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基于半監(jiān)督學(xué)習(xí)的腦部CT圖像出血區(qū)域分割方法及系統(tǒng)與流程

文檔序號:12367107閱讀:來源:國知局

技術(shù)特征:

1.一種基于半監(jiān)督學(xué)習(xí)的腦部CT圖像出血區(qū)域分割方法,其特征在于,該方法包括以下步驟:

(1)訓(xùn)練Tri-training模型;

(2)基于Tri-training模型的出血區(qū)域分割;

所述步驟1包括以下子步驟:

(1.1)轉(zhuǎn)換CT圖像格式:從計(jì)算機(jī)斷層掃描設(shè)備或數(shù)據(jù)庫中獲取包含出血區(qū)域的CT圖像序列,截取像素值的有效區(qū)間,轉(zhuǎn)換成常用的bmp或jpg圖像處理格式。

(1.2)標(biāo)記訓(xùn)練樣本:將CT圖像序列分為兩部分,一部分序列作為有標(biāo)記樣本集,另一部分作為無標(biāo)記樣本集,針對有標(biāo)記樣本,手動標(biāo)出出血區(qū)域,其中出血區(qū)域標(biāo)記為1,其余部分標(biāo)記為0。

(1.3)圖像三維重建:將CT圖像序列重建到三維區(qū)間,通過三維濾波去除噪聲,得到三維矩陣。

(1.4)超體素分割:對重建得到的三維矩陣,應(yīng)用三維簡單線性迭代聚類算法(3DSLIC)對其進(jìn)行分割,得到規(guī)則排列的超體素。該步驟具體為:

(1.4.1)計(jì)算三維矩陣中的體素總數(shù)N,確定要?jiǎng)澐值某w素個(gè)數(shù)K,計(jì)算超體素的初始邊長以Ns為步長在三個(gè)維度上均勻抽樣,作為初始的聚類中心Ck=[gk,xk,yk,zk]T,其中,gk為第k個(gè)聚類中心的灰度值,xk,yk,zk為第k個(gè)聚類中心的位置坐標(biāo)。

(1.4.2)在以聚類中心點(diǎn)為中心的3×3×3鄰域范圍內(nèi),選取梯度最小點(diǎn)作為新的聚類中心點(diǎn),梯度G(x,y,z)計(jì)算方法如下:

G(x,y,z)=[g(x+1,y,z)-g(x-1,y,z)]2+[g(x,y+1,z)-g(x,y-1,z)]2+[g(x,y,z+1)-g(x,y,z-1)]2

其中,g(x+1,y,z)表示坐標(biāo)(x+1,y,z)處的像素值,g(x-1,y,z)等同理。

(1.4.3)初始化體素標(biāo)簽l(i)=-1,體素到聚類中心的距離d(i)=+∞,相鄰的兩次聚類中心的差異閾值為threshold;

(1.4.4)以每個(gè)聚類中心點(diǎn)Ck為中心,在2Ns×2Ns×2Ns的鄰域范圍內(nèi)計(jì)算體素i到聚類中心Ck的距離D(i,Ck),其中p,q為調(diào)解參數(shù),gi,xi,yi,zi分別為體素i的像素值和三維坐標(biāo)。

<mrow> <mi>D</mi> <mrow> <mo>(</mo> <mi>i</mi> <mo>,</mo> <msub> <mi>C</mi> <mi>k</mi> </msub> <mo>)</mo> </mrow> <mo>=</mo> <msqrt> <mrow> <mfrac> <msup> <mrow> <mo>(</mo> <msub> <mi>g</mi> <mi>i</mi> </msub> <mo>-</mo> <msub> <mi>g</mi> <mi>k</mi> </msub> <mo>)</mo> </mrow> <mn>2</mn> </msup> <msup> <mi>p</mi> <mn>2</mn> </msup> </mfrac> <mo>+</mo> <mfrac> <msup> <mrow> <mo>(</mo> <mo>(</mo> <msub> <mi>x</mi> <mi>i</mi> </msub> <mo>-</mo> <msub> <mi>x</mi> <mi>k</mi> </msub> <mo>)</mo> <mo>+</mo> <mo>(</mo> <msub> <mi>y</mi> <mi>i</mi> </msub> <mo>-</mo> <msub> <mi>y</mi> <mi>k</mi> </msub> <mo>)</mo> <mo>+</mo> <mo>(</mo> <msub> <mi>z</mi> <mi>i</mi> </msub> <mo>-</mo> <msub> <mi>z</mi> <mi>k</mi> </msub> <mo>)</mo> <mo>)</mo> </mrow> <mn>2</mn> </msup> <msup> <mi>q</mi> <mn>2</mn> </msup> </mfrac> </mrow> </msqrt> </mrow>

