蘇太豬一般抗病力綜合選擇指數(shù)選擇育種方法
【專利摘要】本發(fā)明涉及一種蘇太豬一般抗病力綜合選擇指數(shù)選擇育種方法。方法是仔豬在35日齡時(shí)采集前腔靜脈血，獲得血清樣品后測(cè)定白介素2(IL-2)、白介素4(IL-4)、白介素6(IL-6)、白介素10(IL-10)、白介素12(IL-12)、β干擾素(IFN-β)的濃度，同時(shí)對(duì)實(shí)驗(yàn)豬群體進(jìn)行分組，之后將上述6個(gè)指標(biāo)數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為標(biāo)準(zhǔn)化Z分值，代入所建綜合選擇指數(shù)公式計(jì)算每個(gè)群體的綜合選擇指數(shù)值，根據(jù)值的大小確定一般抗病力較強(qiáng)個(gè)體。本發(fā)明的檢測(cè)方法操作簡(jiǎn)單，準(zhǔn)確度高，并可實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化的直接檢測(cè)，本發(fā)明將在豬的抗病育種實(shí)踐中發(fā)揮巨大作用。
【專利說明】蘇太豬一般抗病力綜合選擇指數(shù)選擇育種方法
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001]本發(fā)明涉及豬抗病育種領(lǐng)域，具體涉及一種建立蘇太豬一般抗病力綜合選擇指數(shù)篩選高抗病力個(gè)體的選擇育種方法。
【背景技術(shù)】
[0002]近年來，隨著生豬養(yǎng)殖規(guī)模程度的不斷加快，單純追求高產(chǎn)通常導(dǎo)致豬的疾病抵抗力降低，一些原有疾病未根除，又出現(xiàn)了新的疾病，嚴(yán)重制約了養(yǎng)豬業(yè)的發(fā)展。疾病可導(dǎo)致豬肉產(chǎn)品低劣、產(chǎn)量下降，同時(shí)它還嚴(yán)重降低遺傳進(jìn)展，給養(yǎng)豬業(yè)造成的直接經(jīng)濟(jì)損失約占總產(chǎn)值的12%-15%。因此，做好疾病預(yù)防是養(yǎng)豬業(yè)健康快速發(fā)展的重要前提。傳統(tǒng)的疾病防控措施如改善環(huán)境、疫苗接種和藥物治療等并不能從根本上控制疾病，同時(shí)濫用抗生素也導(dǎo)致豬肉產(chǎn)品攜帶大量殘留藥物，繼而危害人類身體健康。因而如何在培育高產(chǎn)品種的同時(shí)，找到一條安全可靠且經(jīng)濟(jì)可行的生豬疾病防治途徑，已然是科學(xué)家和養(yǎng)豬業(yè)共同關(guān)心的緊迫問題。
[0003]據(jù)文獻(xiàn)報(bào)道，雖然常規(guī)飼養(yǎng)管理和藥物疫苗不能根本上控制疾病，但可以通過抗病育種來提高機(jī)體對(duì)疾病的抵抗力。衡量動(dòng)物機(jī)體對(duì)疾病抵抗能力大小的指標(biāo)有很多，細(xì)胞因子(cytokines，CK)是其中一項(xiàng)重要指標(biāo)，其是由機(jī)體免疫細(xì)胞分泌的一類具有廣泛生物學(xué)活性的小分子多肽，具有免疫調(diào)節(jié)、抗腫瘤、促進(jìn)造血、參與炎癥反應(yīng)以及神經(jīng)內(nèi)分泌效應(yīng)等多種生物學(xué)功能；在動(dòng)物體內(nèi)，絕大多數(shù)細(xì)胞因子含量較低，其主要作用是提高動(dòng)物的免疫功能。據(jù)報(bào)道，免疫指標(biāo)可代表機(jī)體的免疫功能狀態(tài)，從而間接反映機(jī)體的抗病能力，因此可通過免疫指標(biāo)的測(cè)定來了解動(dòng)物的一般抗病力。然而迄今為止，尚未建立對(duì)蘇太豬一般抗病力的評(píng)價(jià)體系，因而無法從眾多的細(xì)胞因子測(cè)定指標(biāo)中選擇最佳數(shù)量指標(biāo)，形成一套適用的綜合評(píng)價(jià)指標(biāo)體系。
