專利名稱：用于預(yù)測治療結(jié)果的基于計(jì)算機(jī)的系統(tǒng)的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
本發(fā)明涉及管理衛(wèi)生保健的計(jì)算機(jī)系統(tǒng)，尤其是涉及預(yù)測給用戶治療的治療價(jià)值的系統(tǒng)和方法。該系統(tǒng)特別適合輔助用戶基于治療功效做出決定。該系統(tǒng)可以經(jīng)配置以給病人和/或其醫(yī)師顯示個(gè)性化治療信息，或給例如保健支付者或藥品開發(fā)人員顯示關(guān)于現(xiàn)有治療或假想治療的價(jià)值的信息。
背景技術(shù)：
正如在臨床實(shí)踐中觀察到的，雖然已經(jīng)開發(fā)出用于對(duì)治療成本分類和進(jìn)行顯示的眾多基于計(jì)算機(jī)的系統(tǒng)，但是很少有嘗試來設(shè)計(jì)能夠預(yù)測結(jié)果的系統(tǒng)。用于預(yù)測治療結(jié)果的ー個(gè)例子是Archimedes有限公司的系統(tǒng)，例如W02009/158585 (Archimedes有限公司)。該系統(tǒng)使用包括身體器官和身體函數(shù)的建模的 人體復(fù)雜生物模型。接著，該系統(tǒng)接受病人特征的輸入和它們的結(jié)果，將這些映射到人體生物模型并且為每個(gè)模擬個(gè)體導(dǎo)出益處函數(shù)。該模型允許用戶生成和研究模擬個(gè)體的更大群體，這些群體復(fù)制從中導(dǎo)出輸入特征的群體(例如，HMO的客戶)。不過，這樣的系統(tǒng)似乎不允許在藥物還沒有在體內(nèi)使用的群體中的治療模擬。此外，該系統(tǒng)要求其參數(shù)難以確認(rèn)的復(fù)雜生物模型，而且由于每個(gè)模擬個(gè)體是獨(dú)立建模的，從而需要極大數(shù)量的數(shù)學(xué)函數(shù)。在US2005/013663中報(bào)告的另ー個(gè)系統(tǒng)，其共享Archimedes系統(tǒng)的途徑的公共方面，因?yàn)槠涫褂糜蓮?fù)雜生物模型表示的每個(gè)虛擬個(gè)體，并且試圖將真實(shí)病人與虛擬個(gè)體之中的最接近的代表匹配。該系統(tǒng)也是高度復(fù)雜的并且依賴生物模型的準(zhǔn)確度。因此，存在對(duì)改進(jìn)的系統(tǒng)的需要，該系統(tǒng)用于在新病人中或新群體中預(yù)測治療結(jié)果以及在體內(nèi)投藥前用于藥物候選。

發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的結(jié)果處理系統(tǒng)通常包括執(zhí)行預(yù)測治療結(jié)果的方法的處理器，例如系統(tǒng)通常會(huì)包括ー組輸入，與輸入通信的處理器，以及可選的顯示器，與處理器通信的通信裝置或數(shù)據(jù)存儲(chǔ)裝置。該組輸入生成表征治療的ー組數(shù)據(jù)，由T表示。該治療可以是假設(shè)治療(例如，生物目標(biāo)的調(diào)節(jié)、假設(shè)的化學(xué)結(jié)構(gòu))或真實(shí)治療。該治療與描述個(gè)體群中的治療益處的函數(shù)關(guān)聯(lián)，通常以處于治療的醫(yī)療事件的發(fā)生進(jìn)行描述，將治療益處描述為沒有上述治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(例如，醫(yī)療事件的發(fā)生)的函數(shù)。該治療可選地與一個(gè)或更多變量(X)關(guān)聯(lián)。變量(X)是除了包含在沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)中的特征之外的個(gè)體特征的矢量，以及其中所述變量(X)和(Y)可以是(若干)環(huán)境型，顯型或基因型衍生變量。變量(X)能夠可選擇地稱為第一變量以及變量(Y)稱為第二變量。處理器利用將治療益處描述為在缺少上述治療情況下風(fēng)險(xiǎn)(Re)和變量(X)的函數(shù)，為虛擬群體或感興趣病人計(jì)算治療益處。處理器能夠從群體或個(gè)體的治療中計(jì)算任意一個(gè)或更多數(shù)量益處指示器，接著可以輸出所述益處指示器?？蛇x地，治療的益處可以以文字形式或圖表形式顯示、存儲(chǔ)或通信，例如到數(shù)據(jù)庫或進(jìn)ー步到處理器。可選顯示生成包括從在群體或個(gè)體的治療中獲得的、包括文字形式或圖表形式的、任意一個(gè)或更多數(shù)量益處指示器的顯示。通過將每個(gè)治療(T)與方程式關(guān)聯(lián)，該方程式描述在群體中的其益處與描述病人間可變性的變量，治療(T)的集合能夠在與導(dǎo)出函數(shù)的群體在數(shù)量或特征(例如，變量(X)和/或(Y))方面不同的模擬群體中評(píng)估。該方法不像之前系統(tǒng)所述的情況要求単獨(dú)函數(shù)描述每個(gè)體的復(fù)雜生物過程，相反，而是使用能夠應(yīng)用于貫穿具有不同個(gè)體特定特征的個(gè)體給定治療的益處函數(shù)。因此，單個(gè)益處函數(shù)能夠應(yīng)用于整體群體，而且由于單個(gè)益處函數(shù)能夠針對(duì)每個(gè)治療或每個(gè)治療藥征(例如，具有定義劑量、計(jì)劃等的治療方案)，從而簡化該系統(tǒng)并消除潛在的錯(cuò)誤源。該發(fā)明對(duì)，例如估算治療是否適合感興趣群體，或者治療如何與另ー個(gè)治療比較，包括但不限于估算治療在感興趣群體中是否劃算是有用的。該發(fā)明在個(gè)性化醫(yī)療方面也 是有用的；用戶能夠輸入病人描述符(變量)和之前提到的益處函數(shù)和變量，并且能夠用于給用戶計(jì)算和顯示病人會(huì)從治療中獲得的益處。此外，利用這樣的函數(shù)，可選地利用變量，只要提供至少作為風(fēng)險(xiǎn)和變量(X)函數(shù)的益處函數(shù)，甚至在完全沒有臨床驗(yàn)證情況下，可以在模擬群體中評(píng)估候選治療(T)。后者尤其在計(jì)算機(jī)模擬的藥物發(fā)現(xiàn)中特別有價(jià)值，例如，用于估算生物目標(biāo)。本發(fā)明對(duì)識(shí)別和/或估算生物標(biāo)記或生物標(biāo)記組合也是有用的，例如疾病生物標(biāo)記或?qū)χ委燁A(yù)防響應(yīng)生物標(biāo)記(例如，治療益處(Rc-Rt)預(yù)防生物標(biāo)記)。而且，本發(fā)明允許針對(duì)群體或個(gè)體的、易于估算和示出治療益處的輸出。該輸出可以通過直觀圖表輸出(例如，給病人示出益處的地方)允許用戶輕易捕獲潛在方法的方式，或以數(shù)量的方式(例如，治療比較對(duì)衛(wèi)生經(jīng)濟(jì)學(xué)或藥物發(fā)現(xiàn)是需要的地方)。在一個(gè)實(shí)施例中，提供計(jì)算機(jī)實(shí)施方法，其包括由結(jié)果處理系統(tǒng)為ー個(gè)或更多個(gè)體計(jì)算的治療益處(Rc-Rt)或治療結(jié)果率(Rt)，其中所述計(jì)算包括計(jì)算治療(T)的益處，其與描述針對(duì)群體的治療益處(Rc-Rt)的函數(shù)關(guān)聯(lián),其中治療益處(Rc-Rt)被描述為沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)的函數(shù),優(yōu)選地,其中所述函數(shù)是描述治療益處(Rc-Rt)的函數(shù),治療益處(Rc-Rt)被描述為下列變量的函數(shù)(i)依賴于第一變量(Y)的沒有治療(T)時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)，以及(ii)第二變量(X)，其中所述第二變量(X)是除了包含在沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)中的特征之外的個(gè)體特征的矢量，并且第一變量(Y)是包含在沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)中的個(gè)體特征的矢量，以及其中所述變量(X)和(Y)可以是(若干)環(huán)境型，顯型或基因型衍生變量；接收描述所述ー個(gè)或更多個(gè)體的病人描述符，其中所述每個(gè)體與風(fēng)險(xiǎn)(Re)和第二變量(X)關(guān)聯(lián)；以及可選地，輸出針對(duì)所述個(gè)體的治療益處(Rc-Rt)指示器或治療結(jié)果率。在本發(fā)明任意方法的一個(gè)實(shí)施例中，包括個(gè)性化醫(yī)療、生物標(biāo)記識(shí)別或估算方法，藥物發(fā)現(xiàn)、可移植性和進(jìn)展監(jiān)測方法，該方法可以包括為多個(gè)治療(T)中的每個(gè)計(jì)算治療益處，其中所述每個(gè)治療(T)與描述針對(duì)群體的治療益處的函數(shù)(例如，特殊函數(shù)，優(yōu)選地，針對(duì)姆個(gè)治療的單個(gè)函數(shù))關(guān)聯(lián)，其中所述治療益處被描述為沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)和第ニ變量(X)的函數(shù)。當(dāng)計(jì)算出針對(duì)多個(gè)治療的治療益處吋，該系統(tǒng)可用于比較治療(例如，治療排名，識(shí)別合適的治療)，或通常更多是輸出或顯示多個(gè)治療(例如，作為治療選項(xiàng)；用于比較)。這種整合多個(gè)治療的方法對(duì)醫(yī)師或涉及藥物發(fā)現(xiàn)的人員，藥物開發(fā)以及衛(wèi)生經(jīng)濟(jì)學(xué)來說特別有用。在本發(fā)明方法的一個(gè)實(shí)施例中，(若干)個(gè)體是(若干)真實(shí)人類病人。在本發(fā)明方法的一個(gè)實(shí)施例中，(若干)個(gè)體是(若干)模擬個(gè)體。在本發(fā)明方法的一個(gè)實(shí)施例中，所述接收病人描述符的步驟包括生成模擬個(gè)體或模擬的個(gè)體群。在本發(fā)明方法的一個(gè)實(shí)施例中，所述(若干)個(gè)體包括多個(gè)真實(shí)人類病人。在本發(fā)明方法的一個(gè)實(shí)施例中，所述個(gè)體包括模擬的個(gè)體群?？蛇x地，所述模擬的個(gè)體群是虛擬現(xiàn)實(shí)群體。優(yōu)選地，該方法包括在群體的每個(gè)體中計(jì)算治療益處。優(yōu)選地，該方法的輸出提供群體中的治療益處。 在本發(fā)明方法的一個(gè)實(shí)施例中，利用由用戶輸入的、結(jié)果處理系統(tǒng)生成的或從數(shù)據(jù)源接收的信息或數(shù)據(jù)，計(jì)算治療益處。在一個(gè)實(shí)施例中，數(shù)據(jù)源是醫(yī)療記錄系統(tǒng)。在ー個(gè)實(shí)施例中，所述信息包括臨床治療使用的數(shù)據(jù)。在一個(gè)實(shí)施例中，所述信息包括病理生理學(xué)治療模型的輸出?？蛇x地，該方法進(jìn)ー步從這樣的信息導(dǎo)出描述針對(duì)群體的治療益處的所述函數(shù)，所述治療益處被描述為沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)的函數(shù)。在一個(gè)實(shí)施例中，所述信息包括描述針對(duì)群體的治療益處的函數(shù)，所述治療益處被描述為沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)和其他病人描述符的函數(shù)。在本發(fā)明方法的一個(gè)實(shí)施例中，該方法進(jìn)ー步包括為所述個(gè)體顯示治療益處(Rc-Rt)的函數(shù)。在一個(gè)實(shí)施例中，顯示界面是以圖表的形式。在本發(fā)明方法的一個(gè)實(shí)施例中，該方法進(jìn)ー步包括估算治療是否適用病人。在本發(fā)明方法的一個(gè)實(shí)施例中，該方法進(jìn)ー步包括為所述個(gè)體估算變量對(duì)治療益處的效果，例如，比較變量對(duì)治療益處的效果或確定對(duì)治療益處的效果?？蛇x地，影響治療益處的變量被確定為生物標(biāo)記，例如，治療(T)響應(yīng)預(yù)測生物標(biāo)記。在本發(fā)明方法的一個(gè)實(shí)施例中，該方法進(jìn)ー步包括估算治療是否適用于感興趣群體。在本發(fā)明方法的一個(gè)實(shí)施例中，該方法迸一歩包括為所述個(gè)體比較變量對(duì)治療益處的效果；可選地，所述變量是可檢測的生物或細(xì)胞成分，以及其中確定對(duì)治療益處具有效果的成分被認(rèn)為是生物標(biāo)記，例如，治療(T)響應(yīng)預(yù)測標(biāo)記。在本發(fā)明方法的一個(gè)實(shí)施例中，該方法進(jìn)ー步包括監(jiān)控開發(fā)，例如藥品的步驟。這樣的估算或比較步驟可以由計(jì)算機(jī)實(shí)施系統(tǒng)或用戶執(zhí)行。在本發(fā)明方法的一個(gè)實(shí)施例中，個(gè)體包括一個(gè)或多個(gè)真實(shí)病人。在本發(fā)明方法的一個(gè)實(shí)施例中，一個(gè)或更多個(gè)體包括模擬個(gè)體或模擬群體。在本文任何實(shí)施例的ー個(gè)方面，輸入數(shù)據(jù)包括已經(jīng)在臨床中驗(yàn)證或非臨床中估算(例如，在體外試驗(yàn)、生化分析、在非人體動(dòng)物的體內(nèi)試驗(yàn))的治療數(shù)據(jù)。本發(fā)明公開的方法對(duì)個(gè)性化醫(yī)療是有用的。在包括由結(jié)果處理系統(tǒng)為病人計(jì)算治療益處(Rc-Rt)的本發(fā)明ー個(gè)實(shí)施例中，其中所述計(jì)算包括計(jì)算針對(duì)病人的多個(gè)治療(T)的益處，其中的每個(gè)與描述針對(duì)群體的治療益處(Rc-Rt)函數(shù)關(guān)聯(lián),其中治療益處(Rc-Rt)被描述為沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)的函數(shù),優(yōu)選地，根據(jù)第一變量(Y)和第二變量(X)，其中所述函數(shù)是描述治療益處(Rc-Rt)的函數(shù)，所述治療益處(Rc-Rt)被描述為沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)的函數(shù)，其中所述第二變量(X)是除了包含在沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)中的特征之外的個(gè)體特征的矢量，以及其中所述變量(X)和(Y)可以是(若干)環(huán)境型、顯型或基因型變量；為病人接收針對(duì)所述變量(X)和(Y)的病人描述符；以及為所述病人輸出針對(duì)治療T的治療益處(Rc-Rt)指示器。