臨界轉(zhuǎn)化態(tài)emt基因在制備或篩選診斷肺癌的藥物或試劑盒、或篩選治療肺癌的藥物中的用圖
【專利摘要】本發(fā)明涉及生物技術(shù)領(lǐng)域，特別是涉及臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因在制備或篩選診斷肺癌的藥物或試劑盒、或篩選治療肺癌的藥物中的用途。本發(fā)明提供臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因在制備或篩選診斷肺癌的藥物或試劑盒、或篩選治療肺癌的藥物中的用途。本發(fā)明發(fā)明人發(fā)現(xiàn)通過檢測(cè)瘤株中臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因的表達(dá)水平，能夠識(shí)別出臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因高表達(dá)的瘤株，并可進(jìn)一步預(yù)測(cè)該類瘤株為高風(fēng)險(xiǎn)、預(yù)后差的類型。
【專利說明】
臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因在制備或篩選診斷肺癌的藥物或試劑盒、或篩選治療肺癌的藥物中的用途
技術(shù)領(lǐng)域
[0001]本發(fā)明涉及生物技術(shù)領(lǐng)域，特別是涉及臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因在制備或篩選診斷肺癌的藥物或試劑盒、或篩選治療肺癌的藥物中的用途。
【背景技術(shù)】
[0002]惡性腫瘤是威脅人民健康的最大危險(xiǎn)因素之一，我國每年僅腫瘤死亡人數(shù)近200萬人，惡性腫瘤造成的經(jīng)濟(jì)損失高達(dá)1400多億元人民幣。腫瘤預(yù)后是指對(duì)發(fā)病后，疾病未來過程的一種預(yù)先估計(jì)。在醫(yī)學(xué)上，“預(yù)后”是指根據(jù)經(jīng)驗(yàn)預(yù)測(cè)的疾病發(fā)展情況。預(yù)后主要涉及到三方面，將發(fā)生什么結(jié)果、發(fā)生不良結(jié)局的可能性有多大、什么時(shí)候會(huì)發(fā)生。預(yù)后分析是對(duì)疾病發(fā)病后發(fā)展為各種不同結(jié)局的預(yù)測(cè)；是臨床非常實(shí)用、對(duì)臨床很有指導(dǎo)作用的臨床研究。研究和評(píng)價(jià)預(yù)后的目的，為了便于了解各種疾病對(duì)人類危害性的大小、探索影響預(yù)后的因素、研究改善預(yù)后的具體措施。
[0003]上皮細(xì)胞向間質(zhì)細(xì)胞的轉(zhuǎn)變(epithelialto mesen-chymal transit1n, EMT)的概念在22年前被首次提出以來，越來越多的研究表明它與上皮細(xì)胞惡性腫瘤的發(fā)生和發(fā)展關(guān)系密切，受到了高度的關(guān)注。EMT是一種哺乳動(dòng)物胚胎發(fā)育過程中必需的生理現(xiàn)象。造腸運(yùn)動(dòng)前期原始中胚層的形成、發(fā)育中期神經(jīng)脊發(fā)育成體節(jié)、骨和肌肉等組織需要EMT的密切參與。由于EMT是上皮細(xì)胞獲得迀移能力的有效方式，在成體中成為了占惡性腫瘤90%以上的上皮細(xì)胞癌浸潤轉(zhuǎn)移的一個(gè)重要途徑。目前體內(nèi)和體外實(shí)驗(yàn)證據(jù)都表明，EMT在乳腺癌、結(jié)腸癌、肺癌、前列腺癌、肝癌、胰腺癌等多種癌癥的原發(fā)性浸潤和繼發(fā)性轉(zhuǎn)移中起著舉足輕重的作用。因此，研究EMT的發(fā)生和調(diào)控機(jī)制，對(duì)于尋找治療惡性腫瘤特別是腫瘤細(xì)胞轉(zhuǎn)移的目標(biāo)靶點(diǎn)有重要意義。
[0004]另外，有研究表明，在由E狀態(tài)向M狀態(tài)轉(zhuǎn)化的過程中存在著一種中間狀態(tài)，即，臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT (P狀態(tài))。處于P狀態(tài)的細(xì)胞既保留了上皮細(xì)胞的特性也展示出間質(zhì)細(xì)胞的特征。同時(shí)，有實(shí)驗(yàn)表明，E狀態(tài)向P狀態(tài)的轉(zhuǎn)變是可逆的，因此P狀態(tài)代表了一種可轉(zhuǎn)移的表型；而P狀態(tài)向M狀態(tài)的轉(zhuǎn)變則較為依賴于細(xì)胞類型，在某些細(xì)胞中可逆，某些細(xì)胞中不可逆。類似于EMT的過程，由E狀態(tài)向P狀態(tài)的轉(zhuǎn)變以及可逆的P狀態(tài)向E狀態(tài)的轉(zhuǎn)變都可能與疾病的發(fā)生進(jìn)程相關(guān)，例如，腫瘤的轉(zhuǎn)移。