亚洲成年人黄色一级片,日本香港三级亚洲三级,黄色成人小视频,国产青草视频,国产一区二区久久精品,91在线免费公开视频,成年轻人网站色直接看

預(yù)測(cè)對(duì)治療的應(yīng)答的方法

文檔序號(hào):432360閱讀:320來源:國知局

專利名稱::預(yù)測(cè)對(duì)治療的應(yīng)答的方法預(yù)測(cè)對(duì)治療的應(yīng)答的方法發(fā)明領(lǐng)域本發(fā)明涉及預(yù)測(cè)對(duì)在患者中使用HER二聚化抑制劑治療的應(yīng)答的方法,所述方法包括下述步驟在來自患者的生物樣品中評(píng)估選自由表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子oc和HER2標(biāo)記基因組成的組的標(biāo)記基因或標(biāo)記基因的組合,或標(biāo)記基因組合,其包括雙調(diào)蛋白標(biāo)記基因和選自上皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子oc和HER2標(biāo)記基因的標(biāo)記基因,并且通過評(píng)估第一步的結(jié)果而預(yù)測(cè)在患者中使用HER二聚體化抑制劑治療的應(yīng)答。還公開在其中應(yīng)用這些標(biāo)記的其它應(yīng)用和方法。發(fā)明背景人表皮生長因子受體(ErbB或HER)家族包括4個(gè)成員(HER14),通過激活復(fù)雜的信號(hào)級(jí)聯(lián),這些成員是細(xì)胞生長、存活和分化的重要的調(diào)控子。來自表皮生長因子(EGF)超家族的至少11種不同的基因產(chǎn)物結(jié)合這些受體中的三種,EGFR(也叫作ErbBl或HER1),HER3(ErbB3)和HER4(ErbB4)。盡管還沒有鑒定結(jié)合和激活HER2(ErbB2或neu)的配體,一般理解,HER2是與其它HER受體合作作用以擴(kuò)增并且在一些情形中起始受體-配體信號(hào)傳導(dǎo)的共同受體。與相同的受體類型(同型二聚體作用)或另一種HER家族成員(異型二聚化作用)的二聚化作用對(duì)于它們的活性是重要的。HER2是用于其它HER家族成員的優(yōu)選的二聚化配偶體。充分記錄了HER家族在許多上皮腫瘤類型中的作用,并且HER家族的作用已經(jīng)導(dǎo)致合理研發(fā)特異性針對(duì)HER受體的新型癌癥藥劑。重組人源化抗-HER2單克隆抗體(MAb)曲妥單抗是患有HER2-陽性轉(zhuǎn)移乳腺癌(MBC)患者的護(hù)理標(biāo)準(zhǔn)。HER2蛋白堪因的過表達(dá)/擴(kuò)增,其在20-30%的乳腺癌病例中發(fā)生,是使用曲妥單抗治療的先決條件。Pertuzumab(Omnitarg;以前為2C4)是第一種已知為HER二聚化抑制齊IJ(HDIs)的新種類藥劑。Pertuzumab在其二聚化結(jié)構(gòu)域結(jié)合HER2,由此抑制其形成活性二聚體受體復(fù)合物的能力,.并且因此阻滯最終導(dǎo)致細(xì)胞生長和分裂的下游信號(hào)級(jí)聯(lián)。Pertuzumab是針對(duì)HER2細(xì)胞外結(jié)構(gòu)域的完全人源化的重組單克隆抗體。Pertuzumab與在人上皮細(xì)胞上的HER2的結(jié)合防止HER2與HER家族的其它成員(包括EGFR,HER3,HER4)形成復(fù)合物以及可能的HER2二聚體化。通過阻滯復(fù)合物形成,Pertuzumab防止由HER1、HER3和HER4的配體(例如,EGF,TGFa,雙調(diào)蛋白,和調(diào)蛋白)激活的生長-刺激作用和細(xì)胞存活信號(hào)。Pertuzumab的其它名稱為2C4或OmnitargTM。Pertuzumab是基于人IgGl(K)構(gòu)架序列的完全人源化的重組單克隆抗體。Pertuzumab的結(jié)構(gòu)由兩條重鏈(449個(gè)殘基)和兩條輕鏈(214個(gè)殘基)組成。與曲妥單抗(Herceptin⑧)相比,Pertuzumab在輕鏈中有12個(gè)氨基酸差異,并且在IgGl重鏈中有29個(gè)氨基酸差異。WO2004/092353和WO2004/091384描述Her2與其它受體形成異型二聚體應(yīng)該與Pertuzumab的效力和適用性聯(lián)系。Zabrecky,J.R.等,J.Biol.Chem.(生物的化學(xué)雜志)266(1991)1716-1720公開,Her2細(xì)胞外結(jié)構(gòu)域的釋放可能參與瘤形成,并且其檢測(cè)可以用作癌癥診斷。Colomer,R.等,Clin.CancerRes.(臨床癌癥研究)6(2000)2356-2362公開在晚期乳腺癌中循環(huán)Her2細(xì)胞外結(jié)構(gòu)域和對(duì)化學(xué)治療的抗性。Hait,W.N.,Clin.CancerRes.(臨床癌癥研究)7(2001)2601-2604綜合評(píng)論了Her2細(xì)胞外結(jié)構(gòu)域的診斷和預(yù)測(cè)價(jià)值。發(fā)明概述仍然需要提供在使用HER二聚化抑制劑治療的癌癥患者中確定疾病發(fā)展的其它方法。因此,在本發(fā)明的一個(gè)實(shí)施方案中,提供在患者中預(yù)測(cè)對(duì)使用HER二聚化抑制劑治療的應(yīng)答的方法,所述方法包括步驟a)在來自患者的生物樣品中評(píng)估-選自由表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a和HER2標(biāo)記基因組成的組的標(biāo)記基因或標(biāo)記基因的組合,或-標(biāo)記基因組合,其包括雙調(diào)蛋白標(biāo)記基因和選自表皮生長因子、9轉(zhuǎn)化生長因子a和HER2標(biāo)記基因的標(biāo)記基因,和b)通過評(píng)估步驟a)的結(jié)果而預(yù)測(cè)在患者中使用HER二聚體化抑制劑治療的應(yīng)答。在本發(fā)明的另一個(gè)實(shí)施方案中,在嚴(yán)格條件下與表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a或HER2標(biāo)記多聚核苷酸雜交的探針,或與表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a或HER2標(biāo)記蛋白結(jié)合的抗體,用來預(yù)測(cè)在患者中使用HER二聚體化抑制劑治療的應(yīng)答,或者在嚴(yán)格條件下與雙調(diào)蛋白、表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a或HER2標(biāo)記多聚核苷酸雜交的探針,或與雙調(diào)蛋白、表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a或HER2標(biāo)記蛋白結(jié)合的抗體用來選擇在患者中抑制疾病發(fā)展的組合物。在本發(fā)明的另一個(gè)實(shí)施方案中,提供一種試劑盒,其包括在嚴(yán)格條件下與雙調(diào)蛋白、表皮生長因子、轉(zhuǎn)化因子a或HER2標(biāo)記多聚核苷酸退火的探針,或者與雙調(diào)蛋白、表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a或HER2標(biāo)記蛋白結(jié)合的抗體。在本發(fā)明的另一個(gè)實(shí)施方案中,提供選擇抑制患者的疾病發(fā)展的組合物的方法,所述方法包括a)在多種測(cè)試組合物存在下,分別暴露包含來自癌癥患者的生物樣品的整分試樣;b)將與測(cè)試組合物接觸的生物樣品整分試樣中選自由雙調(diào)蛋白、表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a和HER2標(biāo)記基因組成的組的標(biāo)記基因或標(biāo)記基因的組合的表達(dá)水平與沒有接觸測(cè)試組合物的生物樣品整分試樣中選自由雙調(diào)蛋白、表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a和HER2標(biāo)記基因組成的組的標(biāo)記基因或標(biāo)記基因的組合的表達(dá)水平進(jìn)行比較;c)相對(duì)于沒有接觸測(cè)試組合物的整分試樣,選擇在包含所述測(cè)試組合物的整分試樣中改變了所述標(biāo)記基因或標(biāo)記基因的組合的表達(dá)水平的一種測(cè)試組合物,其中在與所述測(cè)試組合物接觸的生物樣品的整分試樣中所述標(biāo)記基因或標(biāo)記基因的組合的表達(dá)水平與在沒有接觸所述測(cè)試組合物的生物樣品的整分試樣中的所述相應(yīng)標(biāo)記基因或標(biāo)記基因的組合的表達(dá)水平之間存在至少10%的差異是選擇所述測(cè)試組合物的指征。在本發(fā)明的另一個(gè)實(shí)施方案中,提供一種獲得候選藥劑的方法,所述方法包括a)將來自癌癥患者的生物樣品的整分試樣與候選藥劑接觸,并且確定選自由雙調(diào)蛋白、表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子oc和HER2標(biāo)記基因組成的組的標(biāo)記基因或標(biāo)記基因的組合在所述整分試樣中的表達(dá)水平,b)確定在沒有與所述候選藥劑接觸的生物樣品整分試樣中相應(yīng)的標(biāo)記基因或相應(yīng)的標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平,c)通過將與所述候選藥劑接觸的生物樣品的整分試樣中所述標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平與在沒有接觸所述候選藥劑的生物樣品的整分試樣中相應(yīng)的標(biāo)記基因或相應(yīng)的標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平進(jìn)行比較,而觀察所述候選藥劑的效果,d)通過所述觀察到的效果獲得所述藥劑,其中在與所述候選藥劑接觸的生物樣品的整分試樣中所述標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平與在沒有接觸所述候選藥劑的生物樣品的整分試樣中的相應(yīng)的標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平之間存在至少10%的差異是所述候選藥劑作用的指征。在本發(fā)明的另一個(gè)實(shí)施方案中,提供通過按照本發(fā)明的方法獲得的候選藥劑或包含按照本發(fā)明的藥劑的藥物制劑。在本發(fā)明的另一個(gè)實(shí)施方案中,提供按照本發(fā)明的藥劑用于制備治療癌癥的組合物。在本發(fā)明的另一個(gè)實(shí)施方案中,提供生產(chǎn)藥物的方法,其包括本發(fā)明的方法的步驟和i)以足以對(duì)受試者以治療有效量提供所述藥物的量合成在步驟(c)中鑒定的候選藥劑或其類似物或衍生物;和/或ii)將步驟(c)中鑒定的藥物候選物候選藥劑或其類似物或衍生物與藥用載體結(jié)合。在本發(fā)明的另一個(gè)實(shí)施方案中,選自由雙調(diào)蛋白、表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子oc和HER2標(biāo)記蛋白或標(biāo)記多聚核苷酸組成的組的標(biāo)記蛋白或標(biāo)記多聚核苷酸用于獲得候選藥劑或者用于選擇在患者中抑制疾病發(fā)展的組合物。在本發(fā)明的另一個(gè)實(shí)施方案中,HER二聚體化抑制劑用于制備用來治療人癌癥患者的藥物,其特征在于所述治療或療法包括評(píng)估來自患者的生物樣品。-選自由表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a和HER2標(biāo)記基因組成的組的標(biāo)記基因或標(biāo)記基因的組合,或-標(biāo)記基因的組合,其包括雙調(diào)蛋白標(biāo)記基因和選自表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a和HER2標(biāo)記基因的標(biāo)記基因。冠詞"a"和"an"用于本文是指一個(gè)到多于一個(gè)(即,到至少一個(gè))的冠詞的語法實(shí)體。通過舉例的方式,"anelement"意指一個(gè)元件或者多于一個(gè)元件。術(shù)語"生物樣品"應(yīng)該一般意指從個(gè)體、體液、細(xì)胞系、組織培養(yǎng)物或其它來源獲得的任何生物樣品。體液例如淋巴、血清、血漿、尿、精液、滑液和脊髓液。從哺乳動(dòng)物獲得活組織切片和體液的方法是本領(lǐng)域內(nèi)公知的。如果術(shù)語"樣品"單獨(dú)使用時(shí),它還應(yīng)該意指所述"樣品"是"生物樣品",即,所述術(shù)語互換地使用。術(shù)語"對(duì)使用HER二聚體化抑制劑的治療的應(yīng)答"或"患者對(duì)使用HER二聚體化抑制劑的治療的應(yīng)答"是指使用HER二聚體化抑制劑的治療或者作為使用HER二聚體化抑制劑治療的結(jié)果所給與患有疾病或病況(諸如癌癥)的患者的臨床益處。臨床益處包括來自于使用HER二聚體化抑制劑治療或者作為使用HER二聚體化抑制劑治療的結(jié)果的完全緩解、部分緩解、穩(wěn)定的疾病(沒有發(fā)展)、沒有進(jìn)展的存活、沒有疾病的存活、在(疾病)進(jìn)展時(shí)間上的改善、在死亡時(shí)間上的改善、或者在患者的全部生存時(shí)間上的改善。存在確定對(duì)治療的應(yīng)答的標(biāo)準(zhǔn),并且這些標(biāo)準(zhǔn)允許比較備選治療方案的功效(Slapak和Kufe,PrinciplesofCancerTherapy,inHarrisons'sPrinciplesofInternalMedicine,(Harrisons內(nèi)禾斗醫(yī)學(xué)原理的癌癥治療原理),第13版,eds.Isselbacher等,McGraw-Hill有限公司,1994)。例如,癌癥的完全應(yīng)答或完全緩解是所有可檢測(cè)的惡性疾病的消失。例如,癌癥的部分應(yīng)答或部分緩解可以是在一個(gè)或多個(gè)損傷最大垂直直徑的產(chǎn)物中大約50%的減少,或者在任何損傷的大小中不存在增加或不出現(xiàn)新的損傷。當(dāng)用于本文時(shí),術(shù)語"癌癥發(fā)展"包括并且可以指轉(zhuǎn)移,癌癥復(fù)發(fā),或在一個(gè)損傷的最大垂直直徑的產(chǎn)物中至少大約25%的增加或者出現(xiàn)新的損傷。如果癌癥的復(fù)發(fā)或轉(zhuǎn)移被減少、減緩、延遲或防止,那么癌癥優(yōu)選乳腺癌的發(fā)展得到"抑制"。術(shù)語"發(fā)展/死亡時(shí)間(TTP)"是"沒有進(jìn)展的存活(PFS)"的同義語。這描述了通常用于腫瘤學(xué)試驗(yàn)的臨床終點(diǎn)。在此處,對(duì)每名患者的檢查等于從開始對(duì)試驗(yàn)患者進(jìn)行治療(如在試驗(yàn)過程中定義)直到檢測(cè)惡性發(fā)展(如在試驗(yàn)流程中所定義)或者任何不幸的發(fā)作(不論是否是首次發(fā)作)而經(jīng)過的時(shí)間。如果在一段時(shí)間后停止觀察患者(例如,在研究末期),并且沒有觀察到癥狀,那么這一觀察時(shí)間t叫作"經(jīng)過檢査"。術(shù)語"死亡時(shí)間(TTD)"是"全部生存(OS)"的同義語。