基于生物云平臺(tái)的項(xiàng)目結(jié)題報(bào)告分析系統(tǒng)和方法
【專(zhuān)利摘要】本發(fā)明公開(kāi)了基于生物云平臺(tái)的項(xiàng)目結(jié)題報(bào)告分析系統(tǒng)和方法，系統(tǒng)包括：結(jié)題報(bào)告解析，對(duì)各個(gè)項(xiàng)目的結(jié)題報(bào)告進(jìn)行解析，并將解析結(jié)果以及原始數(shù)據(jù)整合封裝成相應(yīng)的項(xiàng)目文件；結(jié)題報(bào)告呈現(xiàn)模塊，查詢(xún)所有的項(xiàng)目文件并以列表形式展示，將某個(gè)項(xiàng)目按照預(yù)設(shè)樣式顯示；綜合分析模塊，接收用戶(hù)界面模塊發(fā)送的用戶(hù)請(qǐng)求并生成分析任務(wù)，按照分析任務(wù)的指示進(jìn)行分析，并將分析結(jié)果發(fā)送給結(jié)題報(bào)告呈現(xiàn)模塊；結(jié)題報(bào)告呈現(xiàn)模塊，還從項(xiàng)目文件列表中查詢(xún)并讀取項(xiàng)目文件對(duì)應(yīng)的分析結(jié)果，并對(duì)項(xiàng)目文件以及相應(yīng)的分析結(jié)果進(jìn)行展示。通過(guò)將結(jié)題報(bào)告的內(nèi)容、原始數(shù)據(jù)和分析軟件集成到一個(gè)頁(yè)面中，使用戶(hù)在查看結(jié)題報(bào)告的同時(shí)查看原始數(shù)據(jù)并進(jìn)行分析，提高工作效率。
【專(zhuān)利說(shuō)明】基于生物云平臺(tái)的項(xiàng)目結(jié)題報(bào)告分析系統(tǒng)和方法

【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001]本發(fā)明涉及生物信息分析【技術(shù)領(lǐng)域】，特別涉及基于生物云平臺(tái)的項(xiàng)目結(jié)題報(bào)告分析系統(tǒng)和方法。

【背景技術(shù)】
[0002]隨著高通量測(cè)序技術(shù)的不斷發(fā)展，生物數(shù)據(jù)的產(chǎn)出速度非?？炜?，目前全世界二代測(cè)序技術(shù)的數(shù)據(jù)產(chǎn)出速度為每年13Pbp，并且還在不斷加速中，生物信息學(xué)研究已經(jīng)正式進(jìn)入大數(shù)據(jù)時(shí)代。
[0003]除了在進(jìn)行生物信息分析時(shí)需要大量的計(jì)算資源之外，生物信息分析本身也是一個(gè)非常復(fù)雜的過(guò)程。因此，大部分科研工作者進(jìn)行分析時(shí)采用的普遍模式是把研究的樣本材料和研究目的提供給專(zhuān)業(yè)的生物信息分析公司進(jìn)行分析，由公司完成測(cè)序和分析，分析完成后，用戶(hù)得到一份紙質(zhì)的結(jié)題報(bào)告或者是word版(或pdf版)的結(jié)題報(bào)告以及大量的原始數(shù)據(jù)，結(jié)題報(bào)告中列出了分析得到的圖或表，而原始數(shù)據(jù)一般由于數(shù)據(jù)量很大，在個(gè)人電腦上無(wú)法查看，也無(wú)法進(jìn)行后續(xù)的分析。
[0004]但是隨著用戶(hù)自行分析的需求不斷增長(zhǎng)，云計(jì)算技術(shù)在生物信息分析領(lǐng)域中的應(yīng)用越來(lái)越多。目前已有的生物云平臺(tái)，分析模式都是用戶(hù)上傳數(shù)據(jù)，選擇相應(yīng)的軟件進(jìn)行分析，沒(méi)有將結(jié)題報(bào)告、原始數(shù)據(jù)和后續(xù)分析整合起來(lái)，導(dǎo)致用戶(hù)只能查看結(jié)果圖表，無(wú)法查看原始數(shù)據(jù)以及結(jié)題報(bào)告的過(guò)程中進(jìn)行相關(guān)的分析，導(dǎo)致工作效率降低。


