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基于交互式字典遷移的序列醫(yī)學(xué)圖像快速分割方法

文檔序號:6376617閱讀:173來源:國知局
專利名稱:基于交互式字典遷移的序列醫(yī)學(xué)圖像快速分割方法
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明屬于圖像處理技術(shù)領(lǐng)域,特別是醫(yī)學(xué)圖像的處理,主要可用于多幅腹部CT序列圖像的胃癌病變區(qū)域分割。
背景技術(shù)
醫(yī)學(xué)圖像分割是醫(yī)生根據(jù)需 要把感興趣的目標(biāo)區(qū)域,即將可能存在病變區(qū)域、重要組織和器官等從背景中分離出來的過程。它是現(xiàn)代醫(yī)學(xué)圖像處理中的一個重要的研究領(lǐng)域,也是病變區(qū)域提取、檢測和跟蹤等后續(xù)醫(yī)學(xué)圖像處理的基礎(chǔ)。由于這些操作都需要以一個準(zhǔn)確的分割結(jié)果為前提,然后才能進(jìn)行準(zhǔn)確地定位分析,所以醫(yī)學(xué)圖像分割結(jié)果的準(zhǔn)確性對于醫(yī)生對病情的診斷并做出正確治療方案具有非常重要的意義。圖像特征是圖像的重要屬性,圖像分割過程中提取特征是重要的一步,常用的圖像特征有灰度共生矩陣,小波變換特征等。由于圖像分割方法都要對圖像進(jìn)行特征提取,特征提取雖然是線下過程,但是由于需要對圖像的每一個像素點分別進(jìn)行特征提取,所以這一過程十分耗時。交互式分割方法是現(xiàn)在應(yīng)用最熱門和最廣泛的處理醫(yī)學(xué)圖像的方法。它結(jié)合了自動分割與手動分割的優(yōu)點,既允許人工參與提供一些先驗信息,但又不完全依賴于人工參與。由于醫(yī)學(xué)圖像有復(fù)雜的背景,自動分割運算量大,在沒有人工指導(dǎo)的情況下準(zhǔn)確率很難保證。而交互式分割在允許人工參與的情況下保證了準(zhǔn)確率。它的具體做法是由用戶標(biāo)記出圖像中感興趣區(qū)域的大致范圍,從而提供部分先驗信息,然后分割算法再根據(jù)這些信息對圖像進(jìn)行分割。雖然交互式分割有以上優(yōu)點,但它也存在缺點,由于交互式分割方法一次只能分割一幅圖像,用戶必須對每幅待分割的圖像標(biāo)記出目標(biāo)和背景,然后一幅一幅分割。對于CT序列圖像,一個病人的序列圖有上百幅,如果單幅分割,則極大的增加了工作量。目前交互式分割方法主要有Live wire方法和活動輪廓模型方法等。Live wire方法是通過搜索邊緣來進(jìn)行圖像分割的方法,它將圖像看成是一個連通圖,通過構(gòu)造代價函數(shù)和選擇關(guān)鍵點,在全圖范圍內(nèi)尋找給定兩點間的最優(yōu)路徑作為物體的邊緣。這個方法的缺點是它對交互者要求較高,輸入交互點位置的偏移可能導(dǎo)致分割結(jié)果出錯,而且在多幅序列圖像中如果出現(xiàn)分割結(jié)果不好的圖像時也不能及時修正分割結(jié)果?;顒虞喞P头椒ㄊ窃趫D像中定義一個曲線,使其在曲線本身決定的內(nèi)能和由圖像數(shù)據(jù)決定的外能的推動下向物體邊緣靠近,其缺點是對初始曲線的位置比較敏感,而且它不能收斂到凹性邊緣。這兩種方法都是基于邊緣的方法。對于上百幅的醫(yī)學(xué)序列圖像,感興趣區(qū)域的邊緣變化很大,這些方法在分割多幅醫(yī)學(xué)圖像時的分割準(zhǔn)確率較低。

