本發(fā)明涉及生物技術(shù)領(lǐng)域,更具體地涉及一種利用磁感應(yīng)蛋白作為純化標(biāo)簽實(shí)現(xiàn)外源蛋白一步純化與固定化的方法及應(yīng)用,以及一種通用載體。
背景技術(shù):
動(dòng)物是否能夠檢測(cè)到地球的磁場(chǎng),以及它們?nèi)绾瓮ㄟ^(guò)感應(yīng)磁場(chǎng)來(lái)實(shí)現(xiàn)定向或遷移,這是最有爭(zhēng)議的話題之一。許多研究人員致力于識(shí)別磁感應(yīng),并尋找磁受體。最近,有研究人員發(fā)現(xiàn)并報(bào)道了一個(gè)磁蛋白生物指南針,它是一個(gè)多聚磁感應(yīng)棒狀蛋白復(fù)合體,這種磁敏復(fù)合體是由已鑒定的假定的磁感應(yīng)蛋白magr和已知的磁受體相關(guān)的光感受器隱花色素cry組成,有cry系統(tǒng)和鐵基系統(tǒng)兩者的特性,在包括地球在內(nèi)的磁場(chǎng)中能自發(fā)排列。并且驗(yàn)證了蛋白質(zhì)復(fù)合體具有固有磁矩。此外,這樣的蛋白質(zhì)復(fù)合體已被證明在物種之間廣泛分布,并且相信會(huì)激發(fā)跨領(lǐng)域的技術(shù)創(chuàng)新。
磁感應(yīng)蛋白magr屬于鐵硫簇結(jié)合蛋白(簡(jiǎn)稱鐵硫蛋白),每一個(gè)蛋白質(zhì)單體都結(jié)合了一個(gè)二鐵二硫形式的鐵硫簇。磁感應(yīng)蛋白magr具有明顯的內(nèi)稟磁矩和清晰的物理模型,其必然掀起生物感磁研究的新一波熱潮,推動(dòng)整個(gè)生物磁感受能力研究的發(fā)展。
分離和純化蛋白質(zhì)是生物技術(shù)中的重要加工過(guò)程。等電點(diǎn)、十二烷基硫酸鈉和凝膠過(guò)濾層析等傳統(tǒng)方法已經(jīng)應(yīng)用于各種蛋白質(zhì)的純化。在低濃度蛋白質(zhì)的情況下,分離和純化意味著更具有挑戰(zhàn)性。目前,已經(jīng)開(kāi)發(fā)的幾種融合標(biāo)簽和親和色譜法提供了一種有效方式來(lái)純化目的融合蛋白。然而,高成本的親和柱和耗時(shí)的操作限制了其大規(guī)模的可用性。通常而言,固定化酶能夠回收和再利用昂貴的酶,并且提高成本效益。盡管進(jìn)行了許多嘗試來(lái)開(kāi)發(fā)和優(yōu)化固定化方法,但是終于發(fā)現(xiàn),比表面積大和量子尺寸效應(yīng)的氧化鐵納米顆粒提供了一種快速,方便和經(jīng)濟(jì)的固定化酶的方法。然而,先前的酶純化是必要的,然后是磁性固定,這對(duì)工業(yè)應(yīng)用造成沉重的負(fù)擔(dān)。因此,實(shí)現(xiàn)酶的一步純化和固定化是很必要的。雖然ni2+官能化修飾的聚多巴胺包被的fe3o4納米粒子可以用于分離純化his標(biāo)簽蛋白。氨基官能化的mcfs的生產(chǎn)是用于粘附醛標(biāo)簽酶。連接dna配體的磁珠的制備是應(yīng)用于β-葡萄糖醛酸酶的分離純化。然而,氧化鐵納米顆粒的表面修飾應(yīng)當(dāng)在純化和固定之前完成和評(píng)價(jià),并且修飾后的納米顆粒的不穩(wěn)定性也限制了它的重復(fù)使用。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明的目的是提供一種利用磁感應(yīng)蛋白作為純化標(biāo)簽實(shí)現(xiàn)外源蛋白一步純化與固定化的方法及應(yīng)用,以及一種通用載體,從而解決現(xiàn)有技術(shù)中外源蛋白表達(dá)量低,分離純化困難的問(wèn)題。
為了解決上述技術(shù)問(wèn)題,本發(fā)明采用以下技術(shù)方案:
根據(jù)本發(fā)明的第一方面,提供一種利用磁感應(yīng)蛋白作為純化標(biāo)簽實(shí)現(xiàn)外源蛋白一步純化與固定化的方法,所述方法包括以下步驟:1)以pet-28a(+)為載體質(zhì)粒,向其中插入磁感應(yīng)蛋白基因,構(gòu)建一通用載體;2)將外源蛋白基因可操作地插入所述步驟1)中的通用載體中,構(gòu)建含有外源蛋白基因的重組表達(dá)質(zhì)粒,再將該重組表達(dá)質(zhì)粒導(dǎo)入宿主細(xì)胞,獲得重組菌株;以及3)培養(yǎng)所述重組菌株,誘導(dǎo)所述外源蛋白基因表達(dá),收集表達(dá)產(chǎn)物,向所述表達(dá)產(chǎn)物中投入納米鐵珠,實(shí)現(xiàn)所述外源蛋白的一步分離純化與固定化。
優(yōu)選地,所述磁感應(yīng)蛋白基因是一種來(lái)自哺乳動(dòng)物家鴿的磁感應(yīng)蛋白基因或一種來(lái)自果蠅的磁感應(yīng)蛋白基因,其中來(lái)自哺乳動(dòng)物家鴿的磁感應(yīng)蛋白基因具有seqidno.1所示的核苷酸序列,來(lái)自果蠅的磁感應(yīng)蛋白基因具有seqidno.2所示的核苷酸序列。
優(yōu)選地,所述步驟1)中通用載體的構(gòu)建還包括在所述磁感應(yīng)蛋白基因序列的下游插入凝血酶切割位點(diǎn)。通過(guò)在通用載體中引入該凝血酶切割位點(diǎn),在外源蛋白以及磁感應(yīng)蛋白共表達(dá)之后,僅僅通過(guò)向表達(dá)產(chǎn)物中加入凝血酶,即可實(shí)現(xiàn)對(duì)磁感應(yīng)蛋白標(biāo)簽的切割,獲得更加接近天然序列的外源蛋白。
可選地,所述步驟2)中重組表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建中,所述外源蛋白基因與所述通用載體上的磁感應(yīng)蛋白基因直接連接。
優(yōu)選地,所述步驟2)中重組表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建中,所述外源蛋白基因與所述通用載體上的磁感應(yīng)蛋白基因通過(guò)一段剛性linker連接,所述剛性linker具有如seqidno.5所示的核苷酸序列。
還優(yōu)選地,所述步驟2)中重組表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建中,所述外源蛋白基因與所述通用載體上的磁感應(yīng)蛋白基因通過(guò)一段柔性linker連接,所述柔性linker具有如seqidno.6所示的核苷酸序列。
作為舉例而非限制,所述宿主細(xì)胞優(yōu)選為大腸桿菌bl21(de3)。
所述外源蛋白包括:脂肪酶、糖苷酶或普魯蘭酶等等。本發(fā)明通過(guò)上述三種外源蛋白驗(yàn)證了磁感應(yīng)蛋白作為純化標(biāo)簽的通用性,但是應(yīng)當(dāng)理解,此處僅作為舉例而非限制,外源蛋白實(shí)際并不僅限于上述三種。
所述步驟3)中還包括:向所述表達(dá)產(chǎn)物中加入適量凝血酶,實(shí)現(xiàn)磁蛋白標(biāo)簽與外源蛋白的分離。
根據(jù)本發(fā)明的第二方面,還提供一種根據(jù)上述方法獲得的通用載體,所述通用載體以pet-28a(+)為載體質(zhì)粒,插入連接有凝血酶切割位點(diǎn)的磁感應(yīng)蛋白基因,所述通用載體依次包括:t7啟動(dòng)子、磁感應(yīng)蛋白基因、凝血酶切割位點(diǎn)、linker、多克隆位點(diǎn)以及t7終止子。
根據(jù)本發(fā)明的第三方面,還提供一種利用磁感應(yīng)蛋白作為純化標(biāo)簽實(shí)現(xiàn)外源蛋白一步純化與固定化的方法在制備工業(yè)酶制劑、蛋白質(zhì)藥物中的應(yīng)用。
與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明具有以下有益效果:
根據(jù)本發(fā)明提供的方法,首次利用磁感應(yīng)蛋白作為純化標(biāo)簽,然后通過(guò)磁感應(yīng)蛋白對(duì)納米鐵珠的吸附,一步實(shí)現(xiàn)了外源蛋白的分離純化與固定化,該方法與傳統(tǒng)的純化方法相比,純化的步驟非常簡(jiǎn)便、快速,節(jié)約了大量的人力、物力以及時(shí)間成本。
根據(jù)本發(fā)明提供的方法,一步實(shí)現(xiàn)了外源蛋白,比如脂肪酶的純化與固定化,并且固定化的脂肪酶相對(duì)于游離的脂肪酶提高了熱穩(wěn)定性與ph的耐受性,增加了可重復(fù)利用性。
根據(jù)本發(fā)明提供的方法,直接采用納米鐵珠對(duì)蛋白的磁性吸附即可實(shí)現(xiàn)對(duì)外源蛋白的一步分離純化,避免了現(xiàn)有技術(shù)需在分離純化前對(duì)納米鐵珠進(jìn)行表面修飾,而修飾后的納米鐵珠的不穩(wěn)定性又限制了其重復(fù)使用的缺陷,而本發(fā)明所提供的方法中納米鐵珠不僅無(wú)需修飾,也不存在重復(fù)使用率低的缺陷,節(jié)約了成本。
根據(jù)本發(fā)明提供的通用載體,磁蛋白純化標(biāo)簽位于一環(huán)化質(zhì)粒(即通用質(zhì)粒)上,易于保存和dna操作。
本發(fā)明所采用的磁感應(yīng)蛋白,只有14.5kda,其單體只有130個(gè)氨基酸左右(不同物種略有差異),更方便進(jìn)行基因操作,對(duì)目標(biāo)生物的負(fù)擔(dān)也會(huì)更小。
本發(fā)明提供的通用載體中帶有純化標(biāo)簽和凝血酶切割位點(diǎn),有利于純化標(biāo)簽的去除,獲得更加接近天然序列的目的蛋白。
本發(fā)明提供的通用載體的多克隆位點(diǎn)中含有稀有接口,兼容絕大多數(shù)異源基因的連接,節(jié)約操作時(shí)間提高工作效率。
總之,本發(fā)明提供了一種以磁感應(yīng)蛋白作為純化標(biāo)簽,一步實(shí)現(xiàn)外源蛋白的純化與固定化的方法,并且該方法步驟簡(jiǎn)便、快速,相比傳統(tǒng)方法節(jié)約了大量的人力、物力和時(shí)間成本,為外源蛋白的一步分離、純化、固定化開(kāi)辟了新的道路。
附圖說(shuō)明
圖1是根據(jù)本發(fā)明的一個(gè)實(shí)施例構(gòu)建的通用質(zhì)粒p28amagr的物理圖譜;其中,包括t7啟動(dòng)子;clmagr:磁蛋白純化標(biāo)簽;mcs:多克隆酶切位點(diǎn);t7終止子;kanr抗性標(biāo)記。
圖2是clmagr的蛋白電泳圖;其中,m:蛋白分子量標(biāo)準(zhǔn);1、2:bl21-pet28a細(xì)胞破碎液的上清、沉淀;3、4:bl21-pet28a-clmagr細(xì)胞破碎液的上清、沉淀;5:鐵珠純化的clmagr蛋白。
圖3是linker模式下和無(wú)linker模式下融合clmagr標(biāo)簽的gfp的蛋白電泳圖;其中,(a)圖,m:蛋白分子量標(biāo)準(zhǔn);1、2:bl21-pet28a細(xì)胞破碎液的上清、沉淀;3、4:bl21-pet28a-clmagr-剛性linker-gfp細(xì)胞破碎液的上清、沉淀;5:鐵珠純化后clmagr-剛性linker-gfp蛋白;6、7:bl21-pet28a-clmagr-柔性linker-gfp細(xì)胞破碎液的上清、沉淀;8:鐵珠純化后clmagr-柔性linker-gfp蛋白。(b)圖,m:蛋白分子量標(biāo)準(zhǔn);1、2:bl21-pet28a細(xì)胞破碎液的上清、沉淀;3、4:bl21-pet28a-clmag-gfp細(xì)胞破碎液的上清、沉淀;5:鐵珠純化后clmagr-gfp蛋白。