【發(fā)明內(nèi)容】

[0005]為了解決現(xiàn)有技術(shù)中用戶(hù)不能在查看分析結(jié)果的同時(shí)查看原始數(shù)據(jù)以及結(jié)題報(bào)告的過(guò)程進(jìn)行相關(guān)分析導(dǎo)致工作效率降低的技術(shù)問(wèn)題，一方面，
[0006]本發(fā)明提供了一種基于生物云平臺(tái)的項(xiàng)目結(jié)題報(bào)告分析系統(tǒng)，包括:結(jié)題報(bào)告解析模塊、用戶(hù)界面模塊、結(jié)題報(bào)告呈現(xiàn)模塊、綜合分析模塊；
[0007]所述結(jié)題報(bào)告解析模塊用于對(duì)各個(gè)項(xiàng)目的結(jié)題報(bào)告進(jìn)行解析，并將解析結(jié)果以及原始數(shù)據(jù)按照預(yù)設(shè)格式整合封裝成相應(yīng)的項(xiàng)目文件；
[0008]所述結(jié)題報(bào)告呈現(xiàn)模塊用于查詢(xún)所有的項(xiàng)目文件并以列表形式展示，將某個(gè)項(xiàng)目按照預(yù)設(shè)樣式顯示；
[0009]所述用戶(hù)界面模塊用于獲取用戶(hù)請(qǐng)求，并將所述用戶(hù)請(qǐng)求發(fā)送給所述綜合分析模塊；
[0010]所述綜合分析模塊用于根據(jù)所述用戶(hù)請(qǐng)求生成分析任務(wù)，按照所述分析任務(wù)的指示進(jìn)行分析，并將分析結(jié)果發(fā)送給所述結(jié)題報(bào)告呈現(xiàn)模塊；
[0011]所述結(jié)題報(bào)告呈現(xiàn)模塊還用于從所述項(xiàng)目文件列表中查詢(xún)并讀取項(xiàng)目文件對(duì)應(yīng)的分析結(jié)果，并對(duì)所述項(xiàng)目文件以及相應(yīng)的分析結(jié)果進(jìn)行展示。
[0012]可選的，還包括:云端數(shù)據(jù)庫(kù)，用于接收并存儲(chǔ)所述結(jié)題報(bào)告解析模塊發(fā)送的項(xiàng)目文件。
[0013]可選的，所述項(xiàng)目文件中包括結(jié)題報(bào)告的文字內(nèi)容、結(jié)果圖表以及結(jié)果數(shù)據(jù)文件；
[0014]所述用戶(hù)請(qǐng)求中包括與選擇的項(xiàng)目文件分析過(guò)程相對(duì)應(yīng)的測(cè)序數(shù)據(jù)、所使用的分析軟件以及分析參數(shù)，且所述用戶(hù)請(qǐng)求是根據(jù)所述結(jié)題報(bào)告呈現(xiàn)模塊中的列表信息生成的。
[0015]可選的，所述綜合分析模塊包括分析軟件模塊和任務(wù)調(diào)度模塊；
[0016]所述分析軟件模塊用于對(duì)所述用戶(hù)請(qǐng)求進(jìn)行解析，根據(jù)解析得到結(jié)題報(bào)告ID、與所述結(jié)題報(bào)告相對(duì)應(yīng)的測(cè)序數(shù)據(jù)、分析軟件以及分析參數(shù)生成分析任務(wù)；
[0017]所述任務(wù)調(diào)度模塊根據(jù)所述分析任務(wù)中的分析軟件選擇相應(yīng)的分析軟件用于分析。
[0018]可選的，所述綜合分析軟件還包括分析軟件庫(kù)，用于存儲(chǔ)各種分析軟件，所述任務(wù)調(diào)度模塊在執(zhí)行所述分析任務(wù)過(guò)程中從所述分析軟件庫(kù)中選擇相應(yīng)的分析軟件。