發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的目的在于針對上述已有技術(shù)的不足,提出一種基于交互式字典遷移的序列醫(yī)學(xué)圖像快速分割方法,以減少單幅交互式分割的工作量,節(jié)省時間,降低對交互者的要求,并采用二次修正的方法提高分割準(zhǔn)確率。
實現(xiàn)本發(fā)明上述目的技術(shù)方案,包括如下步驟(I)輸入腹部CT序列圖像1={1(1),1(2),…,Ιω},η為從序列圖像的數(shù)量,η最大值為 300 ;(2)對每幅圖像I (q)以每個像素點為中心提取5X5的塊作為每個像素的特征,則該圖像所有像素的特征向量集合為ΧΝΧ25ω,N為每幅圖像的大小,其中KqSn;(3)用mean shift方法對CT序列圖像I進(jìn)行初始分割,則CT序列圖像Iω的初分割圖像為Sw,并統(tǒng)計初分割圖像Sw中的區(qū)域數(shù)目m ; (4)選取CT序列圖像Iω,進(jìn)行交互式分割首先,在序列圖像Ιω對應(yīng)的初分割圖像S(1)上的區(qū)域進(jìn)行手動標(biāo)記部分目標(biāo)區(qū)域M0和部分背景區(qū)域Mb,剩余的區(qū)域為未標(biāo)記區(qū)域N ; 然后,根據(jù)合并準(zhǔn)則,重復(fù)合并未標(biāo)記區(qū)域N中與標(biāo)記背景Mb中相似性最大的區(qū)域,直到所有區(qū)域都合并后,得到CT序列圖像1(1)的全部目標(biāo)區(qū)域和背景區(qū)域,即得到分割結(jié)果,其中該目標(biāo)區(qū)域代表腹部CT圖像中的胃癌病變區(qū)域;(5)提取步驟⑷中的目標(biāo)區(qū)域內(nèi)對應(yīng)像素點的特征向量并用K-SVD算法對目標(biāo)特征向量\進(jìn)行訓(xùn)練學(xué)習(xí),生成一個目標(biāo)字典Dtj ;(6)用k均值方法將步驟(4)中得到的背景區(qū)域聚為4類,每類對應(yīng)的特征向量為XB1,XB2, XB3, XB4,并用K-SVD方法分別對其訓(xùn)練學(xué)習(xí),生成背景字典Db= {Db1, Db2, Db3, DbJ,其中Dbi, Db2, Db3, Db4分別為4類背景區(qū)域?qū)?yīng)的背景字典;(7)由目標(biāo)字典Dq和背景字典Db分別去逼近CT序列圖像Iw的特征向量ΧΝΧ25ω,得到所有像素點的目標(biāo)字典逼近誤差%和背景字典逼近誤差eB,然后根據(jù)誤差最小原則計算二值圖像Tw =
[O o/herwise其中,2彡q彡n,i為像素點,其范圍為KiSN;(8)對二值圖像Tw進(jìn)行高斯濾波處理后,計算二值圖像Tw中值為I的像素點在初分割圖像Sw上對應(yīng)區(qū)域的密度d(r)
Στ(^(/) = ι)d(f) =-, . , fe/'~r-r ,
Σι(/、/) = )+Σι 產(chǎn)1 ⑵=o)
/G/-右 Γ 其中為初分割圖中的區(qū)域,其范圍為I Sr Sm, i為像素點,其范圍為N,m為初分割圖像中的區(qū)域總數(shù)目;1( ·)是指示函數(shù),當(dāng)該函數(shù)輸入的等式成立時其函數(shù)值為1,反之函數(shù)值為O ;(9)根據(jù)步驟⑶中的密度d(r)得到CT序列圖像Iw的分割結(jié)果圖像Cw
[I if c/(r) > 0.3( "(/-) = 1' 7,