在一個(gè)實(shí)施例中，所述接收病人描述符的步驟包括接收由用戶輸入的信息，例如，通過輸入裝置或輸入接ロ?？蛇x地，輸出治療益處指示器包括顯示所述治療是否適合所述病人?？蛇x地，所述輸出包括例如，顯示多個(gè)治療中的ー個(gè)，或顯示適合所述病人的多個(gè)治療，可選地，根據(jù)它們對(duì)病人的預(yù)期益處排名?？蛇x地，所述輸出可以進(jìn)一歩包括為多個(gè)個(gè)體以圖表形式顯示所述治療的預(yù)期益處，以及指示針對(duì)所述病人的益處是如何與針對(duì)所述群體的益處比較的；可選地，圖表形式是圖表中具有軸Rt和軸Re的散點(diǎn)圖；可選地，圖表形式是圖表中具有軸Rc-Rt和軸Re的散點(diǎn)圖。 在本文任意實(shí)施例的ー個(gè)方面，輸入數(shù)據(jù)包括模擬的治療數(shù)據(jù)。在本文任意實(shí)施例的ー個(gè)方面，輸入數(shù)據(jù)包括已經(jīng)在臨床中驗(yàn)證或非臨床中估算(例如，在體外試驗(yàn)、生化分析、在非人體動(dòng)物的體內(nèi)試驗(yàn))的治療數(shù)據(jù)。在本文任意實(shí)施例的ー個(gè)方面，利用從臨床治療使用輸入的、生成的、或接收的信息以及(ii )從描述針對(duì)群體的治療益處的函數(shù)的所述數(shù)據(jù)獲取的信息計(jì)算治療益處，其中治療益處被描述為沒有治療T時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)的函數(shù)。在本文任意實(shí)施例的ー個(gè)方面，利用從病理生理學(xué)模型以及治療T模型，例如正式治療模型接收的信息計(jì)算治療益處。病人描述符和/或描述針對(duì)群體的治療益處的函數(shù)能夠從這樣的信息導(dǎo)出，其中所述治療益處被描述為沒有治療T時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)的函數(shù)。治療益處利用用戶輸入的、結(jié)果處理系統(tǒng)生成的或從數(shù)據(jù)源接收的信息或數(shù)據(jù)計(jì)算。本發(fā)明還公開在生物標(biāo)記發(fā)現(xiàn)和估算方面有用的具體過程，提供的方法包括(a)執(zhí)行的計(jì)算機(jī)實(shí)施方法，該方法包括由結(jié)果處理系統(tǒng)為個(gè)體或群體計(jì)算治療益處(Rc-Rt)，其中所述計(jì)算包括計(jì)算與描述針對(duì)群體的治療益處(Rc-Rt)的函數(shù)關(guān)聯(lián)的治療益處(T)，該函數(shù)將所述治療益處(Rc-Rt)描述為沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)的函數(shù)，優(yōu)選地，其中所述函數(shù)將治療益處(Rc-Rt)描述為下列變量的函數(shù)(i)取決于第一變量(Y)的沒有治療時(shí)的的風(fēng)險(xiǎn)(Re)，以及(ii)第二變量(X)，其中所述第二變量(X)是除了包含在沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)中的特征之外的個(gè)體特征的矢量，并且第ー變量(Y)是包含在沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)中的個(gè)體特征的矢量，以及其中所述變量(X)和(Y)可以是(若干)環(huán)境型、顯型或基因型衍生
變量；接收描述所述ー個(gè)或更多個(gè)體的病人描述符，其中所述每個(gè)體與風(fēng)險(xiǎn)(Re)和第二變量(X)關(guān)聯(lián)；以及可選地，輸出針對(duì)所述個(gè)體的治療益處(Rc-Rt)指示器；(b)估算針對(duì)所述個(gè)體或群體的變量在治療益處(Rc-Rt)上的效果。優(yōu)選地，接收或生成具有不同病人描述符的群體，其中呈現(xiàn)所有病人描述符的組合和/或其相應(yīng)值，并且估算變量在治療益處(Rc-Rt)上效果的步驟包括確定哪些參數(shù)(例如，病人描述符和/或其相應(yīng)值)與増加的治療益處關(guān)聯(lián)?？蛇x地，針對(duì)所述群體的、影響治療益處的變量被確定為生物標(biāo)記。在ー個(gè)方面，估算變量的步驟(b)由用戶執(zhí)行。在ー個(gè)方面，(b)由計(jì)算機(jī)(例如，結(jié)果處理系統(tǒng))執(zhí)行，并且該方法進(jìn)ー步包括輸出用于生物標(biāo)記的一個(gè)或更多識(shí)別符，并且可選地，進(jìn)ー步輸出與這樣生物標(biāo)記關(guān)聯(lián)的治療益處(Rc-Rt)指示器。在ー個(gè)方面，接收描述一個(gè)或更多個(gè)體病人描述符的步驟包括從病理生理學(xué)模型接收至少一個(gè)所述病人描述符。優(yōu)選地，從病理生理學(xué)模型接收的病人描述符由組件或病理生理學(xué)模型組件之間的相互關(guān)系表示。在一個(gè)實(shí)施例中，從病理生理學(xué)模型接收針對(duì)第ニ變量(X)的一個(gè)或更多病人描述符。在一個(gè)實(shí)施例中，從病理生理學(xué)模型接收針對(duì)第二變量(X)和風(fēng)險(xiǎn)(Re)的一個(gè)或更多病人描述符，優(yōu)選地，所有病人描述符。在一個(gè)實(shí)施例中，影響治療益處的變量是第二變量X，確定生物標(biāo)記為治療(T)響應(yīng)預(yù)防生物標(biāo)記。在一個(gè)實(shí)施例中，影響治療益處的變量是第二變量Y，確定 生物標(biāo)記為沒有(獨(dú)立于治療(T))治療(T)疾病預(yù)防生物標(biāo)記。例如，生物標(biāo)記可以是疾病狀態(tài)，進(jìn)展，嚴(yán)重性等的指示。可選地，該方法包括實(shí)施體外試驗(yàn)以估算病人，例如真實(shí)人的生物標(biāo)記。例如，生物標(biāo)記可以被確定為特定細(xì)胞或生物成分(例如，基因多態(tài)性或等位基因的存在)的存在或級(jí)別，并且實(shí)施設(shè)計(jì)成檢測這種成分(例如，在個(gè)體的生物標(biāo)本中)的體外試驗(yàn)。本發(fā)明還公開在生物目標(biāo)發(fā)現(xiàn)和更多通用藥物發(fā)現(xiàn)中有用的具體過程，例如藥物發(fā)現(xiàn)。在一個(gè)這樣的實(shí)施例中，治療(T)是模擬治療或開發(fā)治療。在一個(gè)實(shí)施例中，提供的計(jì)算機(jī)實(shí)施方法包括由結(jié)果處理系統(tǒng)為模擬群體計(jì)算治療益處(Rc-Rt)，其中所述計(jì)算包括計(jì)算治療(T)益處，其與(i)和(2)關(guān)聯(lián)，其中(i)組件或病理生理學(xué)模型之家相互關(guān)系的改變，(2)描述針對(duì)群體的治療益處(Rc-Rt)的函數(shù),其中治療益處(Rc-Rt)被描述為沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)的函數(shù)，優(yōu)選地，取決于第一變量(Y)和第二變量(X)，其中所述函數(shù)是描述治療益處(Rc-Rt)的函數(shù),治療益處(Rc-Rt)被描述為沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)的函數(shù),其中所述第二變量(X)是除了包含在沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)中的特征之外的個(gè)體特征的矢量，以及其中所述變量(X)和(Y)可以是(若干)環(huán)境型、顯型或基因型衍生變量；為模擬群體接收病人描述符，其中群體中的每個(gè)體與風(fēng)險(xiǎn)(Re)和第二變量(X)關(guān)聯(lián)；以及輸出模擬群體中的治療益處(Rc-Rt)指示器。在一個(gè)實(shí)施例中，所述接收病人描述符的步驟包括生成模擬個(gè)體或模擬群體。可選地，所述模擬群體是虛擬現(xiàn)實(shí)群體。在一個(gè)實(shí)施例中，該方法進(jìn)ー步包括接收規(guī)定組件或病理生理學(xué)模型組件之間相互關(guān)系的信息，組件或組件相互關(guān)系的改變用于定義治療(T)。可以通過輸入裝置從例如用戶接收信息。在一個(gè)實(shí)施例中，描述針對(duì)群體的治療益處(Rc-Rt)的函數(shù)通過(a)和(b)獲得，其中治療益處(Rc-Rt)被描述為沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)的函數(shù),其中(a)運(yùn)行定義治療(T)的病理生理學(xué)模型，其包括組件或病理生理學(xué)模型組件之間相互關(guān)系的改變，其中所述病理生理學(xué)模型生成感興趣事件的可能性；以及(b)從所述感興趣事件可能性獲得所述函數(shù)。在一個(gè)實(shí)施例中，描述針對(duì)群體的治療益處(Rc-Rt)的所述函數(shù)通過(a)和(b)獲得，其中治療益處(Rc-Rt)被描述為沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)的函數(shù),其中(a)運(yùn)行正式治療模型，其模擬與一個(gè)或更多治療描述符關(guān)聯(lián)的治療(T)，其中所述正式治療模型生成感興趣事件的可能性；以及(10從所述感興趣事件可能性獲得所述函數(shù)。在一個(gè)實(shí)施例中，進(jìn)ー步包括接收臨床數(shù)據(jù)，并且使用所述數(shù)據(jù)修改所述正式治療模型；以及可選地，利用修改的正式治療模型重復(fù)所述步驟(a)和(b)。在本文任意實(shí)施例中，該方法可以有利地包括提供多個(gè)治療(T)，其中在所述多個(gè)治療(T)內(nèi)的每個(gè)治療T與益處函數(shù)關(guān)聯(lián)。因此，可選地，該方法還可以包括(i)為所述多個(gè)治療T中的每個(gè)輸入、生成或接收治療信息，以及可選地存儲(chǔ)治療信息(例如，從臨床試驗(yàn)，從病理生理學(xué)模型)，以及(ii)從所述信息獲得描述針對(duì)群體的治療益處的函數(shù)，其中治療益處被描述為沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)的函數(shù)。 在本文的任意實(shí)施例中，治療益處(Rc-Rt)可以表述為治療益處(Rt)，如同從治療結(jié)果率獲得的治療益處(Rt)。在另ー個(gè)實(shí)施例中，本發(fā)明提供存儲(chǔ)器，其用于存儲(chǔ)由結(jié)果處理系統(tǒng)執(zhí)行的應(yīng)用程序訪問數(shù)據(jù)，其包括存儲(chǔ)在所述存儲(chǔ)器中的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)，所述數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)包括由所述應(yīng)用程序使用的信息，其中所述數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)經(jīng)配置以包括多個(gè)數(shù)據(jù)對(duì)象，每個(gè)數(shù)據(jù)對(duì)象對(duì)應(yīng)于多個(gè)治療(T)中的ー個(gè)，以及其中所述每個(gè)治療(T)與描述針對(duì)群體的治療益處關(guān)聯(lián)(例如，鏈接)，其中所述治療益處被描述為沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)的函數(shù)，優(yōu)選地，取決于第一變量(Y)和第二變量(X)，其中所述函數(shù)是描述治療益處(Rc-Rt)的函數(shù),所述治療益處(Rc-Rt)被描述為沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)的函數(shù)，其中所述第二變量(X)是除了包含在沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)中的特征之外的個(gè)體特征的矢量，以及第ー變量(Y)是包含在沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)中的個(gè)體特征的矢量，以及其中所述變量(X)和(Y)可以是(若干)環(huán)境型、顯型或基因型衍生變量。在另ー個(gè)實(shí)施例中，本發(fā)明提供存儲(chǔ)器，其用于存儲(chǔ)由結(jié)果處理系統(tǒng)執(zhí)行的應(yīng)用程序訪問數(shù)據(jù)，其包括存儲(chǔ)在所述存儲(chǔ)器中的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)，所述數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)包括由所述應(yīng)用程序使用的信息，其中所述數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)經(jīng)配置包括多個(gè)數(shù)據(jù)對(duì)象，每個(gè)數(shù)據(jù)對(duì)象對(duì)應(yīng)于多個(gè)治療(T)中的ー個(gè)，以及其中所述每個(gè)治療(T)與特定群體中的治療益處(Rc-Rt)關(guān)聯(lián)，其中所述治療益處(Rc-Rt)利用描述針對(duì)群體的治療益處的函數(shù)計(jì)算，該治療益處被描述為沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)的函數(shù)，優(yōu)選地，依賴于第一變量(Y)和第二變量(X)，其中所述函數(shù)是描述治療益處(Rc-Rt)的函數(shù),所述治療益處(Rc-Rt)被描述為沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)的函數(shù)，其中所述第二變量(X)是除了包含在沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)中的特征之外的個(gè)體特征的矢量，以及第ー變量(Y)是包含在沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)中的個(gè)體特征的矢量，以及其中所述變量(X)和(Y)可以是(若干)環(huán)境型、顯型或基因型衍生變量。