本發(fā)明屬于土壤微生物群落結(jié)構(gòu)檢測(cè)技術(shù)領(lǐng)域,具體涉及一種土壤厭氧氨氧化微生物群落結(jié)構(gòu)的檢測(cè)方法,特別是一種利用13C-PLFA測(cè)定土壤厭氧氨氧化微生物群落結(jié)構(gòu)的方法。
背景技術(shù):
厭氧氨氧化作用(ANAMMOX-Anaerobic ammonium oxidation)是指在厭氧條件下,微生物以NO2-為電子受體,NH4+為電子供體,將NH4+、NO2-轉(zhuǎn)變?yōu)榈獨(dú)獾纳^(guò)程。1977年Broda從化學(xué)熱力學(xué)出發(fā),計(jì)算其與生物的進(jìn)化關(guān)系時(shí),大膽預(yù)言了Anammox過(guò)程的存在。第一個(gè)被命名的厭氧氨氧化的菌株是從一個(gè)生物反應(yīng)器的實(shí)驗(yàn)室富集培養(yǎng)菌株中利用物理方法珀可梯度離心法分離得到的。隨后Vande Graaf等人證實(shí)了厭氧氨氧化過(guò)程的存在。在這一過(guò)程中起作用的厭氧氨氧化細(xì)菌對(duì)氧極度敏感、生長(zhǎng)非常緩慢,并且在較高細(xì)菌濃度條件下才表現(xiàn)出厭氧氨氧化活性,因此用傳統(tǒng)的微生物分離、純化培養(yǎng)方法研究厭氧氨氧化菌非常困難。但隨著現(xiàn)代技術(shù)的發(fā)展,有許多新方法被引入到土壤微生物分析中。在分析環(huán)境樣品中厭氧氨氧化菌群落組成時(shí),常常采用克隆、測(cè)序構(gòu)建16S rDNA克隆文庫(kù)的方法。該方法避免了對(duì)厭氧氨氧化菌純培養(yǎng)的要求,但是構(gòu)建克隆文庫(kù)工作量大,費(fèi)用高,不能實(shí)現(xiàn)厭氧氨氧化菌群落結(jié)構(gòu)的快速分析。
克隆和DGGE是研究微生物群落結(jié)構(gòu)常用的方法,但這兩種方法均僅能體現(xiàn)群落結(jié)構(gòu)之間的相似性與差異性,若想確切分析各微生物含量,則需結(jié)合其他技術(shù)。磷脂脂肪酸(PLFA)是微生物細(xì)胞膜的主要成分,因微生物不同其PLFA組成與結(jié)構(gòu)各異,不同的磷脂脂肪酸指示不同的微生物,因此將PLFA與穩(wěn)定同位素標(biāo)記相結(jié)合并通過(guò)特定的厭氧氨氧化培養(yǎng)過(guò)程中,則可以更好地分析厭氧氨氧化過(guò)程中參與代謝的各土壤微生物含量,經(jīng)分析后可知厭氧氨氧化微生物的群落結(jié)構(gòu)。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明要解決的技術(shù)問(wèn)題是提供一種土壤厭氧氨氧化微生物群落結(jié)構(gòu)檢測(cè)方法;本發(fā)明將13C標(biāo)記的尿素與PLFA結(jié)合并進(jìn)行厭氧培養(yǎng)來(lái)分析土壤厭氧氨氧化菌群落結(jié)構(gòu)的方法,該方法不僅對(duì)試驗(yàn)條件要求低、穩(wěn)定性好,并且靈敏性高、定量準(zhǔn)確性強(qiáng),能精確地檢測(cè)出在厭氧氨氧化過(guò)程中具有活性、參與反應(yīng)的微生物的群落結(jié)構(gòu)。
為了解決上述技術(shù)問(wèn)題,本發(fā)明提供一種土壤厭氧氨氧化微生物群落結(jié)構(gòu)檢測(cè)方法,包括以下步驟:
設(shè)置6個(gè)容器,每個(gè)容器分別依次進(jìn)行如下的步驟1)~步驟4):
1)、在容器中裝入待測(cè)土壤和13C-尿素溶液,均勻攪拌,從而使土壤中13C-尿素-N的濃度達(dá)到200mg/kg;
