病風(fēng)險。從而促進各類糖尿病醫(yī)療應(yīng)用的發(fā)展,不僅為醫(yī)生的快速判斷提供輔助依據(jù),同時使病人對自身的潛在隱患有更直觀的了解,具有的優(yōu)點如下:

(1)對醫(yī)療體檢數(shù)據(jù)進行預(yù)處理,將更多可用的體檢數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù),不僅增多了訓(xùn)練樣本,也能為更加復(fù)雜的體檢數(shù)據(jù)提供預(yù)測服務(wù)。

(2)結(jié)合體檢數(shù)據(jù)的特殊性,在擴大最終樣本數(shù)量的同時,對低質(zhì)量的樣本進行了篩選。

(3)使用了KNN算法填充缺失數(shù)值,并局部調(diào)整優(yōu)化,既可以利用已有數(shù)據(jù)進行推測,又不耗費過多計算資源。

(4)采用了GBDT+LR模型,既節(jié)省了人工處理分析特征的環(huán)節(jié),又增強了非線性預(yù)測能力。

附圖說明

圖1為本發(fā)明基于醫(yī)療體檢數(shù)據(jù)的糖尿病預(yù)測方法的結(jié)構(gòu)圖;

圖2為醫(yī)療體檢數(shù)據(jù)的診斷結(jié)果清洗與標(biāo)準(zhǔn)化示意圖;

圖3為醫(yī)療體檢數(shù)據(jù)的體檢項目名稱和結(jié)果清洗與標(biāo)準(zhǔn)化示意圖;

圖4為正負例糖尿病體檢者數(shù)據(jù)均衡化示意圖;

圖5為數(shù)據(jù)缺失值填充方法分析圖;

圖6為部分體檢數(shù)據(jù)糖尿病預(yù)測結(jié)果圖。

具體實施方式

為了更為具體地描述本發(fā)明,下面結(jié)合附圖及具體實施方式對本發(fā)明的技術(shù)方案進行詳細說明。

如圖1所示,本發(fā)明基于醫(yī)療體檢數(shù)據(jù)的糖尿病預(yù)測方法的具體步驟如下:

步驟1,數(shù)據(jù)預(yù)處理:對每個用戶的體檢數(shù)據(jù)進行預(yù)處理,得到同一格式的體檢數(shù)據(jù)。

如圖2所示,對于原生的醫(yī)生診斷數(shù)據(jù),由于出自不同醫(yī)生和具體的不同場景,產(chǎn)生的診斷結(jié)果是復(fù)雜的,不能直接使用。例如所需要判斷的糖尿病診斷中有糖尿病、糖尿病性視網(wǎng)膜病變、高度糖尿病發(fā)病風(fēng)險等,需要經(jīng)過數(shù)據(jù)清洗和標(biāo)準(zhǔn)化才能夠作為診斷的標(biāo)簽使用。經(jīng)過自然語言處理后,首先獲取所有和糖尿病有關(guān)的診斷詞,經(jīng)過人工評判和相關(guān)醫(yī)學(xué)知識的輔助,最終分成三個標(biāo)簽:糖尿病,疑似糖尿病,非糖尿病。同時,還有相關(guān)體檢項目名稱也需要進行清洗和標(biāo)準(zhǔn)化,如圖3所示。比如說糖化血紅蛋白項目,可能有糖化血紅蛋白A1、糖化血紅蛋白A1(HbA1)、糖化血紅蛋白、A1(HbA1)等,它們都是指代同一個體檢項目,只是在不同體檢套餐中有不同的名稱。除了體檢項目名稱,還有體檢項目結(jié)果也需要進行清洗標(biāo)準(zhǔn)化,例如:結(jié)果可能為拒檢、拒測、未檢、21、88cm、左手:135右手:129、76未、++32等,這些數(shù)據(jù)都會在清洗和標(biāo)準(zhǔn)化后有統(tǒng)一的數(shù)據(jù)格式和單位。