可選地，每個(gè)治療(T)進(jìn)ー步與所述特定群體關(guān)聯(lián)。在一個(gè)實(shí)施例中，這樣的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)對(duì)給用戶提供治療信息是有用的。在ー個(gè)方面，本發(fā)明提供計(jì)算機(jī)實(shí)施的方法，該方法包括接收查詢(例如，經(jīng)由輸入裝置或輸入接ロ從用戶)，識(shí)別滿足所述查詢的一個(gè)或更多治療(T)，訪問用于存儲(chǔ)本發(fā)明的數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)器，以及例如，為個(gè)體或群體輸出針對(duì)所述治療(T)的益處(Rc-Rt)指示器。查詢可以是本發(fā)明系統(tǒng)用于識(shí)別一個(gè)或更多治療的任何信息；查詢可以包括例如，一個(gè)或多個(gè)治療(T)的選擇或規(guī)范，根據(jù)任何所期望特征(例如)、疾病或所期望醫(yī)療結(jié)果的選擇或規(guī)范，對(duì)ー組治療(T)的選擇和規(guī)范組合。當(dāng)提供輸入數(shù)據(jù)到本文任意實(shí)施例中或任何實(shí)施例內(nèi)的任意單個(gè)步驟時(shí)，提供輸入數(shù)據(jù)的步驟可以包括任何合適方法，包括例如接收輸入數(shù)據(jù)、利用輸入裝置或接ロ輸入輸入數(shù)據(jù)、存儲(chǔ)輸入數(shù)據(jù)和/或從用于存儲(chǔ)數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)器檢索輸入數(shù)據(jù)。同樣地，輸出數(shù)據(jù)可以包括任何合適方法，包括例如存儲(chǔ)、通信、顯示等。本發(fā)明還提供用于預(yù)測ー個(gè)或多個(gè)治療益處的設(shè)備，所述設(shè)備包括用于執(zhí)行計(jì)算機(jī)指令的計(jì)算機(jī)，其中所述計(jì)算機(jī)包括用于執(zhí)行本文所述任意方法的計(jì)算機(jī)指令。本發(fā)明還提供計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)，其存儲(chǔ)用于預(yù)測一個(gè)或多個(gè)治療益處的計(jì)算機(jī)程序，其中所述計(jì)算機(jī)程序包括用于執(zhí)行本文所述任意方法的指令。


圖I是示出本發(fā)明的多功能系統(tǒng)的示意圖。圖2是示出能夠由多功能系統(tǒng)執(zhí)行的本發(fā)明不同過程的示意圖。圖3是輸出感興趣事件的可能性的急中風(fēng)病理生理學(xué)模型。圖4是輸出感興趣事件的可能性的急中風(fēng)病理生理學(xué)模型；該模型能夠被合并到合并了其他過程，例如細(xì)胞死亡的更為完整的急中風(fēng)模型。圖5是在正式治療模型中的藥理學(xué)模型。輸入是在時(shí)間t給身體提供CuD量的在劑量D的治療。PK模型通過幾個(gè)連續(xù)步驟將其轉(zhuǎn)換為血濃度(C (t))。然后，在生理參數(shù)IO (t)變化期間轉(zhuǎn)換血濃度。若IO (t)是疾病治療功效的支持，其被引用為ζ。這個(gè)變量影響在病理生理學(xué)模型中表示的疾病過程。IO (t)或由治療影響的類似參數(shù)是到副作用模型的輸入。IO (t)是治療功效的生物標(biāo)記。圖6是階梯式正式治療模型，其包括輸出到病理生理學(xué)模型的藥理模型。基于我們對(duì)藥理學(xué)和生理學(xué)的理解，每個(gè)步驟由ー個(gè)或幾個(gè)方程式建模。圖7是進(jìn)行可移植性研究或生物標(biāo)記評(píng)價(jià)研究的過程。圖8是進(jìn)行可移植性研究或生物標(biāo)記評(píng)價(jià)研究的過程。圖Sbis是跨多群體進(jìn)行可移植性和/或生物標(biāo)記研究的過程。圖9是評(píng)價(jià)生物目標(biāo)的過程。圖10示出急中風(fēng)病理生理學(xué)模型的結(jié)果；模型中的變化是鈉通道的阻塞，并且模型的輸出是隨著以分鐘為單位的時(shí)間推移的對(duì)浮腫的作用(表述為rADCw值)。圖11示出急中風(fēng)病理生理學(xué)模型的結(jié)果，其中局部缺血的過程通過改變鈉通道(NaP)調(diào)節(jié)。圖12示出在人體和鼠類中的鈉通道阻塞效果，其提供針對(duì)在鼠類中有效但在人體中無效的藥物的可能解釋。圖13示出監(jiān)控藥物開發(fā)的方法。圖14示出預(yù)測心絞痛發(fā)作，隨后利用正式治療模型以假想強(qiáng)心藥治療的結(jié)果；線條示出作為劑量函數(shù)的預(yù)測，而帶狀物示出來自從中獲得藥物數(shù)據(jù)的臨床試驗(yàn)的結(jié)果。圖15是示出應(yīng)用于虛擬現(xiàn)實(shí)群體的強(qiáng)心藥的效果模型確定的治療益處的圖形顯/Jn ο圖16、17和18示出預(yù)測針對(duì)病人的治療益處的方法。圖19示出本發(fā)明的示范性顯示；以軸Rt和軸Re描繪的散點(diǎn)圖示出利用伊伐布雷定(ivrabradine)的治療益處,其中斑塊破裂是感興趣事件。圖20示出硬件實(shí)施例。
具體實(shí)施例方式定義“治療”，如本文所使用的，是指以治療、治愈或預(yù)防疾病為目的，通過改變生命系統(tǒng)的機(jī)能，包括一個(gè)或更多癥狀的減輕或改善、疾病范圍減小、穩(wěn)定(即，不惡化)疾病狀態(tài)、預(yù)防疾病傳播、延遲或減緩疾病進(jìn)展、疾病狀態(tài)改善或緩和以及緩解(無論是局部的還是整 體的)，無論是可檢測的或不可檢測的，從而可能更改疾病過程的任何干預(yù)(例如，手術(shù)、用藥等)。“可移植性研究”，如本文所使用的，是指治療功效和/或耐受性的可移植性評(píng)估?？梢浦残灾高@樣的操作通過該操作，治療功效和/或耐受性的預(yù)測從在不同于感興趣的第二群體或個(gè)體的(若干)第一群體或(若干)個(gè)體中獲取的數(shù)據(jù)被推斷到第二群體或個(gè)體。術(shù)語“生物目標(biāo)”，如本文所使用的，是指生物成分，生物成分的改變具有更改感興趣生物系統(tǒng)的機(jī)能的可能性。生物目標(biāo)的非限定性例子包括分子，例如DNA、RNA、蛋白質(zhì)、糖蛋白、脂蛋白、糖類、脂肪酸、酶；激素和化學(xué)反應(yīng)的分子(例如，H+、超氧化物、ATP、以及檸檬酸) ’離子;糖蛋白；大分子和分子復(fù)合物；細(xì)胞和細(xì)胞的各部分，例如亞細(xì)胞器官(例如，線粒體、原子核、高爾基氏復(fù)合體、溶酶體、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)以及核糖體)；以及上述的組合。術(shù)語“目標(biāo)評(píng)價(jià)”，如本文所使用的，是指對(duì)生物目標(biāo)改變的(若干)病理生理學(xué)模型輸出的影響的評(píng)估。術(shù)語“改變”，如本文關(guān)于病理生理學(xué)模型所使用的，是指設(shè)計(jì)為表示環(huán)境和/或?qū)ο蟑煼ㄖ姓鎸?shí)生活變化的生物系統(tǒng)模型中參數(shù)或分量的更改。示范性改變包括存在調(diào)節(jié)(例如，激活或抑制)細(xì)胞或生物成分(例如生物目標(biāo))的功能的現(xiàn)有或假設(shè)藥物，以及治療療程，僅僅時(shí)間推移(例如，老化)，暴露于環(huán)境毒素，増加的鍛煉及其類似。正如本文所使用，術(shù)語“病人”是指真實(shí)的或模擬的個(gè)體，優(yōu)選地是指人類。術(shù)語“模擬個(gè)體”是指本發(fā)明的系統(tǒng)、代碼、裝置和方法中真實(shí)個(gè)體的表示。正如本文所使用，術(shù)語“治療描述符”是指對(duì)描述治療參數(shù)有用的任何信息。例子包括藥物劑量、藥物服用頻率、藥物的處方、聯(lián)合治療藥物、聯(lián)合治療劑量、藥物服用頻率、藥物服用持續(xù)時(shí)間、代謝物、藥物半衰期、腎藥物代謝、代謝途徑或代謝酶、對(duì)象飲食習(xí)慣、對(duì)象鍛煉養(yǎng)生、不同于使用值的任何建議值(例如，由衛(wèi)生行政部門建議的)等。某些治療描述符還可以是其依賴于個(gè)體的程度的病人描述符，例如，藥物半衰期。治療描述符替代地可以是純治療描述符，例如藥物服用劑量。正如本文所使用，術(shù)語“病人描述符”是指對(duì)描述病人特征有用的任何信息。例子包括，與被整合到無治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)中的感興趣結(jié)果(事件)的發(fā)生(它們被稱為“風(fēng)險(xiǎn)因子”)相關(guān)的(若干)變量(Y)，以及與沒有整合到Re中的益處強(qiáng)度相關(guān)的(若干)變量(X)。生物標(biāo)記是病人描述符的例子。術(shù)語“細(xì)胞成分”是指生物細(xì)胞或其一部分。細(xì)胞成分的非限制性例子包括例如DNA、RNA、蛋白質(zhì)、脂蛋白、糖類、脂肪酸、酶的分子；激素、化學(xué)反應(yīng)分子(例如，H+、超氧化物、ATP (三磷酸腺苷)以及檸檬酸) ’離子;糖蛋白；高分子和分子復(fù)合物；細(xì)胞和細(xì)胞的各部分，例如亞細(xì)胞器官(例如，線粒體、原子核、高爾基氏(Golgi)復(fù)合體、溶酶體、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)以及核糖體)；以及上述的組合。術(shù)語“生物成分”是指生物系統(tǒng)的一部分。生物系統(tǒng)可以包括，例如，單個(gè)細(xì)胞、體內(nèi)細(xì)胞集合或體外細(xì)胞的集合、比如細(xì)胞培養(yǎng)、器官、組織、多細(xì)胞生物體，例如單個(gè)人類病人、多細(xì)胞生物體細(xì)胞子集或多細(xì)胞生物體種群，例如ー組病人或作為整體的總體人類群體。生物系統(tǒng)還可以包括例如多組織系統(tǒng)，比如神經(jīng)系統(tǒng)、免疫系統(tǒng)或心血管系統(tǒng)。是生物系統(tǒng)一部分的生物成分可以包括，例如細(xì)胞外成分、細(xì)胞成分、細(xì)胞內(nèi)成分或其組合。生物成分的例子包括DNA ;RNA;蛋白質(zhì)、脂蛋白、糖類、脂肪酸、酶；激素、有機(jī)小分子、高分子和分子復(fù)合物、細(xì)胞；器官；組織；細(xì)胞、組織或器官的各部分；亞細(xì)胞器，例如線粒體、原子核、高爾基氏復(fù)合體、溶酶體、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)以及核糖體；例如H+的化學(xué)反應(yīng)分子；超氧化物；ATP ；檸檬酸；蛋白質(zhì)白蛋白；離子以及其組合。關(guān)于生物成分的術(shù)語“機(jī)能”是指生物成分與一個(gè)或更多額外生物成分的相互作·用。根據(jù)某些生物機(jī)制，生物系統(tǒng)的每個(gè)生物成分可以與生物系統(tǒng)的ー個(gè)或更多額外生物成分相互作用。生物成分彼此相互作用的生物機(jī)制可以是已知的或未知的。生物機(jī)制可以包含，例如，生物系統(tǒng)的合成、調(diào)整、體內(nèi)平衡或控制網(wǎng)絡(luò)。例如，ー個(gè)生物成分與另ー個(gè)生物成分的相互作用可以包括，例如將ー個(gè)生物成分轉(zhuǎn)化為另ー個(gè)生物成分(例如通過合成或退化)、生物成分的直接物理相互作用、通過中間生物事件作為中介的生物成分非直接相互作用或某些其他機(jī)制或任何集成網(wǎng)絡(luò)((若干)遺傳網(wǎng)絡(luò)、(若干)mRNA網(wǎng)絡(luò)、(若干)基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)、(若干)蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò))。在某些情況下，ー個(gè)生物成分與另ー個(gè)生物成分的相互作用可以包括，例如，另ー個(gè)生物成分對(duì)ー個(gè)生物成分的調(diào)控調(diào)整，例如生產(chǎn)率、水平的抑制或刺激，或由另ー個(gè)生物成分決定ー個(gè)生物成分的活性。術(shù)語“生物過程”是指生物系統(tǒng)的生物成分之間的相互作用或相互作用集合。在某些情況下，生物過程可以指從生物系統(tǒng)的某方面和生物成分之間相互作用的網(wǎng)絡(luò)提取的生物成分集合。生物過程可以包括，例如生化或分子途徑/路徑和聯(lián)網(wǎng)的生物組分((若干)遺傳網(wǎng)絡(luò)、(若干)mRNA網(wǎng)絡(luò)、(若干)基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)、(若干)蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò))。生物過程還可以包括，例如，出現(xiàn)在細(xì)胞、器官、組織或多細(xì)胞生物體的環(huán)境內(nèi)的途徑或與細(xì)胞、器官、組織或多細(xì)胞生物體的環(huán)境接觸的途徑。生物過程的例子包括其中分子被分解以提供細(xì)胞能量的生化途徑、其中分子組合以提供細(xì)胞結(jié)構(gòu)或能量存儲(chǔ)的生化途徑、其中蛋白質(zhì)或核酸被合成、活化或破壞的途徑以及其中蛋白質(zhì)或核酸前體被合成或破壞的生化途徑。這種生化途徑的生物成分包括，例如，酶、合成中間體、培養(yǎng)基前體以及中間物種。術(shù)語“藥物”指的是，無論通過已知還是未知生物機(jī)制以及是否用于治療的，能夠影響生物狀態(tài)的任何復(fù)雜度的化合物。在某些情況下，藥物通過與生物成分相互作用發(fā)揮其作用，生物成分可以被稱為藥物的治療目標(biāo)。模擬治療目標(biāo)的機(jī)能的藥物可以被稱為“激活藥物”或“促效藥”，而抑制治療目標(biāo)的機(jī)能的藥物可以被稱為“抑制藥物”或“對(duì)抗剤”。藥物的作用可以是，例如RNA的一個(gè)或更多物種的轉(zhuǎn)移率或退化率的藥物調(diào)解變化、ー個(gè)或更多多肽的移植處理率或移植處理范圍或移植后處理率或移植后處理范圍的藥物調(diào)解變化、一個(gè)或更多蛋白質(zhì)的退化率或退化范圍的藥物調(diào)解變化、一個(gè)或更多蛋白質(zhì)活動(dòng)或活性的藥物調(diào)解抑制或藥物調(diào)解刺激，以及諸如此類。