備注說(shuō)明:13C-尿素進(jìn)入土壤后在土壤脲酶的作用下水解為銨和13CO2,為厭氧氨氧化提供了無(wú)機(jī)能源,厭氧氨氧化菌為化能自養(yǎng)型直接利用了13CO2,通過(guò)13C-PLFAs檢測(cè)土壤厭氧氨氧化的群落結(jié)構(gòu);
2)、向步驟1)所得的土壤中加入KNO3溶液,均勻攪拌,從而使土壤中NO3--N濃度達(dá)200mg/kg;
3)、向步驟2)所得的土壤中加水(迅速加水)調(diào)至泥漿態(tài),并封閉容器;
4)、用惰性氣體替換掉容器中的空氣,然后放入?yún)捬跖囵B(yǎng)箱進(jìn)行厭氧30±1℃培養(yǎng);
5)、將步驟4)所得的6個(gè)容器分別培養(yǎng)1~2h,1d,3d,7d,10d,直至NO3--N、NH4+-N值穩(wěn)定的那天;
對(duì)6個(gè)培養(yǎng)階段對(duì)應(yīng)的容器分別進(jìn)行內(nèi)容:
取土(例如5g),使用SKALAR連續(xù)流動(dòng)分析儀測(cè)定土壤NO3--N和NH4+-N含量;
例如,具體可為:將SKALAR連續(xù)流動(dòng)分析儀中氮?dú)馄块_(kāi)氮?dú)庵?.2MPa,松開(kāi)流量計(jì)值45單位,開(kāi)加熱器,并打開(kāi)主機(jī)99℃的加熱器,使用SKALAR連續(xù)流動(dòng)分析儀測(cè)定土壤NO3--N和NH4+-N含量;
備注說(shuō)明:容器中剩余的土壤可直接進(jìn)行下述步驟,如果不是及時(shí)進(jìn)行下述步驟,也可暫時(shí)放入-18℃保存;
6)、根據(jù)NO3--N,NH4+-N的含量變化速率,選取變化速率最高的培養(yǎng)階段所對(duì)應(yīng)的容器中的土壤,提取其中的PLFA(磷脂脂肪酸);
變化速率最高的培養(yǎng)階段的判斷規(guī)則為:6個(gè)培養(yǎng)階段的土壤在相同培養(yǎng)時(shí)間(單位培養(yǎng)時(shí)間)內(nèi)NO3--N,NH4+-N的濃度下降值最高的培養(yǎng)階段為變化速率最高的培養(yǎng)階段,若NO3--N,NH4+-N的變化速率不一致,則取二者變化速率的均值最大的為變化速率最高的培養(yǎng)階段;
備注說(shuō)明:上述單位培養(yǎng)時(shí)間內(nèi)NO3--N,NH4+-N的濃度下降值可依據(jù)常規(guī)的利用Origin擬合曲線后,據(jù)Origin中Analysis-Mathematics-Differentiate的方法,即能輕易檢測(cè)獲得;
7)、通過(guò)氣相色譜-燃燒-同位素比率質(zhì)譜聯(lián)用法(GC-c-IRMS)測(cè)定提取出的PLFA中13C的豐度D13C,13C的豐度即13C標(biāo)記的磷脂脂肪酸的豐度。
備注說(shuō)明:13C標(biāo)記的磷脂脂肪酸可以指示參與厭氧氨氧化過(guò)程的微生物,即可知厭氧氨氧化微生物的豐度,進(jìn)而分析得出群落結(jié)構(gòu),所以可以根據(jù)13C的豐度得出土壤厭氧氨氧化微生物的群落結(jié)構(gòu)。
作為本發(fā)明的土壤厭氧氨氧化微生物群落結(jié)構(gòu)檢測(cè)方法的改進(jìn):
所述步驟1)中,每個(gè)容器中加入30g新鮮的待測(cè)土壤和1.2mL濃度為5g/L的13C-尿素溶液;
所述步驟2)中,每個(gè)容器中加入1.2mL濃度為5g/L的KNO3溶液。
作為本發(fā)明的土壤厭氧氨氧化微生物群落結(jié)構(gòu)檢測(cè)方法的進(jìn)一步改進(jìn):
所述步驟6)中提取PLFA的方法(采用修進(jìn)后的布萊和戴爾方法,布萊和戴爾方法僅應(yīng)用于于食品,且只能確定總脂類含量,修進(jìn)后的方法提取和分離出了磷脂脂肪酸來(lái)確定土壤微生物結(jié)構(gòu))包括以下步驟:
在土壤(或凍干土壤)加入氯仿:甲醇:檸檬酸檸檬酸鈉緩沖液(0.15M,ph4.0)(1:2:0.8v/v/v)進(jìn)行提取;
將提取物(即,提取液)轉(zhuǎn)移至硅膠固相萃取柱后分別用氯仿和丙酮洗去中心脂和糖脂后,用甲醇將磷脂洗脫;洗脫后的磷脂添加內(nèi)標(biāo)十九烷酸甲酯(C19:0)后,通過(guò)溫和堿性甲基化方法將脂肪酸甲基化為相應(yīng)的脂肪酸甲酯(FAMES)。溫和堿性甲基化方法,即,在含有磷脂的試管中加入1mL的甲醇甲苯混合液(甲醇:甲苯=1:1)和1mL 0.2M的KOH甲醇溶液,放入37℃的水浴鍋中加熱進(jìn)行甲酯化后,加入2mL水、0.3mL冰醋酸,再用正己烷氯仿混合液(兩次,每次2mL,正己烷:氯仿=4:1)萃取磷脂脂肪酸甲酯,并用氮?dú)獯蹈傻玫街舅峒柞ァ?/p>
備注說(shuō)明:脂肪酸甲酯(FAMES)與PLFA(磷脂脂肪酸)的關(guān)系為甲醇分解磷脂脂肪酸得脂肪酸甲酯,因此,在獲知脂肪酸甲酯的量的前提下能輕易獲得PLFA(磷脂脂肪酸)的量。
作為本發(fā)明的土壤厭氧氨氧化微生物群落結(jié)構(gòu)檢測(cè)方法的進(jìn)一步改進(jìn):
所述步驟7)為:
利用步驟6)所得脂肪酸甲酯經(jīng)氣相色譜(GC)分離,具體為:首先打開(kāi)氮?dú)鈿馄康目傞y,調(diào)節(jié)壓力至0.5MPa,打開(kāi)空氣發(fā)生器、氫氣發(fā)生器電源,向氣瓶供氣;打開(kāi)流量控制器機(jī)殼,調(diào)節(jié)壓力與流量,調(diào)節(jié)氫氣與空氣的壓力為50KPa,載氣壓力為70KPA,總氣壓為300KPa,調(diào)節(jié)尾吹至30ml/min后進(jìn)樣;分離之后由相連接的火陷離子檢測(cè)器(FID)檢測(cè)(儀器為美國(guó)Agilent公司,系統(tǒng)中存有美國(guó)MIDI公式的磷脂脂肪酸數(shù)據(jù)庫(kù)),以此進(jìn)行脂肪酸的定量;單個(gè)PLFA的13C/12C由氣相色譜-燃燒法-穩(wěn)定同位素比質(zhì)譜儀(GC-C-IRMS)進(jìn)行測(cè)定,其中Delta V同位素比質(zhì)儀連有TraceGCUltra氣相色譜、GC Combustion III(所有設(shè)備為德國(guó)Thermo Finnigan公司);
PLFA單體的量按照公式(1)進(jìn)行計(jì)算:
Mi=dilution×(PFAME×ng Std)/(PISTD×W) (1)
(1)式中,Mi為單個(gè)磷脂脂肪酸(PLFA)的量(以干土計(jì)),單位為μg/g;PFAME為樣品峰面積;PISTD為內(nèi)標(biāo)(methyl ester C19:0,6.2ng/μL)峰面積;PFAME及PISTD由由氣相色譜儀獲得;ng Std為內(nèi)標(biāo)的濃度(6.2ng/μL);dilution為稀釋倍數(shù);W為烘干土干重(以干土計(jì)),3g。
各個(gè)脂肪酸中C來(lái)源于尿素-C的量(Pi,μg/g)用公式(2)進(jìn)行計(jì)算:
Pi=Mi*(δ13Cc-δ13Ccontrol)/(δ13CM-δ13Ccontrol) (2)
其中,Mi是單個(gè)PLFA的濃度,由公式(1)算得,δ13Cc和δ13Ccontrol是標(biāo)記前和標(biāo)記后單個(gè)脂肪酸的δ13C,δ13CM是添加尿素的δ13C,由同位素比質(zhì)儀得。
各土壤中PLFA總的13C富集比例(pt)即13C的豐度D13C用下式(3)進(jìn)行計(jì)算:
pt=∑Pi/∑Mi (3)
其中Mi是單個(gè)脂肪酸中C的含量(μg/kg)。
