本發(fā)明涉及一種基于多模態(tài)影像特征融合的阿爾茨海默病分類方法,實現(xiàn)對smri灰質(zhì)和pet多模態(tài)影像的特征提取,并有效地融合多模態(tài)特征以進(jìn)一步提升阿爾茨海默病的輔助診斷性能,涉及醫(yī)學(xué)影像和深度學(xué)習(xí)領(lǐng)域。
背景技術(shù):
1、阿爾茨海默病(alzheimer's?disease,ad)是一種中樞神經(jīng)系統(tǒng)的退行性疾病,主要以記憶、語言、認(rèn)知甚至情感障礙為特征,可影響患者的日常生活,是最常見的癡呆癥類型。隨著全球老齡化的趨勢,阿爾茨海默病患者的數(shù)量在逐年增加,實現(xiàn)對ad的早期發(fā)現(xiàn)和準(zhǔn)確診斷對于延緩疾病進(jìn)展,提高患者的生活質(zhì)量至關(guān)重要。目前,ad的臨床診斷需要認(rèn)知行為學(xué)評估和影像學(xué)及其他輔助檢查的基礎(chǔ)上進(jìn)行綜合評估。影像學(xué)檢查是一種相對方便、可靠的診斷輔助手段,在檢測和確診阿爾茨海默病方面發(fā)揮著重要作用,影像學(xué)檢查的結(jié)果可以在一定程度上協(xié)助醫(yī)生提高阿爾茨海默病診斷的準(zhǔn)確性。隨著影像學(xué)技術(shù)的發(fā)展,出現(xiàn)了多種神經(jīng)影像學(xué)技術(shù),包括結(jié)構(gòu)成像smri和功能成像pet等。smri作為一種無創(chuàng)、無輻射的結(jié)構(gòu)成像,是目前臨床上應(yīng)用最廣泛的影像學(xué)工具,醫(yī)生通過smri可以觀察到大腦中一些明顯的結(jié)構(gòu)變化來評估ad。在功能成像方面,18f-fdg?pet是一種分子檢查方式,通過向體內(nèi)注射放射性元素來觀察葡萄糖代謝情況,分析大腦的葡萄糖代謝功能以評估ad。上述兩種成像技術(shù)為ad的篩查和早期診斷提供了更多依據(jù)。為此,利用當(dāng)前的深度學(xué)習(xí)技術(shù),如何有效地利用這兩種影像特征來提升ad診斷性能是近年的研究熱點。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、本發(fā)明為解決上述問題提供一種基于多模態(tài)影像特征融合的阿爾茨海默病分類方法,實現(xiàn)基于多模態(tài)smri灰質(zhì)和pet影像的ad輔助診斷,提升對ad的分類準(zhǔn)確率。首先,考慮到腦影像的特點,為減少卷積特征提取中細(xì)節(jié)信息的丟失,在全連接層中整合了低級特征和高級特征。其次,為了有效融合兩個不同模態(tài)影像的相關(guān)特征,我們通過基于非共享參數(shù)的網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練方式對多模態(tài)影像實現(xiàn)了特征提取和特征學(xué)習(xí),并進(jìn)一步利用了空間金字塔池化對多模態(tài)影像特征降維,最后通過全連接層和softmax層得到最終的分類預(yù)測,提高了分類和輔助診斷的可靠性。
2、adni數(shù)據(jù)集是目前全球公開的數(shù)據(jù)集,用于研究阿爾茨海默病的診斷。我們選擇了數(shù)據(jù)庫中461名受試者的smri影像和pet影像作為子數(shù)據(jù)集,為了避免數(shù)據(jù)泄露的情況發(fā)生,按受試者的id劃分訓(xùn)練集驗證集和測試集。受試者分為:認(rèn)知正常(normal?control,nc)和ad受試者。我們的發(fā)明在adni子數(shù)據(jù)集上取得了較好的測試結(jié)果,并通過消融實驗驗證了該發(fā)明的合理性和有效性。
3、本發(fā)明通過以下技術(shù)方案來實現(xiàn)上述目的:
4、1、步驟一中構(gòu)建數(shù)據(jù)集,用于ad輔助診斷的公開數(shù)據(jù)集是adni,本發(fā)明專利的數(shù)據(jù)子集總共使用了adni數(shù)據(jù)庫中461位受試者的smri和pet影像,其中nc受試者為246名,ad受試者為215名。我們根據(jù)受試者數(shù)量以70%、15%和15%的比例按受試者編號劃分?jǐn)?shù)據(jù)集,前n-1個編號的受試者用于網(wǎng)絡(luò)訓(xùn)練,n后的一半數(shù)據(jù)用于驗證,另一半用于測試,所有受試者沒有來自同一個人,這避免了由于數(shù)據(jù)泄露而導(dǎo)致的測試結(jié)果不準(zhǔn)確。利用clinica軟件平臺對兩種模態(tài)影像進(jìn)行預(yù)處理,經(jīng)過偏差校正,模板配準(zhǔn)和像素歸一化后得到標(biāo)準(zhǔn)的影像,預(yù)處理后的兩種影像分辨率大小為121×145×121。