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0005]鑒于以上所述現(xiàn)有技術(shù)的缺點(diǎn)，本發(fā)明的目的在于提供臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因在制備或篩選診斷肺癌的藥物、或篩選治療肺癌的藥物中的用途，用于解決現(xiàn)有技術(shù)中的問題。本發(fā)明發(fā)明人發(fā)現(xiàn)臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因高表達(dá)與高風(fēng)險(xiǎn)肺癌的聯(lián)系，通過檢測(cè)肺癌樣株中臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因的表達(dá)水平，識(shí)別出臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因高表達(dá)的腫瘤株，并可進(jìn)一步預(yù)測(cè)出該類腫瘤株可能具有較高的惡性程度，并表現(xiàn)出較差的預(yù)后。
[0006]為實(shí)現(xiàn)上述目的及其他相關(guān)目的，本發(fā)明第一方面提供臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因在制備或篩選診斷肺癌的藥物或試劑盒、或篩選治療肺癌的藥物中的用途。
[0007]所述臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因是指調(diào)控細(xì)胞由E狀態(tài)經(jīng)由臨界轉(zhuǎn)化態(tài)P狀態(tài)轉(zhuǎn)變?yōu)镸狀態(tài)的基因。
[0008]所述篩選診斷肺癌藥物具體指使用臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因，通過監(jiān)測(cè)臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因表達(dá)量對(duì)可能作為診斷肺癌藥物使用的物質(zhì)進(jìn)行生物活性、藥理作用或藥用價(jià)值的評(píng)估。
[0009]所述篩選診斷肺癌的試劑盒具體指使用臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因，通過監(jiān)測(cè)臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因的表達(dá)量對(duì)可能作為診斷肺癌的試劑盒進(jìn)行性能的評(píng)估，所述性能如準(zhǔn)確性、特異性、穩(wěn)定性等。
[0010]所述篩選治療乳腺癌藥物具體指使用臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因，通過監(jiān)測(cè)臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因表達(dá)量對(duì)可能作為治療肺癌藥物使用的物質(zhì)進(jìn)行生物活性、藥理作用或藥用價(jià)值的評(píng)估。
[0011]優(yōu)選的，所述制備診斷肺癌的藥物或試劑盒中，所述診斷肺癌具體指對(duì)肺癌惡性程度的預(yù)測(cè)和/或?qū)Ψ伟╊A(yù)后的判斷。
[0012]更優(yōu)選的，所述肺癌惡性程度的預(yù)測(cè)具體指通過臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因表達(dá)量的檢測(cè)對(duì)腫瘤樣株的惡性程度進(jìn)行預(yù)測(cè)。
[0013]更優(yōu)選的，所述肺癌預(yù)后的判斷具體指通過臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因表達(dá)量的檢測(cè)對(duì)腫瘤病人的病程和/或結(jié)局進(jìn)行預(yù)后判斷。
[0014]具體的，臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因高表達(dá)表示肺癌樣株具有較高的惡性程度，并表現(xiàn)出較差的預(yù)后；臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因低表達(dá)表示肺癌樣株具有較低的惡性程度，并表現(xiàn)出較好的預(yù)后。
[0015]優(yōu)選的，所述臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因選自HNF4A、JUNB, ETS2中的任意一種或多種的組合。