[O otherwise.其中,2彡q彡n,Cw中值為I的區(qū)域為目標(biāo)區(qū)域,值為O的區(qū)域為背景區(qū)域;(10)判斷分割結(jié)果圖像Cw分割是否正確,即計算分割結(jié)果圖Cw與上一幅分割結(jié)果圖C(H)的信息差異指標(biāo)VI,當(dāng)信息差異指標(biāo)VI>0. 25時,判定為分割結(jié)果不正確,返回步驟⑷開始執(zhí)行,即對序列圖像Iw進(jìn)行交互式分割;否則,執(zhí)行步驟(11);(11)計算步驟(9)得到的分割結(jié)果圖像Cw的目標(biāo)區(qū)域的特征向量集合X' ,并用K-SVD方法對其訓(xùn)練學(xué)習(xí),得到一個新目標(biāo)字典D' ,計算新目標(biāo)字典D'。與原目標(biāo)字典%的誤差E= I IDtrD'」I2,若誤差E〈l,則將新目標(biāo)字典D'。中的原子遷移到原目標(biāo)字典%中,更新目標(biāo)字典% ;否則,原目標(biāo)字典%不變;(12)統(tǒng)計步驟(11)中字典的遷移次數(shù),當(dāng)字典遷移次數(shù)等于4時,計算當(dāng)前目標(biāo)字典%中原子的貢獻(xiàn)度g,并按貢獻(xiàn)度g的大小進(jìn)行降序排列,保留貢獻(xiàn)度g最大的前50個原子,構(gòu)造新的目標(biāo)字典
(13)重復(fù)執(zhí)行步驟(7)到步驟(10),對輸入的腹部CT序列圖像I中還未分割的圖像進(jìn)行目標(biāo)區(qū)域提取,直到所有序列圖像都分割出目標(biāo)區(qū)域為止。本發(fā)明與現(xiàn)有的技術(shù)相比具有以下優(yōu)點I.本發(fā)明采用遷移思想,將一幅圖像的先驗信息遷移到其它圖像來進(jìn)行分割,從而極大的節(jié)省了時間并減少了工作量;2.本發(fā)明對分割不準(zhǔn)確的圖像進(jìn)行二次交互式分割,從而提高了圖像的分割準(zhǔn)確率;3.本發(fā)明通過以灰度像素塊來代替特征提取,從而提高了速度;


圖I是本發(fā)明的流程圖;圖2是本發(fā)明所使用的三幅腹部CT序列圖像;圖3是本發(fā)明對圖2進(jìn)行初始分割后的圖像;圖4是本發(fā)明對圖2中第一幅圖像交互式分割后的圖像;圖5是本發(fā)明對圖2中第二幅圖像分割后的圖像;圖6是本發(fā)明對圖2中第三幅圖像分割后的圖像。
具體實施例方式參照圖1,本發(fā)明基于交互式字典遷移的序列醫(yī)學(xué)圖像快速分割方法給出以下實施例步驟I :輸入腹部CT序列圖像,如圖2a、圖2b和圖2c。步驟2 :對圖2a、圖2b和圖2c分別以每個像素點為中心提取5 X 5的塊作為每個像素的特征,則圖2a、圖2b和圖2c中所有像素的特征向量分別為X⑴,X(2),X(3)。步驟3 :用mean shift方法分別對圖2a、圖2b和圖2c分別進(jìn)行初始分割得到圖3a、圖3b和圖3c。步驟4 :選取圖2a,進(jìn)行交互式分割首先,在初分割圖3a上進(jìn)行手動標(biāo)記,如圖4a所示,用實線段標(biāo)記部分目標(biāo)區(qū)域M0,用虛線段標(biāo)記部分背景區(qū)域Mb,剩余的區(qū)域為未標(biāo)記區(qū)域N ;然后,根據(jù)最大相似性的合并準(zhǔn)則,重復(fù)合并未標(biāo)記區(qū)域N中與標(biāo)記背景Mb中相似性最大的區(qū)域,直到所有區(qū)域都合并后,得到圖2a的全部目標(biāo)區(qū)域和背景區(qū)域,分割結(jié)果二值圖像如圖4b所示,該目標(biāo)區(qū)域代表腹部CT圖像中的胃癌病變區(qū)域。
