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一種異構(gòu)臨床醫(yī)療信息共享系統(tǒng)和方法

文檔序號:6469569閱讀:348來源:國知局
專利名稱:一種異構(gòu)臨床醫(yī)療信息共享系統(tǒng)和方法
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明屬于信息技術(shù)領(lǐng)域,涉及一種共享系統(tǒng),尤其涉及一種異構(gòu)臨床醫(yī)療信息共享系 統(tǒng);本發(fā)明還涉及上述共享系統(tǒng)的共享方法。
背景技術(shù)
數(shù)據(jù)元在科學(xué)數(shù)據(jù)的匯交、分發(fā)、服務(wù)和應(yīng)用環(huán)節(jié),以及數(shù)據(jù)的采集、加工和處理環(huán)節(jié) 中,起到了確立數(shù)據(jù)名稱、含意、表示格式、標識等方面的特征的作用。通用數(shù)據(jù)元的重用 是數(shù)據(jù)共享的重要組成部分。由于目前所有的數(shù)據(jù)共享都是基于網(wǎng)絡(luò)進行的,如何能夠自動 生成網(wǎng)絡(luò)可以訪問的數(shù)據(jù),以及為臨床醫(yī)生提供簡便的數(shù)據(jù)錄入界面是一個非常具有挑戰(zhàn)性 的工作。
一、基本數(shù)據(jù)元的定義與數(shù)據(jù)錄入
臨床數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)在臨床試驗相關(guān)的臨床研究中具有舉足輕重的地位,它的主要宗旨是 確認資料收集的完整性和正確性,并且試驗數(shù)據(jù)可以很好地支持統(tǒng)計分析,以及最后對其試 驗結(jié)果的闡述和解釋。上世紀80年代,隨著臨床試驗的大量開展,人們開始探索利用計算機 管理臨床研究數(shù)據(jù),從最初的數(shù)據(jù)本地錄入系統(tǒng)到后來基于網(wǎng)絡(luò)的數(shù)據(jù)錄入系統(tǒng)。臨床數(shù)據(jù) 管理系發(fā)展地越來越完善。目前,大規(guī)模的臨床數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)已經(jīng)在大的Parma公司中使用, 開發(fā)模式多是以臨床試驗的需求為導(dǎo)向,個性化開發(fā)模式。另一方面,臨床醫(yī)療數(shù)據(jù)隨著醫(yī) 院信息化的開展也在不斷地增加。臨床醫(yī)生對患者數(shù)據(jù)的管理,也就不再局限于表單的填寫 或手工的統(tǒng)計。臨床醫(yī)生對于數(shù)據(jù)管理的要求越來越大。
當然,由臨床醫(yī)生開發(fā)或定制這樣一個系統(tǒng)是不經(jīng)濟或者沒有可行性的,而這個問題在 發(fā)展中國家尤為突出。因此,在進行臨床試驗時,廠商或課題組會向臨床醫(yī)生提供一個程序 或網(wǎng)絡(luò)入口來收集項目相關(guān)的數(shù)據(jù)。然而,臨床醫(yī)生卻不能用這些系統(tǒng)來研究自己感興趣的、 特殊的問題。因此,目前臨床醫(yī)生特別是發(fā)展中國家,例如中國,會使用EXCEL、 SPSS或 SAS等統(tǒng)計分析或電子表格軟件來進行數(shù)據(jù)的收集和整理。由于這些工具以數(shù)據(jù)分析見長, 所以這些工具的使用過程中會引入許多的錯誤,例如錯行輸入、不規(guī)范輸入,這些問題會給 后期的數(shù)據(jù)清晰過程帶來很大的問題,并會影響數(shù)據(jù)分析結(jié)果。因此,臨床醫(yī)生缺乏有效的 臨床數(shù)據(jù)管理系統(tǒng),造成了大量的臨床有用信息的無意義丟失。
針對這種情況,生物醫(yī)學(xué)信息學(xué)研究人員已經(jīng)著手開發(fā)一些可以為臨床醫(yī)生免費使用的臨床試驗信息管理系統(tǒng)。OpenClinica項目是美國NIH資助的一個開源的臨床試驗軟件平臺, 用于管理各種各樣的臨床試驗的數(shù)據(jù),可以用于臨床數(shù)據(jù)的遞交、驗證和注釋,同時可以用 于數(shù)據(jù)的過濾與抽提以及研究的監(jiān)察和報告。OpenClinica系統(tǒng)提供了 CRF表設(shè)計、在線數(shù)據(jù) 錄入、臨床研究管理、數(shù)據(jù)導(dǎo)出以及報告輸出等內(nèi)容。這個系統(tǒng)將CRF表的設(shè)計交給臨床研 究人員,而系統(tǒng)負責(zé)管理CRF表以及由CRF表所產(chǎn)生的數(shù)據(jù)。這是一個非常值得借鑒的模式。
OpenClinica系統(tǒng)的前提假設(shè)市表單已經(jīng)設(shè)計完成,可以開始進行數(shù)據(jù)的錄入。然而,CRF 表的設(shè)計過程實際上是一個復(fù)雜、精細,需要多人參與的過程,往往需要進行多次的修改和 嚴格的定義。OpenClinica采用Excel表格進行數(shù)據(jù)的定義與描述。這種形式對于數(shù)據(jù)的定義 不嚴格,而且數(shù)據(jù)之間的關(guān)聯(lián)往往不能很好地定義。
這方面,在流行病學(xué)領(lǐng)域的Epidata軟件可以允許用戶定制數(shù)據(jù)模型,并對數(shù)據(jù)進行定義。 由于其數(shù)據(jù)模型的定義與展現(xiàn)可以在一個平臺下瀏覽和修改,甚至可以用文本編輯器進行修 改,因此在流行病學(xué)領(lǐng)域的表單制定方面得到了廣泛的應(yīng)用。
然而,這些信息系統(tǒng)對于用戶在數(shù)據(jù)填寫當中的靈活性還不能很好的支持。例如,對于 患者的隨訪數(shù)據(jù)的記錄,由于隨訪次數(shù)不定,這些基于關(guān)系型數(shù)據(jù)庫的軟件系統(tǒng)往往采用了 空間預(yù)留的方法來解決這個問題?;陉P(guān)系型數(shù)據(jù)庫,也可以通過采用更為抽象的模型(如 HL7RIM模型)來定義和記錄數(shù)據(jù)。數(shù)據(jù)噪音是影響臨床試驗結(jié)果分析最大的問題,目前數(shù) 據(jù)填寫的質(zhì)量主要依靠填寫人員的教育,但是這種抽象模型在臨床試驗的數(shù)據(jù)填寫過程中較 難理解,開發(fā)成本較高,并且有可能會影響錄入數(shù)據(jù)的質(zhì)量。