[0016]本發(fā)明第二方面提供一種基于臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因高表達(dá)的高風(fēng)險(xiǎn)肺癌的新型診斷法，所述診斷方法具體為通過檢測(cè)肺癌樣株中臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因的表達(dá)水平對(duì)肺癌病人的預(yù)后進(jìn)行判斷。
[0017]具體的，所述檢測(cè)肺癌樣株中臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因的表達(dá)水平是指將現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫中的腫瘤樣株信息進(jìn)行數(shù)據(jù)分布分析，再檢測(cè)肺癌樣株中EMT基因的表達(dá)水平，根據(jù)數(shù)據(jù)識(shí)別出EMT基因高表達(dá)的肺癌樣株。
[0018]在本發(fā)明的實(shí)施例中，優(yōu)選采用在在統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件R工作平臺(tái)中調(diào)用聚類分析程序包meIust進(jìn)行數(shù)據(jù)分布分析。
[0019]所述肺癌病人的預(yù)后進(jìn)行判斷具體指，臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因高表達(dá)的這類肺癌株可能具有較高的惡性程度，并表現(xiàn)出較差的預(yù)后。
[0020]本發(fā)明發(fā)明人發(fā)現(xiàn)通過檢測(cè)瘤株中臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因的表達(dá)水平，能夠識(shí)別出臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因高表達(dá)的瘤株，并可進(jìn)一步預(yù)測(cè)該類瘤株為高風(fēng)險(xiǎn)、預(yù)后差的類型。此夕卜，經(jīng)公開可得的肺癌病人微陣列和二代測(cè)序的基因表達(dá)數(shù)據(jù)和存活數(shù)據(jù)證實(shí)，通過臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因表達(dá)量的表征，能夠有效預(yù)測(cè)出高風(fēng)險(xiǎn)、預(yù)后差的瘤株，可見臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因在制備或篩選診斷肺癌的藥物或試劑盒、或篩選治療肺癌的藥物的用途中具有高度產(chǎn)業(yè)利用價(jià)值。
【附圖說明】
[0021]圖1顯示為本發(fā)明的基于高表達(dá)臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因的新型腫瘤預(yù)后診斷法的示意圖
[0022]圖2顯示為多個(gè)連續(xù)時(shí)間點(diǎn)采樣下表達(dá)差異較大的基因的聚類分析熱圖
[0023]圖3顯示為公開可得的五套臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因HNF4A高表達(dá)瘤株的存活曲線分析圖
【具體實(shí)施方式】
[0024]如圖1所示，本發(fā)明發(fā)明人通過識(shí)別處于臨界轉(zhuǎn)化態(tài)的EMT基因，檢測(cè)所選肺癌樣株中臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT類基因的表達(dá)水平，并進(jìn)一步應(yīng)用臨界轉(zhuǎn)化態(tài)的EMT基因的表達(dá)水平預(yù)測(cè)肺癌的預(yù)后，從而提供了 EMT基因在制備或篩選診斷肺癌的藥物(試劑盒)、或篩選治療肺癌的藥物中的用途。
[0025]具體包括如下步驟:
[0026]步驟1，檢測(cè)肺癌樣株中臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT類基因的表達(dá)水平，包括臨界轉(zhuǎn)化態(tài)的EMT基因的識(shí)別和臨界轉(zhuǎn)化態(tài)的EMT基因表達(dá)水平的測(cè)定；
[0027]步驟2，應(yīng)用高表達(dá)臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因進(jìn)行預(yù)后判斷，包括單個(gè)基因或多個(gè)基因組合的高表達(dá)瘤株的識(shí)別以及預(yù)測(cè)出臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT類基因具有較高表達(dá)水平的肺癌樣株可能具有較高的惡性程度，并表現(xiàn)出較差的預(yù)后。