作為本發(fā)明的土壤厭氧氨氧化微生物群落結(jié)構(gòu)檢測(cè)方法的進(jìn)一步改進(jìn):所述步驟1)中,容器為100mL的玻璃螺口培養(yǎng)瓶,用軟橡膠塞加塞實(shí)現(xiàn)密封。該玻璃螺口培養(yǎng)瓶例如為:底部直徑約4.5cm,口徑約1.3cm,甁身高約9.5cm。
作為本發(fā)明的土壤厭氧氨氧化微生物群落結(jié)構(gòu)檢測(cè)方法的進(jìn)一步改進(jìn):所述步驟3)中,每30g土壤加水5~7ml(較佳為6mL)。
本發(fā)明明確了土壤厭氧氨氧化微生物群落結(jié)構(gòu)的檢測(cè)方法,同時(shí)也可以作為底泥、污泥反應(yīng)器、濕地等環(huán)境中厭氧氨氧化微生物群落結(jié)構(gòu)檢測(cè)的參考。
附圖說(shuō)明
下面結(jié)合附圖對(duì)本發(fā)明的具體實(shí)施方式作進(jìn)一步詳細(xì)說(shuō)明。
圖1是菜園土NO3--N,NH4+-N趨勢(shì)圖;
圖2是菜園土13C–PLFA圖譜;
圖3是無(wú)機(jī)肥處理水稻土NO3--N,NH4+-N趨勢(shì)圖;
圖4是無(wú)機(jī)肥處理水稻土13C–PLFA圖譜;
圖5是有機(jī)無(wú)機(jī)配施處理水稻土NO3--N,NH4+-N趨勢(shì)圖;
圖6是有機(jī)無(wú)機(jī)配施處理水稻土13C-PLFA圖譜;
具體實(shí)施方式
下面結(jié)合具體實(shí)施例對(duì)本發(fā)明進(jìn)行進(jìn)一步描述,但本發(fā)明的保護(hù)范圍并不僅限于此:
下面實(shí)例將進(jìn)一步說(shuō)明本發(fā)明方法的可行性和應(yīng)用效果。
實(shí)施例1、菜園土中土壤厭氧氨氧化微生物群落結(jié)構(gòu)的檢測(cè)方法,依次進(jìn)行以下步驟:
準(zhǔn)備6個(gè)100mL培養(yǎng)瓶,每個(gè)培養(yǎng)瓶分別進(jìn)行如下的步驟1)~步驟4):
1)、在每個(gè)培養(yǎng)瓶加入30g新鮮的待測(cè)土壤,吸取鮮配的1.2mL濃度為5g/L的13C-尿素溶液均勻?yàn)⒂诿總€(gè)培養(yǎng)瓶的土壤中并迅速攪拌混勻,使土壤中13C-尿素-N的濃度達(dá)到約200mg/kg;
2)、吸取1.2mL濃度為5g/L的KNO3溶液均勻?yàn)⒂诓襟E1)所得的培養(yǎng)瓶土壤中,并攪拌混勻使NO3--N濃度約達(dá)200mg/kg;
3)、迅速加水6ml調(diào)至泥漿態(tài)并加橡皮塞封閉100mL培養(yǎng)瓶;
4)、用注射器向培養(yǎng)瓶?jī)?nèi)充惰性氣體He趕走空氣,放入?yún)捬跖囵B(yǎng)箱進(jìn)行厭氧30℃培養(yǎng)。
5)、將步驟4)所得的6個(gè)容器分別培養(yǎng)1~2h,1d,3d,7d,10d,直至NO3--N,NH4+-N值穩(wěn)定的那天(約14天);
對(duì)6個(gè)培養(yǎng)階段對(duì)應(yīng)的容器分別進(jìn)行內(nèi)容:
破壞性取土,每個(gè)培養(yǎng)瓶各取5g土,于150ml震蕩瓶中,加50ml 1mol/L KCl浸提液在20℃,180r/s震蕩1小時(shí),過(guò)濾上機(jī)測(cè)定,將SKALAR連續(xù)流動(dòng)分析儀中氮?dú)馄块_(kāi)氮?dú)庵?.2Mpa,松開(kāi)流量計(jì)值45單位,開(kāi)加熱器,并打開(kāi)主機(jī)99℃的加熱器,使用SKALAR連續(xù)流動(dòng)分析儀測(cè)定NO3--N,NH4+-N,每個(gè)培養(yǎng)瓶中剩余的土壤(25g)可放入-18℃冰箱保存(也可即可直接進(jìn)行后續(xù)步驟)。