圖4是無(wú)linker模式下融合clmagr標(biāo)簽的脂肪酶、糖苷酶、普魯蘭酶的蛋白電泳圖;其中,(a)圖,m:蛋白分子量標(biāo)準(zhǔn);1、2:bl21-pet28a細(xì)胞破碎液的上清、沉淀;3、4:bl21-p28amagr-lipase細(xì)胞破碎液的上清、沉淀;5:鐵珠純化后clmagr-lipase蛋白;(b)圖,m:蛋白分子量標(biāo)準(zhǔn);1、2:bl21-pet28a細(xì)胞破碎液的上清、沉淀;3、4:bl21-p28amagr-α-af細(xì)胞破碎液的上清、沉淀;5:鐵珠純化后clmagr-α-af蛋白;(c)圖,m:蛋白分子量標(biāo)準(zhǔn);1、2:bl21-pet28a細(xì)胞破碎液的上清、沉淀;3、4:bl21-p28amagr-pullulanase細(xì)胞破碎液的上清、沉淀;5:鐵珠純化后clmagr-pullulanase蛋白。
圖5是游離脂肪酶與固定化脂肪酶的酶學(xué)性質(zhì)對(duì)比;其中,(a)游離脂肪酶和固定化脂肪酶在不同溫度下的相對(duì)活性曲線;(b)游離脂肪酶和固定化脂肪酶的熱穩(wěn)定性;(c)游離脂肪酶和固定化脂肪酶在各種ph條件下的相對(duì)活性曲線;(d)游離脂肪酶和固定化脂肪酶的ph穩(wěn)定性;
圖6是固定化脂肪酶的可重復(fù)利用性;
圖7是去掉clmagr標(biāo)簽的脂肪酶的蛋白電泳圖;其中,m:蛋白分子量標(biāo)準(zhǔn);1:bl21-pet28a細(xì)胞破碎液的上清;2:bl21-p28amagr-lipase細(xì)胞破碎液的上清;3:鐵珠純化后clmagr-lipase蛋白;4:凝血酶在4℃下將純化的clmagr-lipase蛋白消化10h得到的脂肪酶條帶;5:凝血酶在20℃下將純化的clmagr-lipase蛋白消化3.5h得到的脂肪酶條帶;6:凝血酶在37℃下將純化的clmagr-lipase蛋白消化1.5h得到的脂肪酶條帶。
具體實(shí)施方式
以下結(jié)合具體實(shí)施例,對(duì)本發(fā)明做進(jìn)一步說(shuō)明。應(yīng)理解,以下實(shí)施例僅用于說(shuō)明本發(fā)明而非用于限制本發(fā)明的范圍。
本發(fā)明所用的原料或試劑,如無(wú)特殊說(shuō)明,均市售可得。
下列實(shí)施例中未注明具體條件的實(shí)驗(yàn)方法,通常按照常規(guī)條件,如《分子克?。簩?shí)驗(yàn)室手冊(cè)》(newyork:coldspringharborlaboratorypress,1989)中所述的條件進(jìn)行,或按照制造廠商所建議的條件。
應(yīng)當(dāng)理解,根據(jù)本發(fā)明所提供的方法,該方法適用于任何磁感應(yīng)蛋白,但是由于存在無(wú)法窮舉的原因,本文僅以兩種磁感應(yīng)蛋白作為舉例說(shuō)明,其中一種是來(lái)自哺乳動(dòng)物家鴿的磁感應(yīng)蛋白基因,另一種是來(lái)自果蠅的磁感應(yīng)蛋白基因,其中來(lái)自哺乳動(dòng)物家鴿的磁感應(yīng)蛋白基因具有seqidno.1所示的核苷酸序列,來(lái)自果蠅的磁感應(yīng)蛋白基因具有seqidno.2所示的核苷酸序列。但是,應(yīng)當(dāng)理解,來(lái)自果蠅的磁感應(yīng)蛋白作為純化標(biāo)簽的應(yīng)用與來(lái)自哺乳動(dòng)物家鴿的磁感應(yīng)蛋白的應(yīng)用在方法上是基本一致的,區(qū)別僅在于具體核苷酸序列的不同。因此,以下具體實(shí)施方式僅以來(lái)自哺乳動(dòng)物家鴿的磁感應(yīng)蛋白基因?yàn)槔瑏?lái)自果蠅的磁感應(yīng)蛋白基因的應(yīng)用則不再贅述。
實(shí)施例中用到的試劑、緩沖液和培養(yǎng)基如下:
主要試劑配置:
卡那霉素:無(wú)菌雙蒸水配置50mg/ml的kanr溶液,使用孔徑0.22μm無(wú)菌濾膜除菌,-20℃保存。
50×tae:冰醋酸57ml,tris242g,0.5mol/ledta(ph8.0)40ml,ddh2o定容至1000ml。
蛋白電泳緩沖液:tris-base:3g,sds(十二烷基磺酸鈉):1g,甘氨酸(glycine):14.4g,加雙蒸水定容至1000ml,調(diào)節(jié)ph為8.3。