步驟2,數(shù)據(jù)樣本均衡化:對同一格式的體檢數(shù)據(jù)進行均衡化,得到均衡化的體檢數(shù)據(jù)。

如圖4,在數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化之后,可以獲取到一定數(shù)量的樣本數(shù)據(jù),此事往往存在的問題是,正負例樣本不均衡,因為患糖尿病的用戶在所有的體檢用戶中只是占據(jù)了一個部分。為均衡化正負例樣本數(shù)據(jù),本實施例采用的是隨機采樣正例患糖尿病用戶的數(shù)據(jù),并排序抽取缺失數(shù)據(jù)較少的負例樣本數(shù)據(jù)。這樣既擴大了正例樣本數(shù)據(jù)量,又篩選了較差的負例樣本。

步驟3,缺失值填充:對均衡化的體檢數(shù)據(jù)進行數(shù)據(jù)缺失值填充,得到完整的體檢數(shù)據(jù)。

在均衡化的數(shù)據(jù)中,仍然存在許多數(shù)據(jù)缺失值,需要進行填充,如圖5。本實施例中選擇采用其他特征對缺失值進行預(yù)測。對于簡單計算數(shù)據(jù)的中值、均值等進行填充的方法,存在隨機性較大,會人為增加噪音的問題,會降低數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性。而對于把缺失特征值映射到高維空間的方法,則會增加計算量,需要較大的資源。選擇的采用其他特征對缺失值進行預(yù)測的方法,主要需要依賴其他變量的相關(guān)性,對于體檢數(shù)據(jù)而言較為適合。具體采用KNN算法計算該數(shù)據(jù)最相似的k條記錄,根據(jù)其相似性加權(quán)平均獲得最終的填充值。也就是利用用戶自身其他特征尋找最相似的k個用戶,并綜合k個用戶的值進行體檢數(shù)據(jù)的缺失值填充。

步驟4,模型訓(xùn)練:將完整的患糖尿病的體檢數(shù)據(jù)作為正訓(xùn)練樣本,將完整的未患糖尿病的體檢數(shù)據(jù)作為負訓(xùn)練樣本;采用GBDT+LR模型進行訓(xùn)練,并根據(jù)模型的效果進行模型調(diào)整融合,得到最終預(yù)測模型。

GBDT又叫MART(Multiple Additive Regression Tree),是一種常用的非線性模型,它基于集成學(xué)習(xí)中的boosting思想,每次迭代都在減少殘差的梯度方向新建立一顆決策樹,迭代多少次就會生成多少顆決策樹。GBDT的思想使其具有天然優(yōu)勢可以發(fā)現(xiàn)多種有區(qū)分性的特征以及特征組合,決策樹的路徑可以直接作為LR輸入特征使用,省去了人工尋找特征、特征組合的步驟。LR是一種線性擬合模型,可以利用Logistic函數(shù)(或稱為Sigmoid函數(shù))變成分類器。

步驟5,模型預(yù)測:將處理后的新用戶的體檢數(shù)據(jù)作為預(yù)測樣本輸入到最終預(yù)測模型,得到新用戶的患糖尿病概率。

獲取到模型結(jié)果后,對于每一個新的用戶體檢數(shù)據(jù),只需要自動化上述流程即可得到他的患糖尿病概率。如圖6所示的是部分體檢數(shù)據(jù)糖尿病預(yù)測結(jié)果圖,分析從圖6可得:利用該方法進行預(yù)測得到的糖尿病預(yù)測準(zhǔn)確率很好。

以上所述的具體實施方式對本發(fā)明的技術(shù)方案和有益效果進行了詳細說明,應(yīng)理解的是以上所述僅為本發(fā)明的最優(yōu)選實施例,并不用于限制本發(fā)明,凡在本發(fā)明的原則范圍內(nèi)所做的任何修改、補充和等同替換等,均應(yīng)包含在本發(fā)明的保護范圍之內(nèi)。

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