藥物的例子包括典型的、研究或治療或預(yù)防感興趣的基于蛋白質(zhì)、基于核酸或合成的化學(xué)品(例如，小分子)；天然發(fā)生的因子，例如內(nèi)分泌、旁分泌、自分泌因子或與任何類型細(xì)胞受體相互作用的因子；例如細(xì)胞內(nèi)信號(hào)傳遞途徑元素的細(xì)胞內(nèi)因子；與其他天然資源，例如植物來源化學(xué)品隔離的因子。藥物還可以包括，例如用于像DNA和RNA的基因治療中的藥劑。而且，抗體、病毒、細(xì)菌以及由細(xì)菌和病毒(例如，毒素、作為疫苗有用的抗原劑)產(chǎn)生的生物活性劑可以被認(rèn)為是藥物。對(duì)于某些應(yīng)用，藥物可以包括包含ー組藥物的合成物或包含一組藥物和一組賦形物的合成物。術(shù)語“醫(yī)學(xué)產(chǎn)品”是指具有對(duì)身體或類似物起作用能力或者像藥物那樣能夠影響生物狀態(tài)的任何系統(tǒng)、工具或復(fù)合物；醫(yī)藥產(chǎn)品可以通過任何活動(dòng)方式，包括化學(xué)、生物化學(xué)或物理(例如X-射線、正電子)方式起作用。醫(yī)學(xué)產(chǎn)品，像藥物，是治療。術(shù)語“生物狀態(tài)”指的是與生物系統(tǒng)關(guān)聯(lián)的狀態(tài)。在某些情況下，生物狀態(tài)指的是與生物系統(tǒng)的ー組生物過程的發(fā)生關(guān)聯(lián)的狀態(tài)。根據(jù)某些生物機(jī)制，生物系統(tǒng)的每個(gè)生物過程能夠與生物系統(tǒng)的ー個(gè)或更多額外生物過程相互作用。由于生物過程相對(duì)于彼此變化，因此生物狀態(tài)通常也改變。生物狀態(tài)通常取決于生物過程彼此相互作用的各種生物機(jī)制。生物狀態(tài)可以包括，例如物質(zhì)濃度狀態(tài)、營養(yǎng)物或激素濃度、在細(xì)胞組織中、在血漿中、 組織間液、細(xì)胞內(nèi)液或腦脊髓液，例如任何生物標(biāo)記。例如，與浮腫關(guān)聯(lián)的生物狀態(tài)與流入到神經(jīng)元的水流關(guān)聯(lián)和/或通過水的表觀擴(kuò)散系數(shù)(生物標(biāo)記rADCw)關(guān)聯(lián)；與血糖過低和血內(nèi)胰島素不足關(guān)聯(lián)的生物狀態(tài)分別由低血糖和低血胰島素的狀態(tài)表征。這些狀態(tài)可以通過實(shí)驗(yàn)施加或可以固有存在于特定生物系統(tǒng)中。作為另ー個(gè)例子，神經(jīng)元的生物狀態(tài)可以包括，例如神經(jīng)元在休息的狀態(tài)、神經(jīng)元正在發(fā)動(dòng)可能行動(dòng)的狀態(tài)、神經(jīng)元正在釋放神經(jīng)傳遞素的狀態(tài)或其組合。作為進(jìn)一歩例子，血漿營養(yǎng)素集的生物狀態(tài)可以包括其中人從整通宵喚醒的狀態(tài)、剛剛飯后的狀態(tài)、兩餐之間的狀態(tài)。作為另ー個(gè)例子，風(fēng)濕性關(guān)節(jié)的生物狀態(tài)可以包括明顯的軟骨退化和炎癥細(xì)胞增生。生物狀態(tài)可以包括“疾病狀態(tài)”，疾病狀態(tài)指的是與生物系統(tǒng)關(guān)聯(lián)的異?；蛴泻顟B(tài)。疾病狀態(tài)通常與生物系統(tǒng)中疾病的異?；蛴泻πЧP(guān)聯(lián)。在某些情況下，疾病狀態(tài)指的是與生物系統(tǒng)的ー組生物過程的發(fā)生關(guān)聯(lián)的狀態(tài)，其中該組生物過程在生物系統(tǒng)中疾病的異?；蛴泻πЧ衅鹱饔?。可以在，例如細(xì)胞、器官、組織、多細(xì)胞生物體或多細(xì)胞生物體種群中觀察疾病狀態(tài)。疾病狀態(tài)的例子包括與哮喘、糖尿病、肥胖癥、傳染病(例如，病毒的、細(xì)菌感染)、癌癥、中風(fēng)、心臟血管疾病(例如，動(dòng)脈硬化、冠狀動(dòng)脈疾病、心臟瓣膜疾病、心律不齊、心臟衰竭、高血壓、體位性低血壓、休克、心內(nèi)膜炎、主動(dòng)脈及其分支疾病、外圍血管系統(tǒng)失調(diào)以及先天性心臟疾病)以及炎癥或自身免疫性疾病(例如，風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎、多發(fā)性硬化)。術(shù)語“生物標(biāo)記”指的是任何可檢測的特征(例如，物理特征)或分子、其他化學(xué)物種(例如，離子)，或者是生物狀態(tài)(例如，疾病)或疾病敏感性或具有特定生物狀態(tài)的指示器或預(yù)測器的顆粒，或者是治療功效或安全指示器或預(yù)測器的顆粒。示范性生物標(biāo)記包括蛋白質(zhì)(例如，抗原或抗體)、碳水化合物、細(xì)胞、病毒、核酸(例如，在多態(tài)位點(diǎn)存在的核苷酸)，以及小有機(jī)分子或更普通的任何生物或細(xì)胞成分。生物標(biāo)記可以是生物標(biāo)記復(fù)合體。示范性生物標(biāo)記包括能夠被檢測或測量的病人描述符(例如，變量X和/或Y),或者能夠從在體內(nèi)或體外檢測或測量的病人描述符獲取的信號(hào)。示范性生物標(biāo)記還可以包括能夠在體內(nèi)或體外測量的任何疾病參數(shù)，或能夠從在體內(nèi)或體外測量的疾病參數(shù)獲取的信號(hào)；這樣的生物標(biāo)記通常是疾病狀態(tài)或疾病進(jìn)展的指示。術(shù)語“響應(yīng)者”指的是體驗(yàn)在給出閾值上方(包括在兩個(gè)閾值之間)的治療益處的病人?？梢愿鶕?jù)任何合適方式或標(biāo)準(zhǔn)定義閾值。正如本文所使用，“效果模型”指的是數(shù)學(xué)函數(shù)，其將針對(duì)個(gè)體群的治療益處描述為沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)和個(gè)體的一個(gè)或更多其它特征(例如，病人描述符)的函數(shù)。效果模型可以采用函數(shù)的形式，其將治療益處(Re-Rt)或治療結(jié)果的概率(Rt)描述為(i)取決于變量(Y)的沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(RC)和(i i)變量(X)的函數(shù)，其中變量(X)是除了包含在沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)中的特征之外的個(gè)體特征的矢量，以及其中所述變量(X)和(Y)可以是環(huán)境型、顯型(表現(xiàn)型)或基因型衍生變量。正如本文所使用，“正式治療模型”指的是包括藥理學(xué)模型和可選的 副作用模型(例如，毒理學(xué))的模型，藥理學(xué)模型可操作鏈接于整合感興趣事件作為輸出的病理生理學(xué)模型，副作用模型整合副作用和毒性效應(yīng)作為輸出。正如本文所使用，術(shù)語“機(jī)械模型”指的是描述系統(tǒng)，例如生物系統(tǒng)的特征或習(xí)性的計(jì)算模型，例如具有ー組差分方程的模型。機(jī)械模型可以是因果模型，其通常在數(shù)學(xué)關(guān)系中鏈接兩個(gè)或更多因果相關(guān)變量，其中數(shù)學(xué)關(guān)系反映影響這些變量的(若干)根本機(jī)制，例如生物機(jī)制。正如本文所使用，術(shù)語“病理生理學(xué)模型”指的是包括一個(gè)或更多過程(例如，生物過程)以表示健康體內(nèi)平衡動(dòng)態(tài)和體內(nèi)平衡改變，例如，表示疾病、表示生物狀態(tài)、疾病狀態(tài)的模型。1.0概述——組件和步驟在本節(jié)中描述本發(fā)明示范性系統(tǒng)的組件和步驟。正如將在節(jié)2. O (功能概述)中說明的，根據(jù)本發(fā)明的系統(tǒng)和方法不需要包括在節(jié)I. O中描述的所有組件和步驟。取決于所期望的特定應(yīng)用，可以組裝不同組件以產(chǎn)生實(shí)現(xiàn)特定目標(biāo)的系統(tǒng)。不同的這種系統(tǒng)的例子使用在節(jié)2. O提供的組件子集。圖I提供能夠?qū)崿F(xiàn)本文所述所有過程的系統(tǒng)和方法的概覽，其包括用于目標(biāo)和/或藥物發(fā)現(xiàn)、監(jiān)控進(jìn)展、可移植性研究、生物標(biāo)記發(fā)現(xiàn)和個(gè)性化醫(yī)療的方法。在概括描繪核心多功能系統(tǒng)的虛線內(nèi)指示組件；該系統(tǒng)包括病理生理學(xué)模型(網(wǎng)絡(luò)，塊101)、藥理學(xué)模型(PK/PD，塊102)、模擬的個(gè)體群(SPI，塊103)、效果模型(EM，塊104)、對(duì)個(gè)體群益處的計(jì)算(分別在塊105到108中的NEc、ΝΕΑ、NEAt以及BAtp)。應(yīng)當(dāng)明白根據(jù)要執(zhí)行的過程，不是所有組件是必需的。在核心系統(tǒng)外面示出的是可選部件數(shù)據(jù)庫(知識(shí)數(shù)據(jù)庫(塊109)、進(jìn)展數(shù)據(jù)庫(塊110)、臨床數(shù)據(jù)庫(塊111)以及病人描述符數(shù)據(jù)庫(塊112))、下行過程(目標(biāo)選擇(±夾113)、配合基選擇(塊114))、監(jiān)控進(jìn)展(塊115)、可移植性研究(塊116)以及個(gè)性化醫(yī)療(塊117))。應(yīng)當(dāng)明白這些可選部件可以單獨(dú)或一起包含在核心系統(tǒng)內(nèi)，但不是必須的。本發(fā)明不同過程的概述在圖2中示出。本發(fā)明的方法最低限度地包括(a)提供與效果模型關(guān)聯(lián)的治療，(b)為個(gè)體或個(gè)體群提供輸入，(C)計(jì)算治療益處，以及(d)輸出治療益處的指示器。在一個(gè)方面,該系統(tǒng)和方法包括(a)提供ー個(gè)或多個(gè)真實(shí)或模擬治療(T)，其中每個(gè)治療(T)與效果模型函數(shù)關(guān)聯(lián)，例如通過接收該函數(shù)與治療識(shí)別符作為輸入或在從關(guān)于治療的輸入信息導(dǎo)出該函數(shù)的步驟中，優(yōu)選地，其中所述函數(shù)將治療益處(Rc-Rt)或治療結(jié)果率(Rt)描述為取決于變量(Y)以及變量(X)的沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)的函數(shù)，其中變量(X)是除了包含在沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)中的特征之外的個(gè)體特征的矢量，以及其中所述變量(X)和(Y)可以是(若干)環(huán)境型、顯型或基因型衍生變量；(b)為ー個(gè)或更多個(gè)體(例如，真實(shí)病人、模擬個(gè)體群)提供病人描述符，其中每個(gè)體與風(fēng)險(xiǎn)(Re)和變量(X)關(guān)聯(lián)；(C)為所述(若干)個(gè)體的一個(gè)或更多所述治療(T)計(jì)算治療益處(作為Rc-Rt的函數(shù))；以及(d)輸出，優(yōu)選地給用戶顯示所述(若干)個(gè)體的治療益處(作為Rc-Rt的函數(shù))指
示器。 這樣的系統(tǒng)可以用作沒有額外部件的系統(tǒng)，例如本文描述的用于某些個(gè)性化醫(yī)療應(yīng)用。在個(gè)性化醫(yī)療應(yīng)用中，接收病人信息，計(jì)算治療益處以及輸出治療益處的指示器。在某些事物標(biāo)記識(shí)別或評(píng)估方法中，評(píng)估病人描述符對(duì)治療益處的效果，其中影響治療益處的描述符被識(shí)別為生物標(biāo)記(例如，治療功效的生物標(biāo)記)。根據(jù)使用情況，該系統(tǒng)和方法可以包括額外的部件或步驟。當(dāng)該系統(tǒng)用于目標(biāo)評(píng)價(jià)過程(例如，藥物篩選、生物目標(biāo)評(píng)價(jià)中)、監(jiān)控進(jìn)展、可移植性研究和某些個(gè)性化醫(yī)療應(yīng)用中吋，該系統(tǒng)會(huì)包括用于模擬個(gè)體群的輸入，其中甸個(gè)體與風(fēng)險(xiǎn)(Re)和變量(X)關(guān)聯(lián)。當(dāng)該系統(tǒng)用于目標(biāo)評(píng)價(jià)過程、監(jiān)控進(jìn)展、某些可移植性研究和某些個(gè)性化醫(yī)療應(yīng)用中吋，該系統(tǒng)會(huì)包括病理生理學(xué)模型。而且，在目標(biāo)評(píng)價(jià)過程的藥物篩選應(yīng)用中，在監(jiān)控進(jìn)展和某些可移植性研究中，該系統(tǒng)會(huì)包括正式治療模型。當(dāng)該系統(tǒng)用于識(shí)別或評(píng)估生物標(biāo)記的方法中吋，該系統(tǒng)會(huì)包括病理生理學(xué)模型，可選地，進(jìn)ー步包括用所有模型參數(shù)或變量的分布構(gòu)建的模擬個(gè)體群。在一個(gè)實(shí)施例中，在該方法和系統(tǒng)中，可以輸入、生成或接收與治療關(guān)聯(lián)的效果模型，以及可選地存儲(chǔ)該效果模型(例如，通過訪問與效果模型關(guān)聯(lián)的治療的數(shù)據(jù)庫)。在另ー個(gè)實(shí)施例中，與治療關(guān)聯(lián)的效果模型通過系統(tǒng)的方法在步驟中導(dǎo)出，步驟包括(i)輸入、生成或接收，以及可選地存儲(chǔ)用于治療T的信息，以及(ii)從所述信息導(dǎo)出用于治療的效果模型。該系統(tǒng)和方法的各個(gè)要素描述如下。I. I治療輸入和益處函數(shù)治療(T)可以是任何合適的治療。治療可以是真實(shí)治療或模擬治療。模擬治療的例子是ー個(gè)或更多生物成分(例如，生物過程的改變，生物目標(biāo)的改變，例如抑制或刺激)或生物系統(tǒng)的改變。真實(shí)治療通常包括來自其臨床和/或非臨床使用的信息可用的治療(例如，治療方法，藥物)。在本發(fā)明的方法和系統(tǒng)中，每個(gè)治療會(huì)與益處函數(shù)(術(shù)語“益處函數(shù)”在本文中也稱為“效果模型”)關(guān)聯(lián)，其將針對(duì)群體的治療益處描述為沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)和病人特征(X)的函數(shù)。效果模型(EM)在圖2的塊104a到104d中示出。