[0004]一般抗病力多個(gè)測(cè)量指標(biāo)中需要構(gòu)建一套適用的綜合評(píng)價(jià)指標(biāo)體系，在該體系中指標(biāo)模型的構(gòu)建是關(guān)鍵問題之一，主成分分析法(principal component analysis, PCA)正好科學(xué)地解決了這一問題。PCA是研究如何將多指標(biāo)問題轉(zhuǎn)化為較少的綜合指標(biāo)的一種重要統(tǒng)計(jì)方法，能使問題變得比較簡(jiǎn)單、直觀，近來已成為多指標(biāo)綜合評(píng)價(jià)和權(quán)重系數(shù)確定的
重要方法。
[0005]蘇太豬，是蘇州市蘇太豬育種中心(現(xiàn)蘇州蘇太企業(yè)有限公司)歷經(jīng)十五年由杜洛克與太湖豬雜交培育的優(yōu)質(zhì)瘦肉型豬新品種，1999年通過國(guó)家畜禽品種審定委員會(huì)的新品種審定，具有生產(chǎn)性能優(yōu)良、肉質(zhì)鮮美等優(yōu)點(diǎn)。本發(fā)明的目的就是通過主成分分析方法建立“蘇太豬一般抗病力綜合選擇指數(shù)選擇育種方法”，篩選一般抗病力較強(qiáng)個(gè)體，通過選擇育種培育高抗病力新品系。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0006]本發(fā)明是通過建立主成分綜合評(píng)價(jià)模型，根據(jù)不同群體/個(gè)體的綜合得分來對(duì)蘇太豬一般抗病力進(jìn)行綜合指數(shù)選育的方法和應(yīng)用。[0007]本發(fā)明采用的技術(shù)方案包括以下步驟:
[0008](I)將待選育的蘇太仔豬進(jìn)行群體或個(gè)體分組，測(cè)定各組蘇太仔豬白介素2(11^-2)、白介素4(11^-4)、白介素6(11^-6)、白介素 IO(IL-1O)、白介素 12(IL_12)、和 β 干擾素(IFN-β)的濃度；
[0009](2)將上述測(cè)得的指標(biāo)數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為標(biāo)準(zhǔn)化Z分值，代入下述綜合選擇指數(shù)公式，計(jì)算每個(gè)群體的綜合選擇指數(shù)值fi，
[0010]fi = -0.153ZxJ0.069Zx3+0.491Zx4+0.458Zx5+0.438Zx6,其中 Zx1^ Zx3> Zx4> Zx5、Zx6分別為IL-2、IL-6、IL-10、IL-12和IFN-β測(cè)定值的標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)(Zx2的系數(shù)為0，故未列出)；
[0011]fi值越大表示該群體個(gè)體的一般抗病力越強(qiáng)；根據(jù)育種目的選留fi值高的群體或個(gè)體。
[0012]本發(fā)明中對(duì)將待選育的蘇太豬進(jìn)行群體或個(gè)體分組，具體是根據(jù)主成分分析步驟的要求對(duì)實(shí)驗(yàn)豬群體進(jìn)行分組，分組依據(jù)可以為家系、個(gè)體、日齡、性別、免疫狀態(tài)等各個(gè)方面。 [0013]指標(biāo)數(shù)據(jù)的測(cè)定方法，具體可以是:蘇太仔豬在35日齡時(shí)采集前腔靜脈血，獲得血清樣品后利用豬多細(xì)胞因子檢測(cè)試劑盒(Affymetrix公司，美國(guó))對(duì)白介素2(IL_2)、白介素4(IL-4)、白介素6(IL-6)、白介素IO(IL-1O)、白介素12(IL_12)、和β干擾素(IFN-β)進(jìn)行濃度測(cè)定。
[0014]fi = -0.ΙδβΖχ^Ο.069Ζχ3+0.491Ζχ4+0.458Ζχ5+0.438Ζχ6,其中 Zx1^ Zx3> Zx4> Ζχ5、Zx6分別為IL-2、IL-6、IL-10、IL-12和IFN-β測(cè)定值的標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)(Zx2的系數(shù)為0，故未列出)。
[0015]本發(fā)明的優(yōu)點(diǎn)體現(xiàn)在:
[0016]I)先前的抗病力評(píng)估還僅局限于研究少數(shù)幾個(gè)參數(shù)進(jìn)行判斷，無法綜合、準(zhǔn)確地判斷一般抗病力的強(qiáng)弱。本發(fā)明則很好地解決了如何從眾多指標(biāo)中選擇最佳數(shù)量指標(biāo)的難題，最終達(dá)到科學(xué)評(píng)價(jià)豬個(gè)體健康狀況的目的。