步驟5 :計算分割結(jié)果圖4c中的目標(biāo)區(qū)域內(nèi)所有像素點的特征向量X。,并用K-SVD方法對目標(biāo)特征向量\進(jìn)行訓(xùn)練學(xué)習(xí),生成一個目標(biāo)字典%。步驟6 :用k均值方法將圖4c中的背景區(qū)域聚為4類,每類對應(yīng)的特征向量為XB1,XB2, XB3, XB4,并用K-SVD方法分別對其訓(xùn)練學(xué)習(xí),生成背景字典DB={DB1,Db2, Db3, Db4},其中DB1,Db2, Db3, Db4分別為4類背景區(qū)域?qū)?yīng)的背景字典。步驟7 由目標(biāo)字典Dtj和背景字典Db= {DB1,Db2, Db3, Db4}分別去逼近圖2b的特征向量X(2),得到所有像素點的目標(biāo)字典逼近誤差%和背景字典的逼近誤差eB,然后根據(jù)誤差最小原則計算二值圖像Tw
權(quán)利要求
1.一種基于交互式字典遷移的序列醫(yī)學(xué)圖像快速分割方法,包括如下步驟 (1)輸入腹部CT序列圖像
2.根據(jù)權(quán)利要求I所述的方法,其中步驟(4)所述的合并準(zhǔn)則是最大相似性準(zhǔn)則,它先計算各個區(qū)域間的歐式距離,然后依次合并歐氏距離最大的兩個區(qū)域直到所有區(qū)域合并完畢,合并時取每個區(qū)域中出現(xiàn)頻率最高的灰度值作為此區(qū)域的特征值。
3.根據(jù)權(quán)利要求I所述的方法,其中所述步驟(7)中計算目標(biāo)字典%和背景字典DB={DB1, Db2, Db3, DbJ的逼近誤差,是通過公式
4.根據(jù)權(quán)利要求I所述的方法,其中所述步驟(10)計算分割結(jié)果圖Cw與上一幅分割結(jié)果圖Car1)的信息差異指標(biāo)VI,其計算步驟為 IOa)分別計算分割結(jié)果圖Cw和上一幅分割結(jié)果圖Car1)的信息熵H(C)
5.根據(jù)權(quán)利要求I所述的方法,其中所述步驟(11)中的貢獻(xiàn)度g,是指每個原子對目標(biāo)數(shù)據(jù)重構(gòu)的貢獻(xiàn),其計算步驟為Ila)每次移除目標(biāo)字典%中的一個原子,計算剩余原子對特征向量X'。的逼近誤差Hi):;、'
全文摘要
本發(fā)明公開了一種基于交互式字典遷移的序列醫(yī)學(xué)圖像快速分割方法。主要解決現(xiàn)有單幅圖像分割速度慢和工作量大的問題。其實現(xiàn)過程是輸入腹部CT序列圖像;用mean shift方法對其初分割并以每個像素為中心提取5×5塊作為特征;對一幅圖像進(jìn)行交互式分割得到目標(biāo)和背景;對目標(biāo)和背景區(qū)域分別進(jìn)行訓(xùn)練生成目標(biāo)和背景字典后,去逼近序列中未分割的圖像,根據(jù)誤差最小原則將所有像素標(biāo)記為目標(biāo)或背景并進(jìn)行高斯平滑;計算初分割圖像中每個區(qū)域的目標(biāo)像素點的密度,去掉密度小的區(qū)域后得到分割結(jié)果;對于分割不正確的圖像進(jìn)行再次交互式分割;通過字典遷移來更新目標(biāo)字典。本發(fā)明具有對醫(yī)學(xué)圖像分割效果好和速度快的優(yōu)點,可用于對醫(yī)學(xué)CT序列圖像的分割。
文檔編號G06T7/00GK102831614SQ20121033219
公開日2012年12月19日 申請日期2012年9月10日 優(yōu)先權(quán)日2012年9月10日
發(fā)明者緱水平, 馬麗敏, 周治國, 劉芳, 張曉鵬, 唐磊, 王之龍, 王云利 申請人:西安電子科技大學(xué)
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