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一種局部增強(qiáng)的多模態(tài)差分進(jìn)化蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)從頭預(yù)測(cè)方法與流程

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技術(shù)總結(jié)
一種局部增強(qiáng)的多模態(tài)差分進(jìn)化蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)從頭預(yù)測(cè)方法,包括以下步驟:在差分進(jìn)化算法框架下,采用Rosetta?score3粗粒度知識(shí)能量模型來(lái)降低構(gòu)象空間維數(shù);將構(gòu)象種群劃分為多個(gè)模態(tài),以保持種群多樣性,采用片段組裝技術(shù)來(lái)提高預(yù)測(cè)精度,同時(shí)采用蒙特卡洛算法對(duì)種群做增強(qiáng);在種群進(jìn)化后期,使用抽象凸估計(jì)技術(shù),建立模態(tài)的下界估計(jì)模型,構(gòu)建廣義下降方向,對(duì)模態(tài)內(nèi)個(gè)體做局部增強(qiáng),以得到更為優(yōu)良的局部構(gòu)象;結(jié)合差分進(jìn)化算法較強(qiáng)的全局搜索能力,可以對(duì)構(gòu)象空間進(jìn)行更為有效的搜索。本發(fā)明基于差分進(jìn)化算法,提出一種構(gòu)象空間搜索維數(shù)較低、收斂速度較快、預(yù)測(cè)精度較高的局部增強(qiáng)的多模態(tài)差分進(jìn)化蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)從頭預(yù)測(cè)方法。

技術(shù)研發(fā)人員:張貴軍;郝小虎;王柳靜;周曉根;陳凱;謝騰宇;李章維
受保護(hù)的技術(shù)使用者:浙江工業(yè)大學(xué)
文檔號(hào)碼:201610846348
技術(shù)研發(fā)日:2016.09.23
技術(shù)公布日:2017.03.15

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