[0017]2)該發(fā)明可從不同家系、個(gè)體、日齡、性別、免疫狀態(tài)等各個(gè)方面開展抗病力差異分析。養(yǎng)豬生產(chǎn)者可根據(jù)自身?xiàng)l件任意選擇適用的分類，或者對(duì)同一群體/個(gè)體進(jìn)行多方面的綜合評(píng)估，以達(dá)到多樣化、綜合選育的目的，從而加快豬的抗病育種進(jìn)展。
[0018]3)本發(fā)明的檢測(cè)方法操作簡(jiǎn)單，準(zhǔn)確度高，并可實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化的直接檢測(cè)，本發(fā)明將在豬的抗病育種實(shí)踐中發(fā)揮巨大作用。
【具體實(shí)施方式】
[0019]實(shí)施例一:
[0020]一、蘇太豬一般抗病力指標(biāo)(重要細(xì)胞因子)的測(cè)定
[0021]對(duì)180頭(每組60頭)35日齡仔豬前腔靜脈采血，4°C放置30min，常規(guī)分離血清。依次使用對(duì)應(yīng)緩沖液對(duì)標(biāo)準(zhǔn)樣進(jìn)行四倍八點(diǎn)濃度梯度稀釋，建立標(biāo)準(zhǔn)曲線。同時(shí)使用對(duì)應(yīng)緩沖液稀釋樣本血清，按照操作說明，利用豬多細(xì)胞因子檢測(cè)試劑盒(Affymetrix公司，美國(guó))對(duì)樣本血清進(jìn)行處理，送入已校正的Bio-plex懸液芯片系統(tǒng)中讀出對(duì)應(yīng)熒光值，然后通過標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算樣品中細(xì)胞因子(IL-2、IL-4、IL-6、IL-10、IL-12和IFN-β )的濃度。[0022]二、主成分分析
[0023]利用SPSS16.0統(tǒng)計(jì)軟件的Factor模塊對(duì)上述免疫指標(biāo)進(jìn)行主成分分析。
[0024]1、原始數(shù)據(jù)的無量綱化
[0025]設(shè)有η個(gè)樣本，P項(xiàng)指標(biāo):2i> = (.Tv ^ X/) /?,其中i為第i個(gè)個(gè)體Q =
I,2, 3,......，n), j為第j個(gè)抗性指標(biāo)(j = 1，2，3，......，p),和Sj分別是第j個(gè)抗性指標(biāo)
的樣本平均值和標(biāo)準(zhǔn)差。
[0026]2、計(jì)算相關(guān)系數(shù)(r)，建立相關(guān)矩陣(R)
[0027]
【權(quán)利要求】
1.蘇太豬一般抗病力綜合選擇指數(shù)選擇育種方法，其特征在于具體包含以下步驟: (1)將待選育的豬進(jìn)行群體或個(gè)體分組，各組蘇太仔豬在35日齡時(shí)測(cè)定IL-2、IL-4、IL-6、IL-10、IL-12 和 IFN-β 濃度； (2)將上述測(cè)得的指標(biāo)數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為標(biāo)準(zhǔn)化Z分值，代入下述綜合選擇指數(shù)公式，計(jì)算每個(gè)群體的綜合選擇指數(shù)值fi，
fi = -0.153ZxJ0.069Zx3+0.491Zx4+0.458Zx5+0.438Zx6,其中 Zx” Zx3、Zx4、Zx5、Zx6 分別為IL-2、IL-6、IL-10、IL-12和IFN-β測(cè)定值的標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)； fi值越大表示該群體個(gè)體的一般抗病力越強(qiáng)；根據(jù)育種目的選留fi值高的群體或個(gè)體。
【文檔編號(hào)】A01K67/027GK103931560SQ201410191082
【公開日】2014年7月23日 申請(qǐng)日期:2014年5月7日 優(yōu)先權(quán)日:2014年5月7日
【發(fā)明者】吳圣龍, 包文斌, 朱世平, 蔡家嘉, 霍永久, 朱國(guó)強(qiáng), 喻禮懷, 黃雪根, 華金第 申請(qǐng)人:揚(yáng)州大學(xué)