5、2、步驟二中本發(fā)明提出了對兩種模態(tài)影像特征提取的實現(xiàn)。首先,將預(yù)處理后的兩種影像分別經(jīng)過兩個3d?resnet10子網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行特征提取,然后對4個卷積層中獲取的特征圖實施通道注意力機(jī)制作用,最后將每個卷積層中的多模態(tài)特征圖進(jìn)行拼接,得到4組多模態(tài)影像的融合特征,通過該方法對兩種腦影像實現(xiàn)了有效的特征提取,同時多模態(tài)影像通過互補(bǔ)信息特性提供了更好的特征特異性。
6、3、步驟三中本發(fā)明提出了空間金字塔池化對融合特征的降維,空間金字塔池化是一種增加感受野的方法,同時還解決了池化作用中導(dǎo)致的一些細(xì)節(jié)信息的損失問題??臻g金字塔池化模塊對融合特征作用后得到多尺度特征圖,其特征圖尺度分別為4×4×4、2×2×2和1×1×1,然后對多尺度特征圖進(jìn)行展平拼接,最后利用1維卷積分別對4組多模態(tài)特征降維,降維后的特征維度分別為128,256,512,1024,再將4組降維后的特征在全連接層中進(jìn)行拼接得到1960維度的1維特征向量。由于空間金字塔池化策略對融合特征表示階段考慮了多尺度信息,其池化作用使采樣特征具有更好的魯棒性,這些降維后的特征包含了多模態(tài)特征的多尺度信息,有利于網(wǎng)絡(luò)分類性能的進(jìn)一步提升。
7、4、步驟四中本發(fā)明提出了多模態(tài)子網(wǎng)絡(luò)非共享參數(shù)的訓(xùn)練方式,拼接后的1960維特征向量經(jīng)過全連接層和softmax后輸出最后的預(yù)測結(jié)果,多模態(tài)網(wǎng)絡(luò)中的兩個子網(wǎng)絡(luò)在訓(xùn)練時通過非共享參數(shù)的方式學(xué)習(xí)各自的影像特征,網(wǎng)絡(luò)采用交叉熵?fù)p失進(jìn)行優(yōu)化實現(xiàn)分類。
1.一種基于多模態(tài)影像特征融合的阿爾茨海默病分類方法,其特征在于包括以下步驟:
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于多模態(tài)影像特征融合的阿爾茨海默病分類方法,其特征在于步驟一中數(shù)據(jù)集的制作和預(yù)處理,構(gòu)建過程如下:基于公開數(shù)據(jù)集adni選擇同一受試者的smri和pet影像構(gòu)成本發(fā)明的數(shù)據(jù)集,通過非泄露方式劃分訓(xùn)練集、驗證集和測試集;對smri和pet影像進(jìn)行預(yù)處理,包括偏差校正,模板配準(zhǔn)和歸一化等流程,并對smri進(jìn)行灰質(zhì)組織的提取,預(yù)處理后的smri灰質(zhì)影像和pet影像的分辨率大小皆為121×145×121。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于多模態(tài)影像特征融合的阿爾茨海默病分類方法,其特征在于步驟二中多模態(tài)特征的提取和融合,構(gòu)建過程如下:將步驟一數(shù)據(jù)集中的smri灰質(zhì)和pet影像輸入3dresnet10殘差網(wǎng)絡(luò)中,獲得多模態(tài)影像特征并進(jìn)行特征融合;首先,兩個殘差子網(wǎng)絡(luò)分別對多模態(tài)影像進(jìn)行特征提取,然后對殘差網(wǎng)絡(luò)4個卷積層獲取的特征圖進(jìn)行通道注意力作用,再將作用后的特征圖在相應(yīng)卷積層中拼接得到4組融合后的多模態(tài)特征。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于多模態(tài)影像特征融合的阿爾茨海默病分類方法,其特征在于步驟三中多模態(tài)融合特征的降維,構(gòu)建過程如下:首先,利用空間金字塔池化對步驟二中獲取的多模態(tài)特征作用,獲得多尺度特征圖,其尺度分別為4×4×4、2×2×2和1×1×1,然后將多尺度特征圖展平后拼接,最后再利用1維卷積降維,對4組多模態(tài)特征降維后的特征維度分別為128、256、512、1024,在全連接層中再進(jìn)行融合得到1920維度的一維特征向量。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于多模態(tài)影像特征融合的阿爾茨海默病分類方法,其特征在于步驟四中多模態(tài)子網(wǎng)絡(luò)非共享參數(shù)的學(xué)習(xí)方式,構(gòu)建過程如下:將步驟三獲取的1920維度的1維向量經(jīng)過全連接層和softmax層得到最后的預(yù)測結(jié)果,多模態(tài)網(wǎng)絡(luò)采用交叉熵?fù)p失進(jìn)行優(yōu)化,兩個子網(wǎng)絡(luò)通過非共享參數(shù)的訓(xùn)練方式能更好地學(xué)習(xí)各模態(tài)影像的特征,進(jìn)一步提高了基于多模態(tài)影像特征融合的阿爾茨海默病輔助診斷性能。