這描述通常用于腫瘤學(xué)試驗(yàn)的臨床終點(diǎn)。在此處,對(duì)每名患者的檢査等于從開始對(duì)試驗(yàn)患者進(jìn)行治療(如在方法中所定義)直到任何不幸的發(fā)作而經(jīng)過的時(shí)間。如果在一段時(shí)間t后停止觀察患者(例如,在研究末期),并且患者到這時(shí)存活,那么這一觀察時(shí)間t叫作"經(jīng)過檢査"。術(shù)語"共變量"具有下述意義。在回歸模型中通??紤]臨床終點(diǎn),其中所述終點(diǎn)代表因變量并且生物標(biāo)記代表主要的或目標(biāo)獨(dú)立變量(回歸量)。如果考慮來自臨床數(shù)據(jù)庫的其它變量,那么這些表示為(臨床)共變量。術(shù)語"臨床共變量"在此處用來描述所有關(guān)于患者的臨床信息,其通常在基線可獲得。這些臨床共變量包括人口統(tǒng)計(jì)學(xué)信息,如性別、年齡等,其它既往癥信息,伴隨疾病,伴隨治療,體檢結(jié)果,獲得的普通實(shí)驗(yàn)室參數(shù),目標(biāo)腫瘤的己知特征,量化惡性疾病的程度的信息,臨床表現(xiàn)得分如ECOG或Kamofsky指數(shù),臨床疾病分段,預(yù)治療的時(shí)間選擇和結(jié)果以及疾病歷史,和所有類似的信息,其可以與臨床預(yù)后相關(guān)。術(shù)語"原始或未調(diào)整的分析"在本文是指回歸分析,其中除了考慮的生物標(biāo)記外,在回歸模型中不應(yīng)用其它的臨床共變量,既不作為獨(dú)立因子也不作為分層共變量。術(shù)語"通過共變量調(diào)整"是指回歸分析,其中除了考慮的生物標(biāo)記外,在回歸模型中使用其它臨床共變量,作為獨(dú)立因子或者作為分層共變量。術(shù)語"單變量"在本文是指回歸模型或繪圖方法,其中作為獨(dú)立的變量只有一個(gè)目標(biāo)生物標(biāo)記是所述模型的一部分。可以考慮這些單變量模型,有和無其它臨床共變量。術(shù)語"多變量"在本文是指回歸模型或繪圖方法,其中作為獨(dú)立的變量多于一個(gè)的目標(biāo)生物標(biāo)記是所述模型的一部分。可以考慮這些多變量模型,有和無其它臨床共變量。"核苷酸"是進(jìn)一步包含與核苷的糖部分共價(jià)連接的磷酸基的"核苷"。對(duì)于那些包含五元呋喃糖基糖的"核苷",磷酸基可以連接到糖的2'、3'或5'羥基部分。"核苷酸"是"寡核苷酸"的"單體單位",在本文更通常表示為"寡聚體化合物",或者"多聚核苷酸",更通常表示為"多聚體化合物"。由此其它通用表述為脫氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)。當(dāng)用于本文時(shí),術(shù)語"多聚核苷酸"與"核酸"同義。術(shù)語"探針"是指合成的或生物產(chǎn)生的核酸(DNA或RNA),通過設(shè)計(jì)或選擇,其包含允許它們?cè)诙x的預(yù)先確定的嚴(yán)格性下特異地(即,優(yōu)先)與"核酸"雜交的特異性核苷酸序列。"探針"可以鑒定為"捕獲探針",意指其"捕獲"所述核酸,以致它可以從可能掩蓋其檢測(cè)的不需要的物質(zhì)中分離出來。當(dāng)完成分離時(shí),檢測(cè)捕獲的"目標(biāo)核酸"可以使用適當(dāng)?shù)姆椒▽?shí)現(xiàn)。"捕獲探針"通常已經(jīng)附著到固相上。按照本發(fā)明,術(shù)語在"嚴(yán)格條件"下的雜交給出與Sambrook等(MolecularCloning,ALaboratoryManual(分子克隆,實(shí)驗(yàn)室手冊(cè)),ColdSpringHarborLaboratoryPress(冷泉港實(shí)驗(yàn)室出版社)(1989),第U01-1.104段)中相同的含義。優(yōu)選地,"嚴(yán)格雜交"是這樣的情形,艮卩,當(dāng)用1XSSC和0.1%SDS在50°C,優(yōu)選地在55。C,更優(yōu)選地在62。C,并且最優(yōu)選地在68"C洗滌1小時(shí)后,并且更優(yōu)選地用0.2XSSC和0.P/。SDS在5(TC,優(yōu)選地在55。C,更優(yōu)選地在62。C,并且最優(yōu)選地在68"C洗滌1小時(shí)后,仍然檢測(cè)得到雜交信號(hào)。SSC緩沖液的組成在Sambrook等(MolecularCloning,ALaboratoryManual(分子克隆,實(shí)驗(yàn)室手冊(cè)),ColdSpringHarborLaboratoryPress(冷泉港實(shí)驗(yàn)室出版社)(1989))中描述。"轉(zhuǎn)錄的多聚核苷酸"是與通過基因轉(zhuǎn)錄,諸如本發(fā)明的標(biāo)記基因的轉(zhuǎn)錄,和如果有的話,所述轉(zhuǎn)錄物的正常的轉(zhuǎn)錄后加工(例如,剪接)而形成的成熟RNA的全部或部分互補(bǔ)或同源的多聚核苷酸(例如,RNA,cDNA,或者RNA或cDNA中一種的類似物)。術(shù)語"cDNA"是互補(bǔ)DNA,mRNA的單鏈或雙鏈DNA拷貝的縮寫。術(shù)語"mRNA"是作為蛋白合成的模板的RNA的縮寫。術(shù)語"標(biāo)記基因"意欲包括按照本發(fā)明用于在患者中、特別是在乳腺癌患者中確定癌癥的發(fā)展的基因。它還可以叫作癌癥、優(yōu)選地乳腺癌標(biāo)記基因。術(shù)語"標(biāo)記多聚核苷酸"意欲包括由按照本發(fā)明的標(biāo)記基因編碼的核苷酸轉(zhuǎn)錄物(hnRNA或mRNA),或者從所述核苷酸轉(zhuǎn)錄物衍生的cDNA,或者所述轉(zhuǎn)錄物或cDNA的片段。術(shù)語"標(biāo)記蛋白"或"標(biāo)記多肽"意欲包括由按照本發(fā)明的標(biāo)記基因編碼的蛋白或多肽,或者包含所述標(biāo)記蛋白的多肽或蛋白片段。術(shù)語"基因產(chǎn)物"意欲包括標(biāo)記多聚核苷酸和由所引用的基因編碼的標(biāo)記蛋白。如果標(biāo)記基因在來自患者的樣品中的表達(dá)水平不同于在來自參照受試者的樣品的水平,達(dá)到大于用來評(píng)估表達(dá)的檢測(cè)的標(biāo)準(zhǔn)誤差的量,并且優(yōu)選地至少10%,并且更優(yōu)選地為所述量的25%,50%,75%,100%,125%,150%,175%,200%,300%,400%,500%或1,000%,那么標(biāo)記基因的表達(dá)"顯著"不同于所述標(biāo)記基因在參照樣品中的表達(dá)水平。備選地,如果在來自患者的樣品中的表達(dá)水平低于在來自對(duì)照受試者的樣品中的水平,達(dá)到大于用來評(píng)估表達(dá)的檢測(cè)的標(biāo)準(zhǔn)誤差的量,并且優(yōu)選地至少10%,并且更優(yōu)選地為所述量的25%,50%,75%,100%,125%,150%,175%,200%,300%,400%,500%或1,000%,那么可以認(rèn)為標(biāo)記基因在患者中的表達(dá)"顯著"低于在對(duì)照受試者中的表達(dá)水平。如果它與之相關(guān),特別優(yōu)選地它與之相同,那么標(biāo)記多聚核苷酸或標(biāo)記蛋白與另一種標(biāo)記多聚核苷酸或標(biāo)記蛋白"相對(duì)應(yīng)"。術(shù)語"表達(dá)的zK平(levelofexpression)"或"表達(dá)水平(expressionlevel)"互換使用,并且通常是指樣品中多聚核苷酸或氨基酸產(chǎn)物或蛋白的量。"表達(dá)"通常是指這樣的過程,即通過這樣的過程基因編碼的信息轉(zhuǎn)換成在細(xì)胞中存在并且運(yùn)作的結(jié)構(gòu),因此,按照本發(fā)明術(shù)語(標(biāo)記)基因的"表達(dá)"包括轉(zhuǎn)錄成多聚核苷酸,翻譯成蛋白以及甚至蛋白的翻譯后修飾。轉(zhuǎn)錄的多聚核苷酸、翻譯的蛋白或翻譯后修飾的蛋白的片段也應(yīng)該視為表達(dá),而不管它們是否起始于,例如,通過交替剪接產(chǎn)生的轉(zhuǎn)錄物,降解的轉(zhuǎn)錄物,或者起始于蛋白的翻譯后加工,例如,通過蛋白水解的加工。當(dāng)用于本文時(shí),"表達(dá)的基因"包括轉(zhuǎn)錄成作為mRNA的多聚核苷酸然后翻譯成蛋白的那些基因。這一術(shù)語還應(yīng)該包括轉(zhuǎn)錄成RNA但是不翻譯成蛋白的那些表達(dá)的基因(例如,轉(zhuǎn)運(yùn)和核糖體RNAs)。術(shù)語"過量表達(dá)"和"低量表達(dá)(underexpression)"分別是指當(dāng)與用作對(duì)照的樣品中的基線表達(dá)水平相比時(shí)表達(dá)水平的向上或向下的偏差。因此,"過量表達(dá)"也是"增加的表達(dá)","低量表達(dá)"是"減少的表達(dá)"。術(shù)語"雙調(diào)蛋白"涉及編碼蛋白的基因,并且涉及蛋白本身,所述蛋白為表皮生長因子家族的一員。它是一種自分泌生長因子以及星形膠質(zhì)細(xì)胞、神經(jīng)膜細(xì)胞和成纖維原細(xì)胞的促分裂原。它涉及表皮生長因子(EGF)和轉(zhuǎn)化生長因子oc(TGF-oc)。這種蛋白與EGF/TGF-a受體相互作用,以促進(jìn)正常上皮細(xì)胞的生長,并且抑制某些侵入性癌癥細(xì)胞系的生長。按照本發(fā)明,雙調(diào)蛋白的氨基酸序列是按照SEQIDNO:1的氨基酸序列。按照本發(fā)明,"雙調(diào)蛋白"cDNA的核酸序列是按照SEQIDNO:5的核酸序列,其可在GenBank上獲得,登記號(hào)為NM_001657。術(shù)語"轉(zhuǎn)化生長因子a"涉及編碼蛋白的基因,并且涉及蛋白本身,所述蛋白為轉(zhuǎn)化生長因子(TGFs)家族的一員。這些是生物活性多肽,其可逆地賦予培養(yǎng)的細(xì)胞轉(zhuǎn)化的表型。"轉(zhuǎn)化生長因子-a"表現(xiàn)出與表皮生長因子約40%的序列相同性,并且與EFG競爭與EGF受體結(jié)合,刺激其磷酸化,并且產(chǎn)生促有絲分裂的反應(yīng)。按照本發(fā)明,"轉(zhuǎn)化生長因子-a"的氨基酸序列是按照SEQIDNO:3的氨基酸序列。按照本發(fā)明,"轉(zhuǎn)化生長因子-a"cDNA的核酸序列是按照SEQIDNO:7的核酸序列,其可在GenBank獲得,登記號(hào)為NM—003236。術(shù)語"表皮生長因子"涉及編碼蛋白的基因,并且涉及蛋白本身,所述蛋白為生長因子家族的一員。"表皮生長因子(EGF)"對(duì)體內(nèi)特異細(xì)胞的分化具有深遠(yuǎn)的作用,并且是外胚層和中胚層來源的各種培養(yǎng)的細(xì)胞的有力的促有絲分裂因子。據(jù)信EGF前體作為膜-結(jié)合的分子而存在,其蛋白水解分裂產(chǎn)生刺激細(xì)胞分裂的53個(gè)氮基酸的肽激素。按照本發(fā)明,"表皮生長因子"的氨基酸序列是按照SEQIDNO:2的氨基酸序列。按照本發(fā)明,"表皮生長因子(EGF)"cDNA的核酸序列是按照SEQIDNO.6的核酸序列,其可在GenBank獲得,登記號(hào)為NM—001963。"表皮生長因子受體"縮寫為EGFR,一種170-kD的糖蛋白,由N-端細(xì)胞外結(jié)構(gòu)域、疏水性跨膜結(jié)構(gòu)域、和含有激酶結(jié)構(gòu)域的C-端細(xì)胞內(nèi)區(qū)域組成。mRNA具有翻譯成不同的受體蛋白的不同的變體。按照本發(fā)明,"表皮生長因子受體"的氨基酸序列是按照SEQIDNO:11(轉(zhuǎn)錄變體1;GenBank登記號(hào)NM—005228),SEQIDNO:12(轉(zhuǎn)錄變體2;GenBank登記號(hào)NM—201282),SEQIDNO:13(轉(zhuǎn)錄變體3;GenBank登記號(hào)NM_201283),或SEQIDNO:14(轉(zhuǎn)錄變體4;GenBank登記號(hào)NM—201284)的氨基酸序列。EGFR,其由erbBl基因編碼,己經(jīng)有原因地參與人惡性腫瘤。特別地,已經(jīng)在乳腺癌、膀胱癌、肺癌、頭癌、頸癌和胃癌以及成膠質(zhì)細(xì)胞瘤中觀察到增加的EGFR表達(dá)。EGFR配體-誘導(dǎo)的二聚體化激活內(nèi)在的RTK結(jié)構(gòu)域(Src同源結(jié)構(gòu)域l,SHl),這導(dǎo)致在細(xì)胞質(zhì)結(jié)構(gòu)域的非催化尾中的6個(gè)特異的EGFR酪氨酸殘基的自動(dòng)磷酸化。癌細(xì)胞中EGFR激活的細(xì)胞作用包括增加的增殖,細(xì)胞運(yùn)動(dòng)的促進(jìn),粘附,侵入,血管發(fā)生,和通過抑制細(xì)胞程序性死亡而提高細(xì)胞存活。激活的EGFR通過刺激促分裂原-激活的蛋白激酶(MAPK)級(jí)聯(lián)而誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞增殖。術(shù)i吾"人neu","c-erbB-2","erbB2","erbB-2","HER-2/腿","Her2"和"HER-2"在本文互換使用。術(shù)語"Her2"涉及編碼蛋白的基因,并且涉及蛋白本身,所述蛋白為受體酪氨酸激酶的表皮生長因子(EGF)受體家族的家族的一員。這種蛋白沒有結(jié)合其自身的結(jié)構(gòu)域的配體,并且因此不能結(jié)合生長因子。然而,它的確牢固地結(jié)合其它配體-結(jié)合的EGF受體家族成員,以形成異型二聚體,這穩(wěn)定結(jié)合并且增強(qiáng)下游信號(hào)傳導(dǎo)途徑的激酶-調(diào)控的活化作用的配體,諸如包括促分裂原-激活的蛋白激酶和磷脂酰肌醇-3激酶的那些。已經(jīng)報(bào)道了在同種型a的氨基酸位置654和655(同種型b的位置624和625)的等位基因變異,其中按照本發(fā)明,最常見的等位基因,11e654/Ile655是優(yōu)選的。已經(jīng)在許多癌癥中,包括乳腺和卵巢腫瘤,報(bào)道了這一基因的擴(kuò)增和/或過量表達(dá)。交替剪接導(dǎo)致一些其它的轉(zhuǎn)錄變體,一些編碼不同的同種型,另一些尚未被充分地表征。按照本發(fā)明,Her2的氨基酸序列是按照SEQIDNO:4的氨基酸序列。按照本發(fā)明,"Her2"cDNA的核酸序列是按照SEQIDNO:8的核酸序列,其可在17GenBank獲得,登記號(hào)為NM—004448.2。"Her2的細(xì)胞外結(jié)構(gòu)域"或"Her2的切除的細(xì)胞外結(jié)構(gòu)域(shedextracellulardomainofHer2)"是一種97-115kDa的糖蛋白,其基本上對(duì)應(yīng)人Her2基因產(chǎn)物的細(xì)胞外結(jié)構(gòu)域。它可以作為p105(Zabrecky,J.R.等,J.Biol.Chem.(生物的化學(xué)雜志)266(1991)1716-1720;US5,401,638;US5,604,107)。Her2細(xì)胞外結(jié)構(gòu)域的量化和檢測(cè)在US5,401,638禾BUS5,604,107中描述。術(shù)語"Her3"代表受體酪氨酸激酶的表皮生長因子受體(EGFR)家族的另一個(gè)成員。這種膜-結(jié)合的蛋白沒有活性激酶結(jié)構(gòu)域。所述的蛋白可以結(jié)合配體,但是不能將信號(hào)傳輸?shù)郊?xì)胞內(nèi)。它與其它EGF受體家族成員形成異型二聚體,所述其它EGF受體家族成員的確具有導(dǎo)致細(xì)胞增殖或分化的激酶活性。在許多癌癥中發(fā)現(xiàn)這種基因的擴(kuò)增和/或其蛋白的過量表達(dá)。