[0028]以下通過特定的具體實(shí)例說明本發(fā)明的實(shí)施方式，本領(lǐng)域技術(shù)人員可由本說明書所揭露的內(nèi)容輕易地了解本發(fā)明的其他優(yōu)點(diǎn)與功效。本發(fā)明還可以通過另外不同的【具體實(shí)施方式】加以實(shí)施或應(yīng)用，本說明書中的各項(xiàng)細(xì)節(jié)也可以基于不同觀點(diǎn)與應(yīng)用，在沒有背離本發(fā)明的精神下進(jìn)行各種修飾或改變。
[0029]在進(jìn)一步描述本發(fā)明【具體實(shí)施方式】之前，應(yīng)理解，本發(fā)明的保護(hù)范圍不局限于下述特定的具體實(shí)施方案；還應(yīng)當(dāng)理解，本發(fā)明實(shí)施例中使用的術(shù)語是為了描述特定的具體實(shí)施方案，而不是為了限制本發(fā)明的保護(hù)范圍；在本發(fā)明說明書和權(quán)利要求書中，除非文中另外明確指出，單數(shù)形式“一個(gè)”、“一”和“這個(gè)”包括復(fù)數(shù)形式。
[0030]當(dāng)實(shí)施例給出數(shù)值范圍時(shí)，應(yīng)理解，除非本發(fā)明另有說明，每個(gè)數(shù)值范圍的兩個(gè)端點(diǎn)以及兩個(gè)端點(diǎn)之間任何一個(gè)數(shù)值均可選用。除非另外定義，本發(fā)明中使用的所有技術(shù)和科學(xué)術(shù)語與本技術(shù)領(lǐng)域技術(shù)人員通常理解的意義相同。除實(shí)施例中使用的具體方法、設(shè)備、材料外，根據(jù)本技術(shù)領(lǐng)域的技術(shù)人員對(duì)現(xiàn)有技術(shù)的掌握及本發(fā)明的記載，還可以使用與本發(fā)明實(shí)施例中所述的方法、設(shè)備、材料相似或等同的現(xiàn)有技術(shù)的任何方法、設(shè)備和材料來實(shí)現(xiàn)本發(fā)明。
[0031 ] 除非另外說明，本發(fā)明中所公開的實(shí)驗(yàn)方法、檢測(cè)方法、制備方法均采用本技術(shù)領(lǐng)域常規(guī)的分子生物學(xué)、生物化學(xué)、染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和分析、分析化學(xué)、細(xì)胞培養(yǎng)、重組DNA技術(shù)及相關(guān)領(lǐng)域的常規(guī)技術(shù)。這些技術(shù)在現(xiàn)有文獻(xiàn)中已有完善說明，具體可參見Sambrook等 MOLECULAR CLONING:A LABORATORY MANUAL, Second edit1n，Cold Spring HarborLaboratory Press,1989and Third edit1n, 2001 ；Ausubel 等，CURRENT PROTOCOLS INMOLECULAR B1LOGY，John ffiley&Sons?New York，1987and per1dic updates ;the seriesMETHODS IN ENZYMOLOGY，Academic Press,San Diego ;WoIffe，CHROMATIN STRUCTURE ANDFUNCT1N, Third edit1n，Academic Press, San Diego, 1998 !METHODS IN ENZYMOLOGY，Vol.304,Chromatin(P.M.ffassarman and A.P.ffolffe,eds.),Academic Press，San Diego,1999 ;和 METHODS IN MOLECULAR B1LOGY，Vol.119，Chromatin Protocols (P.B.Becker,ed.)Humana Press, Totowa, 1999 等。
[0032]實(shí)施例
[0033]步驟I，檢測(cè)腫瘤樣株中臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT類基因的表達(dá)水平。
[0034]EMT樣品制備:
[0035]1、在37°C、5% C02條件下，用含10%胎牛血清和I %青鏈霉素的DMEM/F-12培養(yǎng)基(完全培養(yǎng)基)，在10厘米培養(yǎng)皿中培養(yǎng)人肺腺癌細(xì)胞A549細(xì)胞至對(duì)數(shù)生長期。
[0036]2、當(dāng)細(xì)胞生長至對(duì)數(shù)生長期時(shí)，將培養(yǎng)皿中的培養(yǎng)基棄掉，加入ImlPBS清洗一遍，之后再加入Iml濃度為0.25%的胰酶37°C消化5分鐘左右。
