本公開涉及生物信息處理，尤其涉及一種聯(lián)合變異基因檢測的進程中斷處理方法、裝置、電子設(shè)備及存儲介質(zhì)。

背景技術(shù)：

1、相關(guān)技術(shù)中，在進行群體基因組聯(lián)合變異檢測時，由于參與處理的樣本的數(shù)據(jù)量很大，計算規(guī)模大，使得群體基因組聯(lián)合變異檢測的總耗時較長。

2、這種方式下，如果聯(lián)合變異檢測運行中途出現(xiàn)機房斷電、集群中個別計算機硬件故障以及集群網(wǎng)絡(luò)故障等情況時，造成運行中斷，使得聯(lián)合變異檢測中斷，需重新進行分析處理，造成較大時間成本以及計算資源損失。

技術(shù)實現(xiàn)思路

1、本公開旨在至少在一定程度上解決相關(guān)技術(shù)中的技術(shù)問題之一。

2、為此，本公開的目的在于提出一種聯(lián)合變異基因檢測的進程中斷處理方法、裝置、電子設(shè)備、存儲介質(zhì)及計算機程序產(chǎn)品。

3、本公開第一方面實施例提出一種聯(lián)合變異基因檢測的進程中斷處理方法，包括：對變異記錄數(shù)據(jù)樣本進行區(qū)間劃分處理，得到變異記錄數(shù)據(jù)樣本對應(yīng)的數(shù)據(jù)處理區(qū)間，基于計算節(jié)點和數(shù)據(jù)處理區(qū)間對變異記錄數(shù)據(jù)樣本進行聯(lián)合變異檢測處理，在聯(lián)合變異檢測過程發(fā)生進程中斷事件時，獲取計算節(jié)點的檢測進度信息，根據(jù)檢測進度信息，對變異記錄數(shù)據(jù)樣本進行聯(lián)合變異檢測處理，得到目標群體基因組變異信息。

4、本公開第二方面實施例提出一種聯(lián)合變異基因檢測的進程中斷處理裝置，包括：第一處理模塊，用于對變異記錄數(shù)據(jù)樣本進行區(qū)間劃分處理，得到變異記錄數(shù)據(jù)樣本對應(yīng)的數(shù)據(jù)處理區(qū)間；第二處理模塊，用于基于計算節(jié)點和數(shù)據(jù)處理區(qū)間對變異記錄數(shù)據(jù)樣本進行聯(lián)合變異檢測處理；獲取模塊，用于在聯(lián)合變異檢測過程發(fā)生進程中斷事件時，獲取計算節(jié)點的檢測進度信息；第三處理模塊，用于根據(jù)檢測進度信息，對變異記錄數(shù)據(jù)樣本進行聯(lián)合變異檢測處理，得到目標群體基因組變異信息。

5、本公開第三方面實施例提出了一種電子設(shè)備，包括存儲器、處理器及存儲在存儲器上并可在處理器上運行的計算機程序，處理器執(zhí)行程序時，實現(xiàn)如本公開第一方面實施例提出的聯(lián)合變異基因檢測的進程中斷處理方法。

6、本公開第四方面實施例提出了一種非臨時性計算機可讀存儲介質(zhì)，其上存儲有計算機程序，該程序被處理器執(zhí)行時實現(xiàn)如本公開第一方面實施例提出的聯(lián)合變異基因檢測的進程中斷處理方法。

7、本公開第五方面實施例提出了一種計算機程序產(chǎn)品，當(dāng)計算機程序產(chǎn)品中的指令由處理器執(zhí)行時，執(zhí)行如本公開第一方面實施例提出的聯(lián)合變異基因檢測的進程中斷處理方法。

8、本公開實施例中提出的聯(lián)合變異基因檢測的進程中斷處理方法、裝置、電子設(shè)備、存儲介質(zhì)及計算機程序產(chǎn)品，至少可以包括以下有益效果：對變異記錄數(shù)據(jù)樣本進行區(qū)間劃分處理，得到變異記錄數(shù)據(jù)樣本對應(yīng)的數(shù)據(jù)處理區(qū)間，基于計算節(jié)點和數(shù)據(jù)處理區(qū)間對變異記錄數(shù)據(jù)樣本進行聯(lián)合變異檢測處理，在聯(lián)合變異檢測過程發(fā)生進程中斷事件時，獲取計算節(jié)點的檢測進度信息，根據(jù)檢測進度信息，對變異記錄數(shù)據(jù)樣本進行聯(lián)合變異檢測處理，得到目標群體基因組變異信息，能夠?qū)ψ儺愑涗洈?shù)據(jù)樣本進行區(qū)間劃分，基于細小數(shù)據(jù)處理區(qū)間進行聯(lián)合變異檢測處理，當(dāng)檢測處理發(fā)生意外中斷時，獲取未完成檢測的數(shù)據(jù)處理區(qū)間繼續(xù)啟動檢測處理任務(wù)以實現(xiàn)中斷續(xù)跑，有效減少檢測處理的損失，維持檢測處理的平穩(wěn)完成。