合適的效果模型是描述治療益處(Rc-Rt)的函數(shù)，其將治療益處(Rc-Rt)描述為依賴于ー個(gè)或更多變量(Y)和變量(X)的沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)的函數(shù)，其中變量(X)是除了包含在沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)中的特征之外的個(gè)體特征的矢量，以及其中所述變量(X)和(Y)可以是(若干)環(huán)境型、顯型或基因型衍生變量。到本發(fā)明方法和系統(tǒng)中的針對(duì)治療的輸入可以包括治療描述符，其包括治療信息和/或用于治療的效果模型。應(yīng)當(dāng)明白可以基于針對(duì)治療的輸入信息由本發(fā)明的方法和系統(tǒng)獲取/導(dǎo)出效果模型。結(jié)果，除了通常包括的治療識(shí)別符以外，針對(duì)治療的輸入可以包括，關(guān)于無關(guān)聯(lián)效果模型的治療(例如來自流暢使用的結(jié)果)的信息，使得隨后由本發(fā)明的方法或系統(tǒng)生成效果模型并且該效果模型與該治療關(guān)聯(lián)。本文會(huì)進(jìn)ー步描述從不同類型信息獲取效果模型的方法。在另ー個(gè)實(shí)施例中，針對(duì)治療的輸入可以包括之前從治療信息獲取的效果模型；在本發(fā)明方法和系統(tǒng)的這個(gè)實(shí)施例中，不需要進(jìn)ー步獲取針對(duì)該治療的效果模型。關(guān)于治療的信息可以包括數(shù)據(jù)和/或治療描述符。例如數(shù)據(jù)的信息可以包括任何實(shí)驗(yàn)結(jié)果，例如來自體外分析(例如，功能分析，微陣列數(shù)據(jù)等)或體內(nèi)分析的信息，包括但不限于在生物成分或細(xì)胞成分或生物系統(tǒng)的功能上的治療效果、其治療目標(biāo)、藥理學(xué)信息等。信息還可以包括來自臨床使用的任何信息，包括但不限于臨床試驗(yàn)或臨床實(shí)踐中的應(yīng)用，例如和用于上市治療的情況一祥。因此，在任何實(shí)施例中，該方法可以可選地進(jìn)ー步包括獲得針對(duì)治療的實(shí)驗(yàn)結(jié)果的步驟以及可選地存儲(chǔ)所述結(jié)果。接著，該實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)被整合為 本發(fā)明方法和系統(tǒng)的輸入。在許多情況下，通過利用例如MedLine(聯(lián)機(jī)醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)分析和檢索系統(tǒng))、Chemical Abstracts (化學(xué)文摘)、Biosis Previews (生物文摘)等的允許大量科學(xué)雜志或摘要，例如Science (《科學(xué)》)、Nature (《自然》)、Proceedings of the NationalAcademy of Sciences (《美國國家科學(xué)院學(xué)報(bào)》)的計(jì)算機(jī)搜索的搜索工具以及“讀取”和分析出版物以提取數(shù)據(jù)的任何搜索引擎，可以從科學(xué)出版物獲得關(guān)于治療的信息的包括。信息源還包括任何公共數(shù)據(jù)庫、私有數(shù)據(jù)庫以及例如在特定實(shí)驗(yàn)室內(nèi)開發(fā)和只限于該特定實(shí)驗(yàn)室的保密數(shù)據(jù)的專有數(shù)據(jù)。用于治療的信息可以替代地或額外包括來自病理生理學(xué)模型或正式治療模型的輸出。因此，在任何實(shí)施例中，該方法可選地可以進(jìn)一歩包括將治療模型化或建模為病理生理學(xué)模型或正式治療模型的步驟(即，運(yùn)行模型)，以及可選地存儲(chǔ)所述結(jié)果。在包括來自臨床使用、來自病理生理學(xué)模型或正式治療模型的信息的情況下，信息通常包括用于ー個(gè)或更多以治療方案治療的病人的病人描述符以及針對(duì)(若干)個(gè)體的結(jié)果(例如，醫(yī)療結(jié)果、感興趣事件的發(fā)生)。在信息來自臨床使用的情況下，病人優(yōu)選地是真實(shí)病人。在信息是來自病理生理學(xué)模型或正式治療模型的輸出的情況下，病人可以是模擬的，優(yōu)選地作為疾病模型。模擬治療通常包括可用信息是僅僅來自模擬或主要來自模擬的治療，其中可用信息沒有來自例如實(shí)驗(yàn)或臨床實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù)。模擬治療可以被表示為感興趣生物目標(biāo)的改變；該改變可以表示模擬治療的治療目標(biāo)或由模擬治療造成的非直接效果。改變生物目標(biāo)的步驟在組件“病理生理學(xué)模型”下討論。病理生理學(xué)模型產(chǎn)生能夠被用于獲取治療的效果模型的治療信息。病人描述符會(huì)優(yōu)選地包括Ca)與整合在沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)中的感興趣結(jié)果(事件)的發(fā)生(其被稱為“風(fēng)險(xiǎn)因子”)相關(guān)的(若干)變量(Y)，和/或(b)與沒有整合在Re中的益處強(qiáng)度相關(guān)的(若干)變量(X)。與益處強(qiáng)度相關(guān)的(若干)變量(X)可選地與治療描述符(例如，體重，其調(diào)整藥物的分布容積)相互作用。與益處強(qiáng)度相關(guān)的(若干)變量(X)的例子包括身體質(zhì)量指數(shù)(體重指數(shù))、酶活性、血壓、ー個(gè)或ー組基因等位基因、靜止和/或刺激(例如，飯后，服藥或其他調(diào)整等)后的任何生物成分水平或任何習(xí)性或環(huán)境分量。與結(jié)果的發(fā)生相關(guān)的(若干)變量(Y)的例子包括血總膽固醇、血壓、年齡、性別、習(xí)性或環(huán)境分量例如抽煙或過去抽煙、體育鍛煉等。在一個(gè)實(shí)施例中，病人描述符是生物標(biāo)記。在這樣的實(shí)施例中，生物標(biāo)記可以是能夠被檢測或測量的病人描述符(例如，X和/或Y)，或者是從能夠在體內(nèi)或體外檢測或測量的病人描述符獲取的信號(hào)。當(dāng)這樣的生物標(biāo)記可以是當(dāng)從X和Y導(dǎo)出時(shí)，由治療給出的益處大小的預(yù)測器，或在僅從Y導(dǎo)出時(shí)，是疾病(例如，疾病狀態(tài)、進(jìn)展、嚴(yán)重度等)的預(yù)測器。在一個(gè)例子中，病人描述符是根據(jù)節(jié)I. I. I (疾病的新生物標(biāo)記的識(shí)別)的方法識(shí)別的生物
ο 應(yīng)當(dāng)明白本發(fā)明的方法和系統(tǒng)可以用于對(duì)任何醫(yī)藥產(chǎn)品建摸，以及更一般用于建模任何治療。能夠體現(xiàn)治療的藥物例子包括，例如5 α還原酶抑制劑，5氨基水楊酸，5ΗΤ3受體拮抗劑，金剛烷抗病毒藥物，腎上腺皮質(zhì)類固醇，腎上腺皮質(zhì)激素抑制劑，腎上腺素能支氣管擴(kuò)張劑，高血壓急癥試劑，肺動(dòng)脈高壓試劑，醛固酮受體拮抗劑，烷化劑，α -腎上腺素受體拮抗劑，α -葡萄糖苷酶抑制劑，替代藥物，抗阿米巴藥，氨基糖甙類，氨基青霉素，氨基水楊酸鹽，胰淀素類似物，鎮(zhèn)痛藥組合，鎮(zhèn)痛藥，雄激素和合成代謝類固醇，血管緊張素轉(zhuǎn)化酶抑制劑，血管緊張素Π抑制劑，肛用制劑，厭食藥物，抗酸劑，驅(qū)腸蟲劑，抗血管生成的眼科劑，單克隆抗體，抗感染藥，抗腎上腺素能藥物、作用于中樞，抗腎上腺素能藥物、作用于周圍的，抗雄激素，抗心絞痛藥物，抗心律失常藥物，平喘組合，抗生素/抗腫瘤藥物，抗膽堿能止吐藥，抗膽堿抗帕金森氏病藥物，抗膽堿能支氣管擴(kuò)張劑，抗膽堿能變時(shí)性藥物，抗膽堿能藥/抗痙攣藥，止瀉藥，抗利尿激素，解毒剤，鎮(zhèn)吐抗眩藥，抗真菌藥物，抗促性腺激素試劑，抗痛風(fēng)藥物，抗組胺劑，降血脂藥物，降血脂組合，抗高血壓藥物組合，抗高尿酸血癥藥物，抗瘧藥物，抗瘧藥物組合，抗瘧藥喹啉，抗代謝物，抗偏頭痛藥，抗腫瘤藥物解毒剤，抗腫瘤藥物干擾素，抗腫瘤單克隆抗體，抗腫瘤藥物，抗帕金森氏病藥物，抗血小板藥，抗假單胞菌青霉素，抗銀屑病，抗精神病藥，治風(fēng)濕藥，防腐劑和殺菌劑，抗甲狀腺藥，抗毒素及抗毒血清，抗結(jié)核藥物，抗結(jié)核組合，鎮(zhèn)咳藥，抗病毒藥，抗病毒藥物組合，抗病毒干擾素，抗焦慮藥，鎮(zhèn)靜藥，以及催眠藥，芳香化酶抑制劑，非典型抗精神病藥物，唑類抗真菌藥物，細(xì)菌性疫苗，巴比妥類抗驚厥藥，巴比妥酸，BCR-ABL酪氨酸激酶抑制劑，苯ニ氮卓類抗驚厥藥，苯ニ氮卓類藥物，腎上腺素受體阻斷劑，內(nèi)酰胺酶抑制劑，膽汁酸多價(jià)螯合剤，生物制品，ニ膦酸鹽，骨吸收抑制劑，支氣管擴(kuò)張劑組合，支氣管擴(kuò)張劑，降血鈣素，鈣通道阻斷劑，氨基甲酸酯抗驚厥藥，碳青霉烯類，碳酸酐酶抑制劑抗驚厥藥，碳酸酐酶抑制劑，心臟強(qiáng)調(diào)劑，心臟選擇性受體阻滯劑，心血管藥物，兒茶酚胺，CD20單克隆抗體，CD33單克隆抗體，CD52單克隆抗體，CTLA4抗體，中樞神經(jīng)系統(tǒng)藥物，先鋒霉素族抗菌素，耵聹溶解齊U，螯合劑，趨化因子受體拮抗劑，氯離子通道激活劑，膽固醇吸收抑制劑，膽堿能激動(dòng)劑，膽堿能神經(jīng)肌肉興奮劑，膽堿酯酶抑制劑，中樞神經(jīng)興奮劑，凝血改性劑，集落刺激因子，避孕劑，促腎上腺皮質(zhì)激素，香豆素和茚ニ酮，C0X-2抑制劑，解充血藥，皮膚病藥物，診斷用放射性藥物，ニ苯并氮雜抗驚厥藥，消化酶，ニ肽基肽酶4抑制劑，利尿剤，多巴胺能抗帕金森藥物，用于酒精依賴的藥物，棘白菌素，表皮生長因子受體抑制劑，雌激素受體拮抗劑，雌激素，祛痰劑，因子Xa抑制劑，脂肪酸衍生物抗驚厥藥，纖維酸衍生物，第一代頭孢菌素，第四代頭孢菌素，功能性腸紊亂劑，膽石溶解劑，Y-氨基丁酸類似物，Y-氨基丁酸再攝取抑制劑，Y-氨基丁酸轉(zhuǎn)氨酶抑制劑，胃腸藥，全身麻酔藥，泌尿生殖道感染劑，GI興奮劑，糖皮質(zhì)激素，血糖升高劑，糖肽類抗生素，糖蛋白血小板抑制劑，替加環(huán)素，促性腺激素釋放激素，促性腺激素釋放激素拮抗劑，促性腺激素類，組I、II、III、IV或V抗心律失常藥，生長激素受體阻滯劑，生長激素，幽門螺旋桿菌根除劑，H2受體拮抗劑，造血干細(xì)胞剝離器，肝素拮抗藥，肝素，HER2抑制劑，中藥產(chǎn)品，組蛋白去こ?；敢种苿に靥娲煼?，激素，激素類/抗腫瘤藥物，こ內(nèi)酰脲抗驚厥藥，非法(街道)藥物，免疫球蛋白，免疫劑，免疫抑制劑，陽痿藥物，體內(nèi)診斷試劑，腸促胰島素類似物，吸入抗感染藥物，吸入糖皮質(zhì)激素，正性肌力藥，胰島素，胰島素樣生長因子，整合酶鏈轉(zhuǎn)移抑制劑，干擾素類，靜脈營養(yǎng)產(chǎn)品，碘造影剤，離子碘造影剤，鐵制品，酮內(nèi)酯類抗菌藥，瀉藥，制麻風(fēng)[菌]苗，白三烯調(diào)節(jié)劑，林可霉素的衍生物，脂糖肽類，局部注射的麻醉劑，髓袢利尿剤，肺表面活性剤，淋巴染色劑，溶酶體酶，大環(huán)內(nèi)酯衍生物，大環(huán)內(nèi)酯類，磁共振成像造影介質(zhì)，肥大細(xì)胞穩(wěn)定劑，醫(yī)用氣體，氯茴苯酸類，代謝劑，甲基黃嘌呤，鹽皮質(zhì)激素，礦物質(zhì)和電解質(zhì)，雜劑，雜項(xiàng)止痛藥，雜項(xiàng)抗生素，雜項(xiàng)抗驚厥藥，雜項(xiàng)類抗抑郁藥，雜項(xiàng)降糖藥，雜項(xiàng)止吐藥，雜項(xiàng)抗真菌藥物，雜項(xiàng)降血脂劑， 雜項(xiàng)抗瘧藥物，雜項(xiàng)抗腫瘤藥物，雜項(xiàng)抗帕金森氏病藥物，雜項(xiàng)抗精神病藥物，雜項(xiàng)抗結(jié)核藥物，雜項(xiàng)抗病毒藥物，雜項(xiàng)抗焦慮藥、鎮(zhèn)靜劑和安眠藥，雜項(xiàng)生物制品，雜項(xiàng)骨吸收抑制齊U，雜項(xiàng)心血管藥物，雜項(xiàng)中樞神經(jīng)系統(tǒng)藥物，雜項(xiàng)凝血調(diào)節(jié)劑，雜項(xiàng)利尿剤，泌尿生殖系統(tǒng)的其它藥物，雜項(xiàng)GI試劑，雜項(xiàng)激素，雜項(xiàng)代謝劑，雜項(xiàng)眼科藥物，雜項(xiàng)滴耳劑，雜項(xiàng)呼吸系統(tǒng)藥物，雜項(xiàng)性激素，雜項(xiàng)外用制劑，雜項(xiàng)未分類試劑，雜項(xiàng)陰道用藥，有絲分裂抑制劑，單胺氧化酶抑制劑，單克隆抗體，口腔和咽喉產(chǎn)品，mTOR抑制劑，mTOR激酶抑制劑，黏液溶解齊IJ，多激酶抑制劑，肌肉松弛劑，擴(kuò)瞳劑，麻醉性鎮(zhèn)痛藥組合，麻醉性鎮(zhèn)痛藥，鼻抗感染藥，鼻抗組胺藥和減充血?jiǎng)?，鼻潤滑和沖洗剤，滴鼻劑，鼻腔類固醇，天然青霉素，神經(jīng)氨酸酶抑制齊U，神經(jīng)肌肉阻斷劑，新一代頭孢菌素，煙酸衍生物，硝酸鹽，非核苷類逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑，非心臟選擇性β -受體阻滯劑，非碘造影剤，非離子型碘化造影介質(zhì)，非磺脲類藥物，非甾體抗炎劑，去甲腎上腺素再攝取抑制劑，去甲腎上腺素-多巴胺的再攝取抑制劑，核苷類逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑(NRTIs)，保健產(chǎn)品，營養(yǎng)產(chǎn)品，眼科麻醉劑，眼科抗感染藥，眼科抗炎劑，眼科抗組胺藥和減充血?jiǎng)?