5×loadingbuffer:ph6.8的1mtris-hcl:0.6ml,10%sds:2ml,2-巰基乙醇:0.5ml,50%甘油:5ml,1%溴酚藍(lán):1ml,雙蒸水:0.9ml。
sds-page染色液:冰乙酸:100ml,無(wú)水乙醇:450ml,考馬斯亮藍(lán)r-250:1g,雙蒸水:450ml。
sds-page脫色液:無(wú)水乙醇:100ml,冰乙酸:200ml,雙蒸水:700ml。
lb培養(yǎng)基(1l)配方:氯化鈉:10g,蛋白胨:10g,酵母粉:5g,原始ph;其固體培養(yǎng)基:在lb液體培養(yǎng)基中加入15-20%的瓊脂粉;121℃,濕熱滅菌20分鐘。
質(zhì)粒提取試劑盒購(gòu)自invitrogen(usa),膠回收試劑盒購(gòu)自omega公司。
實(shí)施例1pet28a-clmagr重組表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建
1)合成如seqidno.1所示的clmagr基因的核苷酸序列,該序列由金斯瑞生物科技有限公司合成;
2)分別合成以下引物:
引物clmagrf:5’cgcggatccatggcatctagcgcatcatc3’,其中,下劃線部分為bamhi識(shí)別位點(diǎn);
引物clmagrr:5’acggagctcgatgttaaagctttctccac3’,其中,下劃線部分為saci識(shí)別位點(diǎn)。
3)在上述引物的引導(dǎo)下,以步驟1)中的序列為模板進(jìn)行pcr擴(kuò)增。
4)將pet-28a(+)空載質(zhì)粒,以及步驟3)得到的帶有bamhi和saci酶切位點(diǎn)的基因,分別用bamhi和saci進(jìn)行雙酶切?;厥沾笃?,用t4dna連接酶連接,熱激法轉(zhuǎn)化大腸桿菌dh5a,用含50μg/ml卡那霉素的lb固體培養(yǎng)基進(jìn)行篩選,pcr法挑取陽(yáng)性克隆,試劑盒提取陽(yáng)性克隆質(zhì)粒,經(jīng)基因測(cè)序鑒定,獲得正確的克隆質(zhì)粒,命名為pet28a-clmagr。
實(shí)施例2磁蛋白的異源高效可溶性表達(dá)和磁蛋白的磁性驗(yàn)證
1)將實(shí)施列1中的獲得的表達(dá)質(zhì)粒pet28a-clmagr采用熱激法轉(zhuǎn)入到大腸桿菌bl21(de3),挑取單菌落,在含有50μg/ml卡那霉素的5mllb培養(yǎng)基中37℃培養(yǎng)8小時(shí),然后按1%的比例轉(zhuǎn)接到新鮮的40mllb培養(yǎng)基中繼續(xù)繁殖。當(dāng)od600達(dá)到0.6~0.8時(shí),加入iptg至終濃度20μm。在20℃下誘導(dǎo)13小時(shí)后,收集細(xì)胞并用純水洗滌。將收集的細(xì)胞重懸于tbs緩沖液(20mmtris,150mmnacl,ph7.5)中,并超聲破碎15分鐘。將細(xì)胞裂解液離心,分別收集上清與沉淀,進(jìn)行sds-page電泳。
2)將步驟1)收集的上清取0.5ml,加入0.1ml的fe3o4-sio2納米粒子(10mgml-1),室溫孵育10mim,通過(guò)離心收集所得沉淀,并用tbs緩沖液洗滌三次以除去非吸附雜蛋白。通過(guò)十二烷基硫酸鈉聚丙烯酰胺凝膠電泳(sds-page)檢測(cè)吸附的蛋白質(zhì)。實(shí)驗(yàn)結(jié)果如圖2所示,clmagr基因在大腸桿菌中實(shí)現(xiàn)了異源高效可溶性表達(dá),并且該表達(dá)的磁蛋白經(jīng)驗(yàn)證具有一定的磁性。
實(shí)施例3linker的設(shè)計(jì)模式
1)分別設(shè)計(jì)并合成剛性linker和柔性linker,以及引物linker1f,linker2f,linker1r/linker2r,gfp1f/gfp1r,gfp2f/gfp2r,gfp3f/gfp3r;