測(cè)得NO3--N,NH4+-N濃度結(jié)果如圖1所示,將該結(jié)果依據(jù)常規(guī)的在利用Origin擬合曲線后,據(jù)Origin中Analysis-Mathematics-Differentiate的方法進(jìn)行運(yùn)算,NO3--N,NH4+-N濃度下降速率均最快的前兩天為培養(yǎng)后第7天及第14天。
6)、取-18℃冰箱保存的培養(yǎng)后7天及14天的土壤用修進(jìn)的布萊和戴爾方法提取PLFA。向3.0g(凍干土壤樣本)中加入15.2ml的氯仿:甲醇:檸檬酸檸檬酸鈉緩沖液(0.15M,ph4.0)(1:2:0.8v/v/v)進(jìn)行提取(250rpm、室溫、提取2h),在提取所得的殘?jiān)屑尤?.6ml的氯仿:甲醇:檸檬酸檸檬酸鈉緩沖液(0.15M,ph4.0)(1:2:0.8v/v/v)進(jìn)行再次的提取(提取工藝參數(shù)同上);將2次提取所得的提取液進(jìn)行合并,作為提取物。
將提取物轉(zhuǎn)氮?dú)獯蹈珊?,用甲醇溶?體積用量為1ml*2次)繼而氮?dú)獯蹈珊?,用氯?體積用量為0.5ml*3次)溶解移至硅膠固相萃取柱后(內(nèi)裝C18型號(hào)/規(guī)格的硅膠500mg)分別用氯仿(10ml,流速為0.3m/min)和丙酮(10ml,流速為0.3m/min)洗去中心脂和糖脂后,用甲醇(8ml,流速為0.3m/min)將磷脂洗脫;收集磷脂洗脫液。
洗脫后的磷脂(即,磷脂洗脫液)氮?dú)獯蹈珊筇砑?00μl的內(nèi)標(biāo)十九烷酸甲酯(19:0,6.2ng/μL)后氮?dú)獯蹈?,從而形成含有磷脂的試管。通過(guò)溫和堿性甲基化方法將脂肪酸甲基化為相應(yīng)的脂肪酸甲酯(FAMES)。溫和堿性甲基化方法即,在上述含有磷脂的試管中加入1mL的甲醇甲苯混合液(甲醇:甲苯=1:1)和1mL 0.2M的KOH甲醇溶液,放入37℃的水浴鍋中加熱進(jìn)行甲酯化后,加入2mL水、0.3mL冰醋酸,再用正己烷氯仿混合液(兩次,每次2mL,正己烷:氯仿=4:1)萃取磷脂脂肪酸甲酯,并用氮?dú)獯蹈傻玫街舅峒状住?/p>
7)、利用步驟6)所得脂肪酸甲酯經(jīng)氣相色譜(GC)分離,首先打開(kāi)氮?dú)鈿馄康目傞y,調(diào)節(jié)壓力至0.5MPa,打開(kāi)空氣發(fā)生器、氫氣發(fā)生器電源,向氣瓶供氣;打開(kāi)流量控制器機(jī)殼,調(diào)節(jié)壓力與流量,調(diào)節(jié)氫氣與空氣的壓力為50KPa,載氣壓力為70KPA,總氣壓為300KPa,調(diào)節(jié)尾吹至30ml/min后進(jìn)樣,分離之后由相連接的火陷離子檢測(cè)器(FID)檢測(cè)(儀器為美國(guó)Agilent公司,系統(tǒng)中存有美國(guó)MIDI公式的磷脂脂肪酸數(shù)據(jù)庫(kù)),以此進(jìn)行脂肪酸的定量。單個(gè)PLFA的13C/12C由氣相色譜-燃燒法-穩(wěn)定同位素比質(zhì)譜儀(GC-C-IRMS)進(jìn)行測(cè)定,其中Delta V同位素比質(zhì)儀連有TraceGCUltra氣相色譜、GC Combustion III(所有設(shè)備為德國(guó)Thermo Finnigan公司);
PLFA單體的量按照公式(1)進(jìn)行計(jì)算:
Mi=dilution*(PFAME*ng Std)/(PISTD*W) (1)
(1)式中,Mi為單個(gè)磷脂脂肪酸(PLFA)的量(以干土計(jì)),單位為μg/g;PFAME為樣品峰面積;PISTD為內(nèi)標(biāo)(methyl ester C19:0,6.2ng/μL)峰面積;PFAME及PISTD由由氣相色譜儀獲得;ng Std為內(nèi)標(biāo)的濃度(6.2ng/μL);dilution為稀釋倍數(shù);W為烘干土干重(以干土計(jì)),3g。