如果D(i,Ck)≤d(i),令體素的標(biāo)簽l(i)=k,體素到聚類中心的距離d(i)=D(i,Ck)。

(1.4.5)對每個(gè)聚類中心點(diǎn)的鄰域都計(jì)算完距離后,根據(jù)體素標(biāo)簽計(jì)算新的聚類中心點(diǎn)Ck(new)

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其中,Nk表示屬于第k個(gè)聚類中心的體素的總個(gè)數(shù)。

(1.4.6)計(jì)算新聚類中心和原聚類中心之間的差異E:

<mrow> <mi>E</mi> <mo>=</mo> <mfrac> <mn>1</mn> <mi>K</mi> </mfrac> <munderover> <mo>&Sigma;</mo> <mrow> <mi>k</mi> <mo>=</mo> <mn>1</mn> </mrow> <mi>K</mi> </munderover> <mo>|</mo> <mo>|</mo> <msub> <mi>C</mi> <mi>k</mi> </msub> <mo>-</mo> <msub> <mi>C</mi> <mrow> <mi>k</mi> <mrow> <mo>(</mo> <mi>n</mi> <mi>e</mi> <mi>w</mi> <mo>)</mo> </mrow> </mrow> </msub> <mo>|</mo> <mo>|</mo> </mrow>

更新聚類中心Ck=Ck(new),如果差異E≤threshold,結(jié)束循環(huán),反之,重復(fù)步驟(1.4.4)到步驟(1.4.6),直到差異E≤threshold。

(1.4.7)對于有標(biāo)簽體素集,統(tǒng)計(jì)每個(gè)超體素內(nèi)的體素標(biāo)簽,選擇體素最多的標(biāo)簽作為整個(gè)超體素的標(biāo)簽。

(1.5)提取特征:對每個(gè)超體素,提取超體素的灰度直方圖作為特征?;叶戎狈綀D的統(tǒng)計(jì)范圍為[Gmedian-40,Gmedian+80],特征總數(shù)為40。其中Gmedian表示CT圖像中腦部區(qū)域的灰度中值,由統(tǒng)計(jì)得到。

(1.6)訓(xùn)練半監(jiān)督模型:用有標(biāo)簽樣本和無標(biāo)簽樣本一起訓(xùn)練構(gòu)成tri-training模型的三個(gè)不同類型的分類器。該步驟包括以下子步驟:

(1.6.1)對有標(biāo)記樣本集進(jìn)行可重復(fù)取樣以獲得三個(gè)有標(biāo)記訓(xùn)練樣本集,三個(gè)訓(xùn)練樣本集分別用來訓(xùn)練產(chǎn)生一個(gè)分類器,這里的三個(gè)分類器分別為人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(ANN),支持向量機(jī)(SVM)和隨機(jī)森林(RF)。其中ANN分類器是一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)的三層神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),隱層節(jié)點(diǎn)數(shù)為20,激活函數(shù)為sigmoid函數(shù)。SVM分類器是通過LIBSVM工具箱實(shí)現(xiàn)的,核函數(shù)為高斯徑向基函數(shù),參數(shù)C設(shè)定為1。RF分類器的樹數(shù)量為100。

(1.6.2)三個(gè)分類器分別對無標(biāo)記樣本集進(jìn)行標(biāo)注,如果兩個(gè)分類器對同一個(gè)未標(biāo)記樣本的標(biāo)簽預(yù)測相同,用該標(biāo)簽標(biāo)記這個(gè)樣本,然后將其加入第三個(gè)分類器的有標(biāo)記訓(xùn)練樣本集;

(1.6.3)用更新過的有標(biāo)記訓(xùn)練樣本集再次訓(xùn)練三個(gè)分類器;

(1.6.4)重復(fù)步驟(1.6.2)、(1.6.3)直到分類器的參數(shù)不再發(fā)生變化。

所述步驟2包括以下子步驟:

(2.1)從計(jì)算機(jī)斷層掃描設(shè)備中導(dǎo)出包含出血區(qū)域的CT圖像;

(2.2)轉(zhuǎn)換CT圖像格式:對于步驟(2.1)獲取的的CT圖像,截取像素值的有效區(qū)間,轉(zhuǎn)換成常用的bmp或jpg圖像處理格式。