—、基本數(shù)據(jù)兀與數(shù)據(jù)訪問
目前,如果要最小代價地訪問數(shù)據(jù),最有效的方法是模型驅(qū)動開發(fā)途徑。例如,caBIG項 目。caDSR是美國癌癥研究所的caBIG項目核心層的一部分,是用來管理基本數(shù)據(jù)元,支持 數(shù)據(jù)標準化。正如Dennis所描述的,caDSR提供了一個CDE Browser的工具,允許研究組長 從已經(jīng)成為標準的基本數(shù)據(jù)元中選取基本數(shù)據(jù)元,組成病例報告表(case reportform, CRF)。 這種方式是元數(shù)據(jù)管理的理想狀態(tài),希望所有的人使用相同的語言,利用通用數(shù)據(jù)元設(shè)計基 于UML模型和數(shù)據(jù)模型,這在實際操作中這種工作方式往往會干擾PI正常的工作程序,而 且臨床醫(yī)生需要學(xué)習(xí)新的知識才能勝任這份工作。因此,在實際的應(yīng)用中不會往往很難接受。
基于以上技術(shù)上的不足,本發(fā)明設(shè)計了以下基于網(wǎng)格的異構(gòu)臨床醫(yī)療信息共享的方法和 系統(tǒng)。

發(fā)明內(nèi)容
6本發(fā)明所要解決的技術(shù)問題是提供一種異構(gòu)臨床醫(yī)療信息共享系統(tǒng),該系統(tǒng)可以自動 生成語義完整的可用于臨床文檔傳輸和共享的標準臨床文檔,實現(xiàn)臨床信息的無縫連接和有 效共享。
此外,本發(fā)明還提供上述信息共享系統(tǒng)的共享方法。 為解決上述技術(shù)問題,本發(fā)明采用如下技術(shù)方案 一種異構(gòu)臨床醫(yī)療信息共享系統(tǒng),該系統(tǒng)包括 術(shù)語集模塊,用于規(guī)范共享文檔中所使用的術(shù)語;
文檔模板生成模塊,用于定義標準臨床數(shù)據(jù)文檔的組成元素及個元素之間的關(guān)系并自動 生成文檔模板;
文檔管理模塊,用于文檔管理,用戶通過該文檔管理模塊對醫(yī)療文檔進行管理,進行錄 入、修改、査詢操作、及文檔的傳輸和共享;以及 存儲臨床數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)庫;
所述術(shù)語集模塊、文檔模板生成模塊、文檔管理模塊、數(shù)據(jù)庫依次連接。 作為本發(fā)明的一種優(yōu)選方案,所述系統(tǒng)還包括連接所述術(shù)語集模塊的方言術(shù)語注冊模塊,
用用戶在制定臨床文檔時根據(jù)需要使用自定義術(shù)語。
作為本發(fā)明的一種優(yōu)選方案,所述系統(tǒng)還包括連接所述術(shù)語集模塊的方言映射模塊,用
于將用戶自定義方言術(shù)語集映射到標準數(shù)據(jù)集。
作為本發(fā)明的一種優(yōu)選方案,所述文檔模板生成模塊包括一模板自動生成單元,將系統(tǒng)
圖形用戶界面上的部件生成底層的模板文檔。
作為本發(fā)明的一種優(yōu)選方案,所述數(shù)據(jù)擁有者可自由地在自治與共享之間轉(zhuǎn)換;數(shù)據(jù)消
費者通過網(wǎng)格查詢系統(tǒng),利用本地數(shù)據(jù)元査詢多個數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)。
作為本發(fā)明的一種優(yōu)選方案,所述術(shù)語集模塊為一個標準化的臨床術(shù)語集合,包括目前
國內(nèi)國際上通用的臨床檢測術(shù)語、通用的臨床信息傳輸標準及用戶根據(jù)需要自定義的方言術(shù)語。
作為本發(fā)明的一種優(yōu)選方案,所述方言術(shù)語注冊模塊對用戶的請求給予應(yīng)答,使用特定 的算法為每個用戶分配一個唯一的標識符,注冊裝置根據(jù)用戶的唯一標識符為該用戶的方言
進行注冊;只有通過注冊的方言才可出現(xiàn)在術(shù)語集合中。
作為本發(fā)明的一種優(yōu)選方案,所述方言映射模塊在用戶需要進行文檔傳輸或者需要文檔 共享時,將用戶自定義的方言術(shù)語按照制定的算法映射到國際通用的醫(yī)療文檔標準術(shù)語集上。
作為本發(fā)明的一種優(yōu)選方案,所述文檔模板生成模塊為用戶提供了自動生成文檔模板的功能;對文檔模板的制定有進一步限定,自動生成的文檔模板的基本結(jié)構(gòu)是參照國際標準制 定的,每個模塊下的內(nèi)容可以根據(jù)用戶需求個性化定制;所述文檔模板生成模塊產(chǎn)生的文檔 模板具有通用性、可讀性。
作為本發(fā)明的一種優(yōu)選方案,文檔模板生成模塊生成的不同文檔部分所使用的標準術(shù)語
集合的子集不同。
作為本發(fā)明的一種優(yōu)選方案,所述文檔模板生成模塊可以對已經(jīng)存在的模板進行修改; 所述文檔模板生成模塊提供將模板提交到文檔管理模塊,以便用于文檔的錄入的功能。
作為本發(fā)明的一種優(yōu)選方案,所述文檔管理模塊可以進行文檔的錄入、修改、査詢;文 檔管理模塊可將數(shù)據(jù)庫中的文檔導(dǎo)出成適合數(shù)據(jù)挖掘的文檔形式;通過文檔管理模塊錄入的
文檔機構(gòu),必須符合臨床信息共享系統(tǒng)所對定的文檔結(jié)構(gòu)標準,該模板為通過文檔生成裝置 生成的文檔模板,或為符合存貯、機構(gòu)標準的任何模板;對文檔管理模塊管理的文檔有進一 步要求,文檔必須符合臨床信息共享系統(tǒng)所規(guī)定的文檔結(jié)構(gòu)的;通過文檔管理模塊對文檔數(shù) 據(jù)庫中的文檔進行管理;所述文檔管理模塊具有權(quán)限分配功能,用戶只能操作特定的文檔。
一種異構(gòu)臨床醫(yī)療信息共享方法,所述方法包括
文檔結(jié)構(gòu)的定義和表述步驟;
文檔模板生成步驟,用于定義臨床數(shù)據(jù)標準文檔的組成元素及個元素之間的關(guān)系并自動 生成文檔模板。
作為本發(fā)明的一種優(yōu)選方案,所述方法還包括術(shù)語注冊步驟,用戶在制定臨床文檔時根 據(jù)需要使用自定義術(shù)語。
作為本發(fā)明的一種優(yōu)選方案,所述方法還包括使用文檔模板創(chuàng)建標準文檔步驟。