，眼科診斷試劑，眼科青光眼藥物，眼科潤滑和沖洗剤，眼用制劑，眼科類固醇，眼科抗感染類固醇，眼科手術(shù)劑，ロ服營養(yǎng)補(bǔ)充劑，耳部麻酔剤，耳部抗感染藥，耳部制劑，耳部類固醇，耳部抗感染類固醇，惡唑烷ニ酮抗驚厥藥，甲狀旁腺激素和類似物，青霉素酶耐青霉素，青霉素類，外圍類鴉片受體拮抗劑，周圍血管擴(kuò)張藥，外周作用抗肥胖劑，吩噻嗪類止吐藥，吩噻嗪類抗精神病藥物，苯基哌嗪類抗抑郁藥，血漿增容劑，血小板聚集抑制劑，血小板刺激剤，多烯類抗菌素，保鉀利尿剤，益生菌，孕激素受體調(diào)節(jié)劑，孕激素類，催乳激素抑制劑，前列腺素D2受體拮抗劑，蛋白酶抑制劑，質(zhì)子泵抑制劑，補(bǔ)骨脂素，心理治療劑，心理治療組合，嘌呤核苷，吡咯烷抗驚厥藥，喹諾酮類，造影剤，放射性添加剤，放射齊[J，放射性共軛試劑，放射性藥劑，RANK配體抑制劑，重組人促紅細(xì)胞生成素，腎素抑制劑，呼吸系統(tǒng)藥物，呼吸道吸入性產(chǎn)品，利福霉素衍生物，水楊酸鹽，硬化劑，第二代頭孢菌素，選擇性雌激素受體調(diào)節(jié)劑，選擇性5-羥色胺再攝取抑制劑，五羥色胺去甲腎上腺素再攝取抑制劑，羥色胺能神經(jīng)消化管調(diào)制器，性激素組合，性激素，骨骼肌松弛劑組合，骨骼肌松弛齊 ，戒煙劑，生長抑素及生長抑素類似物，殺精子劑，他汀類藥物，無菌沖洗液，鏈霉菌衍生工具，琥珀酰亞胺基碳酸酯抗驚厥藥，磺胺類藥，磺脲類藥物，合成排卵興奮劑，四環(huán)類抗抑郁藥，四環(huán)素類，治療用放射性藥物，噻嗪類利尿剤，噻唑烷ニ酮類，ニ甲基噻吩，第三代頭孢菌素，凝血酶抑制劑，溶栓劑，甲狀腺藥物，宮縮劑，外用痤瘡劑，外用制劑，局部麻酔劑，外用抗感染藥物，外用抗生素，外用抗真菌藥物，局部抗組胺藥，外用抗牛皮癬藥，外用抗病毒藥物，外用收斂劑，局部清創(chuàng)劑，外用脫色剤，外用潤膚劑，外敷角質(zhì)層試劑，外用類固醇，外用類固醇與抗感染藥，類毒素，三嗪抗驚厥藥，三環(huán)類抗抑郁藥，三官能單克隆抗體，腫瘤壞死因子(TNF)抑制劑，酪氨酸激酶抑制劑，超聲對(duì)比介質(zhì)，上呼吸道疾病組合用藥，尿素抗驚厥藥，泌尿系統(tǒng)抗感染藥，尿解痙劑，尿PH值調(diào)節(jié)劑，宮縮劑，疫苗，疫苗組合，陰道抗感染藥，陰道用制劑，血管擴(kuò)張劑，后葉加壓素受體拮抗劑，血管升壓類藥物，VEGF/VEGFR抑制齊U，病毒疫苗，黏劑，維生素和礦物質(zhì)組合以及維生素。I. I. I疾病的新生物標(biāo)記的識(shí)別(X，Y)在某些實(shí)施例中，提供識(shí)別用于本文進(jìn)ー步描述的系統(tǒng)和方法中的生物標(biāo)記的可選步驟。在其他實(shí)施例中，獨(dú)立于本文所述的任何系統(tǒng)和方法，可以單獨(dú)使用識(shí)別生物標(biāo)記的方法。當(dāng)從X，Y獲取生物標(biāo)記時(shí)，生物標(biāo)記可以是疾病(例如，疾病狀態(tài)、進(jìn)展、嚴(yán)重度等)·的預(yù)測器。雖然許多這樣的生物標(biāo)記以及它們與疾病的相關(guān)性以及由此沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)在本領(lǐng)域是眾所周知的，但是識(shí)別還未知是與感興趣的疾病狀態(tài)相關(guān)的新生物標(biāo)記是有用的。在ー個(gè)方面，本文提供識(shí)別后續(xù)可以用作為本發(fā)明方法中的變量X的這種生物標(biāo)記的方法。生物標(biāo)記和用于其識(shí)別的方法因此特別適合用于使用病人描述符(特別是描述符X)的本發(fā)明更廣泛方法中。該方法使用如節(jié)I. 2所述的病理生理學(xué)模型，以便評(píng)估病理生理學(xué)模型的組件和疾病狀態(tài)之間的相關(guān)性。病理生理學(xué)模型包括組件和/或組件之間的相互關(guān)系，其組件或相互關(guān)系代表病人描述符(尤其是描述符X，以及描述符Y)，并且這些描述符因此是候選生物標(biāo)記。病理生理學(xué)模型針對(duì)風(fēng)險(xiǎn)因子矢量(Y)內(nèi)不同分量和其他描述符X的組合或風(fēng)險(xiǎn)因子矢量(Y，x)內(nèi)多個(gè)分量的不同值和其他疾病相關(guān)分量X的組合運(yùn)行。運(yùn)行病理生理學(xué)模型會(huì)計(jì)算分量值的每個(gè)組合的感興趣事件風(fēng)險(xiǎn)(發(fā)生的可能性)，并且會(huì)從這樣的計(jì)算產(chǎn)生一組輸出信息。感興趣事件可以是任何合適的參數(shù)，例如疾病狀態(tài)、進(jìn)展、嚴(yán)重度等的指示器。接著，可以利用統(tǒng)計(jì)方法評(píng)估該結(jié)果以識(shí)別與感興趣疾病狀態(tài)相關(guān)的那些生物標(biāo)記。在這樣的情況下，生物標(biāo)記將是病理生理學(xué)模型的組件；優(yōu)選地，這些生物標(biāo)記會(huì)進(jìn)ー步對(duì)應(yīng)于能夠在體內(nèi)或體外被檢測或測量的病人描述符。因此，在ー個(gè)方面，本發(fā)明提供識(shí)別疾病的生物標(biāo)記的方法，該方法包括(a)運(yùn)行病理生理學(xué)模型，該模型包括一個(gè)或多個(gè)組件或病理生理學(xué)模型組件之間的相互關(guān)系，這些組件或相互關(guān)系代表候選生物標(biāo)記，并且其中該病理生理學(xué)模型生成針對(duì)每個(gè)候選生物標(biāo)記或生物標(biāo)記組合(或與每個(gè)候選生物標(biāo)記關(guān)聯(lián)的值)的感興趣事件可能性；以及(b)識(shí)別與感興趣事件的増加或減少的可能性相關(guān)的生物標(biāo)記或生物標(biāo)記組合。其中所述相關(guān)的生物標(biāo)記或生物標(biāo)記組合被確定為疾病的生物標(biāo)記(例如，疾病狀態(tài)的生物標(biāo)記，進(jìn)展、嚴(yán)重度)?？蛇x地，該方法進(jìn)ー步包括由本發(fā)明的結(jié)果處理系統(tǒng)計(jì)算治療益處，其中所述生物標(biāo)記是包含在個(gè)體特征的矢量內(nèi)，所述個(gè)體特征包含在沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)中(變量(Y))。I. I. 2益處函數(shù)可以與效果模型一起輸入治療信息(例如，數(shù)據(jù)，治療描述符)或在沒有該效果模型的情況下輸入該治療信息，用于特定治療。在一個(gè)實(shí)施例中，輸入包括效果模型；在這樣的情況下，除了效果模型以外，治療信息可以是最低程度的，例如，除了效果模型以外，該治療的識(shí)別符就是最低程度需要的全部。在另ー個(gè)實(shí)施例中，輸入治療信息，并且通過從用于每個(gè)治療的信息導(dǎo)出效果模型來獲得效果模型。在后一實(shí)施例中，用于治療的信息通常包括臨床數(shù)據(jù)，來自病理生理學(xué)模型或正式治療模型的輸出?？梢酝ㄟ^任何合適的方法提供治療信息，例如，通過輸入裝置輸入或通過從數(shù)據(jù)庫接收輸入來輸入?？蛇x地，本發(fā)明的系統(tǒng)包括數(shù)據(jù)庫，所述數(shù)據(jù)庫包括一個(gè)或多個(gè)治療以及用于每個(gè)治療的信息，其中這樣的信息包括效果模型和/或與治療目標(biāo)、體內(nèi)試驗(yàn)、體外試驗(yàn)結(jié)果或臨床使用結(jié)果相關(guān)的信
息。優(yōu)選地，信息將包括變量(例如，X，Y);例如，臨床使用的結(jié)果會(huì)包括針對(duì)以治療T進(jìn)行治療的病人的結(jié)果(例如，感興趣事件的發(fā)生)和描述病人特征的病人描述符(X)和(Y)，其中病人描述符(X)和(Y)是環(huán)境型、顯型或基因型衍生變量。效果模型在感興趣事件的發(fā)生方面表述治療益處。期望的治療效果通常是風(fēng)險(xiǎn)降低或感興趣的(若干)相反或不需要事件的發(fā)生(例如，死亡和/或發(fā)病、有關(guān)的易感性或指示它的任何參數(shù))的減少，例如可能由疾病造成的情況。在心絞痛的例子中，某人可能想降低胸疼發(fā)生的可能性。在這個(gè)例子中，使用效果模型，其中Re是若個(gè)體不接收治療T時(shí)這些個(gè)體中這個(gè)臨床事件(胸疼)的頻率。在相同時(shí)間段期間，在相同但是已治療的對(duì)象中，頻率變成Rt。這兩個(gè)頻率之間的關(guān)系取決于治療、疾病和治療目的，即針對(duì)功效選擇的感興趣“事件”(通常是臨床標(biāo)準(zhǔn))，例如胸疼、突然死亡、心腦血管疾病情況下的心肌梗塞。感興趣事件可以是任何期望的可檢測事件，包括但不限于任何臨床可觀察的現(xiàn)象或任何可檢測量度(例如，生物標(biāo)記)或?qū)е屡R床可觀察過程的底層生物機(jī)制。該事件可以是如同臨床事件(例如，中風(fēng)、死亡等)是否發(fā)生，或任何定量閾值或定性閾值(例如，腫瘤生長、進(jìn)展或復(fù)原、腫瘤體積、新的腫瘤形成、生物標(biāo)記水平或生物成分水平、可選地在器官中或在循環(huán)中、rADCw水平、基因表達(dá)、激素水平、生活質(zhì)量量表評(píng)分等)的發(fā)生ー樣那樣簡單。Rt與Re之間關(guān)系的形式由下列方程式表示Rt=f (Re, T, x),其中T指示其是依賴治療的，以及X是除了與Re相關(guān)的那些個(gè)體特征之外的與Rt相關(guān)的個(gè)體特征的矢量。X可以是顯型或基因型衍生變量。某些可以被個(gè)體的環(huán)境改變。從這樣的關(guān)系，導(dǎo)出RC-Rt=g (Rc，T，X)，這個(gè)函數(shù)給出絕對(duì)益處，就是說，病人(Rc，X)所期望的從T獲得的好處。用于導(dǎo)出針對(duì)治療T的基于治療信息的效果模型的方法將取決于為治療提供的信息。通常，通過將ー個(gè)或更多回歸方法應(yīng)用于可用數(shù)據(jù)可以導(dǎo)出效果模型，其中可用數(shù)據(jù)包括但不限干，廣義線性和非線性回歸、邏輯和泊松回歸、監(jiān)瞀的機(jī)器學(xué)習(xí)算法(例如，ネ申經(jīng)網(wǎng)絡(luò)、支持向量機(jī))，以及其他方法(響應(yīng)面建模、多元自適應(yīng)回歸樣條函數(shù))。I.從臨床數(shù)據(jù)導(dǎo)出效果模型在由某些可移植性研究方法或個(gè)性化醫(yī)療方法示例的一個(gè)實(shí)施例中，治療與從臨床治療的使用產(chǎn)生的信息關(guān)聯(lián)。在這個(gè)實(shí)施例中，被治療個(gè)體的治療效果(例如，在感興趣事件的發(fā)生方面)可以與未治療個(gè)體的治療效果作比較；提供來自臨床試驗(yàn)的數(shù)據(jù)(例如，病人描述符和針對(duì)每個(gè)體的醫(yī)療結(jié)果)并應(yīng)用回歸技木，以便估計(jì)治療的效果模型，即給出針對(duì)群體的每個(gè)體的益處Rc_Rt=f (Re, X)的函數(shù)。2.從病理生理學(xué)模型導(dǎo)出效果模型在由目標(biāo)評(píng)價(jià)方法示例的一個(gè)實(shí)施例中，通過病理生理學(xué)模型的使用對(duì)治療效果建摸。在這樣的情況下，治療信息通常包括關(guān)于感興趣事件發(fā)生的可能性的信息。例子包括改變?cè)诓±砩韺W(xué)模型中的生物目標(biāo)，改變代表會(huì)促使這種改變的治療。在待評(píng)估生物目標(biāo)的這個(gè)實(shí)施例中，代表第一生物狀態(tài)(例如疾病狀態(tài))的未改變病理生理學(xué)模型的效果(例如，在感興趣事件的發(fā)生方面)可以與包括所述改變的已更改病理生理學(xué)模型作比較，優(yōu)選地，在真實(shí)或虛擬個(gè)體群的每種情況下，考慮(若干)變量。接著，回歸技術(shù)可以被應(yīng)用于沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)和治療益處(Rt)的ニ維數(shù)據(jù)集，以便估計(jì)治療的效果模型，即給出每個(gè)個(gè)體的益處Rc-Rt=f (Rc，X)的函數(shù)。在簡化情況下，可以通過數(shù)學(xué)解決描述病理生理學(xué)模型的方程組獲得效果模型。因此，產(chǎn)生的益處將描述通過改變生物目標(biāo)預(yù)測的益處，允許評(píng)估生理作用和生物目標(biāo)的治療可能性。 3.從正式治療模型導(dǎo)出效果模型在由進(jìn)展監(jiān)控方法示例的另ー個(gè)實(shí)施例中，為藥理學(xué)信息是可用或模擬的治療輸入信息。在這樣的實(shí)施例中，輸入藥理信息，以及在正式治療模型中對(duì)治療建模，正式治療模型包括藥理學(xué)模型和病理生理學(xué)模型以及(若干)變量。在沒有治療情況下的病理生理學(xué)模型結(jié)果(例如，在感興趣事件的發(fā)生方面)可以與由治療修改的病理生理學(xué)模型效果作比較；接著，回歸技術(shù)可以應(yīng)用于沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)和治療益處(Rt)的ニ維數(shù)據(jù)集，以便估計(jì)治療的效果模型，即為群體的每個(gè)個(gè)體給出益處Rc_Rt=f (Re, X)的函數(shù)。應(yīng)當(dāng)明白，可選地，在使用包括正式治療模型的方法或系統(tǒng)時(shí)的任何步驟，可以執(zhí)行提供臨床數(shù)據(jù)并利用所述數(shù)據(jù)修改正式治療模型的步驟。這樣的步驟將通過比較結(jié)果和來自從臨床數(shù)據(jù)獲得的正式治療模型結(jié)果的益處具有確認(rèn)和改善正式治療模型精度的效果。這樣的步驟可以包括將從正式治療模型計(jì)算的效果模型與從臨床數(shù)據(jù)導(dǎo)出的效果模型作比較。該比較考慮公式和包含的變量。可以探究任何差異。通常假設(shè)從正式治療模型計(jì)算的效果模型比從臨床數(shù)據(jù)計(jì)算的效果模型更接近現(xiàn)實(shí)。該比較專注于包含在從臨床數(shù)據(jù)導(dǎo)出的效果模型中并且不包含在從正式治療模型導(dǎo)出的效果模型中的變量，或反之亦然。接著，若個(gè)體或群體益處的精度被提高和/或若其具有很強(qiáng)的生物相關(guān)性，那么這些變量包含在后一模型中并且被集成或者保持在正式治療模型中。I. 2病理生理學(xué)模型在某些實(shí)施例中，例如用于目標(biāo)評(píng)估、監(jiān)控進(jìn)展、可移植性研究和個(gè)性化醫(yī)療的某些方法中使用病理生理學(xué)模型。優(yōu)選地，病理生理學(xué)模型解釋生物機(jī)制上全部可用知識(shí)或生物機(jī)制上可用知識(shí)的預(yù)期選擇部分，其中生物機(jī)制引起疾病并且將整合臨床可觀察結(jié)果作為輸出。病理生理學(xué)模型可以是包括具有或不具有數(shù)學(xué)、邏輯、數(shù)值和/或計(jì)算機(jī)化儀器的邏輯形式集合的模型，其中數(shù)學(xué)、邏輯、數(shù)值和/或計(jì)算機(jī)化儀器代表用于描述疾病狀態(tài)的動(dòng)態(tài)習(xí)性的邏輯形式。病理生理學(xué)模型優(yōu)選是疾病模型。在病理生理學(xué)模型中表示的過程可以包括任何臨床可觀察現(xiàn)象或引起臨床可觀察過程的底層生物機(jī)制，無論生物機(jī)制自身在臨床設(shè)置中是否易于測量。