(2.3)圖像三維重建:將CT圖像重建到三維區(qū)間,通過三維濾波去除噪聲,得到三維矩陣。

(2.4)超體素分割:對重建得到的三維矩陣,應(yīng)用三維簡單線性迭代聚類算法(3DSLIC)對其進(jìn)行分割,得到規(guī)則排列的超體素。

(2.5)提取特征:對每個(gè)超體素,提取超體素的灰度直方圖作為特征?;叶戎狈綀D的統(tǒng)計(jì)范圍為[Gmedian-40,Gmedian+80],特征總數(shù)為40。

(2.6)分類樣本:用通過步驟(1.1)-(1.6)訓(xùn)練好的tri-training分類器分類超體素,即為每一個(gè)超體素分配一個(gè)標(biāo)簽,其中出血區(qū)域標(biāo)簽ti=1,其他區(qū)域標(biāo)簽ti=0。

(2.7)三維重建:將所有ti=1的超體素在三維空間進(jìn)行重建,通過去噪,平滑等處理得到出血區(qū)域的三維顯示,實(shí)現(xiàn)腦部CT圖像出血區(qū)域的分割。

2.一種實(shí)現(xiàn)權(quán)利要求1所述方法的基于半監(jiān)督學(xué)習(xí)的腦部CT圖像出血區(qū)域分割系統(tǒng),其特征在于,包括圖像預(yù)處理模塊,超體素劃分模塊,特征提取模塊,分類模塊和三維重建模塊。所述圖像預(yù)處理模塊對二維CT圖像序列進(jìn)行格式轉(zhuǎn)換、簡單圖像處理并將二維圖像存儲到三維矩陣。所述超體素劃分模塊將三維矩陣劃分為超體素。所述特征提取模塊包括計(jì)算灰度直方圖模塊和計(jì)算標(biāo)簽?zāi)K。所述分類模塊包括訓(xùn)練分類器模塊和分類樣本模塊,在訓(xùn)練過程中用于訓(xùn)練分類器,在實(shí)際應(yīng)用過程中將超體素分為前景部分和背景部分。所述三維重建模塊將屬于前景的超體素在三維空間進(jìn)行重建。

3.如權(quán)利要求2所述的一種基于半監(jiān)督學(xué)習(xí)的腦部CT圖像出血區(qū)域分割系統(tǒng),其特征在于,所述圖像預(yù)處理模塊從計(jì)算機(jī)斷層掃描設(shè)備或者數(shù)據(jù)庫中獲取包含出血區(qū)域的CT圖像,截取像素值的有效區(qū)間,轉(zhuǎn)換成常用的bmp或jpg圖像處理格式,并將二維圖像序列存儲到三維矩陣。

4.如權(quán)利要求2所述的一種基于半監(jiān)督學(xué)習(xí)的腦部CT圖像出血區(qū)域分割系統(tǒng),其特征在于,所述超體素劃分模塊應(yīng)用三維簡單線性迭代聚類算法對三維矩陣進(jìn)行分割,得到規(guī)則排列的超體素作為樣本。

5.如權(quán)利要求2所述的一種基于半監(jiān)督學(xué)習(xí)的腦部CT圖像出血區(qū)域分割系統(tǒng),其特征在于,所述特征提取模塊包括計(jì)算灰度直方圖模塊和計(jì)算標(biāo)簽?zāi)K:計(jì)算灰度直方圖模塊提取超體素的灰度直方圖作為超體素的特征;計(jì)算標(biāo)簽?zāi)K用于訓(xùn)練過程中計(jì)算樣本的標(biāo)簽。

6.如權(quán)利要求2所述的一種基于半監(jiān)督學(xué)習(xí)的腦部CT圖像出血區(qū)域分割系統(tǒng),其特征在于,所述特征分類模塊包括訓(xùn)練分類器模塊和分類樣本模塊:訓(xùn)練分類器模塊在tri-training模型下,用樣本訓(xùn)練人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),支持向量機(jī)和隨機(jī)森林三個(gè)分類器;分類樣本模塊根據(jù)超體素特征,運(yùn)用訓(xùn)練好的三個(gè)分類器組合而成的tri-training模型分類超體素。

7.如權(quán)利要求2所述的一種基于半監(jiān)督學(xué)習(xí)的腦部CT圖像出血區(qū)域分割系統(tǒng),其特征在于,所述三維重建模塊將分類得到的出血區(qū)域超體素重建到三維空間并顯示。

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