按照本發(fā)明,"Her3"cDNA的氨基酸序列是按照SEQIDNO:9的氨基酸序列,其可在GenBank從具有登記號(hào)NM—001005915的Her3的核酸序列的翻譯而獲得。按照本發(fā)明,"Her3"cDNA的核酸序列是按照SEQIDNO:10的核酸序列,其可在GenBank獲得,登記號(hào)為NM—001005915。術(shù)語"抗體"在本文以最寬泛的意義應(yīng)用,并且特別涵蓋完整的單克隆抗體、多克隆抗體、由至少兩種完整抗體形成的多特異性抗體(multispecificantibodies)(例如雙特異性抗體)、以及抗體片段,條件是它們表現(xiàn)出理想的生物活性。當(dāng)用于本文時(shí),術(shù)語"單克隆抗體"是指從一群基本上均一的抗體獲得的抗體,即,包括所述群體的個(gè)體抗體是相同的,除了可能天然發(fā)生的可能以較少量存在的突變之外。單克隆抗體是高度特異的,針對(duì)單一的抗原位點(diǎn)。此外,與包含針對(duì)不同決定簇(表位)的不同的抗體的多克隆抗體制備物相反,每種單克隆抗體針對(duì)抗原上的單一的決定簇。除了它們的特異性,由于它們可以不受其它抗體的污染而合成,所以單克隆抗體是有利的。修飾詞"單克隆"是指抗體的特征,即從基本上均一的抗體群體獲得,并且不解釋成需要通過任何特別的方法生產(chǎn)抗體。例如,按照本發(fā)明應(yīng)用的單克隆抗體可以通過最先由Kohler,G.等.,Nature(自然)256(1975)495-497描述的雜交瘤方法進(jìn)行制備,或者可以通過重組DNA方法進(jìn)行制備(參見,例如,美國專利號(hào)4,816,567)。"抗體片段"包括完整的抗體的一部分。按照本發(fā)明"結(jié)合"目的抗原的抗體是這樣的一種抗體,即以能夠以足夠的親和力與所述抗原結(jié)合,以致所述抗體用于檢測(cè)所述抗原的存在。按照本發(fā)明的抗體是一種結(jié)合人Her2并且不(顯著地)與其它蛋白交叉反應(yīng)的抗體。在這樣的實(shí)施方案中,當(dāng)通過熒光激活細(xì)胞分選術(shù)(FACS)分析或放射性免疫沉淀(RIA)測(cè)定時(shí),所述抗體與其它蛋白的結(jié)合程度將小于10%。二聚體化一一受體的配對(duì)一一對(duì)于所有HER受體的信號(hào)傳導(dǎo)活性是基本的。按照本發(fā)明,術(shù)語"Her二聚體化抑制劑"或優(yōu)選地"Her2異型二聚體化抑制劑"是指結(jié)合Her2并且抑制Her2異型二聚體化的治療劑。這些優(yōu)選地為抗體,優(yōu)選地單克隆抗體,更優(yōu)選地人源化的抗體,所述抗體結(jié)合Her2并且抑制Her2異型二聚體化。結(jié)合HER2的抗體的實(shí)例包括4D5,7C2,7F3或2C4,以及它們的人源化變體,人源化變體包括如在美國專利號(hào)5,821,337的表3中所述的huMAb4D5-l,huMAb4D5-2,huMAb4D5-3,huMAb4D5-4,huMAb4D5-5,huMAb4D5-6,huMAb4D5-7和huMAb4D5-8;在WO01/00245中所述的人源化2C4突變體編號(hào)560,561,562,568,569,570,571,574,或56869。7C2和7F3及其人源化的變體描述在W098/17797。由于作用機(jī)制不同,并且由于這一抗體不抑制Her二聚體化,所以這一術(shù)語不應(yīng)該用于如以HerceptinTM的名字出售的曲妥單抗(tratuzumab)的單克隆抗體。在本申請(qǐng)中優(yōu)選"抗體2C4",特別是其人源化的變體(WO01/00245;由以ATCCHB-12697保藏在美國弗吉尼亞州Manassass的美國典型培養(yǎng)物收藏中心的雜交瘤細(xì)胞系生產(chǎn)),其與Her2細(xì)胞外結(jié)構(gòu)域中的區(qū)域結(jié)合(例如,在從Her2的約殘基22到約殘基584區(qū)域中的任何一個(gè)或多個(gè)殘基,包括端點(diǎn))。"表位2C4"是抗體2C4與之結(jié)合的ErbB2細(xì)胞外結(jié)構(gòu)域中的區(qū)域。表述"單克隆抗體2C4"是指具有WO01/00245的實(shí)施例中的鼠2C4抗體的抗原結(jié)合殘基或者來源于所述鼠2C4抗體的抗原結(jié)合殘基的抗體。例如,單克隆抗體2C4可以是鼠單克隆抗體2C4或其變體,諸如人源化抗體2C4,其具有鼠單克隆抗體2C4的抗原結(jié)合氨基酸殘基。在WO01/00245的實(shí)施例3中提供人源化2C4抗體的實(shí)例。除非另外指明,當(dāng)用于本文時(shí),表述"rhuMAb2C4"是指包含分別與任選地由中國倉鼠卵巢(CHO)細(xì)胞表達(dá)的人輕鏈和重鏈IgGl(非A同種異型)恒定區(qū)序列融合的WO01/00245的可變輕鏈(VL)和可變重鏈(VH)序列SEQIDNos.3和4的抗體。WO01/00245的優(yōu)選的實(shí)施方案在本文也是優(yōu)選的。人源化抗體2C4還叫作pertuzumab(Omnitarg)。"試劑盒"是包括用于特異性檢測(cè)本發(fā)明的標(biāo)記基因或蛋白的至少一種試劑如探針的任何產(chǎn)品(例如,包裝或容器)。所述產(chǎn)品優(yōu)選地作為實(shí)施本發(fā)明的方法的單位而推銷、分發(fā)或出售。動(dòng)詞"確定(determine)"和"評(píng)估(assess)"應(yīng)該具有相同的意思,并且在本申請(qǐng)中互換地使用。發(fā)明詳述文獻(xiàn)中闡釋了分子生物學(xué)和核酸化學(xué)的常規(guī)技術(shù),這些技術(shù)是本領(lǐng)域技術(shù)之內(nèi)的。例如,參見Sambrook,L等.,MolecularCloning:ALaboratoryManual(分子克隆實(shí)驗(yàn)室手冊(cè)),ColdSpringHarborLaboratoryPress(冷泉港實(shí)驗(yàn)室出版社),ColdSpringHarbor(冷泉港),紐約,1989;Gait,M.J.(ed.),OligonucleotideSynthesis-APracticalApproach(寡核苷酸合成一一種實(shí)用方法),IRL出版社有限公司,1984;Hames,B.D.,和Higgins,S丄(eds.),NucleicAcidHybridisation-APracticalApproach(核酸雜交————禾中實(shí)用方法),IRL出版社有限公司,1985;以及系列叢書,MethodsinEnzymology(酶學(xué)方法),AcademicPress,Inc.(學(xué)術(shù)出版社有限公司),所有這些通過參考結(jié)合于此。本文提及的所有專利、專利申請(qǐng)和公布,上文所述和下文所述的,都通過引用結(jié)合于此。在本發(fā)明的一個(gè)實(shí)施方案中,預(yù)測(cè)在患者中使用HER二聚體化抑制劑治療的應(yīng)答的方法包括下述步驟a)在來自患者的生物樣品中評(píng)估--選自由表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a和HER2標(biāo)記基因組成的組的一種標(biāo)記基因或標(biāo)記基因的組合,或--包括雙調(diào)蛋白標(biāo)記基因和選自表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子oc和HER2標(biāo)記基因的標(biāo)記基因的標(biāo)記基因組合,禾口b)通過評(píng)估步驟a)的結(jié)果而預(yù)測(cè)在患者中使用HER二聚體化抑制劑治療的應(yīng)答。優(yōu)選地,在按照本發(fā)明的方法中,評(píng)估標(biāo)記基因或標(biāo)記基因的組合的步驟a)包括al)評(píng)估所述標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平,a2)確定在步驟al)中的表達(dá)水平是高于還是低于閾值。所述閾值優(yōu)選地為以關(guān)于血清或血漿的質(zhì)量/體積或者關(guān)于腫瘤組織的質(zhì)量/質(zhì)量表示的值。它可以通過本領(lǐng)域熟練的專家已知的以及由本發(fā)明公開的方法進(jìn)行檢測(cè)。在本發(fā)明的一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,如果所述閾值高于或低于所述閾值,那么可以確定對(duì)治療的應(yīng)答。關(guān)于使用按照本發(fā)明的單一標(biāo)記基因,用于轉(zhuǎn)移性乳腺癌患者的情況如下。然而,這可能取決于指征,但是可以基于本發(fā)明的內(nèi)容而確定。關(guān)于單獨(dú)的轉(zhuǎn)化生長因子a標(biāo)記基因,當(dāng)考慮對(duì)Her2低表達(dá)轉(zhuǎn)移性乳腺癌患者使用HER二聚體化抑制劑治療時(shí),對(duì)于沒有進(jìn)展的存活(死亡或進(jìn)展時(shí)間)和全部存活(死亡時(shí)間),低表達(dá)水平是有利的,即,在這些患者中,轉(zhuǎn)化生長因子a標(biāo)記基因的低表達(dá)水平預(yù)測(cè)對(duì)使用HER二聚體化抑制劑治療的良好的應(yīng)答(參見圖7)。這是關(guān)于原始和調(diào)整的兩種臨床共變量的情形。因此,優(yōu)選在步驟al)中評(píng)估的轉(zhuǎn)化生長因子a標(biāo)記基因的表達(dá)水平低于閾值,以在Her2低表達(dá)轉(zhuǎn)移性乳腺癌患者中預(yù)測(cè)對(duì)使用HER二聚體化抑制劑治療的良好的應(yīng)答。這也是在這些患者中關(guān)于單獨(dú)的Her2標(biāo)記基因的情形,特別地關(guān)于可溶的Her2細(xì)胞外結(jié)構(gòu)域,和在這些患者中關(guān)于單獨(dú)的表皮生長因子標(biāo)記基因的情形。關(guān)于單獨(dú)的雙調(diào)蛋白標(biāo)記基因,在原始分析中,當(dāng)考慮對(duì)Her2低表達(dá)轉(zhuǎn)移性乳腺癌患者使用HER二聚體化抑制劑治療時(shí),對(duì)于沒有進(jìn)展的存活(死亡或進(jìn)展時(shí)間)和全部存活(死亡時(shí)間),低表達(dá)水平是有利的,即,在這些患者中,雙調(diào)蛋白標(biāo)記基因的低表達(dá)水平預(yù)測(cè)對(duì)使用HER二聚體化抑制劑治療的良好的應(yīng)答。這是關(guān)于原始和調(diào)整的兩種臨床共變量的情形。臨床共變量的調(diào)整的分析表明,在這些患者中在使用HER二聚體化抑制劑治療后,高表達(dá)水平對(duì)于沒有進(jìn)展的存活(死亡或進(jìn)展時(shí)間)和全部存活(死亡時(shí)間)是有利的。由于標(biāo)記基因,特別是在血清中,可以用于潛在包括其它臨床共變量的多標(biāo)記子預(yù)測(cè)模型中,在這種模型中單個(gè)標(biāo)記基因的有利作用的趨勢(shì)不能以簡單的方式確定,并且可能與在單變量分析即關(guān)于使用單個(gè)標(biāo)記基因所述的情形中發(fā)現(xiàn)的趨勢(shì)相反。更優(yōu)選地,在按照本發(fā)明的方法中,所述閾值在本發(fā)明的方法的步驟al)之前通過下述步驟確定1)在使用HER二聚體化抑制劑治療之前,在來自患者的多份生物樣品中評(píng)估標(biāo)記基因或標(biāo)記基因的組合的表達(dá)水平,2)用HER二聚體化抑制劑治療所述患者,3)將使用HER二聚體化抑制劑治療的患者的應(yīng)答與在步驟a)中確定的所述標(biāo)記基因或標(biāo)記基因的組合的表達(dá)水平相關(guān)聯(lián),由此確定閾值。所述閾值優(yōu)選地是以關(guān)于血清或血漿的質(zhì)量/體積或腫瘤組織的質(zhì)量/質(zhì)量而表示的值。本發(fā)明還考慮按照本發(fā)明的標(biāo)記基因的突變體或變體,和用于按照本發(fā)明的方法的標(biāo)記基因的突變體或變體。在這些突變體或變體中,標(biāo)記基因的天然序列通過取代、刪除或插入而改變。"天然序列"是指與標(biāo)記基因或蛋白的野生型或天然形式相同的氨基酸或核酸序列。本發(fā)明還考慮按照本發(fā)明的蛋白的突變體或變體,和用于按照本發(fā)明的方法的蛋白的突變體或變體。"突變氨基酸序列","突變蛋白"或"突變多肽"是指具有與天然序列不同或者由有意從天然序列制備變體的核苷酸序列編碼的氨基酸序列的多肽。"突變蛋白","變體蛋白"或"突變蛋白質(zhì)(mutein)"意指包含突變的氨基酸序列的蛋白,并且包括由于氨基酸刪除、取代或兩者而不同于按照本發(fā)明的天然蛋白的氨基酸序列的多肽。本發(fā)明還考慮預(yù)測(cè)對(duì)使用HER二聚體化抑制劑和作為化學(xué)治療劑或用于治療癌癥的治療抗體的另一種物質(zhì)或藥劑的組合進(jìn)行治療的應(yīng)答的方法。所述化學(xué)治療劑可以是,例如,吉西他濱(Gemza,;化學(xué)名2',2'-二氟脫氧胞苷(dFdC)),卡鉑(二胺-(環(huán)丁烷-l,l-dicarboxylato(2-)-0,0')-鉑),或紫杉醇(Taxof,化學(xué)名(3-(苯甲酰氨基)-a-羥基-,6,12b-雙(乙?;趸?-12-(苯甲酰基氧基)-2a,3,4,4a,5,6,9,10,ll,12,12a,12b-十二氫-4,ll-二羥基-4a,8,13,13-四甲基-5-氧-7,ll-亞甲基-lH-芳癸并(3,4)benz(l,2-b)oxet-9-基酯,(2aR-(2a-a,4-(3,4a-卩,6-f3,9-a(a-R*,(3-S*),ll-a,12-a,12a-a,2b-a))-苯丙酸)。在本發(fā)明的一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,所述生物樣品是血清、血漿或腫瘤組織。腫瘤組織可以是福爾馬林-固定的石蠟包埋的腫瘤組織或新鮮冷凍的腫瘤組織。在本發(fā)明的另一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,所述HER二聚體化抑制劑抑制HER2與EGFR或HER3或Her4的異型二聚體化。優(yōu)選地,所述HER二聚體化抑制劑是一種抗體,優(yōu)選地是抗體2C4。在整個(gè)本申請(qǐng)中優(yōu)選"抗體2C4",特別是其人源化變體(WO01/00245;由以ATCCHB-12697保藏在美國弗吉尼亞州Manassass的美國典型培養(yǎng)物收藏中心的雜交瘤細(xì)胞系生產(chǎn)),其與Her2細(xì)胞外結(jié)構(gòu)域中的區(qū)域結(jié)合(例如,在從Her2的約殘基22到約殘基584區(qū)域中的任何一個(gè)或多個(gè)殘基,包括端點(diǎn))。在WO01/00245的實(shí)施例3中提供人源化2C4抗體的實(shí)例。人源化抗體2C4還口L]作Omnitarg或pertuzumab。在本發(fā)明的另一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,所述患者是癌癥患者,優(yōu)選地是乳腺癌、卵巢癌、肺癌或前列腺癌患者。所述乳腺癌患者優(yōu)選地是轉(zhuǎn)移性乳腺癌患者或HER2低表達(dá)乳腺癌或轉(zhuǎn)移性乳腺癌患者,或者Her2高表達(dá)乳腺癌或轉(zhuǎn)移性乳腺癌患者。所述卵巢癌患者優(yōu)選地是轉(zhuǎn)移性卵巢癌患者。所述肺癌患者優(yōu)選地是非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)患者。