過程的非限制性例子包括任何生物過程；藥物到受體的結(jié)合(包括，例如結(jié)合常數(shù))；特定化學(xué)反應(yīng)的催化作用，例如酶促反應(yīng)(包括，例如這種反應(yīng)的速率)；細(xì)胞成分例如分子或分子復(fù)合物的合成或退化(包括，例如這種合成或退化的速率)；細(xì)胞成分的修改，例如蛋白質(zhì)的磷酸化或糖基化(包括，例如這種磷酸化或糖基化的速率)；細(xì)胞的增殖、活化、運(yùn)動(dòng)或遷移或細(xì)胞的死亡；任何分子(例如，離子、水、任何化學(xué)反應(yīng)分子，蛋白質(zhì)等)的流動(dòng)及類似過程。圖2的塊IOla到IOld表示病理生理學(xué)模型，其代表包括定性和/或定量相互作用網(wǎng)絡(luò)的生物系統(tǒng)，該網(wǎng)絡(luò)聯(lián)系生物成分和細(xì)胞成分，其中生物成分和細(xì)胞成分描述生物過程、器官、組織和/或身體組分。病理生理學(xué)模型與個(gè)體參數(shù)和/或變量以及風(fēng)險(xiǎn)因子關(guān)聯(lián)。風(fēng)險(xiǎn)因子(Y)被匯總到Re，即感興趣結(jié)果的風(fēng)險(xiǎn)(例如，不良健康事故的頻率)中。進(jìn)一步地，對(duì)于Y，個(gè)體參數(shù)/變量由X表示，其中X是個(gè)體內(nèi)變化性的矢量。因此，X代表除 了包含在Re中的特征之外的個(gè)體特征，以及其中X，像Y—樣，可以是環(huán)境型、顯型或基因型衍生變量。病理生理學(xué)模型通常包括機(jī)械模型。病理生理學(xué)模型可以替代地包括經(jīng)驗(yàn)?zāi)Ｐ秃?或現(xiàn)象模型，或附加包括經(jīng)驗(yàn)?zāi)Ｐ秃?或現(xiàn)象模型。病理生理學(xué)模型的例子包括描述生物過程的模型以及描述生物系統(tǒng)之間的相互作用而不描述底層生物過程的現(xiàn)象模型。應(yīng)當(dāng)明白，病理生理學(xué)模型可以但是不需要模擬整個(gè)人或包含多器官的系統(tǒng)，但是可以模擬至少一個(gè)生理過程，例如包含在疾病過程中的步驟或幾個(gè)步驟。根據(jù)應(yīng)用，只要這樣的模擬允許預(yù)測事件風(fēng)險(xiǎn)，病理生理學(xué)模型可以，例如模擬一個(gè)或更多組細(xì)胞、組織、一個(gè)或更多器官等。在病理生理學(xué)模型中表示的生物過程可以包括，例如信號(hào)發(fā)送和控制通道。這種通道的生物成分包括，例如，主要或中間信號(hào)發(fā)送分子以及通常表征這些通道的、參與信號(hào)發(fā)送或控制級(jí)聯(lián)的蛋白質(zhì)。對(duì)于信號(hào)發(fā)送通道，信號(hào)發(fā)送分子到受體的結(jié)合能夠直接影響中間信號(hào)發(fā)送分子的數(shù)量，并且能夠非直接影響通道蛋白質(zhì)的磷酸化程度(或其他修改)。信號(hào)發(fā)送分子的結(jié)合可以通過，例如，影響細(xì)胞的轉(zhuǎn)換習(xí)性來影響細(xì)胞蛋白質(zhì)的活動(dòng)。這些細(xì)胞蛋白質(zhì)往往是由信號(hào)啟動(dòng)的細(xì)胞事件的重要效應(yīng)器?？刂仆ǖ?，例如，那些控制細(xì)胞周期的定時(shí)和發(fā)生的控制通道與信號(hào)發(fā)送通道共享某些類似點(diǎn)。這里，多個(gè)細(xì)胞事件并且常常不間斷的細(xì)胞事件暫時(shí)協(xié)調(diào)，常常具有反饋控制，以實(shí)現(xiàn)結(jié)果，例如帶染色體分離的細(xì)胞分裂。這種暫時(shí)協(xié)調(diào)是控制通道機(jī)能的結(jié)果，其中控制通道常常由蛋白質(zhì)在彼此的修改或活化(例如，磷酸化)程度上的相互影響調(diào)解。其他控制通道可以包括面對(duì)不斷變化的環(huán)境，能夠?qū)で缶S持最佳細(xì)胞代謝水平的通道。病理生理學(xué)模型可以是利用一組數(shù)學(xué)關(guān)系表示生理系統(tǒng)的一組生物過程的數(shù)學(xué)模型。例如，該模型可以利用第一數(shù)學(xué)關(guān)系表示第一生物過程，以及利用第二數(shù)學(xué)關(guān)系表示第二生物過程。數(shù)學(xué)關(guān)系通常包括一個(gè)或更多變量，可以由模型模擬的行為(例如，時(shí)間演化)。尤其是，該模型的數(shù)學(xué)關(guān)系能夠定義變量之中的相互作用，其中所述變量能夠代表生理系統(tǒng)的各種生物成分的水平或活動(dòng)，以及各種生物成分的組合體或凝聚體表示的水平或活動(dòng)。模型通常包括影響包含在模型中變量的行為的一組參數(shù)。例如，參數(shù)代表變量初始值、變量半衰期、速率常量、轉(zhuǎn)換率以及指數(shù)。由于實(shí)驗(yàn)系統(tǒng)中的可變性，這些變量通常承認(rèn)值的范圍。選擇具體值以便給成分和系統(tǒng)提供符合已知約束的行為。因此，模型中變量的行為隨著時(shí)間而改變。計(jì)算機(jī)模型包括數(shù)學(xué)關(guān)系中的參數(shù)集合。在一個(gè)實(shí)施中，參數(shù)被用于表示固有特征(例如，遺傳因子)以及生物系統(tǒng)的外部特征(例如，環(huán)境因子)。用于模型中的數(shù)學(xué)關(guān)系可以包括，例如常微分方程、偏微分方程、隨機(jī)微分方程、微分代數(shù)方程、差分方程、細(xì)胞式自動(dòng)機(jī)、耦合映射、布爾網(wǎng)絡(luò)方程、模糊邏輯網(wǎng)絡(luò)或其組合。運(yùn)行病理生理學(xué)模型將計(jì)算感興趣事件的風(fēng)險(xiǎn)(發(fā)生的可能性)并且從這樣的計(jì)算產(chǎn)生一組輸出信息。病理生理學(xué)模型會(huì)優(yōu)選地將是病人描述符的描述模型參數(shù)的變量(X)和(Y)和風(fēng)險(xiǎn)關(guān)聯(lián)，可選地，其中用于病理生理學(xué)模型中的變量的一個(gè)或更多個(gè)是生物標(biāo)記，其中變量(X)和(Y)是(若干)環(huán)境型，顯型或基因型衍生變量。接著，輸出信息可以被用于導(dǎo)出針對(duì)生物目標(biāo)的給定改變的效果模型。在例如生物目標(biāo)評(píng)估方法的某些實(shí)施例中，可以執(zhí)行選擇感興趣生物目標(biāo)的步驟，如上述圖2的塊IOlb所示。這個(gè)步驟可以包括輸入，例如，經(jīng)由輸入裝置接收、輸入或者另外指定生物網(wǎng)絡(luò)的一個(gè)或更多改變，所述改變被表示為潛在治療T。因此，指定待評(píng)估的改變，使得然后計(jì)算改變生物目標(biāo)的治療益處。
優(yōu)選的病理生理學(xué)模型基于散漫模型，如下面進(jìn)一步描述的。I.構(gòu)建模型散漫模型在一個(gè)方面，使用散漫模型。散漫模型是在創(chuàng)建計(jì)算模型前的步驟，其是，例如具有一組微分方程的模型。這樣的模型具有適合整合各種級(jí)別相互作用的優(yōu)勢，包括在生物組分級(jí)別的生物過程和在組織和/或器官級(jí)別的過程。通過整合在組織和器官級(jí)別的過程，病理生理學(xué)模型可以用于預(yù)測感興趣臨床事件的風(fēng)險(xiǎn)。因此，散漫病理生理學(xué)模型可以解釋疾病過程，即，其整合上部級(jí)別，包括生理級(jí)別。疾病包圍復(fù)雜現(xiàn)象的幾個(gè)分層組織級(jí)另IJ，從基因到種群。時(shí)間尺度從納秒到幾十年變化，具有針對(duì)前一尺度的化學(xué)相互作用和針對(duì)后一尺度的到臨床事件的演變。在慢性病中，例如癌癥或動(dòng)脈硬化，在分子、細(xì)胞、組織和目標(biāo)器官級(jí)別的事件系列花費(fèi)幾十年實(shí)現(xiàn)死亡或心肌梗死。鑒于快速出現(xiàn)的科學(xué)信息，因此，設(shè)想模型足夠靈活以便整合任何新的相關(guān)知識(shí)。總的來說，對(duì)疾病建模沿著三個(gè)軸發(fā)展現(xiàn)象或子系統(tǒng)軸、時(shí)間軸、整合軸。構(gòu)建散漫病理生理學(xué)模型的第一步是確定對(duì)什么建模并如何獲得(若干)目標(biāo)的精確公式，這是隨后修復(fù)在構(gòu)建過程中出現(xiàn)的選擇所要求的。進(jìn)一步的步驟根據(jù)每個(gè)研究主題改變。但是，通常構(gòu)建模型會(huì)包括在表格I示出的主要步驟，雖然這些步驟不需要按照示出的次序執(zhí)行。表格I
權(quán)利要求
1.一種計(jì)算機(jī)實(shí)施的方法，其包括由結(jié)果處理系統(tǒng)計(jì)算針對(duì)ー個(gè)或更多個(gè)體的治療的益處(Rc-Rt)或治療的結(jié)果率(Rt)，其中所述計(jì)算包括計(jì)算與描述針對(duì)群體的治療益處(Rc-Rt)的函數(shù)關(guān)聯(lián)的治療(T)的益處,所述函數(shù)將治療益處(Rc-Rt)描述為沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)的函數(shù)，優(yōu)選地，其中所述函數(shù)是將所述治療益處(Rc-Rt)描述為下列變量的函數(shù)的函數(shù) i)依賴于第一變量(Y)的沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)，以及 ii)第二變量(X)，其中所述第二變量(X)是除了包含在沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)中的特征之外的個(gè)體特征的矢量，以及第ー變量(Y)是包含在沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)中個(gè)體特征的矢量，以及所述變量(X)和(Y)可以是(若干)環(huán)境型、顯型或基因型衍生變量； 接收描述所述ー個(gè)或更多個(gè)體的病人描述符，其中每個(gè)個(gè)體與風(fēng)險(xiǎn)(Re)和第二變量(X)關(guān)聯(lián)；以及 為所述(若干)個(gè)體輸出治療益處(Rc-Rt)或治療的結(jié)果率(Rt)的指示器。
2.根據(jù)權(quán)利要求I所述的方法，其包括計(jì)算多個(gè)治療(T)的益處，其中每個(gè)治療(T)與將針對(duì)群體的治療益處描述為沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)的函數(shù)的函數(shù)。
3.根據(jù)權(quán)利要求1-2所述的方法，其中所述(若干)個(gè)體是一個(gè)或多個(gè)真實(shí)病人。
4.根據(jù)權(quán)利要求1-2所述的方法，其中所述ー個(gè)或更多個(gè)體是模擬個(gè)體或模擬的個(gè)體群。
5.根據(jù)權(quán)利要求I所述的方法，其中所述接收病人描述符的步驟包括生成模擬個(gè)體或模擬的個(gè)體群。
6.根據(jù)權(quán)利要求4或5所述的方法，其中所述模擬的個(gè)體群是虛擬現(xiàn)實(shí)群體。
7.根據(jù)上述權(quán)利要求任意一個(gè)所述的方法，其中Rt是利用用戶輸入的信息或數(shù)據(jù)計(jì)算的，由結(jié)果處理系統(tǒng)生成或從數(shù)據(jù)源接收。
8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的方法，其中所述數(shù)據(jù)源是醫(yī)療記錄系統(tǒng)。
9.根據(jù)權(quán)利要求7所述的方法，其中所述信息或數(shù)據(jù)包括來自治療的臨床使用的數(shù)據(jù)。
10.根據(jù)權(quán)利要求7所述的方法，其中所述信息或數(shù)據(jù)包括來自治療的病理生理學(xué)模型的輸出。
11.根據(jù)權(quán)利要求10所述的方法，其中治療(T)與病理生理學(xué)模型中組件或相互關(guān)系的改變關(guān)聯(lián)。
12.根據(jù)權(quán)利要求11所述的方法，其中所述病理生理學(xué)模型包括相關(guān)組件的網(wǎng)絡(luò)，所述相關(guān)組件包括生化成分和/或細(xì)胞成分、生物過程、組織、器官、軀干和/或病理生理學(xué)組件。
13.根據(jù)權(quán)利要求7所述的方法，其中所述信息包括描述針對(duì)群體的治療益處的函數(shù)，其將所述治療益處描述為沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)的函數(shù)。
14.根據(jù)上述權(quán)利要求任意一個(gè)所述的方法，其進(jìn)ー步包括顯示針對(duì)所述(若干)個(gè)體的治療益處(Rt)的指示器。
15.根據(jù)權(quán)利要求14所述的方法，其中所述顯示是以圖形的形式。
16.根據(jù)上述權(quán)利要求任意一個(gè)所述的方法，其進(jìn)ー步包括評(píng)定治療是否適合病人。
17.根據(jù)上述權(quán)利要求任意一個(gè)所述的方法，其進(jìn)ー步包括評(píng)定變量對(duì)治療益處的影響。
18.根據(jù)權(quán)利要求17所述的方法，其中所述變量是可檢測的生物或細(xì)胞成分，以及其中確定對(duì)所述(若干)個(gè)體的治療益處具有影響的成分被識(shí)別為生物標(biāo)記。
19.根據(jù)上述權(quán)利要求任意一個(gè)所述的方法，其進(jìn)ー步包括評(píng)定治療是否適合感興趣群體。
20.根據(jù)上述權(quán)利要求任意一個(gè)所述的方法，其進(jìn)ー步包括估算在感興趣群體中的治療益處。
21.—種計(jì)算機(jī)實(shí)施的方法，其包括 由結(jié)果處理系統(tǒng)計(jì)算針對(duì)病人的治療益處(Rt)，其中所述計(jì)算包括計(jì)算針對(duì)病人的多個(gè)治療(T)的益處,其中姆個(gè)治療(T)與描述針對(duì)群體的治療益處(Rt)的函數(shù)關(guān)聯(lián),該函數(shù) 將所述治療益處(Rt)描述為沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)的函數(shù)，優(yōu)選地，其中所述函數(shù)是將治療益處(Rt)描述為沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)的函數(shù),該風(fēng)險(xiǎn)依賴于第一變量(Y)和第二變量(X)，其中所述第二變量(X)是除了包含在沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)中的特征之外的個(gè)體特征的矢量，以及所述變量(X)和(Y)可以是(若干)環(huán)境型、顯型或基因型衍生變量； 為病人接收所述變量(X)和(Y)的病人描述符；以及 輸出針對(duì)所述病人的(若干)治療T的治療益處(Rt)的指示器。