[0037]3、將培養(yǎng)皿放在光學(xué)顯微鏡下觀察，當(dāng)80%的細(xì)胞漂浮起來時(shí)，在培養(yǎng)皿中加入2ml完全培養(yǎng)基終止消化，并將細(xì)胞懸液收集至50ml離心管。
[0038]4、按適當(dāng)比例稀釋細(xì)胞懸液之后，使用血球計(jì)數(shù)板計(jì)算細(xì)胞密度。按照5xl0~6個(gè)細(xì)胞每個(gè)10厘米皿的密度將細(xì)胞懸液鋪至8個(gè)10厘米的培養(yǎng)皿，放置于37°C，5% C02條件下培養(yǎng)24小時(shí)。
[0039]5、培養(yǎng)24小時(shí)之后，棄掉培養(yǎng)皿中的培養(yǎng)基，換成無血清的培養(yǎng)基饑餓處理16-18小時(shí)。
[0040]6、饑餓處理之后，棄掉培養(yǎng)基，換成含5ng/ml TGF-β的誘導(dǎo)培養(yǎng)基(無血清、無雙抗)誘導(dǎo)。
[0041 ] 7、分別在誘導(dǎo)O小時(shí)、6小時(shí)、12小時(shí)、24小時(shí)、36小時(shí)、48小時(shí)、72小時(shí)和96小時(shí)的時(shí)間點(diǎn)，用Trizol法收集細(xì)胞提取total RNA進(jìn)行測(cè)序。
[0042]數(shù)據(jù)分析:
[0043]對(duì)制備的樣本采用二代測(cè)序方法(具體為RNASEQ技術(shù))進(jìn)行測(cè)定，采用RSEM算法(版本號(hào)1.2.12)進(jìn)行序列比對(duì)和表達(dá)值的計(jì)算，參考庫選用ensemble」25，序列比對(duì)工具選用bowtie2，計(jì)算環(huán)境為ROCKS集群，其他參數(shù)采用默認(rèn)，最終得到57773個(gè)基因的表達(dá)水平數(shù)據(jù)，并以TPM的形式進(jìn)行表示。
[0044]隨后，計(jì)算每個(gè)基因在這8個(gè)時(shí)間點(diǎn)下的表達(dá)最大值與最小值之比，以比值大于或等于4倍作為過濾標(biāo)準(zhǔn)I ;至少一個(gè)時(shí)間點(diǎn)下的表達(dá)值大于或等于10個(gè)TPM作為過濾標(biāo)準(zhǔn)2。以上述兩個(gè)過濾標(biāo)準(zhǔn)篩選所有基因的表達(dá)水平數(shù)據(jù)，選出表達(dá)差異較大的1633個(gè)基因進(jìn)行聚類分析。如圖2所示，定義僅在12小時(shí)-36小時(shí)區(qū)間取得最大表達(dá)值的基因?yàn)榕R界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT類基因，共識(shí)別出201個(gè)該類基因。
[0045]步驟2，應(yīng)用高表達(dá)臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因進(jìn)行預(yù)后判斷。
[0046]搜索NCBI的GEO數(shù)據(jù)庫以及TCGA數(shù)據(jù)庫，并設(shè)置過濾標(biāo)準(zhǔn)為肺癌，腫瘤樣本數(shù)大于等于70例并具有臨床信息，特別是病人隨訪的存活時(shí)間數(shù)據(jù)，共得到7套數(shù)據(jù)，具體如下:
[0047]l)SeriesAccess1n:GSE29016ID:200029016Samples(72)
[0048]2)SeriesAccess1n:GSE31210ID:200031210Samples(246)
[0049]3)SeriesAccess1n:GSE33072ID:200033072Samples(131)
[0050]4)SeriesAccess1n:GSE8894ID:200008894Samples(138)
[0051]5)TCGA-LUCA-mRNA-Level3Samples(512)
[0052]6)Series Access1n:GSE13213ID:200013213Samples(117)
[0053]7)Series Access1n:GSE11969ID:200011969Samples(163)
[0054]在識(shí)別出的臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT類基因中選定已有報(bào)道的EMT相關(guān)的肝細(xì)胞核因子HNF4A作為檢測(cè)對(duì)象，提取每套基因表達(dá)數(shù)據(jù)中HNF4A的表達(dá)數(shù)據(jù)，取log2后的數(shù)值作為最終的表達(dá)水平，在統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件R工作平臺(tái)(版本號(hào):3.1.2)中調(diào)用聚類分析程序包mclust (版本號(hào)4.4)，將表達(dá)數(shù)據(jù)分為高表達(dá)和低表達(dá)的兩類。其中GSE13213和GSE11969中HNF4A的表達(dá)水平較低(大部分?jǐn)?shù)值在O附近)，因此不再進(jìn)行下步處理。隨后，對(duì)HNF4A的表達(dá)水平按照數(shù)值大小進(jìn)行由小到大地排序，以低表達(dá)類的最大值和高表達(dá)類的最小值的平均值作為表達(dá)水平的區(qū)分標(biāo)準(zhǔn)。
