本發(fā)明涉及漁業(yè)病害防控,尤其涉及一種靶向魚類無乳鏈球菌sip蛋白的納米抗體nb12及其應(yīng)用。
背景技術(shù):
1、羅非魚(oreochromis?sp.)是聯(lián)合國(guó)糧農(nóng)組織(fao)向全球推薦的最重要的水產(chǎn)養(yǎng)殖品種之一。2023年我國(guó)羅非魚養(yǎng)殖產(chǎn)量高達(dá)181.68萬噸,是全球最大的羅非魚生產(chǎn)國(guó)。近年來,隨著養(yǎng)殖規(guī)模的擴(kuò)大和養(yǎng)殖密度的增加,我國(guó)羅非魚主要養(yǎng)殖地區(qū)暴發(fā)以無乳鏈球菌(streptococcus?agalactiae,gbs)為主的鏈球菌病,其危害之大,被稱為羅非魚養(yǎng)殖業(yè)的“h1n1”,給羅非魚養(yǎng)殖業(yè)帶來巨大的經(jīng)濟(jì)損失。目前,抗生素仍是養(yǎng)殖環(huán)境中防控?zé)o乳鏈球菌病的主要方法。然而抗生素的長(zhǎng)期使用和濫用,不但導(dǎo)致無乳鏈球菌產(chǎn)生嚴(yán)重的耐藥性,還引起了環(huán)境污染、食品安全等一系列問題。
2、在羅非魚無乳鏈球菌病的發(fā)展過程中,無乳鏈球菌毒力因子在入侵以及裂解宿主細(xì)胞等方面發(fā)揮重要作用。毒力因子有許多種,可以分為兩大類:結(jié)構(gòu)產(chǎn)物和分泌產(chǎn)物。結(jié)構(gòu)產(chǎn)物一般與菌體的黏附與定植有關(guān),而分泌產(chǎn)物常常與入侵和損傷機(jī)體細(xì)胞、組織有關(guān)。其中,表面免疫原性蛋白(surface?immunogenic?protein,sip)是gbs的結(jié)構(gòu)產(chǎn)物,位于細(xì)菌的表面,并參與菌體對(duì)宿主細(xì)胞和組織的黏附、定植過程。各類血清型gbs都能表達(dá)sip蛋白,且sip基因在gbs中高度保守,具有潛在的免疫原性,是無乳鏈球菌疫苗抗原的重要候選蛋白。
3、20世紀(jì)90年代,hamers等發(fā)現(xiàn)駱駝科動(dòng)物血清中存在著一種天然缺失了輕鏈部分,只含有重鏈部分的重鏈抗體(heavy-chain?antibodies,hcabs)。將駱駝科動(dòng)物體內(nèi)hcabs的可變區(qū)基因進(jìn)行克隆,可以得到一種僅由重鏈可變區(qū)構(gòu)成的重鏈可變區(qū)單域抗體(variable?domain?of?heavy-chain?antibodies,vhh),又稱納米抗體(nanobodies,nbs)。vhh的單結(jié)構(gòu)域具有分子量小、組織穿透能力強(qiáng)、耐受力強(qiáng)、親和力高、水溶性好、易克隆重組、產(chǎn)量高和成本低等優(yōu)良的特性,推動(dòng)了其在疾病診斷和治療等領(lǐng)域的應(yīng)用。
4、為此,亟需利用vhh的優(yōu)異特性開發(fā)出一種針對(duì)無乳鏈球菌的新型綠色防控方法。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路
1、針對(duì)以上不足,本發(fā)明提供一種靶向魚類無乳鏈球菌sip蛋白的納米抗體nb12,能夠用于制備抑制無乳鏈球菌感染魚類的中和抗體,解決當(dāng)前魚類缺乏有效防控?zé)o乳鏈球菌病中和抗體的問題。具體技術(shù)方案如下:
2、一種靶向魚類無乳鏈球菌sip蛋白的納米抗體nb12,所述納米抗體nb12包含重鏈可變區(qū)vhh,所述vhh包括4個(gè)抗體可變區(qū)內(nèi)骨架區(qū)fr1、fr2、fr3、fr4和3個(gè)互補(bǔ)決定簇cdr1、cdr2、cdr3,如下:
3、fr1的氨基酸序列如seq?id?no.1所示,即avqlvesgggmvqaggslklscvas;
4、fr2的氨基酸序列如seq?id?no.2所示,即mgwfrqaqgkereiiag;
5、fr3的氨基酸序列如seq?id?no.3所示,即yyqdsvkdrftifrdnakntvflqmnslrpedtgvyyc;
6、fr4的氨基酸序列如seq?id?no.4所示,即wgqgtqvtvss;
7、cdr1的氨基酸序列如seq?id?no.5所示,即grtfstlg;
8、cdr2的氨基酸序列如seq?id?no.6所示,即iswtgqat;
9、cdr3的氨基酸序列如seq?id?no.7所示,即aasrsdydplfgs;
10、所述骨架區(qū)fr1-4和互補(bǔ)決定簇cdr1-3按順序交錯(cuò)排列,重鏈可變區(qū)vhh的氨基酸序列如seq?id?no:8所示,即:
11、avqlvesgggmvqaggslklscvasmgwfrqaqgkereiiagyyqdsvkdrftifr?dnakntvflqmnslrpedtgvyycwgqgtqvtvssgrtfstlgiswtgqataasrsdyd?plfgs。
12、本發(fā)明還提供以上所述的靶向魚類無乳鏈球菌sip蛋白的納米抗體nb12的制備方法,包括如下步驟:
13、s1、利用基因工程技術(shù)將編碼vhh基因插入到噬菌體外殼蛋白結(jié)構(gòu)基因中,隨著噬菌體的繁殖,vhh會(huì)以融合蛋白的方式表達(dá)在子代噬菌體的衣殼蛋白上;
14、s2、然后利用包被于固定介質(zhì)中的抗原與vhh之間的親和作用,將特異性結(jié)合抗原的vhh選擇性親和淘選;
15、s3、經(jīng)過2-4輪親和淘選后所得的噬菌體陽性單克隆子進(jìn)行elisa測(cè)定,對(duì)陽性克隆菌株進(jìn)行擴(kuò)培送并測(cè)序分析,即可得到sip蛋白的納米抗體nb12。
16、進(jìn)一步,所述親和淘選的具體步驟為:
17、在免疫管上將包被純化復(fù)性后sip蛋白用脫脂奶粉進(jìn)行封閉,并加入vhh噬菌展示體庫,充分孵育,然后用洗滌液洗滌15-25次除去未特異性結(jié)合sip蛋白的噬菌體;用洗脫液洗脫剩余的結(jié)合噬菌體顆粒,隨后加入10%?aebsf終止洗脫;最后,將洗脫的噬菌體感染復(fù)合菌株,感染后35-40℃下過夜擴(kuò)陪,使用peg/2.5m?nacl溶液沉淀純化擴(kuò)增的噬菌體,收集沉淀并用pbs溶液重懸,即為特異性結(jié)合的噬菌體顆粒,用于下一輪的篩選過程。
18、進(jìn)一步,所述洗滌液為含0.05%?tween?20的pbs溶液t溶液。
19、進(jìn)一步,所述洗脫液為0.25mg/ml的trypsin溶液。
20、進(jìn)一步,所述復(fù)合菌株為大腸桿菌ss320菌株和m13k07輔助噬菌體。
21、本發(fā)明還提供了一種上述靶向魚類無乳鏈球菌sip蛋白的納米抗體nb12的應(yīng)用,本發(fā)明的納米抗體nb12與無乳鏈球菌sip蛋白蛋白可特異性結(jié)合,應(yīng)用于制備抑制無乳鏈球菌感染魚類的中和抗體,以及應(yīng)用于相關(guān)漁業(yè)病害防控。
22、與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明的有益效果是:
23、本發(fā)明制備的納米抗體nb12,能夠高親和靶向羅非魚無乳鏈球菌sip蛋白,為開發(fā)新一代綠色抗菌藥劑的開發(fā)提供基礎(chǔ),具有重要的應(yīng)用價(jià)值。
1.一種靶向魚類無乳鏈球菌sip蛋白的納米抗體nb12,其特征在于,所述納米抗體nb12包含重鏈可變區(qū)vhh,所述vhh包括4個(gè)抗體可變區(qū)內(nèi)骨架區(qū)fr1、fr2、fr3、fr4和3個(gè)互補(bǔ)決定簇cdr1、cdr2、cdr3;
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的靶向魚類無乳鏈球菌sip蛋白的納米抗體nb12,其特征在于,所述骨架區(qū)fr1-4和互補(bǔ)決定簇cdr1-3按順序交錯(cuò)排列,重鏈可變區(qū)vhh的氨基酸序列如seq?id?no:8所示。
3.根據(jù)權(quán)利要求1~2任一項(xiàng)所述的靶向魚類無乳鏈球菌sip蛋白的納米抗體nb12的制備方法,其特征在于,包括如下步驟:
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的靶向魚類無乳鏈球菌sip蛋白的納米抗體nb12的制備方法,其特征在于,所述s2步驟中,進(jìn)行2-4輪親和淘選。
5.根據(jù)權(quán)利要求3所述的靶向魚類無乳鏈球菌sip蛋白的納米抗體nb12的制備方法,其特征在于,親和淘選的具體步驟為:
6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的靶向魚類無乳鏈球菌sip蛋白的納米抗體nb12的制備方法,其特征在于,所述洗滌液為含0.05%tween?20的pbs溶液t溶液。
7.根據(jù)權(quán)利要求5所述的靶向魚類無乳鏈球菌sip蛋白的納米抗體nb12的制備方法,其特征在于,所述洗脫液為0.25mg/ml的trypsin溶液。
8.根據(jù)權(quán)利要求5所述的靶向魚類無乳鏈球菌sip蛋白的納米抗體nb12的制備方法,其特征在于,所述復(fù)合菌株為大腸桿菌ss320菌株和m13k07輔助噬菌體。
9.權(quán)利要求1~2所述的任一項(xiàng)所述的靶向魚類無乳鏈球菌sip蛋白的納米抗體nb12在漁業(yè)病害防控中的應(yīng)用。