9、本公開附加的方面和優(yōu)點將在下面的描述中部分給出，部分將從下面的描述中變得明顯，或通過本公開的實踐了解到。

技術(shù)特征：

1.一種聯(lián)合變異基因檢測的進程中斷處理方法，其特征在于，包括：

2.如權(quán)利要求1所述的方法，其特征在于，所述根據(jù)所述檢測進度信息，對所述變異記錄數(shù)據(jù)樣本進行聯(lián)合變異檢測處理，得到目標群體基因組變異信息，包括：

3.如權(quán)利要求2所述的方法，其特征在于，所述基于所述計算節(jié)點和所述未被檢測的數(shù)據(jù)處理區(qū)間對所述未檢測變異記錄數(shù)據(jù)進行聯(lián)合變異檢測處理，得到第二群體基因組變異信息，包括：

4.如權(quán)利要求2所述的方法，其特征在于，所述處理所述第一群體基因組變異信息和所述第二群體基因組變異信息，得到所述目標群體基因組變異信息，包括：

5.如權(quán)利要求1所述的方法，其特征在于，所述對變異記錄數(shù)據(jù)樣本進行區(qū)間劃分處理，得到所述變異記錄數(shù)據(jù)樣本對應(yīng)的數(shù)據(jù)處理區(qū)間，包括：

6.如權(quán)利要求5所述的方法，其特征在于，所述根據(jù)所述群體來源標識信息，確定所述變異記錄數(shù)據(jù)樣本對應(yīng)的區(qū)間劃分模式，包括：

7.如權(quán)利要求6所述的方法，其特征在于，所述根據(jù)所述區(qū)間劃分模式對所述變異記錄數(shù)據(jù)樣本進行區(qū)間劃分處理，得到所述數(shù)據(jù)處理區(qū)間，包括：

8.如權(quán)利要求7所述的方法，其特征在于，所述根據(jù)所述參考位點數(shù)量和變異位點密度信息對所述變異記錄數(shù)據(jù)樣本進行區(qū)間劃分處理，得到所述數(shù)據(jù)處理區(qū)間，包括：

9.如權(quán)利要求7所述的方法，其特征在于，所述根據(jù)所述參考位點數(shù)量和等位基因密度信息對所述變異記錄數(shù)據(jù)樣本進行區(qū)間劃分處理，得到所述數(shù)據(jù)處理區(qū)間包括：

10.一種聯(lián)合變異基因檢測的進程中斷處理裝置，其特征在于，包括：

11.如權(quán)利要求10所述的裝置，其特征在于，所述第一處理模塊，包括：

12.一種電子設(shè)備，其特征在于，包括：

13.一種計算機可讀存儲介質(zhì)，其特征在于，其上存儲有計算機程序，該程序被處理器執(zhí)行時實現(xiàn)如權(quán)利要求1-9中任一項所述方法。

技術(shù)總結(jié)
本公開提出一種聯(lián)合變異基因檢測的進程中斷處理方法、裝置、電子設(shè)備及存儲介質(zhì)，該方法包括：對變異記錄數(shù)據(jù)樣本進行區(qū)間劃分處理，得到數(shù)據(jù)處理區(qū)間，基于計算節(jié)點和數(shù)據(jù)處理區(qū)間對變異記錄數(shù)據(jù)樣本進行聯(lián)合變異檢測處理，在聯(lián)合變異檢測過程發(fā)生進程中斷事件時，獲取計算節(jié)點的檢測進度信息，根據(jù)檢測進度信息，對變異記錄數(shù)據(jù)樣本進行聯(lián)合變異檢測處理，得到目標群體基因組變異信息。通過本公開，能夠?qū)ψ儺愑涗洈?shù)據(jù)樣本進行區(qū)間劃分，基于細小數(shù)據(jù)處理區(qū)間進行聯(lián)合變異檢測處理，當(dāng)檢測處理發(fā)生意外中斷時，獲取未完成檢測的數(shù)據(jù)處理區(qū)間繼續(xù)啟動檢測處理任務(wù)以實現(xiàn)中斷續(xù)跑，有效減少檢測處理的損失，維持檢測處理的平穩(wěn)完成。

技術(shù)研發(fā)人員：唐靜波,鐘子寅,謝寅龍
受保護的技術(shù)使用者：深圳華大智造科技股份有限公司
技術(shù)研發(fā)日：
技術(shù)公布日：2024/12/19