[0019]可選的，所述用戶(hù)界面模塊為網(wǎng)頁(yè)WEB圖形化用戶(hù)界面模塊。
[0020]可選的，所述云端數(shù)據(jù)庫(kù)還用于存儲(chǔ)分析任務(wù)以及分析結(jié)果。
[0021]可選的，所述預(yù)設(shè)格式為SOAP格式，所述預(yù)設(shè)樣式為PLOS One文章樣式。
[0022]另一方面，
[0023]本發(fā)明還提供了基于生物云平臺(tái)的項(xiàng)目結(jié)題報(bào)告分析方法，包括:
[0024]對(duì)各個(gè)項(xiàng)目的結(jié)題報(bào)告進(jìn)行解析，并將解析結(jié)果以及原始數(shù)據(jù)按照預(yù)設(shè)格式整合封裝成相應(yīng)的項(xiàng)目文件；
[0025]查詢(xún)所有的項(xiàng)目文件并以列表形式展示，將某個(gè)項(xiàng)目按照預(yù)設(shè)樣式顯示；
[0026]獲取用戶(hù)請(qǐng)求，并按照所述用戶(hù)請(qǐng)求發(fā)送給所述綜合分析模塊；
[0027]根據(jù)所述用戶(hù)請(qǐng)求生成分析任務(wù)，按照所述分析任務(wù)的指示進(jìn)行分析，并按照預(yù)設(shè)樣式對(duì)所述項(xiàng)目文件以及相應(yīng)的分析結(jié)果進(jìn)行展示。
[0028]可選的，所述根據(jù)所述用戶(hù)請(qǐng)求生成分析任務(wù)，按照所述分析任務(wù)的指示進(jìn)行分析包括:
[0029]對(duì)所述用戶(hù)請(qǐng)求進(jìn)行解析，根據(jù)解析得到結(jié)題報(bào)告ID、與所述結(jié)題報(bào)告相對(duì)應(yīng)的測(cè)序數(shù)據(jù)、分析軟件以及分析參數(shù)生成分析任務(wù)；
[0030]根據(jù)所述分析任務(wù)中的分析軟件選擇相應(yīng)的分析軟件用于分析。
[0031]利用本發(fā)明提供的上述基于生物云平臺(tái)的項(xiàng)目結(jié)題報(bào)告分析系統(tǒng)和方法，通過(guò)將傳統(tǒng)結(jié)題報(bào)告的內(nèi)容(也就是項(xiàng)目文件)、原始數(shù)據(jù)和分析軟件集成到一個(gè)頁(yè)面中，可以讓用戶(hù)在查看結(jié)題報(bào)告的同時(shí)查看原始數(shù)據(jù)并進(jìn)行分析工作，提高工作效率。利用生物云平臺(tái)技術(shù)，還能夠降低生物信息分析的復(fù)雜度和使用門(mén)檻，用戶(hù)可以通過(guò)在圖形化界面上用鼠標(biāo)點(diǎn)擊就可以完成生物信息分析，操作簡(jiǎn)單方便。

【專(zhuān)利附圖】

【附圖說(shuō)明】
[0032]圖1為實(shí)施例一提供的基于生物云平臺(tái)的項(xiàng)目結(jié)題報(bào)告分析系統(tǒng)的組成結(jié)構(gòu)示意圖；
[0033]圖2為實(shí)施例一中結(jié)題報(bào)告解析模塊對(duì)結(jié)題報(bào)告進(jìn)行解析操作的示意圖；
[0034]圖3為實(shí)施例一中用戶(hù)界面模塊呈現(xiàn)的所有結(jié)題報(bào)告信息的示意圖；
[0035]圖4為實(shí)施例一中結(jié)題報(bào)告呈現(xiàn)模塊呈現(xiàn)的結(jié)題報(bào)告內(nèi)容的示意圖；
[0036]圖5為實(shí)施例一中結(jié)題報(bào)告呈現(xiàn)模塊呈現(xiàn)的分析結(jié)果的示意圖；
[0037]圖6為實(shí)施例一中結(jié)題報(bào)告呈現(xiàn)模塊呈現(xiàn)的原始數(shù)據(jù)的示意圖；