優(yōu)選地,兩種、三種或所有四種標(biāo)記基因、標(biāo)記多聚核苷酸或標(biāo)記蛋白組合使用,即,用于本發(fā)明所有公開的實(shí)施方案中或按照本發(fā)明的方法、用途或試劑盒中。優(yōu)選地,評(píng)估下列各項(xiàng)的表達(dá)水平-表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a或HER2標(biāo)記基因、標(biāo)記蛋白或標(biāo)記多聚核苷酸的組合,-標(biāo)記基因組合,其包括雙調(diào)蛋白標(biāo)記基因和選自表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a和HER2標(biāo)記基因的標(biāo)記基因,-表皮生長因子和轉(zhuǎn)化生長因子a或HER2標(biāo)記基因、標(biāo)記蛋白或標(biāo)記多聚核苷酸的組合,或-轉(zhuǎn)化生長因子a和HER2標(biāo)記基因、蛋白或多聚核苷酸的組合。在本發(fā)明的一個(gè)特別優(yōu)選的實(shí)施方案中,標(biāo)記基因組合由下述各項(xiàng)組成-轉(zhuǎn)化生長因子a和HER2標(biāo)記基因,-轉(zhuǎn)化生長因子a和表皮生長因子標(biāo)記基因,或-雙調(diào)蛋白、表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a和HER2標(biāo)記基因。在本發(fā)明的另一個(gè)特別優(yōu)選的實(shí)施方案中,標(biāo)記基因組合由下述各項(xiàng)組成-表皮生長因子和HER2標(biāo)記基因,-雙調(diào)蛋白和表皮生長因子標(biāo)記基因,-雙調(diào)蛋白和轉(zhuǎn)化生長因子a標(biāo)記基因,-雙調(diào)蛋白和HER2標(biāo)記基因,-雙調(diào)蛋白、表皮生長因子和轉(zhuǎn)化生長因子a標(biāo)記基因,-雙調(diào)蛋白、表皮生長因子和HER2標(biāo)記基因,-雙調(diào)蛋白、轉(zhuǎn)化生長因子ot和HER2標(biāo)記基因,或-表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a和HER2標(biāo)記基因。在本發(fā)明的一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合在樣品中的表達(dá)水平通過檢測(cè)由所述標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合編碼的標(biāo)記蛋白或其片段或者標(biāo)記蛋白或其片段的組合的表達(dá)水平而進(jìn)行評(píng)估。優(yōu)選地,使用特異性與所述標(biāo)記蛋白或其片段或者標(biāo)記蛋白或其片段的組合結(jié)合的試劑,而檢測(cè)所述標(biāo)記蛋白或其片段或者標(biāo)記蛋白或其片段的組合的表達(dá)水平。優(yōu)選地,所述試劑選自由抗體、抗體片段或抗體衍生物的片段組成的組。存在可以用于本發(fā)明的方法的許多不同類型的免疫檢測(cè),例如,酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定(ELISA),熒光免疫吸附測(cè)定(FIA),化學(xué)聯(lián)接的免疫吸附測(cè)定(chemicallinkedimmunosorbentassay,CLIA),方文身寸免疫觀!j定(RIA),禾口免疫印跡。關(guān)于可以應(yīng)用的不同免疫檢測(cè)的綜述,參見Lottspeich和Zorbas(eds.),Bioanalytik,第一版1998,SpektrumAkademischerVerlag,Heidelberg,柏林,德國。因此,在本發(fā)明的另一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,表達(dá)水平應(yīng)用選自由下列各項(xiàng)組成的組的方法進(jìn)行測(cè)定蛋白質(zhì)組學(xué)、流式細(xì)胞術(shù)、免疫細(xì)胞化學(xué)、免疫組織化學(xué)、酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定、多通道酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定和這些方法的變體。因此,更優(yōu)選地,應(yīng)用選自由蛋白質(zhì)組學(xué)、流式細(xì)胞術(shù)、免疫細(xì)胞化學(xué)、免疫組織化學(xué)、酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定、多通道酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定和這些方法的變體組成的組的方法,而確定表達(dá)水平。在本發(fā)明的另一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,所述標(biāo)記蛋白的片段是Her2標(biāo)記蛋白的細(xì)胞外結(jié)構(gòu)域。優(yōu)選地,所述Her2標(biāo)記蛋白的細(xì)胞外結(jié)構(gòu)域具有約105.000道爾頓的分子量。"道爾頓"代表等價(jià)于氫原子重量或1.657X10^克的質(zhì)量單位。在本發(fā)明的另一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,-雙調(diào)蛋白標(biāo)記蛋白的氨基酸序列是氨基酸序列SEQIDNO:1,-表皮生長因子標(biāo)記蛋白的氨基酸序列是氨基酸序列SEQIDNO:2,-轉(zhuǎn)化生長因子a標(biāo)記蛋白的氨基酸序列是氨基酸序列SEQIDNO:3,或-HER2標(biāo)記蛋白的氨基酸序列是氨基酸序列SEQIDNO:4。在本發(fā)明的另一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,血清中關(guān)于下述各項(xiàng)的閾值-關(guān)于轉(zhuǎn)化生長因子a標(biāo)記蛋白的閾值為2.0-10.0,優(yōu)選地2.0-5.0pg/ml,更優(yōu)選地約3.5pg/ml,-關(guān)于表皮生長因子標(biāo)記蛋白的閾值為100-250pg/ml,優(yōu)選地約150pg/ml,或-關(guān)于雙調(diào)蛋白標(biāo)記蛋白的閾值為6-15pg/ml,優(yōu)選地約12pg/ml。在本發(fā)明的另一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,血清中關(guān)于Her2標(biāo)記蛋白細(xì)胞外結(jié)構(gòu)域的閾值為12-22ng/ml,優(yōu)選地約18ng/ml。在本發(fā)明的另一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合在生物樣品中的表達(dá)水平通過檢測(cè)由所述標(biāo)記基因編碼的轉(zhuǎn)錄的標(biāo)記多聚核苷酸或所述轉(zhuǎn)錄的標(biāo)記多聚核苷酸的片段的表達(dá)水平、或者檢測(cè)由標(biāo)記基因組合編碼的轉(zhuǎn)錄的標(biāo)記多聚核苷酸或所述轉(zhuǎn)錄的標(biāo)記多聚核苷酸的片段的表達(dá)水平而進(jìn)行評(píng)估。優(yōu)選地,所述轉(zhuǎn)錄的標(biāo)記多聚核苷酸是cDNA,mRNA或hnRNA,或者其中所述多種轉(zhuǎn)錄的標(biāo)記多聚核苷酸是cDNA,mRNA或hn脂A。優(yōu)選地,檢測(cè)步驟還包括擴(kuò)增所述轉(zhuǎn)錄的多聚核苷酸。擴(kuò)增優(yōu)選地使用特異性地將核酸擴(kuò)增到可檢測(cè)的量的聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)進(jìn)行。其它可用的擴(kuò)增反應(yīng)為連接酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(LCR;WuD.Y.和WallaceR.B.,Genomics(基因組學(xué))4(1989)560-569;禾PBaranyR,Proc.Natl.Acad.Sci.USA(美國國家科學(xué)院學(xué)報(bào))88(1991)189-193);聚合酶連接酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(BaranyF.,PCRMethodsandApplic.(PCR方法與應(yīng)用)1(1991)5-16);Gap-LCR(WO90/01069);修復(fù)鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(EP0439182A2),3SR(Kwoh,D.Y.等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA(美國國家科學(xué)院學(xué)報(bào))86(]989)1173-1177;Guatelli,J.C.等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA(美國國家科學(xué)院學(xué)報(bào))87(1990)1874-1878;WO92/08808),和NASBA(US5,130,238)。此外,存在鏈置換擴(kuò)增(SDA),轉(zhuǎn)錄介導(dǎo)的擴(kuò)增(TMA),禾口Q(3-擴(kuò)增(綜述參見,例如,Whden,A.C.和Persing,D,H.,Annu.Rev.Microbiol.(微生物綜述年刊)50(1996)349-373;Abramson,R.D.和MyersT.W.,Curr.Opin.Biotechnol.(生物技術(shù)當(dāng)代觀點(diǎn))4(1993)41-47)。更優(yōu)選地,檢測(cè)步驟應(yīng)用定量反轉(zhuǎn)錄酶聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的方法。其它適當(dāng)?shù)亩嗑酆塑账釞z測(cè)方法是本領(lǐng)域的專家已知的,并且在標(biāo)準(zhǔn)課本如SambrookJ.等,MolecularCloning:ALaboratoryManual(分子克隆實(shí)驗(yàn)室手冊(cè)),ColdSpringHarborLaboratoryPress(冷泉港實(shí)驗(yàn)室出版社),ColdSpringHarbor(冷泉港),紐約,1989;和Ausubel,R等,CurrentProtocolsinMolecularBiology(分子生物學(xué)現(xiàn)代方法),1987,J.Wiley和Sons,紐約中描述。在進(jìn)行多聚核苷酸檢測(cè)步驟之前還可以存在進(jìn)一步的純化步驟,例如沉淀步驟。檢測(cè)方法可以包括,但不限于,結(jié)合或者插入特異的染料,如溴化乙啶,其插入到雙鏈多聚核苷酸中,并且隨后改變它們熒光。在隨后進(jìn)行限制性消化并且顯現(xiàn)之后,純化的多聚核苷酸還可以任選地通過電泳方法分離。還存在基于探針的檢測(cè),其研究與特異性序列的寡核苷酸雜交,并且隨后檢測(cè)雜化體。在本領(lǐng)域的專家已知的其它步驟之后,還可以測(cè)序DNA。優(yōu)選的模板-依賴性DNA聚合酶是Taq聚合酶。26在本發(fā)明的另一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,標(biāo)記基因的表達(dá)水平通過使用在嚴(yán)格雜交條件下與所述轉(zhuǎn)錄的標(biāo)記多聚核苷酸或其片段退火的探針檢測(cè)所述轉(zhuǎn)錄的標(biāo)記多聚核苷酸或其片段在樣品中的存在而進(jìn)行評(píng)估,或者標(biāo)記基因組合在樣品中的表達(dá)水平通過使用在嚴(yán)格雜交條件下與所述轉(zhuǎn)錄的標(biāo)記多聚核苷酸或其片段退火的探針檢測(cè)所述轉(zhuǎn)錄的標(biāo)記多聚核苷酸或其片段在樣品中的存在而進(jìn)行評(píng)估。這種方法可以在同源檢測(cè)系統(tǒng)中進(jìn)行。"同源"檢測(cè)系統(tǒng)的一個(gè)實(shí)例是T叫Mai^系統(tǒng),其在US5,210,015,US5,804,375和US5,487,972中描述。簡言之,所述方法基于雙標(biāo)記探針和TaqDNA聚合酶的5'-3'核酸外切酶活性。所述探針與通過PCR方法擴(kuò)增的目標(biāo)序列互補(bǔ),并且在每一聚合作用循環(huán)步驟過程中位于兩個(gè)PCR引物之間。所述探針具有附著在其上的兩種熒光標(biāo)記。一種標(biāo)記為報(bào)道染料,諸如6-羧基熒光素(FAM),由于與第二種熒光染料,6-羧基-四甲基-羅丹明(TAMRA)的空間接近性,其通過能量轉(zhuǎn)移而將其發(fā)射光譜猝滅。在每個(gè)擴(kuò)增循環(huán)過程中,在延伸引發(fā)的DNA鏈過程中的T叫DNA聚合酶置換并且降解退火的探針,降解是由于所述聚合酶的內(nèi)在的5'-3'核酸外切酶活性。這種機(jī)制還將報(bào)道染料從TAMRA的猝滅活性釋放出來。結(jié)果,熒光活性隨著探針分裂的增加而增加,其與形成的PCR產(chǎn)物的量成比例。因此,檢測(cè)釋放的熒光標(biāo)記的強(qiáng)度而測(cè)定擴(kuò)增的目標(biāo)序列。"同源"檢測(cè)系統(tǒng)的另一個(gè)實(shí)例由用于LightCycle^設(shè)備的形式(參見例如US6,174,670)而提供,它們中的一些有時(shí)叫作"相吻探針(kissingprobe)"形式。并且,原理是基于兩種相互作用的染料,然而,它們的特征在于,供體-染料的發(fā)射波長通過熒光共振能量轉(zhuǎn)移而激發(fā)受體-染料。最近引入COBASAmpliPrep設(shè)備(RocheDiagnosticsGmbH(Roche診斷有限公司),D-68305Mannheim,德國),以通過使用生物素酰化的序列-特異的捕獲探針與鏈霉抗生物素蛋白-包被的磁性顆粒分離目標(biāo)序列而擴(kuò)大自動(dòng)化(Jungkind,D"J.Clin.Virol.(臨床病毒學(xué)雜志)20(2001)1-6;Stelzl,E.等,J.Clin.Microbiol.(臨床微生物學(xué)雜志)40(2002)1447-1450)。近來它已經(jīng)加入了其它的通用工具,總核酸分離(TNAI)試劑盒(TotalNucleicAcidIsolation(TNAI)Kit,RocheDiagnostics(Roche診斷))。這種實(shí)驗(yàn)室-用途的試劑允許在COBASAmpliPrep設(shè)備上從血漿和血清中一般地、無序列-特異性地分離所有的核酸,其基本上基于由Boom,R.等,J.Clin.Microbiol.(臨床微生物學(xué)雜志)28(1990)495-503研發(fā)的方法。在本發(fā)明的另一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,雙調(diào)蛋白標(biāo)記多聚核苷酸的核酸序列是核酸序列SEQIDNO:5,-表皮生長因子標(biāo)記多聚核苷酸的核酸序列是核酸序列SEQIDNO:6,-轉(zhuǎn)化生長因子a標(biāo)記多聚核苷酸的核酸序列是核酸序列SEQIDNO:7,或-HER2標(biāo)記多聚核苷酸的核酸序列是核酸序列SEQIDNO:8。