22.根據(jù)權(quán)利要求21所述的方法，其中所述輸出治療益處的指示器進(jìn)ー步包括顯示所述治療是否適合所述病人。
23.根據(jù)權(quán)利要求21所述的方法，其中所述輸出治療益處的指示器進(jìn)ー步包括顯示適合所述病人的ー個(gè)或多個(gè)治療。
24.根據(jù)權(quán)利要求23所述的方法，其中所述多個(gè)治療根據(jù)針對(duì)病人的它們的預(yù)測益處排名。
25.根據(jù)權(quán)利要求21-24所述的方法，其中所述輸出治療益處(Rt)的指示器包括從所述治療輸出針對(duì)模擬的個(gè)體群預(yù)測的益處和輸出針對(duì)病人的益處。
26.根據(jù)權(quán)利要求25所述的方法，其中所述輸出指示針對(duì)所述病人的益處與針對(duì)群體的益處是如何比較的。
27.—種計(jì)算機(jī)實(shí)施的方法，其包括 由結(jié)果處理系統(tǒng)計(jì)算針對(duì)模擬的個(gè)體群的治療益處(Rt)，其中所述計(jì)算包括計(jì)算與(i)和(ii)關(guān)聯(lián)的治療(T)的益處，其中(i)是病理生理學(xué)模型的組件或組件之間相互關(guān)系的改變，以及(ii)是將針對(duì)群體的治療益處(Rt)描述為沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)的函數(shù)的函數(shù)，優(yōu)選地，其中所述函數(shù)將治療益處(Rt)描述為依賴于第一變量(Y)和第二變量(X)的沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)的函數(shù)，其中所述第二變量(X)除了包含在沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)中的特征之外的個(gè)體特征的矢量，以及所述變量(X)和(Y)可以是(若干)環(huán)境型、顯型或基因型衍生變量； 接收針對(duì)個(gè)體的模擬群的病人描述符，其中群體中的每個(gè)個(gè)體與風(fēng)險(xiǎn)(Re)和第二變量(X)關(guān)聯(lián)；以及 輸出模擬群中治療益處(Rt)的指示器。
28.根據(jù)權(quán)利要求27所述的方法，其中將針對(duì)群體的治療益處(Rt)描述為沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)的函數(shù)的所述函數(shù)通過(a)和(b)獲得，其中(a)運(yùn)行定義治療(T)的病理生理學(xué)模型，其中所述病理生理學(xué)模型包括病理生理學(xué)模型的組件或組件之間相互關(guān)系的改變，其中所述病理生理學(xué)模型生成感興趣事件的似然性；以及(b)從所述感興趣事件的似然性導(dǎo)出所述函數(shù)。
29.根據(jù)權(quán)利要求28所述的方法，其中所述接收病人描述符的步驟包括生成模擬個(gè)體或模擬的個(gè)體群。
30.根據(jù)權(quán)利要求28或29所述的方法，其中所述模擬的個(gè)體群是虛擬現(xiàn)實(shí)群體。
31.根據(jù)權(quán)利要求27-30所述的方法，其進(jìn)ー步包括接收指定病理生理學(xué)模型的組件或組件之間相互關(guān)系的信息，所述信息的改變定義治療(T)。
32.根據(jù)權(quán)利要求31所述的方法，其中所述信息由用戶經(jīng)由輸入裝置輸入的。
33.根據(jù)權(quán)利要求27-32所述的方法，其中將針對(duì)群體的治療益處(Rt)描述為沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)的函數(shù)的所述函數(shù)通過(a)和(b)獲得，其中(a)運(yùn)行模擬與ー個(gè)或更多治療描述符關(guān)聯(lián)的治療(T)的正式治療模型，其中所述正式治療模型生成感興趣事件的似然性；以及(b)從所述感興趣事件的似然性導(dǎo)出所述函數(shù)。
34.根據(jù)權(quán)利要求33所述的方法，其進(jìn)ー步包括接收臨床數(shù)據(jù)并利用所述數(shù)據(jù)修改所述正式治療模型；以及可選地，利用修改的正式治療模型重復(fù)所述步驟(a)和(b)。
35.根據(jù)權(quán)利要求27-34所述的方法，其中所述輸出治療益處的指示器進(jìn)ー步包括輸出針對(duì)治療的模擬個(gè)體群中避免的事件數(shù)量。
36.根據(jù)權(quán)利要求27-35所述的方法，其中所述輸出治療益處的指示器進(jìn)ー步包括為治療或多個(gè)治療對(duì)模擬的個(gè)體群中避免的事件數(shù)量排名。
37.根據(jù)權(quán)利要求27-36所述的方法，其進(jìn)ー步包括識(shí)別生物目標(biāo)，所述生物目標(biāo)的改變提供模擬的個(gè)體群中的治療益處。
38.根據(jù)權(quán)利要求27-37所述的方法，其進(jìn)ー步包括評(píng)估治療是否適合病人。
39.根據(jù)權(quán)利要求27-37所述的方法，其進(jìn)ー步包括評(píng)估變量對(duì)所述(若干)個(gè)體的治療益處的影響。
40.根據(jù)權(quán)利要求39所述的方法，其中所述變量是可檢測的生物或細(xì)胞成分，以及其中確定對(duì)所述(若干)個(gè)體的治療益處具有影響的成分被識(shí)別為生物標(biāo)記。
41.根據(jù)權(quán)利要求27-37所述的方法，其進(jìn)ー步包括評(píng)估治療是否適合感興趣群體。
42.根據(jù)權(quán)利要求27-37所述的方法，其進(jìn)ー步包括評(píng)估感興趣群體中的治療益處。
43.根據(jù)上述權(quán)利要求任意一個(gè)所述的方法，其進(jìn)ー步包括顯示針對(duì)所述(若干)個(gè)體的治療益處(Rt)的指示器。
44.根據(jù)權(quán)利要求43所述的方法，其中所述顯示是以圖形的形式。
45.根據(jù)權(quán)利要求44所述的方法，其中所述圖形形式包括在具有軸Rt和軸Re的圖形中的散點(diǎn)圖。
46.根據(jù)上述權(quán)利要求中任意一個(gè)所述的方法，其進(jìn)ー步包括評(píng)估那些治療描述符使針對(duì)病人的益處最大。
47.一種評(píng)估生物標(biāo)記的方法，所述方法包括 Ca)執(zhí)行計(jì)算機(jī)實(shí)施的方法，所述計(jì)算機(jī)實(shí)施的方法包括 由結(jié)果處理系統(tǒng)計(jì)算針對(duì)個(gè)體或個(gè)體群的治療益處(Rc-Rt)，其中所述計(jì)算包括計(jì)算與描述針對(duì)群體的治療益處(Rc-Rt)的函數(shù)關(guān)聯(lián)的治療(T)的益處，該函數(shù)將所述治療益處(Rc-Rt)描述為沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)的函數(shù)，優(yōu)選地，其中所述函數(shù)是將所述治療益處(Rc-Rt)描述為下列變量的函數(shù)的函數(shù) iii)依賴于第一變量(Y)的沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)，以及 iv)第二變量(X)，其中所述第二變量(X)是除了包含在沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)中的特征之外的個(gè)體特征的矢量，以及所述第一變量(Y)是包含在沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)中的個(gè)體特征的矢量，以及所述變量(X)和(Y)可以是(若干)環(huán)境型、顯型或基因型衍生變量； 接收描述所述ー個(gè)或更多個(gè)體的病人描述符，其中每個(gè)個(gè)體與風(fēng)險(xiǎn)(Re)和第二變量(X)關(guān)聯(lián)；以及 可選地，輸出針對(duì)所述(若干)個(gè)體的治療益處(Rc-Rt)的指示器；以及 (b)評(píng)估變量在針對(duì)所述ー個(gè)或更多個(gè)體的治療益處(Rc-Rt)上的影響。
48.根據(jù)權(quán)利要求47所述的方法，其中所述接收描述所述一個(gè)或更多個(gè)體的病人描述符的步驟包括從病理生理學(xué)模型接收至少一個(gè)所述病人描述符。
49.一種用于預(yù)測ー個(gè)或多個(gè)治療的益處的設(shè)備，所述設(shè)備包括用于執(zhí)行計(jì)算機(jī)可執(zhí)行指令的一個(gè)或更多計(jì)算機(jī)，其中所述計(jì)算機(jī)包括用于執(zhí)行權(quán)利要求1-48中任意ー個(gè)所述方法的計(jì)算機(jī)可執(zhí)行指令。
50.一種存儲(chǔ)用于預(yù)測一個(gè)或多個(gè)治療的益處的計(jì)算機(jī)程序的計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)，其中所述計(jì)算機(jī)程序包括用于執(zhí)行權(quán)利要求1-48中任意一個(gè)所述方法的指令。
51.一種用于存儲(chǔ)由應(yīng)用程序訪問的數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)器，其中所述應(yīng)用程序在結(jié)果處理系統(tǒng)上執(zhí)行，包括存儲(chǔ)在所述存儲(chǔ)器中的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)，所述數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)包括由所述應(yīng)用程序使用的信息，其中所述數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)經(jīng)配置而包括多個(gè)數(shù)據(jù)對(duì)象，每個(gè)數(shù)據(jù)對(duì)象對(duì)應(yīng)于多個(gè)治療(T)中的ー個(gè)，以及其中每個(gè)治療(T)與描述針對(duì)群體的治療益處(Rt)的函數(shù)關(guān)聯(lián)，該函數(shù)將所述治療益處描述為沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)的函數(shù)，優(yōu)選地，其中所述函數(shù)是將治療益處(Rt)描述為沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)的函數(shù)的函數(shù)，所述風(fēng)險(xiǎn)依賴于第一變量(Y)和第二變量(X)，其中所述第二變量(X)是除了包含在沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)中的特征之外的個(gè)體特征的矢量，以及第ー變量(Y)是包含在沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)中個(gè)體特征的矢量，以及所述變量(X)和(Y)可以是(若干)環(huán)境型、顯型或基因型衍生變量。
52.一種用于存儲(chǔ)由應(yīng)用程序訪問的數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)器，其中所述應(yīng)用程序在結(jié)果處理系統(tǒng)上執(zhí)行，包括存儲(chǔ)在所述存儲(chǔ)器中的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)，所述數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)包括由所述應(yīng)用程序使用的信息，其中所述數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)經(jīng)配置而包括多個(gè)數(shù)據(jù)對(duì)象，每個(gè)數(shù)據(jù)對(duì)象對(duì)應(yīng)于多個(gè)治療(T)中的ー個(gè)，以及其中每個(gè)治療(T)與個(gè)體的特定群中的治療益處(Rt)關(guān)聯(lián)，其中利用描述針對(duì)群體的治療益處的函數(shù)計(jì)算所述治療益處(Rt),該函數(shù)將所述治療益處描述為沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)的函數(shù)，優(yōu)選地，其中所述函數(shù)是將所述治療益處(Rt)描述為取決于第一變量(Y)和第二變量(X)的沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)的函數(shù)，其中所述第二變量(X)是除了包含在沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)中的特征之外的個(gè)體特征的矢量，以及第ー變量(Y)是包含在沒有治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(Re)中個(gè)體特征的矢量，以及所述變量(X)和(Y)可以是(若干)環(huán)境型、顯型或基因型衍生變量。
53.根據(jù)權(quán)利要求52所述的方法，其中每個(gè)治療(T)進(jìn)ー步與所述個(gè)體的特定群關(guān)聯(lián)。
全文摘要
本發(fā)明涉及進(jìn)行藥物和生物標(biāo)記發(fā)現(xiàn)、藥物開發(fā)和個(gè)性化醫(yī)療，以及更一般管理保健的計(jì)算機(jī)系統(tǒng)，尤其是涉及預(yù)測對(duì)個(gè)體治療的治療值的系統(tǒng)和方法。該治療和一函數(shù)關(guān)聯(lián)，該函數(shù)一般以在治療中醫(yī)療事件的發(fā)生情況將個(gè)體群中的治療益處描述為無所述治療時(shí)的風(fēng)險(xiǎn)(例如，發(fā)生醫(yī)療事件)的函數(shù)。
文檔編號(hào)G06F19/12GK102822834SQ201180015982
公開日2012年12月12日 申請(qǐng)日期2011年4月5日 優(yōu)先權(quán)日2010年4月7日
發(fā)明者J-P·伯伊瑟 申請(qǐng)人:諾華探索公司, 諾華保健公司