[0038]圖7為實(shí)施例一中結(jié)題報(bào)告呈現(xiàn)模塊呈現(xiàn)的原始數(shù)據(jù)可以進(jìn)行分析的示意圖；
[0039]圖8為實(shí)施例一中分析軟件模塊呈現(xiàn)的使用結(jié)題報(bào)告中原始數(shù)據(jù)提交分析任務(wù)的不意圖；
[0040]圖9為實(shí)施例一中結(jié)題報(bào)告解析模塊顯示分析結(jié)果的示意圖；
[0041]圖10為實(shí)施例二中提供的基于生物云平臺(tái)的項(xiàng)目結(jié)題報(bào)告分析方法的步驟流程圖。

【具體實(shí)施方式】
[0042]下面結(jié)合附圖和實(shí)施例，對(duì)本發(fā)明的【具體實(shí)施方式】作進(jìn)一步詳細(xì)描述。以下實(shí)施例用于說(shuō)明本發(fā)明，但不用來(lái)限制本發(fā)明的范圍。
[0043]實(shí)施例一
[0044]本實(shí)施例提供了一種基于生物云平臺(tái)的項(xiàng)目結(jié)題報(bào)告分析系統(tǒng)，組成示意圖如圖1所示，包括:結(jié)題報(bào)告解析模塊10、用戶(hù)界面模塊20、結(jié)題報(bào)告呈現(xiàn)模塊30、綜合分析模塊40 ；
[0045]結(jié)題報(bào)告解析模塊10用于對(duì)各個(gè)項(xiàng)目的結(jié)題報(bào)告進(jìn)行解析，并將解析結(jié)果以及原始數(shù)據(jù)按照預(yù)設(shè)格式整合封裝成相應(yīng)的項(xiàng)目文件；
[0046]結(jié)題報(bào)告呈現(xiàn)模塊30用于查詢(xún)所有的項(xiàng)目文件并以列表形式展示，將某個(gè)項(xiàng)目按照預(yù)設(shè)樣式顯示；
[0047]用戶(hù)界面模塊20用于獲取用戶(hù)請(qǐng)求，并將用戶(hù)請(qǐng)求發(fā)送給綜合分析模塊40 ；
[0048]綜合分析模塊40用于根據(jù)用戶(hù)請(qǐng)求生成分析任務(wù)，按照分析任務(wù)的指示進(jìn)行分析，并將分析結(jié)果發(fā)送給結(jié)題報(bào)告呈現(xiàn)模塊30 ；
[0049]結(jié)題報(bào)告呈現(xiàn)模塊30還用于從項(xiàng)目文件列表中查詢(xún)并讀取項(xiàng)目文件對(duì)應(yīng)的分析結(jié)果，并對(duì)項(xiàng)目文件以及相應(yīng)的分析結(jié)果進(jìn)行展示。
[0050]本實(shí)施例提供的系統(tǒng)用于解決用戶(hù)對(duì)于項(xiàng)目結(jié)題報(bào)告、原始數(shù)據(jù)的查看以及后續(xù)分析不方便的問(wèn)題，使用用戶(hù)界面將項(xiàng)目結(jié)題報(bào)告、原始數(shù)據(jù)和分析軟件結(jié)合到同一個(gè)頁(yè)面中，用戶(hù)可以在一個(gè)頁(yè)面中查看結(jié)題報(bào)告的內(nèi)容、原始數(shù)據(jù)的內(nèi)容，還可以選擇測(cè)序數(shù)據(jù)和分析軟件進(jìn)行個(gè)性化分析，得到的分析結(jié)果還可以參與后續(xù)的分析。
[0051]可選的，其中項(xiàng)目文件中包括結(jié)題報(bào)告的文字內(nèi)容、結(jié)果圖表以及結(jié)果數(shù)據(jù)文件；用戶(hù)請(qǐng)求中包括與選擇的項(xiàng)目文件分析過(guò)程相對(duì)應(yīng)的測(cè)序數(shù)據(jù)、所使用的分析軟件以及分析參數(shù)，且用戶(hù)請(qǐng)求是根據(jù)結(jié)題報(bào)告呈現(xiàn)模塊30中的列表信息生成的。