作為本發(fā)明的一種優(yōu)選方案,所述方法還包括文檔管理步驟,用戶對醫(yī)療文檔進行管理, 迸行錄入、修改、查詢操作、及文檔的傳輸和共享。
作為本發(fā)明的一種優(yōu)選方案,所述方法還包括自動解析文檔模板結(jié)構(gòu)的步驟,根據(jù)文檔 模板的結(jié)構(gòu)自動生成文檔錄入的界面。
作為本發(fā)明的一種優(yōu)選方案,所述文檔模板生成步驟包括用戶根據(jù)實際需要,通過一 模板自動生成單元,將圖形用戶界面上的部件生成底層的模板文檔。
作為本發(fā)明的一種優(yōu)選方案,所述每個文檔模板成為一個數(shù)據(jù)字典;每個數(shù)據(jù)字典包括 元素和元素分組;
所述元素為數(shù)據(jù)字典中最小的結(jié)構(gòu)單位,可為多種數(shù)據(jù)類型;
所述元素分組為共同描述某一臨床概念的多個元素或元素組的集合;元素組包含元素、
8或元素分組、或元素和元素分組的組合。
作為本發(fā)明的一種優(yōu)選方案,對臨床上常見的一對多數(shù)據(jù),使用了動態(tài)組的概念;動態(tài) 組的數(shù)量可動態(tài)添加,祖內(nèi)組織了經(jīng)常在一起使用的元素和分組。
作為本發(fā)明的一種優(yōu)選方案,對臨床上多選的數(shù)據(jù),使用了多選組的概念,以組織用戶 希望用多選形式展現(xiàn)的數(shù)據(jù);所述多選的數(shù)據(jù)在后期的査詢和導(dǎo)出過程中均按照布爾類型基 本數(shù)據(jù)元對待。
作為本發(fā)明的一種優(yōu)選方案,所述術(shù)語注冊步驟中,用戶向術(shù)語注冊中心提交注冊請求, 注冊中心給予應(yīng)答;
機構(gòu)和用戶方言術(shù)語的注冊代號由設(shè)定的編碼機制實現(xiàn); 每個機構(gòu)會得到一個唯一的標識該機構(gòu)的標識符; 每個用戶術(shù)語會根據(jù)機構(gòu)代碼、術(shù)語特征得到一個唯一的標識符。
作為本發(fā)明的一種優(yōu)選方案,所述標準文檔是可以用于臨床文檔共享傳輸?shù)男畔⒌募希?或者加入設(shè)定信息后、可以用于傳輸和共享的信息的集合。
本發(fā)明的有益效果在于本發(fā)明通過各臨床術(shù)語集合的整合和映射,及用戶方言術(shù)語的 補充,擴大臨床術(shù)語集合的覆蓋范圍,增加術(shù)語描述的靈活性,使得臨床實體的描述更加貼 近真實情況。通過臨床數(shù)據(jù)字典、標準文檔生成裝置,實現(xiàn)標準臨床文檔的自動生成,最終 通過映射,建立完善的臨床文檔數(shù)據(jù)庫,對標準臨床文檔進行管理。當用戶定義數(shù)據(jù)字典后, 系統(tǒng)可以自動生成語義完整的可用于臨床文檔傳輸和共享的標準臨床文檔,實現(xiàn)臨床信息的 無縫連接和有效共享。


圖l為本發(fā)明的系統(tǒng)架構(gòu)圖。
圖2為本發(fā)明的術(shù)語集組成示意圖。
圖3為本發(fā)明的系統(tǒng)架構(gòu)圖。
圖4為本發(fā)明方法的流程圖。
圖5為本發(fā)明的標準文檔結(jié)構(gòu)示意圖。
圖6a為采用客戶端/服務(wù)器形式的系統(tǒng)結(jié)構(gòu)示意圖。
圖6b為采用本地服務(wù)形式的系統(tǒng)結(jié)構(gòu)示意圖。
圖6c為采用瀏覽器/服務(wù)器形式的系統(tǒng)結(jié)構(gòu)示意圖。
9圖7為本發(fā)明使用客戶端/服務(wù)器及瀏覽器/服務(wù)器混合架構(gòu)實現(xiàn)的系統(tǒng)結(jié)構(gòu)示意圖。 圖8為基于基本數(shù)據(jù)元數(shù)據(jù)共享的整體架構(gòu)圖。
具體實施例方式
下面結(jié)合附圖詳細說明本發(fā)明的優(yōu)選實施例。 實施例一
請參閱圖l,本發(fā)明揭示了一種異構(gòu)臨床醫(yī)療信息共享系統(tǒng),該系統(tǒng)包括術(shù)語集模塊ll、 方言術(shù)語注冊模塊12、方言映射模塊13、文檔模板生成模塊14、文檔管理模塊15、數(shù)據(jù)庫 16;方言術(shù)語注冊模塊12、方言映射模塊13連接所述術(shù)語集模塊11,術(shù)語集模塊ll、文檔 模板生成模塊14、文檔管理模塊15、數(shù)據(jù)庫16依次連接。
術(shù)語集模塊11用于規(guī)范共享文檔中所使用的術(shù)語。術(shù)語集模塊為一個標準化的臨床術(shù)語 集合,包括目前國內(nèi)國際上通用的臨床檢測術(shù)語、通用的臨床信息傳輸標準及用戶根據(jù)需要 自定義的方言術(shù)語。術(shù)語集模塊ll是對臨床實體及實體間關(guān)系的描述的語義集合,應(yīng)用于本 系統(tǒng)的術(shù)語集可以是任何已經(jīng)標準化的用于臨床數(shù)據(jù)表示與傳輸?shù)男g(shù)語集合;如可以是這些 國際標準和規(guī)范的子集、并集、交集等。同時系統(tǒng)容忍一定的非標準化術(shù)語,在系統(tǒng)中稱為 "方言"術(shù)語。
方言術(shù)語注冊模塊12用于用戶在制定臨床文檔時根據(jù)需要使用自定義術(shù)語。所述方言術(shù) 語注冊模塊對用戶的請求給予應(yīng)答,使用特定的算法為每個用戶分配一個唯一的標識符,注 冊裝置根據(jù)用戶的唯一標識符為該用戶的方言進行注冊;只有通過注冊的方言才可出現(xiàn)在術(shù) 語集合中。用戶可通過方言術(shù)語注冊模塊12向系統(tǒng)提交自定義的術(shù)語集合,通過注冊中心認 證后,注冊中型為每個用戶自定義的方言集合分配一個唯一的標識符,該用戶術(shù)語集合中的 術(shù)語可以自動編號,則方言集合中的每個術(shù)語將得到唯一的標識符。
方言映射模塊13用于將用戶自定義方言術(shù)語集映射到標準數(shù)據(jù)集;其可以將用戶定義的
方言通過一定的映射算法映射到已有的術(shù)語集合中,在用戶進行共享與交換過程中保證了術(shù) 語的統(tǒng)一性和通用性,這里的映射算法可以是用于詞匯映射的任何一種算法,系統(tǒng)實現(xiàn)時可
以根據(jù)實際情況進行選擇。方言映射模塊13在用戶需要進行文檔傳輸或者需要文檔共享時,
將用戶自定義的方言術(shù)語按照制定的算法映射到國際通用的醫(yī)療文檔標準術(shù)語集上。
