技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明公開了一種基于雙向隨機(jī)游走和多標(biāo)簽學(xué)習(xí)的miRNA?環(huán)境因子關(guān)系預(yù)測方法??紤]到單一的生物數(shù)據(jù)的不完整,采用不同的生物數(shù)據(jù)和不同相似性度量方法分別計(jì)算miRNA和環(huán)境因子的相似性。另外,為了減少單個(gè)相似性度量噪聲,本發(fā)明引入相似性矩陣融合方法來提高最終的miRNA和環(huán)境因子相似性可靠性。在此基礎(chǔ)上,采用雙向隨機(jī)游走算法和多標(biāo)簽學(xué)習(xí)方法來預(yù)測潛在的miRNA?環(huán)境因子關(guān)系。本發(fā)明簡單有效,通過與其他方法比較,及在已知數(shù)據(jù)集上測試表明,該發(fā)明在miRNA?環(huán)境因子潛在關(guān)系方面具有較好的預(yù)測性能。案例分析表明,本發(fā)明能夠發(fā)現(xiàn)一些潛在的環(huán)境因子對(duì)應(yīng)miRNA,能為生物學(xué)家進(jìn)行miRNA?環(huán)境因子發(fā)現(xiàn)的進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)提供有價(jià)值的參考信息。
技術(shù)研發(fā)人員:王建新;蘭偉;李敏;羅慧敏
受保護(hù)的技術(shù)使用者:中南大學(xué)
文檔號(hào)碼:201610915233
技術(shù)研發(fā)日:2016.10.20
技術(shù)公布日:2017.03.08