[0052]其中結(jié)題報(bào)告內(nèi)容的預(yù)設(shè)格式為SOAP (Simple Object Access Protocol,簡(jiǎn)單對(duì)象訪(fǎng)問(wèn)協(xié)議)格式。SOAP格式是一種輕量的、簡(jiǎn)單的、基于XML的協(xié)議，它被設(shè)計(jì)成在WEB上交換結(jié)構(gòu)化的和固化的信息。由于SOAP格式可以和現(xiàn)存的許多因特網(wǎng)協(xié)議和格式結(jié)合使用，包括 HTTP (Hypertext transfer protocol,超文本傳輸協(xié)議)，SMTP (SimpleMail Transfer Protocol,簡(jiǎn)單郵件傳輸協(xié)議)，MIME ((Multipurpose Internet MailExtens1ns,多用途網(wǎng)際郵件擴(kuò)充協(xié)議)，它還支持從消息系統(tǒng)到RPC(Remote ProcedureCall Protocol，遠(yuǎn)程過(guò)程調(diào)用)等大量的應(yīng)用程序，適用范圍比較廣泛。
[0053]結(jié)題報(bào)告呈現(xiàn)模塊30在顯示結(jié)題報(bào)告的內(nèi)容時(shí)按照預(yù)設(shè)樣式進(jìn)行顯示。其中顯示時(shí)所采用的預(yù)設(shè)樣式為PLOS One文章樣式，除此之外還可以是其它有關(guān)生物信息期刊的文章樣式。
[0054]可選的，本實(shí)施例的系統(tǒng)中還包括:云端數(shù)據(jù)庫(kù)50，用于接收并存儲(chǔ)結(jié)題報(bào)告解析模塊10發(fā)送的項(xiàng)目文件。另外，云端數(shù)據(jù)庫(kù)50還用于存儲(chǔ)分析任務(wù)以及分析結(jié)果。云端數(shù)據(jù)庫(kù)50中不僅存儲(chǔ)結(jié)題報(bào)告解析模塊提取出來(lái)的結(jié)題報(bào)告的內(nèi)容、分析任務(wù)、分析結(jié)果，使得后續(xù)結(jié)題報(bào)告呈現(xiàn)模塊能夠?qū)@些數(shù)據(jù)同時(shí)進(jìn)行顯示，保證用戶(hù)在查看結(jié)題報(bào)告的同時(shí)能夠?qū)υ紨?shù)據(jù)(即結(jié)題報(bào)告的內(nèi)容)以及分析任務(wù)進(jìn)行顯示，同時(shí)還能在查看原始數(shù)據(jù)的同時(shí)進(jìn)行分析工作，這樣可以提高工作效率。
[0055]可選的，綜合分析模塊40包括分析軟件模塊41和任務(wù)調(diào)度模塊42，具體的，分析軟件模塊41用于對(duì)用戶(hù)請(qǐng)求進(jìn)行解析，根據(jù)解析得到結(jié)題報(bào)告ID、與結(jié)題報(bào)告相對(duì)應(yīng)的測(cè)序數(shù)據(jù)、分析軟件以及分析參數(shù)生成分析任務(wù)；任務(wù)調(diào)度模塊42根據(jù)分析任務(wù)中的分析軟件選擇相應(yīng)的分析軟件用于分析。其中的分析任務(wù)是利用結(jié)題報(bào)告中的相關(guān)數(shù)據(jù)同時(shí)從分析軟件庫(kù)中選擇相應(yīng)的軟件進(jìn)行分析的任務(wù)。因此，綜合分析軟件還包括分析軟件庫(kù)43，用于存儲(chǔ)各種分析軟件，任務(wù)調(diào)度模塊42在執(zhí)行分析任務(wù)過(guò)程中從分析軟件庫(kù)43中選擇相應(yīng)的分析軟件。其中結(jié)題報(bào)告中的相關(guān)數(shù)據(jù)具體為結(jié)題報(bào)告的內(nèi)容、結(jié)果圖表和結(jié)果數(shù)據(jù)文件。