各個(gè)脂肪酸中C來(lái)源于尿素-C的量(Pi,μg/g)用公式(2)進(jìn)行計(jì)算:
Pi=Mi*(δ13Cc-δ13Ccontrol)*100/(δ13CM-δ13Ccontrol) (2)
其中,Mi是單個(gè)PLFA的濃度,由公式(1)算得,δ13Cc和δ13Ccontrol是標(biāo)記前和標(biāo)記后單個(gè)脂肪酸的δ13C,δ13CM是添加尿素的δ13C,由同位素比質(zhì)儀得。
各土壤中PLFA總的13C富集比例(pt)即13C的豐度(D13C)用下式(3)進(jìn)行計(jì)算:
pt=∑Pi/∑Mi*100 (3)
具體實(shí)驗(yàn)如下:
實(shí)驗(yàn):供試土壤采自浙江省余杭麻車頭村;
所得數(shù)據(jù)以14d的15:0iso為例:
PFAME=6.651,PISTD=18.105,ng Std=6.2,W=3,所以Mi=0.759205;
δ13Cc=1.279,δ13Ccontrol=1.074,δ13CM=99,所以Pi=0.208;
∑Pi=1.170,∑Mi=66.242,pt=1.766。
因數(shù)據(jù)量較大,不一一贅述。
共測(cè)得20種磷脂脂肪酸,經(jīng)計(jì)算得出各磷脂脂肪酸的13C富集比例(pt)如圖2所示,橫坐標(biāo)即測(cè)得的各種磷脂脂肪酸,縱坐標(biāo)即各種磷脂脂肪酸占總磷脂脂肪酸的百分比。從圖2可看出,培養(yǎng)后14d菜園土土壤厭氧氨氧化微生物群落結(jié)構(gòu)多樣性。
根據(jù)磷脂脂肪酸所指示的不同微生物,14d的結(jié)果顯示表征細(xì)菌的磷脂脂肪酸含量占約93.9±0.7%,而真菌的占約0.49±0.02%,放線菌的占約5.5±0.2%。
說(shuō)明:培養(yǎng)7d后土壤所得結(jié)論基本同上。
實(shí)驗(yàn)2、無(wú)機(jī)肥處理水稻土土壤厭氧氨氧化微生物群落結(jié)構(gòu)的檢測(cè)
供試土壤采自江蘇省金壇市指前鎮(zhèn)建春村,純NPK處理(100%當(dāng)?shù)赜昧?,N 300kg·hm-2,P2O5 120kg·hm-2,K2O 100kg·hm-2)。采取同實(shí)施例1中的工藝參數(shù)以及工藝步驟。
測(cè)得NO3--N,NH4+-N濃度結(jié)果如圖3所示,經(jīng)運(yùn)算,NO3--N,NH4+-N濃度均在培養(yǎng)后7天及14天的濃度下降速率最快。
所得數(shù)據(jù)以14d的15:0iso為例:
PFAME=31.656,PISTD=28.249,ng Std=6.2,W=3,所以Mi=2.3159;
δ13Cc=1.245,δ13Ccontrol=1.074,δ13CM=99,所以Pi=0.174;
∑Pi=2.985,∑Mi=102.258,pt=2.920。
因數(shù)據(jù)量較大,不一一贅述。
共測(cè)得20種磷脂脂肪酸,經(jīng)計(jì)算得出各磷脂脂肪酸的13C富集比例(pt)如圖4所示,橫坐標(biāo)即測(cè)得的各種磷脂脂肪酸,縱坐標(biāo)即各種磷脂脂肪酸占總磷脂脂肪酸的百分比。從圖4可看出,培養(yǎng)14d無(wú)機(jī)處理水稻土的土壤厭氧氨氧化微生物群落結(jié)構(gòu)多樣性。
根據(jù)磷脂脂肪酸所指示的不同微生物,表征細(xì)菌的磷脂脂肪酸含量占約94.0%,而真菌的占約0.60%,放線菌的占約5.4%。
說(shuō)明:培養(yǎng)7d后土壤所得結(jié)論基本同上。
實(shí)施例3、有機(jī)肥無(wú)機(jī)肥配施處理水稻土土壤厭氧氨氧化微生物群落結(jié)構(gòu)多樣性。