在本發(fā)明的另一個(gè)實(shí)施方案中,在嚴(yán)格條件下與表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a或HER2標(biāo)記多聚核苷酸雜交的探針,或與表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子oc或HER2標(biāo)記蛋白結(jié)合的抗體,用于在患者中預(yù)測(cè)對(duì)使用HER二聚體化抑制劑治療的應(yīng)答,或者在嚴(yán)格條件下與雙調(diào)蛋白、表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a或HER2標(biāo)記多聚核苷酸雜交的探針,或與雙調(diào)蛋白、表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a或HER2標(biāo)記蛋白結(jié)合的抗體,用于選擇在患者中抑制疾病發(fā)展的組合物。所述疾病優(yōu)選地為癌癥,并且所述患者優(yōu)選地是如上文所述的癌癥患者。在本發(fā)明的另一個(gè)實(shí)施方案中,提供一種試劑盒,其包括在嚴(yán)格條件下與雙調(diào)蛋白、表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a或HER2標(biāo)記多聚核苷酸退火的探針,或與雙調(diào)蛋白、表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a或HER2標(biāo)記蛋白結(jié)合的抗體。在本領(lǐng)域已知的這種試劑盒還包括塑料器皿,例如,其在擴(kuò)增步驟中可以用作96孔或384孔格式的微量滴定平板,或者只是用作普通的反應(yīng)管,例如,由Eppendorf,Hamburg,德國制備的普通反應(yīng)管,并且還包括實(shí)施按照本發(fā)明的方法的所有其它的試劑,所述方法優(yōu)選免疫測(cè)定,如酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定(ELISA),熒光免疫吸附測(cè)定(FIA),化學(xué)聯(lián)接的免疫吸附測(cè)定(CLIA),放射免疫測(cè)定(RIA),和免疫印跡。關(guān)于可以應(yīng)用的不同免疫檢測(cè)和試劑的綜述,參見Lottspeich和Zorbas(eds.),Bioanalytik,第——版,1998,SpektrumAkademischerVerlag,Heidelberg,柏林,德國。優(yōu)選地,在試劑盒形式中提供所述探針或抗體與各種標(biāo)記多聚核苷酸或標(biāo)記蛋白的組合,如上文公開的標(biāo)記多聚核苷酸或標(biāo)記蛋白的優(yōu)選組合。在本發(fā)明的另一個(gè)實(shí)施方案中,提供選擇在患者中抑制疾病發(fā)展的組合物的方法,所述方法包括a)在多種測(cè)試組合物的存在下,分別暴露來自癌癥患者的生物樣品的等分試樣;b)將與測(cè)試組合物接觸的生物樣品等分試樣中選自由雙調(diào)蛋白、表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a和HER2標(biāo)記基因組成的組的標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平與在不接觸測(cè)試組合物的生物樣品等分試樣中選自由雙調(diào)蛋白、表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a和HER2標(biāo)記基因組成的組的標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平相比較-,c)相對(duì)于沒有接觸測(cè)試組合物的等分試樣,選擇在包含所述測(cè)試組合物的等分試樣中改變了所述標(biāo)記基因或所述標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平的一種測(cè)試組合物,其中在與所述測(cè)試組合物接觸的生物樣品的等分試樣中所述標(biāo)記基因或所述標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平與在沒有接觸所述測(cè)試組合物的生物樣品的等分試樣中的相應(yīng)標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平之間存在顯著的或至少10%的差異是選擇所述測(cè)試組合物的指征。所述疾病優(yōu)選地是癌癥,并且所述患者優(yōu)選地是如上文所述的癌癥患者。在本發(fā)明的另一個(gè)實(shí)施方案中,提供選擇在患者中抑制疾病發(fā)展的組合物的方法,所述方法包括a)在多種測(cè)試組合物的存在下,分別暴露來自癌癥患者的生物樣品的等分試樣;b)將下述各項(xiàng)在與所述測(cè)試組合物接觸的生物樣品的等分試樣中的表達(dá)水平-選自由表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a和HER2標(biāo)記基因組成的組的標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合,或-標(biāo)記基因組合,其包括雙調(diào)蛋白標(biāo)記基因和選自表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a和HER2標(biāo)記基因的標(biāo)記基因,與下列各項(xiàng)在不與所述測(cè)試組合物接觸的生物樣品等分試樣中的表達(dá)水平進(jìn)行比較-選自由表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a和HER2標(biāo)記基因29組成的組的標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合,或-標(biāo)記基因組合,其包括雙調(diào)蛋白標(biāo)記基因和選自表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a和HER2標(biāo)記基因的標(biāo)記基因;c)相對(duì)于沒有接觸測(cè)試組合物的等分試樣,選擇在包含所述測(cè)試組合物的等分試樣中改變了所述標(biāo)記基因或所述標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平的一種測(cè)試組合物,其中在與所述測(cè)試組合物接觸的生物樣品的等分試樣中所述標(biāo)記基因或所述標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平與在沒有接觸所述測(cè)試組合物的生物樣品的等分試樣中的相應(yīng)標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平之間存在顯著的或至少10%的差異是選擇所述測(cè)試組合物的指征。所述疾病優(yōu)選地是癌癥,并且所述患者優(yōu)選地是如上文所述的癌癥患者。如果標(biāo)記基因在來自患者的樣品中的表達(dá)水平不同于在來自參照受試者的樣品的水平,達(dá)到大于用來評(píng)估表達(dá)的檢測(cè)的標(biāo)準(zhǔn)誤差的量,并且優(yōu)選地為所述量的至少10%,并且更優(yōu)選地為所述量的25%,50%,75%,100%,125%,150°/。,175%,200%,300%,400%,500%或1,000%,那么標(biāo)記基因的表達(dá)"顯著"不同于所述標(biāo)記基因在參照樣品中的表達(dá)水平。備選地,如果在來自患者的樣品中的表達(dá)水平低于在來自參照受試者的樣品中的水平,達(dá)到大于用來評(píng)估表達(dá)的檢測(cè)的標(biāo)準(zhǔn)誤差的量,并且優(yōu)選地為所述量的至少10%,并且更優(yōu)選地為所述量的25%,50%,75%,100%,125%,150%,175%,200%,300%,400%,500%或1,000%,那么可以認(rèn)為標(biāo)記基因在患者中的表達(dá)"顯著"低于在參照受試者中的表達(dá)水平。表達(dá)水平的差別達(dá)到10,000或50,000%。表達(dá)水平的差別優(yōu)選地在10%—10,000%,更優(yōu)選地25%—IO,OOO%,50%—IO,OOO%,100%—10,000%,甚至更優(yōu)選地25%—5,000%,50%—5,000%,100%—5,000%。在本發(fā)明的另一個(gè)實(shí)施方案中,提供衍生(或鑒定)候選藥劑的方法,所述方法包括a)將來自癌癥患者的生物樣品的等分試樣與候選藥劑接觸,并且確定選自由雙調(diào)蛋白、表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a和HER2標(biāo)記基因組成的組的標(biāo)記基因或標(biāo)記基因的組合在所述等分試樣中的表達(dá)水平,b)確定在沒有與所述候選藥劑接觸的生物樣品等分試樣中相應(yīng)的標(biāo)記基因或相應(yīng)的標(biāo)記基因的組合的表達(dá)水平,C)通過將與所述候選藥劑接觸的生物樣品的等分試樣中所述標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平與在沒有接觸所述候選藥劑的生物樣品的等分試樣中相應(yīng)的標(biāo)記基因或相應(yīng)的標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平進(jìn)行比較,而觀察所述候選藥劑的效果,d)從所述觀察到的效果衍生(或鑒定)所述藥劑,其中在與所述候選藥劑接觸的生物樣品的等分試樣中所述標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平與在沒有接觸所述候選藥劑的生物樣品的等分試樣中的相應(yīng)的標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平之間存在至少10%的差異是所述候選藥劑作用的指征。在本發(fā)明的另一個(gè)實(shí)施方案中,提供一種衍生候選藥劑的方法,所述方法包括a)將來自癌癥患者的生物樣品的等分試樣與候選藥劑接觸,并且確定下述各項(xiàng)在所述等分試樣中的表達(dá)水平-選自由表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a和HER2標(biāo)記基因組成的組的標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合,或-標(biāo)記基因組合,其包括雙調(diào)蛋白標(biāo)記基因和選自表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a和HER2標(biāo)記基因的標(biāo)記基因,b)確定在沒有與所述候選藥劑接觸的生物樣品等分試樣中相應(yīng)的標(biāo)記基因或相應(yīng)的標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平,c)通過將與所述候選藥劑接觸的生物樣品的等分試樣中所述標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平與在沒有接觸所述候選藥劑的生物樣品的等分試樣中相應(yīng)的標(biāo)記基因或相應(yīng)的標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平進(jìn)行比較,而觀察所述候選藥劑的效果,d)從所述觀察到的效果衍生所述藥劑,其中在與所述候選藥劑接觸的生物樣品的等分試樣中所述標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平與在沒有接觸所述候選藥劑的生物樣品的等分試樣中的相應(yīng)的標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平之間存在至少10%的差異是所述候選藥劑作用的指征。優(yōu)選地,所述候選藥劑是候選抑制劑。優(yōu)選地,所述候選藥劑是候選增強(qiáng)劑。在本發(fā)明的另一個(gè)實(shí)施方案中,提供通過按照本發(fā)明的方法衍生的候選藥劑。在本發(fā)明的另一個(gè)實(shí)施方案中,提供包含按照本發(fā)明的藥劑的藥物制劑。在本發(fā)明的另一個(gè)實(shí)施方案中,按照本發(fā)明的藥劑用于制備治療癌癥的組合物。優(yōu)選的癌癥形式為上文所述。在本發(fā)明的另一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,生產(chǎn)藥物的方法包括按照本發(fā)明的方法的步驟和i)以足以對(duì)受試者以治療有效量提供所述藥物的量合成在步驟(C)中鑒定的候選藥劑或其類似物或衍生物;和/或ii)將藥物候選物即在步驟(C)中鑒定的候選藥劑或其類似物或衍生物與藥用載體結(jié)合。在本發(fā)明的另一個(gè)實(shí)施方案中,選自由雙調(diào)蛋白、表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a和HER2標(biāo)記蛋白或標(biāo)記多核苷酸組成的組的標(biāo)記蛋白或標(biāo)記多聚核苷酸用于衍生候選藥劑,或者用于選擇在患者中抑制疾病發(fā)展的組合物。所述疾病優(yōu)選地是癌癥,并且所述患者優(yōu)選地是如上文公開的癌癥患者。在本發(fā)明的另一個(gè)實(shí)施方案中,HER二聚體化抑制劑用來制備治療人癌癥患者的藥物,其特征在于所述治療包括在來自患者的生物樣品中評(píng)估下列各項(xiàng)-選自由表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a和HER2標(biāo)記基因組成的組的標(biāo)記基因或標(biāo)記基因的組合,或-標(biāo)記基因組合,其包括雙調(diào)蛋白標(biāo)記基因和選自表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a和HER2標(biāo)記基因的標(biāo)記基因。治療人癌癥患者的藥物的制備并且特別是所述制劑在WO01/00245中描述,其通過引用結(jié)合于此,特別是關(guān)于抗體2C4的。在本發(fā)明的一個(gè)優(yōu)選的實(shí)施方案中,在所述Her二聚體化抑制劑用于制備治療人癌癥患者的藥物的應(yīng)用中,所述治療包括在治療過程中評(píng)估所述標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合至少一次或重復(fù)評(píng)估。優(yōu)選地,評(píng)估所述標(biāo)記基因的表達(dá)水平或標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平。優(yōu)選地,所述HER二聚體化抑制劑是抗體,優(yōu)選地是抗體2C4。優(yōu)選地,所述患者是乳腺癌、卵巢癌、肺癌或前列腺癌患者。在本發(fā)明的所有實(shí)施方案中,應(yīng)用如上文公開的標(biāo)記基因、標(biāo)記多聚核苷酸或標(biāo)記蛋白的組合。在本發(fā)明的所有實(shí)施方案中,關(guān)于在每一步驟中確定的表達(dá)水平的差異的優(yōu)選值也如上文所述。