[0056]上述分析任務(wù)完成后，通過(guò)結(jié)題報(bào)告呈現(xiàn)模塊對(duì)分析結(jié)果進(jìn)行展示，并且將分析結(jié)果顯示在結(jié)題報(bào)告中相關(guān)數(shù)據(jù)的下方，用戶(hù)可以查看、下載以及進(jìn)行其他的分析。
[0057]可選的，用戶(hù)界面模塊20為網(wǎng)頁(yè)WEB圖形化用戶(hù)界面模塊，利用圖形化的用戶(hù)界面可以方便用戶(hù)操作。
[0058]以下以具體方案為例進(jìn)行說(shuō)明:
[0059]利用結(jié)題報(bào)告解析模塊將項(xiàng)目的結(jié)果、原始數(shù)據(jù)等信息按照預(yù)設(shè)格式整合后存入云端數(shù)據(jù)庫(kù)中，如圖2所示。用戶(hù)在WEB圖形化界面上選擇需要查看的結(jié)題報(bào)告，點(diǎn)擊之后，WEB圖形化用戶(hù)界面模塊將用戶(hù)選擇的結(jié)題報(bào)告ID發(fā)送至結(jié)題報(bào)告呈現(xiàn)模塊。用戶(hù)登錄生物云平臺(tái)后，WEB圖形界面模塊從云端數(shù)據(jù)庫(kù)中查詢(xún)出用戶(hù)的所有項(xiàng)目并以列表的形式展現(xiàn)給用戶(hù)，如圖3所示。用戶(hù)選擇某個(gè)結(jié)題報(bào)告查看后，結(jié)題報(bào)告呈現(xiàn)模塊將該項(xiàng)目文件的信息從數(shù)據(jù)庫(kù)中查詢(xún)出來(lái)后按照預(yù)設(shè)樣式進(jìn)行顯示，如圖4所示。用戶(hù)可以在頁(yè)面上查看結(jié)題報(bào)告的內(nèi)容和分析結(jié)果，如圖5所示，也可以查看結(jié)題報(bào)告所涉及的原始數(shù)據(jù)的內(nèi)容，如圖6所示。如果要對(duì)某個(gè)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行進(jìn)一步的分析，可以選擇該原始數(shù)據(jù)旁邊可以使用的分析軟件，如圖7所示。點(diǎn)擊分析軟件后進(jìn)入分析軟件模塊，可以提交分析任務(wù)，如圖8所示。分析任務(wù)完成后，可以查看分析結(jié)果，如圖9所示。
[0060]利用本實(shí)施例提供的基于生物云平臺(tái)的項(xiàng)目結(jié)題報(bào)告分析系統(tǒng)，通過(guò)將傳統(tǒng)結(jié)題報(bào)告的內(nèi)容(也就是項(xiàng)目文件)、原始數(shù)據(jù)和分析軟件集成到一個(gè)頁(yè)面中，可以讓用戶(hù)在查看結(jié)題報(bào)告的同時(shí)查看原始數(shù)據(jù)并進(jìn)行分析工作，提高工作效率。利用生物云平臺(tái)技術(shù)，還能夠降低生物信息分析的復(fù)雜度和使用門(mén)檻，用戶(hù)可以通過(guò)在圖形化界面上用鼠標(biāo)點(diǎn)擊就可以完成生物信息分析，操作簡(jiǎn)單方便。
[0061]實(shí)施例二
[0062]本實(shí)施例中提供了基于生物云平臺(tái)的項(xiàng)目結(jié)題報(bào)告分析方法，步驟流程圖如圖10所示，包括以下步驟:
[0063]步驟S1、對(duì)各個(gè)項(xiàng)目的結(jié)題報(bào)告進(jìn)行解析，并將解析結(jié)果以及原始數(shù)據(jù)按照預(yù)設(shè)格式整合封裝成相應(yīng)的項(xiàng)目文件。
[0064]步驟S2、查詢(xún)所有的項(xiàng)目文件并以列表形式展示，將某個(gè)項(xiàng)目按照預(yù)設(shè)樣式顯示。