文檔模板生成模塊14用于定義標準臨床數(shù)據(jù)文檔的組成元素及個元素之間的關(guān)系并自動
生成文檔模板。文檔模板生成模塊14為用戶提供了自動生成文檔模板的功能;對文檔模板的制定有進一步限定,自動生成的文檔模板的基本結(jié)構(gòu)是參照國際標準制定的,每個模塊下的 內(nèi)容可以根據(jù)用戶需求個性化定制;所述文檔模板生成模塊產(chǎn)生的文檔模板具有通用性、可 讀性。文檔模板生成模塊14生成的不同文檔部分所使用的標準術(shù)語集合的子集不同。此外, 文檔模板生成模塊14可以對已經(jīng)存在的模板進行修改;所述文檔模板生成模塊提供將模板提 交到文檔管理模塊,以便用于文檔的錄入的功能。
在文檔定義時,用戶只允許選擇系統(tǒng)術(shù)語集模塊ll中的術(shù)語對臨床事件進行描述,使用 術(shù)語集模塊ll以外的術(shù)語會被系統(tǒng)識別為非法請求。同時文檔的結(jié)構(gòu)是根據(jù)臨床文檔標記標 準定義好的,保證了臨床文檔結(jié)構(gòu)標準化。文檔每個部分可以使用的術(shù)語也是事先定義好的, 使用定義外的術(shù)語或者使用定義外的結(jié)構(gòu)會被系統(tǒng)識別為非法請求。當用戶定義好文檔結(jié)構(gòu) 后,文檔模板生成模塊14會自動生成臨床數(shù)據(jù)文檔的模板,這種模板記錄了臨床文檔的內(nèi)容 和結(jié)構(gòu),遵循某種醫(yī)療文檔標記與傳輸協(xié)議,可以用于數(shù)據(jù)的交換和共享。在文檔模板定義 時的協(xié)議和規(guī)范可以是目前已有的任何一種通用的協(xié)議和規(guī)范。
另外,文檔模板生成模塊可以包括一模板自動生成單元,用以將系統(tǒng)圖形用戶界面上的 部件生成底層的模板文檔。
文檔管理模塊15用于文檔管理,.用戶通過該文檔管理模塊對醫(yī)療文檔進行管理,進行錄 入、修改、査詢操作、及文檔的傳輸和共享。文檔管理模塊15是連接用戶和文檔數(shù)據(jù)庫16 的接口,是用戶對標醫(yī)療文檔進行管理的工具。用戶通過文檔管理模塊15對醫(yī)療文檔進行錄 入、修改、查詢等操作,同時可以通過文檔管理模塊15進行文檔的傳輸和共享。它可以使用 任何編程語言實現(xiàn),可以移植到任何操作平臺。文檔管理模塊15可將數(shù)據(jù)庫中的文檔導(dǎo)出成 適合數(shù)據(jù)挖掘的文檔形式;通過文檔管理模塊錄入的文檔機構(gòu),必須符合臨床信息共享系統(tǒng) 所對定的文檔結(jié)構(gòu)標準,該模板為通過文檔生成裝置生成的文檔模板,或為符合存貯、機構(gòu) 標準的任何模板;對文檔管理模塊管理的文檔有進一步要求,文檔必須符合臨床信息共享系 統(tǒng)所規(guī)定的文檔結(jié)構(gòu)的;通過文檔管理模塊對文檔數(shù)據(jù)庫中的文檔進行管理;所述文檔管理 模塊具有權(quán)限分配功能,用戶只能操作特定的文檔。
數(shù)據(jù)庫16用于對使用標準化模板創(chuàng)建的醫(yī)療文檔進行存儲,其可以是適用于醫(yī)療文檔存 儲的任何類型的數(shù)據(jù)庫,如關(guān)系型數(shù)據(jù)庫、XML數(shù)據(jù)庫,也可以是任何一種已經(jīng)存在商業(yè)數(shù)據(jù) 庫產(chǎn)品或者根據(jù)需要自己開發(fā)的數(shù)據(jù)庫產(chǎn)品;可以是和標準文檔存儲兼容的醫(yī)療機構(gòu)已有的 數(shù)據(jù)庫,也可以是僅存放標準臨床文檔的專用數(shù)據(jù)庫。
整個臨床信息共享系統(tǒng)可通過軟件、硬件等多種途徑實現(xiàn),具有很強的可移植性,與所使用的操作系統(tǒng)平臺無關(guān)。本系統(tǒng)中,數(shù)據(jù)擁有者可自由地在自治與共享之間轉(zhuǎn)換;數(shù)據(jù)消 費者通過網(wǎng)格査詢系統(tǒng),利用本地數(shù)據(jù)元査詢多個數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)。數(shù)據(jù)擁有者可自由地在自 治與共享之間轉(zhuǎn)換,這種轉(zhuǎn)化并不影響數(shù)據(jù)擁有者的數(shù)據(jù)安全,而且不需要IT工程的修改。
請參閱圖2,圖2展示了臨床信息共享系統(tǒng)術(shù)語集模塊11的一個優(yōu)選實施例。在該實施 例中使用了目前國際和國內(nèi)標準化的醫(yī)療信息標記和傳輸協(xié)議。HL7詞匯集112是國際標準組 織認證的HL7組織制定的醫(yī)療文檔傳輸協(xié)議HL7協(xié)議中定義的詞匯集。中國醫(yī)院信息基本數(shù) 據(jù)集標準113是中華人民共和國衛(wèi)生部制定的用于各醫(yī)療服務(wù)單位之間進行數(shù)據(jù)傳輸?shù)臉藴剩?該實施例中使用的是1.0版本。SN0MED編碼114主要用于臨床數(shù)據(jù)編碼、檢索及分析。系統(tǒng) 自有術(shù)語集115集合了系統(tǒng)設(shè)計開發(fā)過程中根據(jù)實際需要針對某一應(yīng)用領(lǐng)域的專業(yè)術(shù)語集, 例如可以是為了描述結(jié)直腸癌家系數(shù)據(jù)而定義的家系描述術(shù)語集、為了研究肝癌基因組而增 加的癌癥基因組描述術(shù)語集等。用戶根據(jù)自己的習(xí)慣及需要定義自己的術(shù)語集,即方言術(shù)語 集116。
根據(jù)CDA標準,本實施例使用HL7詞匯集112和中國醫(yī)院信息基本數(shù)據(jù)集標準113作為 標準臨床文檔的文檔頭部基本術(shù)語集。使用SNOMED詞匯集114和系統(tǒng)自有詞匯集115作為標 準文檔體部的術(shù)語集。方言術(shù)語集116可以用于定義文檔的頭部117和體部118。
方言術(shù)語集116可以和系統(tǒng)的術(shù)語進行映射,保證術(shù)語集合的標準化和統(tǒng)一性,為實現(xiàn) 臨床數(shù)據(jù)的共享提供語意基礎(chǔ)。
本發(fā)明同時揭示上述異構(gòu)臨床醫(yī)療信息共享系統(tǒng)的信息共享方法。所述方法包括 文檔結(jié)構(gòu)的定義和表述步驟;
文檔模板生成步驟,用于定義臨床數(shù)據(jù)標準文檔的組成元素及個元素之間的關(guān)系并自動 生成文檔模板;