其中,剛性linker的基因序列如seqidno.5所示,柔性linker的基因序列如seqidno.6所示;
linker1f:5’atcgagctcaaagcgaaactgaaagagga3’,其中,下劃線部分為saci識(shí)別位點(diǎn);
linker2f:5’atcgagctcggcggaggtggctctggcgg3’,其中,下劃線部分為saci識(shí)別位點(diǎn);
linker1r/linker2r:5’ttctcctttactcatatggctgccgcgcgg
cacca3’
gfp1f/gfp2f:5’ccatatgagtaaaggagaagaact3’
gfp3f:5’atcgagctcctggtgccgcgcggcagccatatgagtaaaggagaagaac3’,其中,下劃線部分為saci識(shí)別位點(diǎn);
gfp1r/gfp2r/gfp3r:5’agtgcggccgcttatttgtatagttcatcca3’,其中,下劃線部分為noti識(shí)別位點(diǎn)。
2)對(duì)于質(zhì)粒構(gòu)建,使用引物gfp1f/gfp1r,gfp2f/gfp2r擴(kuò)增包括完整orf的gfp的dna片段ⅰ/ⅱ。接著,合成含有凝血酶序列+柔性linker/凝血酶序列+剛性linker的dna片段ⅲ/ⅳ,用引物linker1f/linker1r和linker2f/linker2r擴(kuò)增得到dna片段ⅴ/ⅵ。接著,使用pcr純化過(guò)的片段ⅰ/ⅴ和片段ⅱ/ⅵ作為模板,用引物linker1f/gfp1r和linker2f/gfp2r擴(kuò)增得到dna片段ⅶ/ⅷ。接著,通過(guò)saci和noti消化載體pet28a-clmagr,然后與同經(jīng)過(guò)saci/noti雙酶切的片段ⅶ/ⅷ整合,產(chǎn)生載體pet28a-clmagr-柔性linker-gfp和pet28a-clmagr-剛性linker-gfp。相似的,基因gfp用引物gfp3f/gfp3r擴(kuò)增,其在gfp的5'端引入凝血酶消化序列。在通過(guò)saci/noti消化后,將gfp基因克隆到質(zhì)粒pet28a-clmagr中以獲得載體pet28a-clmagr-gfp。
3)將重組表達(dá)質(zhì)粒pet28a-clmagr-柔性linker-gfp、pet28a-clmagr-剛性linker-gfp和p28amagr-gfp通過(guò)熱激法分別轉(zhuǎn)化到大腸桿菌bl21(de3)中,誘導(dǎo)gfp表達(dá),其誘導(dǎo)條件是:20℃,iptg0.05mmol/l,13小時(shí)通過(guò)離心收集細(xì)胞,用tbs緩沖液洗滌兩次,然后通過(guò)超聲破碎。如上所述,通過(guò)fe3o4-sio2納米顆粒純化融合蛋白,進(jìn)行sds-page電泳。結(jié)果如圖3所示,驗(yàn)證了磁蛋白作為純化標(biāo)簽的可行性。并且將200μl的clmagr-gfp,clmagr-柔性linker-gfp,clmagr-剛性linker-gfp溶液轉(zhuǎn)移到96孔微量培養(yǎng)板中,然后置于biotektmcytationtm3cellimagingmulti-modereader(美國(guó)佛蒙特州)中,在485nm激發(fā)和520nm發(fā)射條件下,測(cè)得三者的熒光強(qiáng)度,結(jié)果見(jiàn)表一。
表一clmagr-rigidlinker-gfp,clmagr-flexiblelinker-gfpandclmagr-gfp的熒光強(qiáng)度