[0065]步驟S3、獲取用戶(hù)請(qǐng)求，并按照用戶(hù)請(qǐng)求發(fā)送給綜合分析模塊。
[0066]步驟S4、根據(jù)用戶(hù)請(qǐng)求生成分析任務(wù)，按照分析任務(wù)的指示進(jìn)行分析，并按照預(yù)設(shè)樣式對(duì)項(xiàng)目文件以及相應(yīng)的分析結(jié)果進(jìn)行展示。
[0067]可選的，本實(shí)施例步驟S4中根據(jù)用戶(hù)請(qǐng)求生成分析任務(wù)，按照分析任務(wù)的指示進(jìn)行分析，包括:
[0068]對(duì)用戶(hù)請(qǐng)求進(jìn)行解析，根據(jù)解析得到結(jié)題報(bào)告ID、與結(jié)題報(bào)告相對(duì)應(yīng)的測(cè)序數(shù)據(jù)、分析軟件以及分析參數(shù)生成分析任務(wù)；
[0069]根據(jù)分析任務(wù)中的分析軟件選擇相應(yīng)的分析軟件用于分析。
[0070]利用本實(shí)施例提供的方法能夠?qū)崿F(xiàn)與實(shí)施例一相同的技術(shù)效果，此處不再贅述。
[0071]以上實(shí)施方式僅用于說(shuō)明本發(fā)明，而并非對(duì)本發(fā)明的限制，有關(guān)【技術(shù)領(lǐng)域】的普通技術(shù)人員，在不脫離本發(fā)明的精神和范圍的情況下，還可以做出各種變化和變型，因此所有等同的技術(shù)方案也屬于本發(fā)明的范疇，本發(fā)明的專(zhuān)利保護(hù)范圍應(yīng)由權(quán)利要求限定。
【權(quán)利要求】
1.一種基于生物云平臺(tái)的項(xiàng)目結(jié)題報(bào)告分析系統(tǒng)，其特征在于，包括:結(jié)題報(bào)告解析模塊、用戶(hù)界面模塊、結(jié)題報(bào)告呈現(xiàn)模塊、綜合分析模塊； 所述結(jié)題報(bào)告解析模塊用于對(duì)各個(gè)項(xiàng)目的結(jié)題報(bào)告進(jìn)行解析，并將解析結(jié)果以及原始數(shù)據(jù)按照預(yù)設(shè)格式整合封裝成相應(yīng)的項(xiàng)目文件； 所述結(jié)題報(bào)告呈現(xiàn)模塊用于查詢(xún)所有的項(xiàng)目文件并以列表形式展示，將某個(gè)項(xiàng)目按照預(yù)設(shè)樣式顯示； 所述用戶(hù)界面模塊用于獲取用戶(hù)請(qǐng)求，并將所述用戶(hù)請(qǐng)求發(fā)送給所述綜合分析模塊；所述綜合分析模塊用于根據(jù)所述用戶(hù)請(qǐng)求生成分析任務(wù)，按照所述分析任務(wù)的指示進(jìn)行分析，并將分析結(jié)果發(fā)送給所述結(jié)題報(bào)告呈現(xiàn)模塊； 所述結(jié)題報(bào)告呈現(xiàn)模塊還用于從所述項(xiàng)目文件列表中查詢(xún)并讀取項(xiàng)目文件對(duì)應(yīng)的分析結(jié)果，并對(duì)所述項(xiàng)目文件以及相應(yīng)的分析結(jié)果進(jìn)行展示。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，其特征在于，還包括:云端數(shù)據(jù)庫(kù)，用于接收并存儲(chǔ)所述結(jié)題報(bào)告解析模塊發(fā)送的項(xiàng)目文件。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述項(xiàng)目文件中包括結(jié)題報(bào)告的文字內(nèi)容、結(jié)果圖表以及結(jié)果數(shù)據(jù)文件； 所述用戶(hù)請(qǐng)求中包括與選擇的項(xiàng)目文件分析過(guò)程相對(duì)應(yīng)的測(cè)序數(shù)據(jù)、所使用的分析軟件以及分析參數(shù)，且所述用戶(hù)請(qǐng)求是根據(jù)所述結(jié)題報(bào)告呈現(xiàn)模塊中的列表信息生成的。