術(shù)語注冊步驟,用戶在制定臨床文檔時根據(jù)需要使用自定義術(shù)語;該步驟中,用戶向術(shù) 語注冊中心提交注冊請求,注冊中心給予應(yīng)答;機構(gòu)和用戶方言術(shù)語的注冊代號由設(shè)定的編 碼機制實現(xiàn);每個機構(gòu)會得到一個唯一的標識該機構(gòu)的標識符;每個用戶術(shù)語會根據(jù)機構(gòu)代 碼、術(shù)語特征得到一個唯一的標識符;
使用文檔模板創(chuàng)建標準文檔步驟;
文檔管理步驟,用戶對醫(yī)療文檔進行管理,進行錄入、修改、査詢操作、及文檔的傳輸和共享;
自動解析文檔模板結(jié)構(gòu)的步驟,根據(jù)文檔模板的結(jié)構(gòu)自動生成文檔錄入的界面。 所述每個文檔模板成為一個數(shù)據(jù)字典;每個數(shù)據(jù)字典包括元素和元素分組;所述元素為 數(shù)據(jù)字典中最小的結(jié)構(gòu)單位,可為多種數(shù)據(jù)類型;所述元素分組為共同描述某一臨床概念的 多個元素或元素組的集合;元素組包含元素、或元素分組、或元素和元素分組的組合。
對臨床上常見的一對多數(shù)據(jù),使用了動態(tài)組的概念;動態(tài)組的數(shù)量可動態(tài)添加,組內(nèi)組 織了經(jīng)常在一起使用的元素和分組。對臨床上多選的數(shù)據(jù),使用了多選組的概念,以組織用 戶希望用多選形式展現(xiàn)的數(shù)據(jù);所述多選的數(shù)據(jù)在后期的査詢和導(dǎo)出過程中均按照布爾類型 基本數(shù)據(jù)元對待。
所述標準文檔是可以用于臨床文檔共享傳輸?shù)男畔⒌募希蛘呒尤朐O(shè)定信息后、可以 用于傳輸和共享的信息的集合。
以下是有關(guān)本發(fā)明有關(guān)基本數(shù)據(jù)元的定義及數(shù)據(jù)錄入、數(shù)據(jù)訪問的介紹。 一、基本數(shù)據(jù)元的定義與數(shù)據(jù)錄入
數(shù)據(jù)元是一個通過一組屬性描述其定義、標識、表示和允許值的數(shù)據(jù)單元。 一般來說,數(shù) 據(jù)元由三部分組成對象類、特征和表示。對象類是人們希望研究、搜集和存儲其相關(guān)數(shù)據(jù) 的事物,比如人、房屋和訂單等。在本發(fā)明中,所涉及的數(shù)據(jù)均以患者(或某一種疾病的患 者)為中心在收集數(shù)據(jù),因此所有的數(shù)據(jù)的對象類均為患者,因此在構(gòu)建基本數(shù)據(jù)元過程中 將隱去此定義。故本發(fā)明中所有的數(shù)據(jù)元只需定義特性和表示,也就是說特性與表示之間是 一對多的關(guān)系。但是,為了語義上保持一致,本發(fā)明不允許在同一個模型中定義同名數(shù)據(jù)元。
1.公用數(shù)據(jù)元字典
公用數(shù)據(jù)元字典(以下簡稱為字典)是指一組用于從事某一種疾病研究所要收集的數(shù)據(jù) 項,其目的就是統(tǒng)一對數(shù)據(jù)的定義,保證應(yīng)用的一致性。它是數(shù)據(jù)信息模型的載體,也是用 戶建模過程中主要編輯的文件。字典以XML文檔的形式存儲,文件的根(Root)為Dictionary 元素,應(yīng)有字典名稱、作者、創(chuàng)建時間和目的等描述信息。這些信息是字典注冊的主要信息。 依據(jù)不同版本字典所收集的信息,可以通過字典之間轉(zhuǎn)換定義進行轉(zhuǎn)換。字典中的每一個條 目的定義可以有若干種屬性,這些屬性的命名和定義本發(fā)明參考了科學(xué)數(shù)據(jù)共享工程技術(shù)標 準(SDS/T 2131-2004和IS0/IEC 11179),并采用了最小信息量的原則。目前,本系統(tǒng)中目 前考慮的數(shù)據(jù)元定義屬性包括標識符、名稱、英文名、說明、表示、值域和版本信息。這些屬性的定義如下。
a) 標識符
定義在數(shù)據(jù)元字典中,為數(shù)據(jù)元分配的與語言無關(guān)的唯一標識。 英文名稱metadatalndentifier 數(shù)據(jù)類型字符串 值 域自由文本 短 名mdid
注 解必選項最大出現(xiàn)次數(shù)為1:必須是第一個著錄項目、標識符須唯一,由 字母(含下劃線)和數(shù)字組成(參考《科學(xué)數(shù)據(jù)共享元數(shù)據(jù)內(nèi)容》)。
通過應(yīng)用如下規(guī)則,來做到注冊系統(tǒng)內(nèi)部的唯一性。標識符由三部分組成 一部分是 注冊系統(tǒng)自身的編碼(4個大寫字母),加下劃線;第二部分是數(shù)據(jù)字典在本注冊系統(tǒng)中的編 號,為9位數(shù)字(如果預(yù)計將來會很多,可以預(yù)留到9位數(shù)字),第三部分是數(shù)據(jù)字典自身基 本數(shù)據(jù)元條目編號,9位數(shù)字。由此,標識符總共是20位。
b) 名稱
定 義數(shù)據(jù)元的中文名稱,是標識數(shù)據(jù)元的主要手段。 英文名稱- DefinitionChinese 數(shù)值類型字符串 值 域自由文本 短 名defCn
注 解必選項最大出現(xiàn)次數(shù)為l。元數(shù)據(jù)實體名稱如果使用英文,則以一個大寫字 母開頭。元數(shù)據(jù)名中不能使用空格,可以是多個單詞連寫,其中每個單詞開頭為大寫字母。
元數(shù)據(jù)名稱在同一個數(shù)據(jù)字典內(nèi)是唯一的。長度限定在18個以內(nèi)(這個長度可以參考當前流 行的數(shù)據(jù)庫的字段的最大長度進行調(diào)整)。對于中文字符限定為9位。
c) 英文名稱
定 義數(shù)據(jù)元的英文名稱 文名稱DefinitionEnglish 數(shù)值類型字符串 值 域自由文本 短 名defEn
注 解基本數(shù)據(jù)源的英文名稱,這個英文名要盡量的簡短,不允許有空格,只允許字
14母、數(shù)字和下劃線,可以是多個單詞連寫,其中每個單詞開頭為大寫字母。長度限定在18個
以內(nèi)(這個長度可以參考當前流行的數(shù)據(jù)庫的字段的最大長度進行確定)。
d) 說明
定義關(guān)于數(shù)據(jù)元的含義和基本特征的說明,并使之區(qū)別于其他數(shù)據(jù)元。 英文名characterization 數(shù)值類型字符串