提供下述實(shí)施例、序列表和附圖,以輔助理解本發(fā)明,本發(fā)明的真正范圍在附上的權(quán)利要求中提出。應(yīng)該理解,在不背離本發(fā)明的精神下,可以在所提出的方法中迸行改進(jìn)。附圖描述圖1:TGF-oc對(duì)數(shù)變換相對(duì)歸類的臨床益處的散點(diǎn)2:雙調(diào)蛋白對(duì)數(shù)變換相對(duì)歸類的臨床益處的散點(diǎn)3:順序(Ordinal)臨床益處TGF-a圖4:順序臨床益處雙調(diào)蛋白圖5:順序臨床益處EGF圖6:順序臨床益處HER2-ECD圖7:關(guān)于雙調(diào)蛋白、EGF、TGF-a、HER2-ECD的TTP和TTD的綜合研究性截點(diǎn)和對(duì)數(shù)排列的p-值圖8:基于研究性單一標(biāo)記截點(diǎn)關(guān)于發(fā)展/死亡時(shí)間的TGF-aKaplanMeier9:基于研究性單一標(biāo)記截點(diǎn)關(guān)于死亡時(shí)間的TGF-aKaplanMeier10:基于研究性單一標(biāo)記截點(diǎn)關(guān)于發(fā)展/死亡時(shí)間的雙調(diào)蛋白KaplanMeier11:基于研究性單一標(biāo)記截點(diǎn)關(guān)于死亡時(shí)間的雙調(diào)蛋白KaplanMeier12:基于研究性單一標(biāo)記截點(diǎn)關(guān)于發(fā)展/死亡時(shí)間的EGFKaplanMeier13:基于研究性單一標(biāo)記截點(diǎn)關(guān)于死亡時(shí)間的EGFKaplanMeier14:基于研究性單一標(biāo)記截點(diǎn)關(guān)于發(fā)展/死亡時(shí)間的HER2-ECDKaplanMeier15:基于研究性單一標(biāo)記截點(diǎn)關(guān)于死亡時(shí)間的HER2-ECDKaplanMeier16:作為組合計(jì)分的實(shí)例,在TTP:順序臨床益處HER2-ECDTGF-a組合中進(jìn)一步提高較大臨床益處/較小臨床益處組之間的間距圖17:關(guān)于TGF-cc和HER2-ECD組合的TTP和TTD的綜合研究性截點(diǎn)和對(duì)數(shù)排列的p-值圖18:基于研究性鬼合標(biāo)記截點(diǎn)關(guān)于發(fā)展/死亡時(shí)間的HER2-ECD/TGF-aKaplanMeier19:基于研究性組合標(biāo)記截點(diǎn)關(guān)于死亡時(shí)間的HER2-ECD/TGF-aKaplanMeier圖實(shí)施例預(yù)測(cè)法則的一般評(píng)論預(yù)測(cè)法則的一般形式由一個(gè)或多個(gè)生物標(biāo)記的函數(shù)的說明組成,所述生物標(biāo)記潛在地包括預(yù)測(cè)應(yīng)答或不應(yīng)答的臨床共變量,或者更一般地,關(guān)于適當(dāng)定義的臨床終點(diǎn)的預(yù)測(cè)益處或缺乏益處。預(yù)測(cè)法則的最簡單形式由沒有共變量的單變量模型組成,其中預(yù)測(cè)通過截點(diǎn)或閾值的方式確定。這可以用短語為關(guān)于特殊的截點(diǎn)c和生物標(biāo)記檢測(cè)X的海維賽德函數(shù)(Heavisidefunction)表達(dá),其中進(jìn)行二元預(yù)測(cè)A或B,那么如果/f(x—c)二0那么預(yù)測(cè)A。如果//(X—c)=1那么預(yù)測(cè)B。這是在預(yù)測(cè)法則中應(yīng)用單變量生物標(biāo)記檢測(cè)的最簡單的方式。如果這樣的簡單法則是充分的,那么它允許作用方向的簡單鑒定,SP,高或低表達(dá)水平對(duì)患者是否是有利的。如果需要考慮臨床共變量和/或如果多個(gè)生物標(biāo)記用于多變量預(yù)測(cè)法34則中,那么這種情況可能更復(fù)雜。為了舉例說明這種情況,這里存在兩個(gè)假設(shè)的實(shí)施例共變量調(diào)整(假設(shè)實(shí)施例)對(duì)于生物標(biāo)記X,在臨床試驗(yàn)群體中發(fā)現(xiàn)高表達(dá)水平與更壞的預(yù)后相關(guān)(單變量分析)。更接近的分析表明在所述群體中存在兩種腫瘤類型,其中的一種具有比另一種更壞的預(yù)后,并且同時(shí)這一腫瘤組的生物標(biāo)記表達(dá)通常更高。調(diào)整的共變量分析表明,對(duì)于每種腫瘤類型,臨床益處和預(yù)后的關(guān)系是相反的,即,在腫瘤類型內(nèi),更低的表達(dá)水平與更好的預(yù)后相關(guān)。這種完全相反的作用被共變量腫瘤類型掩蓋一一并且作為所述預(yù)測(cè)法則的部分的共變量調(diào)整分析逆轉(zhuǎn)了這種趨勢(shì)。多變量預(yù)測(cè)(假設(shè)實(shí)施例)對(duì)于生物標(biāo)記X,在臨床試驗(yàn)群體中發(fā)現(xiàn)高表達(dá)水平與更壞的預(yù)后有點(diǎn)相關(guān)(單變量分析)。對(duì)于第二種生物標(biāo)記Y,通過單變量分析進(jìn)行相似的觀察。X和Y的組合表明,如果兩種生物標(biāo)記都低,那么觀察到良好的預(yù)后。如果兩種生物標(biāo)記都低于某些截點(diǎn)(海維賽德預(yù)測(cè)函數(shù)的AND-聯(lián)系),那么這使得所述法則預(yù)測(cè)益處。對(duì)于所述組合法則,不再存在單變量意義上表述的簡單法則。例如,在X中具有低表達(dá)水平不再自動(dòng)預(yù)測(cè)更好的預(yù)后。這些簡單的實(shí)施例表明,有或無共變量的預(yù)測(cè)法則不能在每種生物標(biāo)記的單變量水平上進(jìn)行判斷。多種生物標(biāo)記的組合加上通過共變量的潛在調(diào)整不允許指定關(guān)于單一生物標(biāo)記的簡單關(guān)系。統(tǒng)計(jì)方法統(tǒng)計(jì)任務(wù)包括下述步驟1.候選生物標(biāo)記的預(yù)選擇2.相關(guān)臨床預(yù)后共變量的預(yù)選擇3.在單變量水平選擇生物標(biāo)記預(yù)測(cè)函數(shù)4.在單變量水平選擇包含臨床共變量的生物標(biāo)記預(yù)測(cè)函數(shù)5.在多變量水平選擇生物標(biāo)記預(yù)測(cè)函數(shù)6.在多變量水平選擇包含臨床共變量的生物標(biāo)記預(yù)測(cè)函數(shù)下述內(nèi)容詳細(xì)描述不同的步驟Adl:預(yù)選擇候選生物標(biāo)記候選生物標(biāo)記的統(tǒng)計(jì)學(xué)預(yù)選擇定位于與臨床益處檢測(cè)相關(guān)性的強(qiáng)度。出于這一目的,不同的臨床終點(diǎn)可以轉(zhuǎn)化成推導(dǎo)的替代計(jì)分,例如,如避免檢查過的觀察的關(guān)于TTP或TTD的臨床益處的程度或發(fā)病率計(jì)分的順序指定。這些替代轉(zhuǎn)換的檢測(cè)可以容易地用于簡單的相關(guān)分析,例如,通過無參量的Spearman等級(jí)相關(guān)方法。這里的備選方案是在時(shí)間-對(duì)-事件回歸模型中將生物標(biāo)記檢測(cè)用作度量共變量(metriccovariates),例如,如Cox比例風(fēng)險(xiǎn)性回歸。取決于生物標(biāo)記值的統(tǒng)計(jì)學(xué)分布,這一步驟可能需要一些預(yù)處理,例如,如變量穩(wěn)定轉(zhuǎn)換和適當(dāng)?shù)谋壤膽?yīng)用,或者備選地,標(biāo)準(zhǔn)化步驟,例如,如應(yīng)用百分?jǐn)?shù)代替原始檢測(cè)。另一種方法是雙變量散點(diǎn)圖的檢查,例如,通過基于單個(gè)的患者而展示散點(diǎn)"-軸=生物標(biāo)記值,y-軸^臨床益處檢測(cè))。例如,這里還有一些通過平滑樣條獲得的無參量回歸線可以用于顯現(xiàn)生物標(biāo)記和臨床益處的相關(guān)性。這些不同的方法的目的是預(yù)選擇生物標(biāo)記候選,其在至少一種所用的益處檢測(cè)中表現(xiàn)出與臨床益處的某種相關(guān)性,同時(shí)關(guān)于其它檢測(cè)的結(jié)果不矛盾。當(dāng)存在可用的對(duì)照組時(shí),那么在不同部分生物標(biāo)記與臨床益處相關(guān)性的差異是使得所述生物標(biāo)記適于進(jìn)一步考慮的不同預(yù)測(cè)的跡象。Ad2:相關(guān)臨床預(yù)后共變量的預(yù)選擇這里術(shù)語"臨床共變量"用于描述關(guān)于患者的所有其它信息,其通常在基線可用。這些臨床共變量包括人口統(tǒng)計(jì)學(xué)信息如性別、年齡等,其它既往癥信息,伴隨疾病,伴隨治療,體檢結(jié)果,獲得的普通實(shí)驗(yàn)室參數(shù),目標(biāo)腫瘤的已知特征,量化惡性疾病的程度的信息,臨床表現(xiàn)得分如ECOG或Kamofsky指數(shù),臨床疾病分段,預(yù)治療的時(shí)間選擇和結(jié)果以及疾病歷史,和所有類似的信息,其可以與臨床預(yù)后相關(guān)。臨床共變量的統(tǒng)計(jì)學(xué)預(yù)選擇類似于預(yù)選擇生物標(biāo)記的方法,并且還定位于與臨床益處檢測(cè)的相關(guān)性的強(qiáng)度。因此原則上,相同的方法如在1下所考慮那樣進(jìn)行應(yīng)用。除了統(tǒng)計(jì)學(xué)標(biāo)準(zhǔn),來自臨床經(jīng)驗(yàn)的標(biāo)準(zhǔn)和理論知識(shí)還可以用來預(yù)選擇相關(guān)的臨床共變量。通過臨床共變量的預(yù)后與生物標(biāo)記的預(yù)后相互作用。如果必要,它們將被視為精確的預(yù)測(cè)。Ad3:在單變量水平選擇生物標(biāo)記預(yù)測(cè)函數(shù)術(shù)語"預(yù)測(cè)函數(shù)"將以--般意義應(yīng)用,意指生物標(biāo)記檢測(cè)的數(shù)函數(shù),其以按比例暗示目標(biāo)預(yù)測(cè)的數(shù)為結(jié)果。簡單的實(shí)施例是關(guān)于特定的截點(diǎn)C和生物標(biāo)記檢測(cè)X的海維賽德函數(shù)的選擇,其中進(jìn)行二元預(yù)測(cè)A或B,那么如果H(x-c^0那么預(yù)測(cè)A。如果H(x-c"l那么預(yù)測(cè)B。這可能是在預(yù)測(cè)法則中使用單變量生物標(biāo)記檢測(cè)的最普通的方式。預(yù)測(cè)函數(shù)的定義通常重復(fù)可以用來研究預(yù)測(cè)可能性的現(xiàn)有的練習(xí)數(shù)據(jù)設(shè)定(trainingdataset)。為了從所述練習(xí)設(shè)定獲得適當(dāng)?shù)慕攸c(diǎn)c,可以采用不同的途徑。首先,具有在1下提及的平滑樣條的散點(diǎn)圖可以用來定義截點(diǎn)。備選地,可以選擇某些分布百分?jǐn)?shù),例如,中值或四分值。還可以通過按照它們關(guān)于臨床益處檢測(cè)的預(yù)測(cè)潛力研究所有可能的截點(diǎn)而系統(tǒng)提取截點(diǎn)。然后可以將這些結(jié)果繪圖,以允許手工選擇或者應(yīng)用某些搜索運(yùn)算法則進(jìn)行最優(yōu)化。這基于使用Cox模型的終點(diǎn)TTP和TTD而實(shí)現(xiàn),其中在每個(gè)檢測(cè)截點(diǎn),生物標(biāo)記用作二元共變量。預(yù)測(cè)標(biāo)準(zhǔn)是獲得的風(fēng)險(xiǎn)比例。然后關(guān)于TTP和TTD的結(jié)果可以一起考慮,以選擇顯示符合兩個(gè)終點(diǎn)的預(yù)測(cè)的截點(diǎn)。用來選擇預(yù)測(cè)函數(shù)的另一種不常用的方法可以基于從練習(xí)設(shè)定獲得的使用生物標(biāo)記值(可能是轉(zhuǎn)換的)作為共變量的固定參數(shù)Cox回歸模型。然后預(yù)測(cè)可以只取決于計(jì)算的風(fēng)險(xiǎn)比例是小于1還是大于1。另一種可能性是基于關(guān)于某種可能性比例(或其單調(diào)轉(zhuǎn)換(monotonictransform))的確定,其中目標(biāo)可能性概率在關(guān)于分離預(yù)測(cè)狀況的練習(xí)設(shè)定中預(yù)先確定。然后將生物標(biāo)記插入到某些概率比例函數(shù)中。Ad4:在單變量水平選擇包含臨床共變量的生物標(biāo)記預(yù)測(cè)函數(shù)這里單變量是指只使用一種生物標(biāo)記一一關(guān)于臨床共變量,這可以是多變量模型。這種方法類似于無臨床共變量的搜索,只是所述方法應(yīng)該允許結(jié)合相關(guān)的共變量信息。選擇截點(diǎn)的散點(diǎn)方法只允許共變量的有限應(yīng)用,例如,二元共變量可以是繪圖內(nèi)的編碼的色彩。如果這一分析依賴于某種回歸方法,那么通常促進(jìn)共變量(還是同時(shí)它們中的多個(gè))的應(yīng)用。基于在3下所述的COX模型的截點(diǎn)搜索,允許共變量的便易結(jié)合,并且由此導(dǎo)致共變量調(diào)整的單變量截點(diǎn)搜索。通過共變量調(diào)整可以如共變量在所述模型中那樣或者通過包含在層次分析中進(jìn)行。預(yù)測(cè)函數(shù)的其它選擇也允許結(jié)合共變量。這直接用于作為預(yù)測(cè)函數(shù)的Cox模型選擇。存在評(píng)估共變量對(duì)相互作用水平的影響的選擇,例如,這意味著,對(duì)于不同的年齡組,應(yīng)用不同的風(fēng)險(xiǎn)比例。對(duì)于預(yù)測(cè)函數(shù)的可能性比例類型,預(yù)測(cè)概率必須包括共變量進(jìn)行評(píng)估。這里可以應(yīng)用多變量模式識(shí)別的方法,或者生物標(biāo)記值可以通過關(guān)于共變量的多次回歸進(jìn)行調(diào)整(在概率估計(jì)之前)。CART技術(shù)(分類和回歸樹;BreimanL.,FriedmanJ.H.,OlshenR.A.,StoneC丄,Chapman&Hall(Wadsworth,Inc.),紐約,1984)可以用于生物標(biāo)記(原始檢測(cè)水平)加上應(yīng)用臨床益處檢測(cè)作為應(yīng)答的臨床共變量。搜索這種方法截點(diǎn),并且將找到包含用于預(yù)測(cè)的共變量的函數(shù)的決策樹類型。通過CART選擇的截點(diǎn)和運(yùn)算法則通常接近最優(yōu),并且可以通過考慮不同的臨床益處檢測(cè)而組合和統(tǒng)一。Ad5:在多變量水平上選擇生物標(biāo)記預(yù)測(cè)函數(shù)當(dāng)存在在不同的單變量預(yù)測(cè)函數(shù)選擇中保持它們的預(yù)測(cè)潛力的一些生物標(biāo)記候選時(shí),那么可以通過生物標(biāo)記組合,即,考慮多變量預(yù)測(cè)函數(shù)而實(shí)現(xiàn)進(jìn)一步的改善?;诤唵蔚暮>S賽德函數(shù)模型,可以評(píng)估生物標(biāo)記組合,例如,通過考慮其中指明最優(yōu)截點(diǎn)的生物標(biāo)記值的雙變量散點(diǎn)圖。那么生物標(biāo)記的組合可以通過合理AND和OR操作組合不同的海維賽德函數(shù)而實(shí)現(xiàn),以獲得提咼的預(yù)測(cè)。