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述綜合分析模塊包括分析軟件模塊和任務(wù)調(diào)度模塊； 所述分析軟件模塊用于對(duì)所述用戶(hù)請(qǐng)求進(jìn)行解析，根據(jù)解析得到結(jié)題報(bào)告ID、與所述結(jié)題報(bào)告相對(duì)應(yīng)的測(cè)序數(shù)據(jù)、分析軟件以及分析參數(shù)生成分析任務(wù)； 所述任務(wù)調(diào)度模塊根據(jù)所述分析任務(wù)中的分析軟件選擇相應(yīng)的分析軟件用于分析。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述綜合分析軟件還包括分析軟件庫(kù)，用于存儲(chǔ)各種分析軟件，所述任務(wù)調(diào)度模塊在執(zhí)行所述分析任務(wù)過(guò)程中從所述分析軟件庫(kù)中選擇相應(yīng)的分析軟件。
6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述用戶(hù)界面模塊為網(wǎng)頁(yè)WEB圖形化用戶(hù)界面模塊。
7.根據(jù)權(quán)利要求2所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述云端數(shù)據(jù)庫(kù)還用于存儲(chǔ)分析任務(wù)以及分析結(jié)果。
8.根據(jù)權(quán)利要求1所述的系統(tǒng)，其特征在于，所述預(yù)設(shè)格式為SOAP格式，所述預(yù)設(shè)樣式為PLOS One文章樣式。
9.基于生物云平臺(tái)的項(xiàng)目結(jié)題報(bào)告分析方法，其特征在于，包括: 對(duì)各個(gè)項(xiàng)目的結(jié)題報(bào)告進(jìn)行解析，并將解析結(jié)果以及原始數(shù)據(jù)按照預(yù)設(shè)格式整合封裝成相應(yīng)的項(xiàng)目文件； 查詢(xún)所有的項(xiàng)目文件并以列表形式展示，將某個(gè)項(xiàng)目按照預(yù)設(shè)樣式顯示； 獲取用戶(hù)請(qǐng)求，并按照所述用戶(hù)請(qǐng)求發(fā)送給所述綜合分析模塊； 根據(jù)所述用戶(hù)請(qǐng)求生成分析任務(wù)，按照所述分析任務(wù)的指示進(jìn)行分析，并按照預(yù)設(shè)樣式對(duì)所述項(xiàng)目文件以及相應(yīng)的分析結(jié)果進(jìn)行展示。
10.根據(jù)權(quán)利要求9所述的方法，其特征在于，所述根據(jù)所述用戶(hù)請(qǐng)求生成分析任務(wù)，按照所述分析任務(wù)的指示進(jìn)行分析包括: 對(duì)所述用戶(hù)請(qǐng)求進(jìn)行解析，根據(jù)解析得到結(jié)題報(bào)告ID、與所述結(jié)題報(bào)告相對(duì)應(yīng)的測(cè)序數(shù)據(jù)、分析軟件以及分析參數(shù)生成分析任務(wù)； 根據(jù)所述分析任務(wù)中的分析軟件選擇相應(yīng)的分析軟件用于分析。
【文檔編號(hào)】G06F19/10GK104331640SQ201410555641
【公開(kāi)日】2015年2月4日 申請(qǐng)日期:2014年10月17日 優(yōu)先權(quán)日:2014年10月17日
【發(fā)明者】鄭洪坤, 劉戈, 劉敏 申請(qǐng)人:北京百邁客生物科技有限公司