供試土壤采自江蘇省金壇市指前鎮(zhèn)建春村,豬糞堆肥6000kg·hm-2+50%NPK處理;其中,純NPK(尿素、過(guò)磷酸鈣、硫酸鉀)處理肥料用量為:N 300kg·hm-2,P2O5 120kg·hm-2,K2O 100kg·hm-2;豬糞堆肥養(yǎng)分含量為:有機(jī)質(zhì)45.4%,N 2.3%,P2O5 2.9%,K2O1.2%,含水量29.1%。采取同實(shí)施例1中的工藝參數(shù)以及工藝步驟。
測(cè)得NO3--N,NH4+-N濃度結(jié)果如圖5所示,經(jīng)運(yùn)算,NO3--N,NH4+-N濃度均在培養(yǎng)后7天及14天的濃度下降速率最快。
所得數(shù)據(jù)以14d的15:0iso為例:
PFAME=16.273,PISTD=24.569,ng Std=6.2,W=3,所以Mi=1.3688;
δ13Cc=1.242,δ13Ccontrol=1.074,δ13CM=99,所以Pi=0.171;
∑Pi=1.734,∑Mi=62.648,pt=2.768。
因數(shù)據(jù)量較大,不一一贅述。
共測(cè)得20種磷脂脂肪酸,經(jīng)計(jì)算得出各磷脂脂肪酸的13C富集比例(pt)如圖6所示,橫坐標(biāo)即測(cè)得的各種磷脂脂肪酸,縱坐標(biāo)即各種磷脂脂肪酸占總磷脂脂肪酸的百分比。從圖6可看出,培養(yǎng)14d有機(jī)處理水稻土的土壤厭氧氨氧化微生物群落結(jié)構(gòu)多樣性。
根據(jù)磷脂脂肪酸所指示的不同微生物,表征細(xì)菌的磷脂脂肪酸含量占約92.1%,而真菌的占約0.6%,放線菌的占約7.3%。
說(shuō)明:培養(yǎng)7d后土壤所得結(jié)論基本同上。
驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)、采用現(xiàn)有的本行業(yè)公認(rèn)的檢測(cè)精度高的DGGE結(jié)合qPCR對(duì)實(shí)施例1、實(shí)施例2、實(shí)施例3所述的土壤進(jìn)行檢測(cè),所得結(jié)果的簡(jiǎn)述如表1所述:
表1
對(duì)比例1-1、將實(shí)施例1中的使土壤中13C-尿素-N的濃度由200mg/kg改成150mg/kg,將NO3--N濃度由200mg/kg改成150mg/kg,其余等同于實(shí)施例1。
結(jié)果顯示,細(xì)菌含量有顯著下降(僅為80%左右),真菌變化不大,放線菌含量有上升,與驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù)相差較大,不能正確顯示實(shí)際結(jié)果。
對(duì)比例1-2、將實(shí)施例1中的使土壤中13C-尿素-N的濃度由200mg/kg改成250mg/kg,將NO3--N濃度由200mg/kg改成250mg/kg,其余等同于實(shí)施例1。
結(jié)果顯示,細(xì)菌含量上升,真菌與放線菌含量均降低(放線菌僅為3.5%左右),與驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù)相差較大,不能正確顯示實(shí)際結(jié)果。
最后,還需要注意的是,以上列舉的僅是本發(fā)明的若干個(gè)具體實(shí)施例。顯然,本發(fā)明不限于以上實(shí)施例,還可以有許多變形。本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員能從本發(fā)明公開(kāi)的內(nèi)容直接導(dǎo)出或聯(lián)想到的所有變形,均應(yīng)認(rèn)為是本發(fā)明的保護(hù)范圍。