CART技術(shù)(分類和回歸樹)可以用于多種生物標(biāo)記(原始檢測(cè)水平)和臨床益處檢測(cè)作為應(yīng)答,以獲得生物標(biāo)記的截點(diǎn)和預(yù)測(cè)函數(shù)的決策樹類型。通過CART選擇的截點(diǎn)和運(yùn)算法則通常接近最優(yōu),并且可以通過考慮不同的臨床益處檢測(cè)而組合和統(tǒng)一。Cox-回歸可以在不同的水平上應(yīng)用。第一種方式是以二元方式結(jié)合多種生物標(biāo)記(即,基于具有一些截點(diǎn)的海維賽德函數(shù))。其它選擇以度量方式應(yīng)用生物標(biāo)記(在適當(dāng)?shù)霓D(zhuǎn)換之后),或者二元和度量方式的結(jié)合。這禾中推算多變量予頁領(lǐng)!j函婁女(evolvingmultivariatepredictionfunction)是如在3下所述的Cox類型。這種多變量可能性比例方法難以實(shí)現(xiàn),但是還描述為多變量預(yù)測(cè)函數(shù)的選擇。Ad6:在多變量水平上選擇包含臨床共變量的生物標(biāo)記預(yù)測(cè)函數(shù)當(dāng)存在相關(guān)的臨床共變量時(shí),那么進(jìn)一步的提高可以通過將多種生物標(biāo)記與多種臨床共變量組合而實(shí)現(xiàn)。將關(guān)于包含臨床共變量的可能性而評(píng)估不同的預(yù)測(cè)函數(shù)選擇?;陉P(guān)于生物標(biāo)記的海維賽德函數(shù)的簡單邏輯組合,其它共變量可以包含在基于在練習(xí)設(shè)定中獲得的對(duì)數(shù)回歸模型的預(yù)測(cè)函數(shù)中。CART技術(shù)和推算決策樹可以容易地與其它共變量一起應(yīng)用,其將包括在預(yù)測(cè)運(yùn)算法則中的那些?;贑ox-回歸的所有預(yù)測(cè)函數(shù)可以應(yīng)用其它臨床共變量。存在評(píng)估共變量對(duì)相互作用水平的影響的選擇,例如,這意味著,對(duì)于不同的年齡組應(yīng)用不同的風(fēng)險(xiǎn)比例。多變量可能性比例方法不直接擴(kuò)展到其它共變量的應(yīng)用。實(shí)施例1評(píng)估來自使用Pertuzumab治療的HER2低表達(dá)轉(zhuǎn)移性乳腺癌患者的基線血清的HER配體和去除的HER2(HER2ECD)水平,如下文所述。用于血清生物標(biāo)記評(píng)估的試劑盒<table>tableseeoriginaldocumentpage39</column></row><table>EGFQuantikine人EGFELISAkit,目錄號(hào)DEG00R&DSystemsLtd.(R&D系統(tǒng)有限公司),19BartonLane,AbingdonOX143NB,英國TGF-aQuantikine人TGF-a免疫測(cè)定,目錄號(hào)DTGAOOR&DSystemsLtd.(R&D系統(tǒng)有限公司),19BartonLane,Abingdon0X143NB,英國流程HER2-ECD:按照供應(yīng)商的推薦進(jìn)行HER2-ECDELISA。雙調(diào)蛋白-準(zhǔn)備所有試劑(由試劑盒提供),標(biāo)準(zhǔn)稀釋物(由試劑盒提供)和樣口-提供在框架中的EvenCoat山羊抗-小鼠IgG微量平板條帶(R&D,目錄號(hào)CP002;不由試劑盒提供)?,F(xiàn)在所述框架叫作ELISA平板。-確定需要的孔的數(shù)目(標(biāo)準(zhǔn)稀釋物數(shù)目+樣品數(shù)目)。-確定平板布局。-向每個(gè)孔加入IOOpl稀釋的捕獲抗體(由試劑盒提供;在PBS中1:180)。-在室溫下溫育l個(gè)小時(shí)。-吹吸每個(gè)孔,并且洗滌,重復(fù)這一步驟三次,總共洗滌4次。洗滌通過將每個(gè)孔充滿400pl洗滌緩沖液(不由試劑盒提供;使用在PBS中的0.05%吐溫-20),使用多支管分液器,并且隨后吹吸而進(jìn)行。在最后洗滌后,通過吹吸去除任何殘余的洗滌緩沖液。倒置平板,并且用潔凈的紙巾吸干。-每個(gè)孔加入100)il標(biāo)準(zhǔn)稀釋物或稀釋的樣品(參見下文)。每次移液步驟之后更換吸頭。-用粘附條帶(由試劑盒提供)蓋上平板。-在室溫下在搖動(dòng)平臺(tái)上溫育2個(gè)小時(shí)。-如前文所述重復(fù)吹吸/洗滌。-吹吸的樣品和洗滌溶液用實(shí)驗(yàn)室消毒劑處理。-每個(gè)孔加入在試劑稀釋液(不由試劑盒提供;使用在PBS中的1%BSA(Roth;白蛋白片段V,目錄號(hào)T844.2))中1:180稀釋的100pl檢測(cè)抗體(由試劑盒提供)。-在室溫溫育2個(gè)小時(shí)。-如前文所述重復(fù)吹吸/洗漆。-向每個(gè)孔加入100pi鏈霉抗生物素蛋白-HRP的工作稀釋液(由試劑盒提供;在試劑稀釋液中l(wèi):200稀釋)。用新的粘附條帶蓋上。-在室溫溫育20min。-如前文所述重復(fù)吹吸/洗滌。-向每個(gè)孔加入IOOpl底物溶液(R&D,目錄號(hào)DY999;不由試劑盒提供)-在室溫溫育20min。避光。-向每個(gè)孔加入50pl終止溶液(1.5MH2S04(Schwefels加rereinst,Merck,目錄號(hào)713);不由試劑盒提供)。小心混合。-使用設(shè)定在450nm的微量平板讀數(shù)儀,立即確定每個(gè)孔的光學(xué)密雙調(diào)蛋白標(biāo)準(zhǔn)曲線在PBS中的1%BSA中制備40ng/ml雙調(diào)蛋白儲(chǔ)液,等分并且保存在-80。C。在PBS中20e/。BSA中的雙調(diào)蛋白溶液超過兩周后不穩(wěn)定,因此不能使用。在每次實(shí)驗(yàn)之前,從等分的雙調(diào)蛋白儲(chǔ)液新鮮制備在PBS中的20%BSA中雙調(diào)蛋白標(biāo)準(zhǔn)曲線。最高濃度為1000pg/ml(雙調(diào)蛋白儲(chǔ)液的1:40稀釋液)。由ELISA試劑盒提供的標(biāo)準(zhǔn)物產(chǎn)生線性標(biāo)準(zhǔn)曲線。所述曲線基于Excel的分析允許確定關(guān)于每次ELISA的曲線方程。雙調(diào)蛋白樣品當(dāng)將樣品l:l稀釋在試劑稀釋液中時(shí),所有的樣品在ELISA的線性范圍內(nèi)。每種樣品一式兩份進(jìn)行檢測(cè)。取決于數(shù)據(jù)的質(zhì)量,和充足量的血清,如果需要。在隨后的實(shí)驗(yàn)中重復(fù)測(cè)定。41EGF:-準(zhǔn)備所有試劑(由試劑盒提供),標(biāo)準(zhǔn)稀釋物(由試劑盒提供)和樣口叩-從框架上移去多余的抗體-包被的微量滴定平板條帶(由試劑盒提供)?,F(xiàn)在所述框架叫作ELISA平板。-確定需要的孔的數(shù)目(標(biāo)準(zhǔn)稀釋物數(shù)目+樣品數(shù)目)X2-確定平板布局。-向每個(gè)孔加入50)il檢測(cè)稀釋液RD1(由試劑盒提供)。-每個(gè)孔加入200|il標(biāo)準(zhǔn)稀釋物或稀釋的樣品(例如,在Calibrator稀釋劑RD6H中1:20)。每次移液步驟之后更換吸頭。-用粘附條帶(由試劑盒提供)蓋上平板。-在室溫下在搖動(dòng)平臺(tái)上溫育2個(gè)小時(shí)。-吹吸每個(gè)孔,并且洗滌,重復(fù)這一步驟三次,總共洗滌4次。洗滌通過將每個(gè)孔充滿400(il洗滌緩沖液(由試劑盒提供),使用多支管分液器,并且隨后吹吸而進(jìn)行。在最后洗滌后,通過吹吸去除任何殘余的洗滌緩沖液。倒置平板,并且用潔凈的紙巾吸干。-吹吸的樣品和洗滌溶液用實(shí)驗(yàn)室消毒劑處理。-向每個(gè)孔加入200^綴合物(由試劑盒提供)。用新的粘附條帶蓋上。-在室溫溫育2個(gè)小時(shí)。-如前文所述重復(fù)吹吸/洗滌。-向每個(gè)孔加入200^底物溶液(由試劑盒提供)。-在室溫溫育20min。避光。-向每個(gè)孔加入50(il終止溶液(由試劑盒提供)。小心混合。-使用設(shè)定在450nm的微量平板讀數(shù)儀,在30分鐘內(nèi)確定每個(gè)孔的光學(xué)密度。EGF標(biāo)準(zhǔn)曲線由ELISA試劑盒提供的標(biāo)準(zhǔn)物產(chǎn)生線性標(biāo)準(zhǔn)曲線。此外,非常小的濃度顯示可檢測(cè)的結(jié)果。EGF樣品使用所述樣品進(jìn)行總共4次檢測(cè)。每種樣品檢測(cè)2-5次,檢測(cè)的次數(shù)取決于結(jié)果的質(zhì)量(平均值+/-80)和充足量的血清的可用性。當(dāng)樣品以1:20稀釋在Calibrator稀釋劑RD6H中時(shí),所有的樣品在ELISA的線性范圍內(nèi)。-準(zhǔn)備所有試劑(由試劑盒提供),標(biāo)準(zhǔn)稀釋物(由試劑盒提供)和樣口叩-從框架上移去多余的抗體-包被的微量滴定平板條帶(由試劑盒提供)?,F(xiàn)在所述框架叫作ELISA平板。-確定需要的孔的數(shù)目(標(biāo)準(zhǔn)稀釋物數(shù)目+樣品數(shù)目)X2-確定平板布局。-向每個(gè)孔加入100)il檢測(cè)稀釋液RDlW(由試劑盒提供)。-每個(gè)孔加入50^標(biāo)準(zhǔn)稀釋物或樣品。每次移液步驟之后更換吸頭。-用粘附條帶(由試劑盒提供)蓋上平板。-在室溫下在搖動(dòng)平臺(tái)上溫育2個(gè)小時(shí)。-吹吸每個(gè)孔,并且洗滌,重復(fù)這一步驟三次,總共洗滌4次。洗滌通過將每個(gè)孔充滿400pi洗滌緩沖液(由試劑盒提供),使用多支管分液器,并且隨后吹吸而進(jìn)行。在最后洗滌后,通過吹吸去除任何殘余的洗滌緩沖液。倒置平板,并且用潔凈的紙巾吸干。-吹吸的樣品和洗滌溶液用實(shí)驗(yàn)室消毒劑處理。-向每個(gè)孔加入200^ilTGF-ot綴合物(由試劑盒提供)。用新的粘附條諧生卜巾皿丄。-在室溫溫育2個(gè)小時(shí)。-如前文所述重復(fù)吹吸/洗滌。-向每個(gè)孔加入200iiil底物溶液(由試劑盒提供)。-在室溫溫育30min。避光。-向每個(gè)孔加入50pl終止溶液(由試劑盒提供)。小心混合。TGF陽a:43-使用設(shè)定在450nm的微量平板讀數(shù)儀,在30分鐘內(nèi)確定每個(gè)孔的光學(xué)密度。TGF-oc標(biāo)準(zhǔn)曲線由ELISA試劑盒提供的標(biāo)準(zhǔn)物產(chǎn)生線性標(biāo)準(zhǔn)曲線。此外,非常小的濃度顯示可檢測(cè)的結(jié)果。TGF-a樣品使用所述樣品進(jìn)行總共4次檢測(cè)。樣品在2-4次獨(dú)立的檢測(cè)中進(jìn)行檢分析血清數(shù)據(jù)以鑒定這樣的因子,即,其基線血清水平與Pertuzumab治療的應(yīng)答相關(guān)。對(duì)于所有的因子,觀察到歪斜模式的分布(平均值,標(biāo)準(zhǔn)偏差,中值,最小值,最大值)?;趯?duì)數(shù)Log(x+l),單調(diào)轉(zhuǎn)換用來減少偏斜。在單變量分析中,研究能否確定與應(yīng)答(在本實(shí)施例中,定義為臨床益處)的可能性相關(guān)的所述因子的適當(dāng)?shù)慕攸c(diǎn)。在這里,具有臨床益處的患者定義為獲得部分應(yīng)答(PR)或保持穩(wěn)定的疾病至少6個(gè)月的那些患者。研究所述因子相對(duì)應(yīng)答種類的散點(diǎn)圖。圖1和圖2顯示臨床應(yīng)答種類分別相對(duì)TGF-a和雙調(diào)蛋白的血清水平的對(duì)數(shù)轉(zhuǎn)換的繪圖,以示例所述方法?;谒錾Ⅻc(diǎn)圖,為所述因子選擇截點(diǎn),以確定經(jīng)歷更大臨床益處的患者組。圖3(TGF-a),圖4(雙調(diào)蛋白),圖5(EGF),和圖6(HER2-ECD)顯示相對(duì)于不同因子分組的臨床益處,所述因子分組基于計(jì)算成原始因子單位的研究性截點(diǎn)。所述截點(diǎn)分離出一些無臨床癥狀的患者,并且,因此提高具有更大的臨床益處的組的應(yīng)答速率。實(shí)施例2在本實(shí)施例中,將來自實(shí)施例1的研究性截點(diǎn)用于評(píng)估所述因子分組對(duì)Pertuzumab治療臨床益處的不同檢測(cè)的單變量作用,其使用發(fā)展/或死亡時(shí)間(TTP)和死亡時(shí)間(TTD)作為備選的臨床終點(diǎn)。在關(guān)于TTP禾口/或TTD的Kaplan-Meier估計(jì)和對(duì)數(shù)-排列檢測(cè)中,觀察到對(duì)于TGF-a、雙調(diào)蛋白、EGF和HER2-ECD的顯著作用,如在圖7的概括中所示。顯示風(fēng)險(xiǎn)比例的Kaplan-Meier圖在圖8和圖9(TGF-a)、10和11(雙調(diào)蛋白)、12和13(EGF),以及14和15(HER2-ECD)中關(guān)于TTP和TTD給出(觀察到事件的最高數(shù)目),其顯示基于關(guān)于用Pertuzumab治療的患者的臨床結(jié)果的這些因子分組的顯著作用。實(shí)施例3在本實(shí)施例中,應(yīng)用多變量方法鑒定進(jìn)一步提高具有來自Pertuzumab治療的更大益處的患者的鑒定的因子組合。反映從CART方法(歸類和回歸樹)推導(dǎo)出來的結(jié)果。CART分類方法使得有必要指明大于O的臨床益處中所有值為得益組。Her2-ECD、TGF-a、雙調(diào)蛋白和EGF的血清水平用作變量。選擇血清Her2-ECD和血清TGF-ct水平的組合以給出最好的結(jié)果。從CART結(jié)果推導(dǎo)關(guān)于血清Her2-ECD和血清TGF-a水平組合的最優(yōu)截點(diǎn),導(dǎo)致在研究群體中用于臨床益處研究性歸類的法則一一低血清Her2-ECD值和低血清TGF-a值的組合在所述研究群體中捕獲2/2PR和2/3SDW個(gè)月,并且排除合理數(shù)目的快速發(fā)展的患者。圖16顯示相對(duì)于TGF-a/HER2-ECD組合分組的臨床益處,所述分組基于研究性組合截點(diǎn)。圖17總結(jié)TGF-a和HER2-ECD組合對(duì)TTP和TTD的作用。在圖18(TTP)和圖19(TTD)中給出的Kaplan-Meier估計(jì)和風(fēng)險(xiǎn)比例證明基于這些因子的組合的分組對(duì)用Pertuzumab治療的患者的臨床結(jié)果的顯著作用。權(quán)利要求1.預(yù)測(cè)在患者中對(duì)使用HER二聚體化抑制劑治療的應(yīng)答的方法,其包括步驟a)在來自患者的生物樣品中評(píng)估-選自由表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子α和HER2標(biāo)記基因組成的組的標(biāo)記基因或標(biāo)記基因的組合,或-標(biāo)記基因組合,其包括雙調(diào)蛋白標(biāo)記基因和選自表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子α和HER2標(biāo)記基因的標(biāo)記基因,和b)通過評(píng)估步驟a)的結(jié)果而預(yù)測(cè)在患者中對(duì)使用HER二聚體化抑制劑治療的應(yīng)答。2.按照權(quán)利要求1的方法,其中評(píng)估標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合的步驟a)包括al)評(píng)估所述標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平,a2)確定在步驟al)中評(píng)估的表達(dá)水平是高于還是低于閾值。3.