根據(jù)上表一結(jié)果可知,當(dāng)在clmagr和gfp之間連入剛性linker時(shí),熒光強(qiáng)度最強(qiáng),其次是不加linker的情況,再次是連入柔性linker的情況。因此,在該實(shí)施例中,在磁感應(yīng)蛋白與外源蛋白之間連入剛性linker時(shí),外源蛋白的表達(dá)量最高。但是,考慮到不加linker的熒光強(qiáng)度僅比連入剛性linker的熒光強(qiáng)度稍低,而不加linker模式構(gòu)建表達(dá)目的蛋白重組質(zhì)粒步驟簡(jiǎn)單,而且選擇不同目的蛋白,它們的構(gòu)象也不同,連入剛性linker是否會(huì)影響相應(yīng)目的蛋白的構(gòu)象也并不確定,而不加linker模式就表明了磁蛋白不影響gfp構(gòu)象,因此,也可選擇不加linker。對(duì)于其他外源蛋白,還可優(yōu)選連入柔性linker。
實(shí)施例4通用質(zhì)粒p28amagr的構(gòu)建:
1)合成帶有clmagr純化標(biāo)簽、凝血酶切位點(diǎn)的核苷酸序列,如seqidno.13所示;
2)合成下列引物:
引物magrf:5’cgcggatccatggcatctagcgcatcatc3’,其中下劃線部分為bamhi識(shí)別位點(diǎn);
引物magrr:5’acggagctcatggctgccgcgcggcacca3’,其中,下劃線部分為saci識(shí)別位點(diǎn)。
3)在上述引物的引導(dǎo)下,以步驟1)中合成的序列為模板進(jìn)行pcr擴(kuò)增。
4)將pet-28a(+)空載質(zhì)粒,以及步驟3)得到的帶有bamhi和saci酶切位點(diǎn)的基因片段,分別用bamhi和saci進(jìn)行雙酶切?;厥沾笃?,用t4dna連接酶連接,熱激法轉(zhuǎn)化大腸桿菌dh5a,用含50μg/ml卡那霉素的lb固體培養(yǎng)基進(jìn)行篩選,pcr法挑取陽(yáng)性克隆,試劑盒提取陽(yáng)性克隆質(zhì)粒,經(jīng)基因測(cè)序鑒定,獲得正確的克隆質(zhì)粒,命名為p28amagr。
實(shí)施例5p28amagr-lipase,p28amagr-α-af和p28amagr-pullulanase的構(gòu)建
為了確認(rèn)該純化方法的普遍性,選擇具有不同分子量大小的脂肪酶、α-l-阿拉伯呋喃糖苷酶(α-af)和普魯蘭酶作為靶蛋白。合成具有sali和xhoi酶切位點(diǎn)的引物lipasef/lipaser、aff/afr、pulluf/pullur,以分別擴(kuò)增脂肪酶,α-af和普魯蘭酶基因的完整orf,純化的pcr產(chǎn)物通過(guò)sali和noti雙酶切后并整合到p28amagr中,產(chǎn)生p28amagr-lipase,p28amagr-α-af和p28amagr-pullulanase重組表達(dá)質(zhì)粒。其中:
lipasef:5’tccgtcgactcctcagggcataaccctgt3’,其中,下劃線部分為sali識(shí)別位點(diǎn);
lipaser:5’gtgctcgagttaatttgtattttgtccgc3’,其中,下劃線部分為xhoi識(shí)別位點(diǎn);
aff:5’tccgtcgacatgaaaaacttcaagatgct3’,其中,下劃線部分為sali識(shí)別位點(diǎn);
afr:5’gtgctcgagtcagttcagtgtgatctcaa3’,其中,下劃線部分為xhoi識(shí)別位點(diǎn);
pulluf:5’tccgtcgacgattctacttcgactaaagt3’,其中,下劃線部分為sali識(shí)別位點(diǎn);
pullur:5’gtgctcgagttattgtttgagaataagcg3’,其中,下劃線部分為xhoi識(shí)別位點(diǎn)。