值 域自由文本 短名- charatz
注解對CDE—個簡短的描述,最好限制在1000字以內(nèi)。也可以參考文獻等等。
e) 表示
定義數(shù)據(jù)元值的數(shù)據(jù)類型及字符串長度的組合表達格式。 英文名representation
數(shù)值類型字符串 值域自由文本 短名represent
注解表示參考《公用數(shù)據(jù)元目錄》第5部分,同見附錄l
f) 值域
定義元數(shù)據(jù)元素取值范圍。數(shù)據(jù)元取值范圍或相關(guān)內(nèi)容的說明。如所采用的代碼標準, 或通過枚舉等方式給出所有可能的取值。 英文名- ValueRange 數(shù)值類型不定 值域不定
短名s range 注解條件選擇項。
g) 版本
定義數(shù)據(jù)元所在的數(shù)據(jù)字典的版本標識。 英文名- PublishVersion 數(shù)值類型字符串
值域自由文本
短名..version
15注解這個version的信息是從數(shù)據(jù)字典的version信息中獲得的,也就是所在更新數(shù)據(jù) 字典的同時,也就更新了CDE的版本信息。
上述CDE的基本信息是字典中每一個條目都必需進行逐一定義。為了與基本數(shù)據(jù)元注冊系 統(tǒng)兼容,上述項目是必須填寫內(nèi)容,再需要的情況下,可以用于基本數(shù)據(jù)元的定義。
在CDE屬性的選擇中,本實施例選擇了最小信息量的原則,這是針對通用的需求。為了滿 足用戶個性化需求,系統(tǒng)還應(yīng)允許添加新的、標準以外的CDE屬性。
2. 如何與HL7標準兼容
HL7 (Health Level Seven)是醫(yī)療衛(wèi)生信息交換標準。HL7消息的開發(fā)方法包括構(gòu)造參 考信息模型的過程、定義數(shù)據(jù)類型、詞匯范圍的協(xié)調(diào)以及XML (Extensible Markup Language) 數(shù)據(jù)交換標準的實現(xiàn)規(guī)范。HL7在為建立醫(yī)療衛(wèi)生計算機信息系統(tǒng)中的交互操作性標準的中具 有無可爭辯的重要地位。
HL7CDA定義了一種文檔擴展標準,針對數(shù)據(jù)交換規(guī)定了 "臨床文檔"的結(jié)構(gòu)和語義。CDA 必須在HL7 RIM的框架下才能夠理解。但是,CDA文檔既可以獨立于消息,也可以包裝在HL7 消息中進行傳送。因為CDA文檔本身不能夠保證這個文檔在交換后沒有改動,因此CDA文檔 依賴于一個文檔管理系統(tǒng)。因此,如果要對CDA進行存儲,最好有一個XML文檔管理系統(tǒng)。 目前,開源軟件系統(tǒng)——eXist是一個原生的XML數(shù)據(jù)庫,可以充當這個文檔管理系統(tǒng)的角色。
3. 控制性詞匯
系統(tǒng)將維護一個控制性醫(yī)學(xué)術(shù)語集(標準的術(shù)語集vs用戶自己創(chuàng)建),在系統(tǒng)實現(xiàn)中將 用于實現(xiàn)自動完成。在某些情況下,術(shù)語集會很大,可以優(yōu)先顯示使用頻率最高的5-IO項, 在用戶輸入下一個字時同理選擇性輸出。因此,需要記錄詞頻信息。
對于枚舉信息,用戶可以通過上下鍵,或鼠標來點選需要的術(shù)語。如果術(shù)語集中沒有的術(shù) 語,在這個系統(tǒng)中是不能輸入的,如果用戶要輸入這個術(shù)語,就必須要創(chuàng)建新的術(shù)語。然后 輸入。對于用戶錄入數(shù)據(jù)集中已經(jīng)有的術(shù)語,將自動進行信息的錄入,例如編碼的自動完成。 如果在術(shù)語中,沒有相關(guān)的術(shù)語,那么用戶可以創(chuàng)建,系統(tǒng)將顯示術(shù)語創(chuàng)建的界面,接受用 戶定義。用戶需要定義,內(nèi)容與CDE其他的基本元素定義相同,唯一不同的是,這些信息是 單獨維護的,稱為術(shù)語表。在這些術(shù)語表中, 一定要預(yù)留與標準術(shù)語表的映射關(guān)系接口。
自動完成功能也提供給其他的輸入框,但是其他的輸入框因為有單獨的CDE定義,所以沒 有不能輸入的功能,只是簡單的輔助輸入功能。用戶可以靈活地添加。另外醫(yī)學(xué)控制性詞匯以外,還可以使用己有的地理和地理編碼標準,對病人的地址、郵編、 國家、省進行描述。
4.對于"值域"核心數(shù)據(jù)元的思考
基本數(shù)據(jù)元定義標準中,只定義了三種基本類型,分別是數(shù)值型、字符型和日期型。"值 域"是一個條件選擇項,對于不同的數(shù)據(jù)類型有不同的屬性設(shè)置。其中,字符和日期/時間型 變量的屬性設(shè)置最為簡單,只要設(shè)置"模式"屬性。例如,身份證號碼是有規(guī)則可循,可以通 過設(shè)置模式檢查數(shù)據(jù)的正確性。再如,電話號碼如果需要輸入?yún)^(qū)號,可以用模式加以限制。
數(shù)值型變量相對比較復(fù)雜,因為同樣是數(shù)值型變量含義可以不同,適用的統(tǒng)計學(xué)方法也 不同。例如,l和2,既可以表示是與否(如男性或女性),也可以表示完全互斥的分組(如, l工人/2農(nóng)民),又可以表示等級(如,l級/2級),甚至可以表示兩個測量結(jié)果(如,1米/2 米)。
如果只以變量類型這個屬性來定義這個數(shù)據(jù)元,就不能區(qū)分出變量間彼此的區(qū)別。因此, 為了區(qū)分開數(shù)值型變量,增加了變量測量尺度(measurement scale)屬性。在統(tǒng)計學(xué)中,按 照對事物描述的精確程度,將所采用的測量尺度從低級到高級分為4個層次定類尺度、定 序尺度、定距尺度和定比尺度。但是,這四個級別在實際應(yīng)用中概念有重復(fù),有必要重新定 義。
定類變量和定序變量根據(jù)變量水平的個數(shù),可以分為兩分類和多分類變量。后者根據(jù)變 量水平是否有序,可以分為無序和有序變量。無序多分類變量是定類多分類變量;有序多分 類變量是定序多分類變量。對于定類多分類變量,在實際應(yīng)用中存在著多選和單選的問題, 因此需要分別對待。
定距變量是對事務(wù)類別或次序之間間距的測度,計量結(jié)果可以進行加減運算。這樣的變 量有體溫。