按照權(quán)利要求2的方法,其中所述閾值在權(quán)利要求2的方法的步驟al)前通過下述確定1)在使用HER二聚體化抑制劑治療之前,在來自患者的多份生物樣品中評(píng)估標(biāo)記基因或標(biāo)記基因的組合的表達(dá)水平,2)用HER二聚體化抑制劑治療所述患者,3)將使用HER二聚體化抑制劑治療的患者的應(yīng)答與在步驟a)中確定的所述標(biāo)記基因或標(biāo)記基因的組合的表達(dá)水平相關(guān)聯(lián),由此確定閾值。4.按照權(quán)利要求1-3中任一項(xiàng)的方法,其中所述生物樣品是血清、血漿或腫瘤組織。5.按照權(quán)利要求1-4中任一項(xiàng)的方法,其中所述HER二聚體化抑制劑抑制HER2與EGFR或HER3的異型二聚體化。6.按照權(quán)利要求5的方法,其中所述HER二聚體化抑制劑是抗體,優(yōu)選抗體2C4。7.按照權(quán)利要求1-6中任一項(xiàng)的方法,其中所述患者是癌癥患者,優(yōu)選乳腺癌、卵巢癌、肺癌或前列腺癌患者。8.按照權(quán)利要求1-7中任一項(xiàng)的方法,其中所述標(biāo)記基因的組合由下列各項(xiàng)組成-轉(zhuǎn)化生長因子ot和HER2標(biāo)記基因,或-雙調(diào)蛋白、表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子oc和HER2標(biāo)記基因。9.按照權(quán)利要求1-8中任一項(xiàng)的方法,其中所述標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合在樣品中的表達(dá)水平通過檢測(cè)由所述標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合編碼的標(biāo)記蛋白或其片段或者標(biāo)記蛋白或其片段的組合的表達(dá)水平而進(jìn)行評(píng)估。10.權(quán)利要求9的方法,其中所述標(biāo)記蛋白或其片段或者標(biāo)記蛋白或其片段的組合的表達(dá)水平使用特異性與所述標(biāo)記蛋白或其片段或者標(biāo)記蛋白或其片段的組合相結(jié)合的試劑而進(jìn)行檢測(cè)。11.權(quán)利要求10的方法,其中所述試劑選自由抗體、抗體片段或抗體衍生物的片段組成的組。12.按照權(quán)利要求9-11中任一項(xiàng)的方法,其中所述表達(dá)水平應(yīng)用選自由下列各項(xiàng)組成的組的方法進(jìn)行測(cè)定蛋白質(zhì)組學(xué)、流式細(xì)胞術(shù)、免疫細(xì)胞化學(xué)、免疫組織化學(xué)、酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定、多通道酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定和這些方法的變體。13.按照權(quán)利要求9-12中任一項(xiàng)的方法,其中所述標(biāo)記蛋白的片段是Her2標(biāo)記蛋白的細(xì)胞外結(jié)構(gòu)域。14.按照權(quán)利要求13的方法,其中所述Her2標(biāo)記蛋白的細(xì)胞外結(jié)構(gòu)域具有約105.000道爾頓的分子量。15.按照權(quán)利要求9-14中任一項(xiàng)的方法其中所述雙調(diào)蛋白標(biāo)記蛋白的氨基酸序列是氨基酸序列SEQIDNO:1,其中所述表皮生長因子標(biāo)記蛋白的氨基酸序列是氨基酸序列SEQIDNO:2,其中所述轉(zhuǎn)化生長因子a標(biāo)記蛋白的氨基酸序列是氨基酸序列SEQIDNO:3,或其中所述HER2標(biāo)記蛋白的氨基酸序列是氨基酸序列SEQIDNO:4。16.按照權(quán)利要求9-15中任一項(xiàng)的方法,其中血清中關(guān)于下述各項(xiàng)的閾值-關(guān)于轉(zhuǎn)化生長因子oc標(biāo)記蛋白的閾值為2.0-5.0pg/ml,優(yōu)選地約3.5pg/ml,-關(guān)于表皮生長因子標(biāo)記蛋白的閾值為100-250pg/ml,優(yōu)選地約150pg/ml,或-關(guān)于雙調(diào)蛋白標(biāo)記蛋白的閾值為6-15pg/ml,優(yōu)選地約12pg/ml。17.按照權(quán)利要求13-15中任一項(xiàng)的方法,其中血清中關(guān)于Her2標(biāo)記蛋白細(xì)胞外結(jié)構(gòu)域的閾值為12-22ng/ml,優(yōu)選地約18ng/ml。18.按照權(quán)利要求1-8中任一項(xiàng)的方法,其中所述標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合在生物樣品中的表達(dá)水平通過檢測(cè)由所述標(biāo)記基因編碼的轉(zhuǎn)錄的標(biāo)記多聚核苷酸或所述轉(zhuǎn)錄的標(biāo)記多聚核苷酸的片段的表達(dá)水平、或者由標(biāo)記基因組合編碼的轉(zhuǎn)錄的標(biāo)記多聚核苷酸或所述轉(zhuǎn)錄的標(biāo)記多聚核苷酸的片段的表達(dá)水平而進(jìn)行評(píng)估。19.權(quán)利要求18的方法,其中所述轉(zhuǎn)錄的標(biāo)記多聚核苷酸是cDNA,mRNA或hnRNA,或者其中所述多種轉(zhuǎn)錄的標(biāo)記多聚核苷酸是cDNA,mRNA或hnRNA。20.按照權(quán)利要求18-19中任一項(xiàng)的方法,其中所述檢測(cè)步驟還包括擴(kuò)增所述轉(zhuǎn)錄的多聚核苷酸或多種轉(zhuǎn)錄的多聚核苷酸。.21.按照權(quán)利要求20的方法,其中檢測(cè)步驟使用定量反轉(zhuǎn)錄酶聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的方法進(jìn)行。22.按照權(quán)利要求18-21中任一項(xiàng)的方法,-其中所述標(biāo)記基因的表達(dá)水平通過使用在嚴(yán)格雜交條件下與所述轉(zhuǎn)錄的標(biāo)記多聚核苷酸或其片段退火的探針檢測(cè)所述轉(zhuǎn)錄的標(biāo)記多聚核苷酸或其片段在樣品中的存在而進(jìn)行評(píng)估,或者-其中所述標(biāo)記基因組合在樣品中的表達(dá)水平通過使用在嚴(yán)格雜交條件下與所述轉(zhuǎn)錄的標(biāo)記多聚核苷酸或其片段退火的探針檢測(cè)所述轉(zhuǎn)錄的標(biāo)記多聚核苷酸或其片段在樣品中的存在而進(jìn)行評(píng)估。23.按照權(quán)利要求18-22中任一項(xiàng)的方法其中所述雙調(diào)蛋白標(biāo)記多聚核苷酸的核酸序列是核酸序列SEQIDNO:5,其中所述表皮生長因子標(biāo)記多聚核苷酸的核酸序列是核酸序列SEQIDNO:6,其中所述轉(zhuǎn)化生長因子a標(biāo)記多聚核苷酸的核酸序列是核酸序列SEQIDNO:7,或其中所述HER2標(biāo)記多聚核苷酸的核酸序列是核酸序列SEQIDNO:8。24.在嚴(yán)格條件下與表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a或HER2標(biāo)記多聚核苷酸雜交的探針,或與表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a或HER2標(biāo)記蛋白結(jié)合的抗體,用于在患者中預(yù)測(cè)對(duì)使用HER二聚體化抑制劑治療的應(yīng)答的應(yīng)用,或者在嚴(yán)格條件下與雙調(diào)蛋白、表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a或HER2標(biāo)記多聚核苷酸雜交的探針,或與雙調(diào)蛋白、表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a或HER2標(biāo)記蛋白結(jié)合的抗體,用于選擇在患者中抑制疾病發(fā)展的組合物的應(yīng)用。25.試劑盒,其包括在嚴(yán)格條件下與雙調(diào)蛋白、表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a或HER2標(biāo)記多聚核苷酸退火的探針,或者與雙調(diào)蛋白、表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a或HER2標(biāo)記蛋白結(jié)合的抗體。26.選擇在患者中抑制疾病發(fā)展的組合物的方法,所述方法包括a)在多種測(cè)試組合物的存在下,分別暴露來自癌癥患者的生物樣品的等分試樣;b)將與測(cè)試組合物接觸的生物樣品等分試樣中選自由雙調(diào)蛋白、表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a和HER2標(biāo)記基因組成的組的標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平與在不接觸測(cè)試組合物的生物樣品等分試樣中選自由雙調(diào)蛋白、表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a和HER2標(biāo)記基因組成的組的標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平相比較;c)相對(duì)于沒有接觸測(cè)試組合物的等分試樣,選擇在包含所述測(cè)試組合物的等分試樣中改變了所述標(biāo)記基因或所述標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平的一種測(cè)試組合物,其中在與所述測(cè)試組合物接觸的生物樣品的等分試樣中所述標(biāo)記基因或所述標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平與在沒有接觸所述測(cè)試組合物的生物樣品的等分試樣中的相應(yīng)標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平之間存在至少10%的差異是選擇所述測(cè)試組合物的指征。27.衍生候選藥劑的方法,所述方法包括a)將來自癌癥患者的生物樣品的等分試樣與候選藥劑接觸,并且確定選自由雙調(diào)蛋白、表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子oc和HER2標(biāo)記基因組成的組的標(biāo)記基因或標(biāo)記基因的組合在所述等分試樣中的表達(dá)水平,b)確定在沒有與所述候選藥劑接觸的生物樣品等分試樣中相應(yīng)的標(biāo)記基因或相應(yīng)的標(biāo)記基因的組合的表達(dá)水平,c)通過將與所述候選藥劑接觸的生物樣品的等分試樣中所述標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平與在沒有接觸所述候選藥劑的生物樣品的等分試樣中相應(yīng)的標(biāo)記基因或相應(yīng)的標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平進(jìn)行比較,而觀察所述候選藥劑的效果,d)從所述觀察到的效果衍生所述藥劑,其中在與所述候選藥劑接觸的生物樣品的等分試樣中所述標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平與在沒有接觸所述候選藥劑的生物樣品的等分試樣中的相應(yīng)的標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平之間存在至少10%的差異是所述候選藥劑作用的指征。28.按照權(quán)利要求27的方法,其中所述候選藥劑是候選抑制劑。29.按照權(quán)利要求27的方法,其中所述候選藥劑是候選增強(qiáng)劑。30.通過按照權(quán)利要求27-29中任一項(xiàng)的方法衍生的候選藥劑。31.藥物制劑,其包含按照權(quán)利要求30的藥劑。32.按照權(quán)利要求30的藥劑的應(yīng)用,其用于制備用于治療癌癥的組33.—種生產(chǎn)藥物的方法,其包括權(quán)利要求27-29中任一項(xiàng)的方法的步驟;并且i)以足以對(duì)受試者以治療有效量提供所述藥物的量合成在步驟(c)中鑒定的候選藥劑或其類似物或衍生物;和/或ii)將藥物候選物,即步驟(C)中鑒定的候選藥劑,或其類似物或衍生物與藥用載體結(jié)合。34.選自由雙調(diào)蛋白、表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a和HER2標(biāo)記蛋白或標(biāo)記多聚核苷酸組成的組的標(biāo)記蛋白或標(biāo)記多聚核苷酸用于衍生候選藥劑或者用于選擇在患者中抑制疾病發(fā)展的組合物的應(yīng)用。35.HER二聚體化抑制劑用來制備治療人癌癥患者的藥物中的應(yīng)用,其特征在于所述治療包括在來自患者的生物樣品中評(píng)估下列各項(xiàng)-選自由表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a和HER2標(biāo)記基因組成的組的標(biāo)記基因或標(biāo)記基因的組合,或-標(biāo)記基因組合,其包括雙調(diào)蛋白標(biāo)記基因和選自表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子a和HER2標(biāo)記基因的標(biāo)記基因。36.按照權(quán)利要求35的應(yīng)用,其中所述治療包括在治療過程中評(píng)估所述標(biāo)記基因或標(biāo)記基因組合至少一次或重復(fù)評(píng)估。37.按照權(quán)利要求35-36中任一項(xiàng)的應(yīng)用,其中評(píng)估所述標(biāo)記基因的表達(dá)水平或標(biāo)記基因組合的表達(dá)水平。38.按照權(quán)利以求35-37中任一項(xiàng)的應(yīng)用,其中所述HER二聚體化抑制劑是抗體,優(yōu)選抗體2C4。39.按照權(quán)利要求35-38中任一項(xiàng)的應(yīng)用,其中所述患者是乳腺癌、卵巢癌、肺癌或前列腺癌患者。全文摘要本發(fā)明涉及預(yù)測(cè)對(duì)在患者中使用HER二聚體化抑制劑治療的應(yīng)答的方法,其包括下述步驟在來自患者的生物樣品中評(píng)估選自由表皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子α和HER2標(biāo)記基因組成的組的標(biāo)記基因或標(biāo)記基因的組合,或標(biāo)記基因組合,其包括雙調(diào)蛋白標(biāo)記基因和選自上皮生長因子、轉(zhuǎn)化生長因子α和HER2標(biāo)記基因的標(biāo)記基因,并且通過評(píng)估第一步的結(jié)果而預(yù)測(cè)在患者中使用HER二聚體化抑制劑治療的應(yīng)答。還公開在其中應(yīng)用這些標(biāo)記的其它應(yīng)用和方法。文檔編號(hào)C12Q1/68GK101405405SQ200680028951公開日2009年4月8日申請(qǐng)日期2006年5月24日優(yōu)先權(quán)日2005年8月12日發(fā)明者安德烈亞斯·斯特勞斯,格哈德·楚格邁爾,約阿希姆·默克斯申請(qǐng)人:霍夫曼-拉羅奇有限公司
網(wǎng)友詢問留言 已有0條留言
  • 還沒有人留言評(píng)論。精彩留言會(huì)獲得點(diǎn)贊!
1