將重組載體p28amagr-lipase,p28amagr-α-af和p28amagr-pullulanase分別轉(zhuǎn)化到大腸桿菌bl21(de3)中。選擇通過(guò)pcr和測(cè)序確認(rèn)的轉(zhuǎn)化體。脂肪酶,α-af和支鏈淀粉酶的誘導(dǎo)條件為:20℃,iptg0.1mmol/l,16小時(shí);20℃,iptg0.2mmol/l,20h;20℃,iptg0.1mmol/l,18小時(shí)。通過(guò)離心收集細(xì)胞,用tbs緩沖液洗滌兩次,然后通過(guò)超聲破碎。如上所述,通過(guò)fe3o4-sio2納米顆粒純化融合蛋白,進(jìn)行sds-page電泳。結(jié)果如圖4所示,驗(yàn)證了磁蛋白作為純化標(biāo)簽的通用性。
實(shí)施例6脂肪酶的一步純化與固定化
1)在bl21-p28amagr-lipase破碎后的上清中投入fe3o4-sio2納米粒子(購(gòu)買(mǎi)于蘇州海貍生物醫(yī)學(xué)工程有限公司),方法見(jiàn)實(shí)施例2中的步驟2),通過(guò)磁蛋白與納米鐵珠的物理吸附作用,一步實(shí)現(xiàn)脂肪酶的純化與固定化。通過(guò)分別對(duì)游離脂肪酶和固定化脂肪酶在不同溫度下和不同ph下的穩(wěn)定性進(jìn)行比較,結(jié)果如圖5所示,固定化脂肪酶的熱穩(wěn)定性和ph穩(wěn)定性均相比游離脂肪酶得到提高。此外,發(fā)明人還對(duì)固定化脂肪酶的可重復(fù)利用性進(jìn)行了研究,結(jié)果如圖6所示,固定化脂肪酶在重復(fù)利用高達(dá)15次后,其相對(duì)活性仍然保持80%,在重復(fù)利用20次后,其相對(duì)活性也仍然高達(dá)75%。由此可知,通過(guò)納米鐵珠對(duì)磁蛋白的物理吸附作用,實(shí)現(xiàn)了脂肪酶的一步純化和固定化,使脂肪酶的穩(wěn)定性和重復(fù)利用性均得到提高。為了得到純的脂肪酶溶液,在步驟1)所得溶液中加入少量的凝血酶,分別在4℃、20℃、37℃、酶切10h、3.5h、1.5h,實(shí)現(xiàn)磁蛋白標(biāo)簽與脂肪酶的分離,結(jié)果如圖7所示,磁蛋白標(biāo)簽與脂肪酶成功分離,獲得了更加接近天然序列的脂肪酶。
以上所述的,僅為本發(fā)明的較佳實(shí)施例,并非用以限定本發(fā)明的范圍,本發(fā)明的上述實(shí)施例還可以做出各種變化。即凡是依據(jù)本發(fā)明申請(qǐng)的權(quán)利要求書(shū)及說(shuō)明書(shū)內(nèi)容所作的簡(jiǎn)單、等效變化與修飾,皆落入本發(fā)明專利的權(quán)利要求保護(hù)范圍。本發(fā)明未詳盡描述的均為常規(guī)技術(shù)內(nèi)容。
序列表
<110>華東理工大學(xué)
<120>一種利用磁感應(yīng)蛋白作為純化標(biāo)簽實(shí)現(xiàn)外源蛋白一步純化與固定化的方法,應(yīng)用及通用載體
<160>21
<210>1
<211>399
<212>dna
<213>家鴿
<400>1
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attcaagcaacaagagcagcacttacacttaccccatcagctgttcagaagataaaagag120
cttcttaaagataaacctgagcatgtaggcgtgaaagtaggtgttcgcacaagaggatgc180
aatggactttcttacacattagaatatacaaaatcaaaaggagactctgatgaagaagta240
gttcaagatggggttagagtgtttattgagaagaaggcacagctgacgcttttaggcact300
gaaatggactatgtagaagacaaactgtccagtgaatttgtcttcaataatccaaacatc360
aaaggaacatgtggctgtggagaaagctttaacatctga399
<210>2
<211>393
<212>dna
<213>果蠅
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