定比變量是能夠測算兩個測度之間比值的一種計量尺度。其與定居變量的差別在于有一 個固定的絕對"零點"。定距變量中的"零"并不表示"沒有",而只是一個測量值,,而定比 變量中的"零"就真正代表"沒有"??梢赃M行加減乘除運算。
由于定距與定比變量的統(tǒng)計學(xué)方法基本上一致,所以多數(shù)統(tǒng)計學(xué)書籍將兩者合并為連續(xù) 型變量。因此本系統(tǒng)也采用了這種合并分類方法。
綜上所述,本實施例將變量類型按精確度從低到高以次定義為二分類變量、定類多分
類變量、定序多分類變量、連續(xù)性變量。定類尺度是對事物的類別或?qū)傩缘囊环N測度,按照事物的某種屬性對其進行分類或分組。 定類變量僅能測度類別差異,不能比較各類之間的大小,所以各類之間沒有順序或等級。因 此,從描述的精確度上講,信息量是最少的,在統(tǒng)計學(xué)上只能計算頻數(shù)和頻率。使用定類變 量對事物進行分類時,必須符合窮盡和互斥的原則。窮盡的原則就是指每一個個體都必須能 夠歸為一個類別,互斥的原則是每個個體都只能歸為一個類別。
在很多場合下都能碰到變量為二分類的資料,例如性別、某一天是否下雨等等。在生物 醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,二分類變量多應(yīng)用于反應(yīng)變量,如患者是否發(fā)生腫瘤轉(zhuǎn)移等等。這種兩分類的變
量,可以用布爾變量(是/否)或數(shù)字(1/0)來表示。本系統(tǒng)采用布爾類型來定義二分數(shù)據(jù)。
值得一提的是,某些情況下,布爾氏記錄可能需要考慮第三級定義。例如,性別。通??梢?br> 有男/女之分,但是有些情況下,性別難以區(qū)分,可能需要定義為"unknown"。這時數(shù)據(jù)就轉(zhuǎn) 變?yōu)槎喾诸悊栴}。因此,二分類變量是多分類的特殊情況。
如上所述,定類多分類變量在展現(xiàn)形式上會有兩種單選或多選。首先,為了解決"多 選"問題,本系統(tǒng)引入了分組的概念。例如,如果有多個癥狀需要詢問患者時,將所有的癥 狀定義為二分類變量,然后將這些變量定義在一個組的下面。這種方法也稱為"多重二分法"。 針對這個問題通常還有多重分類法,在本系統(tǒng)中可以通過多重分組實現(xiàn)(需要核實)。因 此,在值域中將不會出現(xiàn)針對多選形式的定類多分類變量的定義,而只有單選形式的定類多 分類變量。
在某些情況下,表格設(shè)計過程中可能需要患者輸入不在已確定選項內(nèi)的類型,例如輸入 既往病史時,可能羅列中的疾病不足以包括患者的情況。因此需要有"其他"選項,別且能 夠接收患者的輸入。如果有多個必須是用"/"分隔。
其次,為了解決單選問題,本發(fā)明設(shè)計了一個枚舉創(chuàng)建機制,對于每一個反應(yīng)項都要需 要定義編號(value)、定義(label)和注解(notation)。值得注意的是,在實際應(yīng)用過程 中用戶—(如醫(yī)生)會考慮到知識的不完備性,希望填表者填寫不在其中的內(nèi)容,這一點對于 表格的進一步完善非常重要。但是,如何在創(chuàng)建的SCHEMA中實現(xiàn)這一點是一個值得研究的問 題。
定序多分類變量,是對事務(wù)之間的等級或順序差別的反應(yīng)。這種變量只能存在單選問題, 解決方案與定類多分類變量的單選形式相同。
關(guān)于連續(xù)性變量,本實施例更多考慮的是數(shù)據(jù)在計算機存儲過程中的準確性。因為浮點 型數(shù)據(jù)的保存與整形是有區(qū)別的。因此,本系統(tǒng)用實數(shù)和整數(shù)兩種類型數(shù)據(jù)來定義連續(xù)性變 量。同時需要定義變量的最小值和最大值用于簡單的數(shù)據(jù)檢査。另外,與其他類型的數(shù)據(jù)不
18同的是,連續(xù)性變量有缺失值問題a因此可以考慮設(shè)置一個缺失值屬性。
綜上所述,在值域的設(shè)置時有六種類型可以考慮,他們分別是字符串、日期、布爾氏變 量(二分類變量)、單選分類(多分類變量單選類型)、整數(shù)(連續(xù)型變量)和實數(shù)(連續(xù)型 變量)。
其中對于布爾氏變量/兩分類單選之間本發(fā)明建議用戶使用后者。這樣系統(tǒng)的擴展性比較
強。例如,大多數(shù)情況下對于性別只需要Female和Male這兩項就可以了,但是在某些情況 下是不能確定的(如胎兒),這時就需要另外一個定義如兩性人(hermaphrodite)。
關(guān)于數(shù)據(jù)地動態(tài)添加;在很多情況下,會需要考慮,根據(jù)用戶地需要來決定添加數(shù)據(jù)。當 然,每一次提供的表格都是一樣的。目前,不支持再分組、多行。
5. Schema的更新與數(shù)據(jù)的轉(zhuǎn)移。
如前所述,在研究過程中數(shù)據(jù)字典會發(fā)生變化。在2.X版本中,增加字典注冊功能,當 用戶要求覆蓋某一個字典時,系統(tǒng)不會把原先的字典覆蓋,會重新創(chuàng)建一個新的字典,而將 前者至于非active狀態(tài),在必要的時候,用戶可以重新取出。
然后,系統(tǒng)調(diào)用xml文檔的圖形化mapping軟件,進行文檔的轉(zhuǎn)換,由系統(tǒng)根據(jù)兩次schema 的修訂,對未改動,直接轉(zhuǎn)換;對于修改的CDE提示用戶進行定義。因此,在進行修改的字 典注冊時,系統(tǒng)要求用戶上傳XSLT文件,來進行數(shù)據(jù)的轉(zhuǎn)換。
6. 對數(shù)據(jù)元的分組
為了滿足用戶對于數(shù)據(jù)元分類(組)和數(shù)據(jù)展示的需求,本發(fā)明擴展了分組的定義,提 出了常規(guī)組、多選組和動態(tài)組的概念。
對于數(shù)據(jù)元的分類有等級的需求,并可能會有多級定義。這些數(shù)據(jù)的分類是沒有具體的 對應(yīng)數(shù)據(jù),而只是若干通用數(shù)據(jù)元歸屬其下。例如,病史。這個基本數(shù)據(jù)元下可能會有大約 幾十項數(shù)據(jù),而病史中有可以分癥狀。癥狀中又有便頻。便頻不是一個基本數(shù)據(jù)元,基本數(shù) 據(jù)是每日大便的次數(shù),這個數(shù)據(jù)根據(jù)是否〉2次來定義。這類分組被稱為常規(guī)組,也就是常規(guī) 意義上的分組。