[0055]各套數(shù)據(jù)的分割標(biāo)準(zhǔn)如下:
[0056]GSE29016:HNF4A的分割界限為7.0，其中HNF4A高表達(dá)組7例，HNF4A低表達(dá)組65例。
[0057]GSE31210:HNF4A的分割界限為6.3，其中HNF4A高表達(dá)組7例，HNF4A低表達(dá)組239 例。
[0058]GSE33072:HNF4A的分割界限為7.7，其中HNF4A高表達(dá)組16例，HNF4A低表達(dá)組115 例。
[0059]GSE8894:HNF4A的分割界限為2.1，其中HNF4A高表達(dá)組7例，HNF4A低表達(dá)組65例。
[0060]TCGA-LUCA-mRNA-Leve13:HNF4A 的分割界限為 4.5，其中 HNF4A 高表達(dá)組 138 例，HNF4A低表達(dá)組374例。
[0061]不同樣株系列本身的基因表達(dá)量略有差異，且檢測(cè)方法略有不同，導(dǎo)致高表達(dá)和低表達(dá)分割界限的差異。
[0062]依據(jù)瘤株樣本的存活數(shù)據(jù)進(jìn)行存活曲線分析，結(jié)果如圖3所示。其中，橫坐標(biāo)表示的是瘤株樣本來源的病人存活時(shí)間，縱坐標(biāo)表示的是瘤株樣本來源的病人肺癌轉(zhuǎn)移幾率。由圖3中各圖可見，相對(duì)于HNF4A低表達(dá)組而言(向下箭頭所示)，HNF4A高表達(dá)組表示肺癌樣株具有較高的惡性程度，并表現(xiàn)出較差的預(yù)后(向上箭頭所示)。
[0063]綜上所述，本發(fā)明發(fā)明人發(fā)現(xiàn)通過檢測(cè)瘤株中臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT類基因如HNF4A的表達(dá)水平，識(shí)別出這類基因高表達(dá)的瘤株，并可進(jìn)一步預(yù)測(cè)該類瘤株為高風(fēng)險(xiǎn)、預(yù)后差的類型。此外，經(jīng)公開可得的肺癌病人微陣列和二代測(cè)序的基因表達(dá)數(shù)據(jù)和存活數(shù)據(jù)證實(shí)，本發(fā)明能夠有效預(yù)測(cè)出高風(fēng)險(xiǎn)、預(yù)后差的瘤株，具有高度產(chǎn)業(yè)利用價(jià)值。
[0064]上述實(shí)施例僅例示性說明本發(fā)明的原理及其功效，而非用于限制本發(fā)明。任何熟悉此技術(shù)的人士皆可在不違背本發(fā)明的精神及范疇下，對(duì)上述實(shí)施例進(jìn)行修飾或改變。因此，舉凡所屬技術(shù)領(lǐng)域中具有通常知識(shí)者在未脫離本發(fā)明所揭示的精神與技術(shù)思想下所完成的一切等效修飾或改變，仍應(yīng)由本發(fā)明的權(quán)利要求所涵蓋。
【主權(quán)項(xiàng)】
1.臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因在制備或篩選診斷肺癌的藥物或試劑盒、或篩選治療肺癌的藥物中的用途。2.如權(quán)利要求1所述的用途，其特征在于，所述診斷肺癌具體指對(duì)肺癌惡性程度的預(yù)測(cè)和/或?qū)Ψ伟╊A(yù)后的判斷。3.如權(quán)利要求2所述的用途，其特征在于，所述肺癌惡性程度的預(yù)測(cè)具體指通過臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因表達(dá)量的檢測(cè)對(duì)肺癌樣株的惡性程度進(jìn)行預(yù)測(cè)。4.如權(quán)利要求2所述的用途，其特征在于，所述肺癌預(yù)后的判斷具體指通過臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因表達(dá)量的檢測(cè)對(duì)肺癌病人的病程和/或結(jié)局進(jìn)行預(yù)后判斷。5.如權(quán)利要求3或4任一權(quán)利要求所述的用途，其特征在于，臨界轉(zhuǎn)化態(tài)EMT基因高表達(dá)表示肺癌樣株具有較高的惡性程度，并表現(xiàn)出較差的預(yù)后。
【文檔編號(hào)】C12Q1/68GK105986012SQ201510052120
【公開日】2016年10月5日
【申請(qǐng)日】2015年1月30日
【發(fā)明人】常宏淵, 王鵬, 薛夢(mèng)竹
【申請(qǐng)人】中國科學(xué)院上海高等研究院