為了能展現(xiàn)多選題的形式,本發(fā)明定義了多選組。在多選組中,有一個約定就是其下面 的數(shù)據(jù)都是布爾變量。系統(tǒng)會自動地為其添加其他選項,后者是一個字符串。這就是多選組。 許多數(shù)據(jù),例如基因芯片數(shù)據(jù),可能會有多個字段的數(shù)據(jù)。本發(fā)明引入動態(tài)組。用戶在實 際應(yīng)用中可以自行添加一組值進行輸入。目前,l.X版本還有許多不足,例如,字段名應(yīng)該顯示在輸入框上面。有必要增加一個上傳按鈕,允許用戶上傳一個文件,文件中的內(nèi)容將被導(dǎo)
入到網(wǎng)頁中,但不是顯示所有,只顯示前50項。上傳的文檔,將作為附件保存一個連接在這 個XML文檔中。用于后續(xù)的審核。
7醫(yī)療領(lǐng)域特殊數(shù)據(jù)類型的定義
本項目主要定位在醫(yī)療領(lǐng)域,所以需要特化一些特殊的數(shù)據(jù)類型,但這些數(shù)據(jù)類型還是基 于基本數(shù)據(jù)元。
1) 比值類型滴度數(shù)據(jù)(1: 64)和少數(shù)幾種比值,在某些具體的情況下,為了方便起見, 會用分子進行結(jié)果的報告,例如報告32而不是1/32。這些習(xí)慣做法通常容易導(dǎo)致混淆,在本 系統(tǒng)中將使用嚴格的格式??梢钥闯觯味葦?shù)據(jù)實際上是由兩個數(shù)字組成。因此在基本數(shù)P 元導(dǎo)出時,將以數(shù)字類型定義?;緮?shù)據(jù)元的定義要定義分子和分母。按照實數(shù)的定義進行 定義,并提供單位選項,可以不選。默認的情況分母必須大于0。在導(dǎo)出基本數(shù)據(jù)元的時候, 分子和分母作為兩個數(shù)據(jù)元導(dǎo)出。導(dǎo)出的名字在現(xiàn)有名的基礎(chǔ)上加"_分子"和"一分母"。Ratio
的定義和展現(xiàn)參考如下。
2) 索引值,(沒有單位的數(shù)字),使用Real Number數(shù)據(jù)類型??梢杂肞Q類型,帶有一個 無量綱的單位(dimensionlessunit)。例如,1或%。(因此,這種類型可以再低版本中添加)。 主要是為了滿足數(shù)據(jù)單位問題中數(shù)據(jù)單位的約定。實際上就是作為一個數(shù)字存儲。
二基本數(shù)據(jù)元與數(shù)據(jù)訪問
本發(fā)明基于網(wǎng)格的數(shù)據(jù)共享系統(tǒng)還可以包括基于XML的醫(yī)療數(shù)據(jù)收集系統(tǒng)和數(shù)據(jù)庫、 網(wǎng)格服務(wù)系統(tǒng)、基本數(shù)據(jù)元注冊服務(wù)系統(tǒng)、基于xQuery的數(shù)據(jù)査詢系統(tǒng)、患者注冊系統(tǒng)、集 中式醫(yī)療圖像存儲系統(tǒng),以下分別敘述。
1) 建立基于XML的醫(yī)療數(shù)據(jù)收集系統(tǒng)和數(shù)據(jù)庫
本發(fā)明的模型設(shè)計模塊可以允許用戶設(shè)計CRF表單,并自動轉(zhuǎn)換為web表單,進行數(shù)據(jù) 的錄入和檢查。數(shù)據(jù)存儲于eXist XML數(shù)據(jù)庫當中,可以利用xQuery進行數(shù)據(jù)的查詢。 為了滿足sql熟悉的用戶對sql的需求,本發(fā)明采用了 sql2xquery的轉(zhuǎn)化。
2) 建立網(wǎng)格服務(wù)系統(tǒng)
建立網(wǎng)格服務(wù)系統(tǒng),在這個系統(tǒng)的基礎(chǔ)之上,建立網(wǎng)格服務(wù)注冊系統(tǒng),注冊所有的XML數(shù) 據(jù)庫及數(shù)據(jù)服務(wù)信息,可以通過XML數(shù)據(jù)庫的API來訪問其中的數(shù)據(jù)。
3) 建立基本數(shù)據(jù)元注冊服務(wù)系統(tǒng)
20利用利用模型設(shè)計模塊的提供1ocal/remote/caDSR三個選項,分別用于在不同的數(shù)據(jù)庫 中査詢注冊的基本數(shù)據(jù)元。如果基本數(shù)據(jù)元存在,那么就在此XML的元素中加一個屬性值 ^ocal/feemote/^caDSR三個不同的屬性,并將數(shù)據(jù)庫中的值賦給此屬性。例如患者姓名
〈Pat i entName 1 ocal=sc0001 X/Pat i entN咖e〉
本方法充分利用了 XML半結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)庫的優(yōu)勢,利用XML元素的屬性值對基本數(shù)據(jù)元進行 映射和修改。這樣做的最大好處是,數(shù)據(jù)擁有者不需要按照標準數(shù)據(jù)元的名稱來建立自己基 本數(shù)據(jù)元,但對基本數(shù)據(jù)元的定義可以采用注冊服務(wù)中心的標準定義方法,從而達到語義上 的一致。從而能夠在采用和與標準保持一致的前提下,而對自身已有工作最小改動。
通過這種方式,本發(fā)明就將基本數(shù)據(jù)元映射到一個標準的數(shù)據(jù)集上。需要指出的是,通過 這種方式,數(shù)據(jù)的模型將被修改,但是通用數(shù)據(jù)元的名稱并不修改,數(shù)據(jù)擁有者還是用自己 的術(shù)語進行數(shù)據(jù)的收集和查詢,從而達到了 "方言"與"普通話"通行的狀況。由數(shù)據(jù)管理 后臺,按照修改后的數(shù)據(jù)模型對己有數(shù)據(jù)進行核對。
4) 建立基于xQuery的數(shù)據(jù)查詢系統(tǒng),進行聯(lián)合査詢 兩種方式
1統(tǒng)一語言法査詢的時候,首先在數(shù)據(jù)庫中找到患者姓名所對應(yīng)的編碼,例如sc0001, 然后利用xQuery對系統(tǒng)進行查詢。
2本地術(shù)語査詢時用戶可以選擇本地還是網(wǎng)格査詢。無論哪一種,用戶輸入的都是本地 術(shù)語,不同的是,網(wǎng)格査詢選項,將根據(jù)用戶的定義利用網(wǎng)格標準語言進行網(wǎng)格語義査詢。
5) 數(shù)據(jù)集的語義重復(fù)問題
在一個表單中,用戶定義的基本數(shù)據(jù)元是不允許有重復(fù)的,這一點也是符合邏輯的,并且 容易通過軟件實現(xiàn)。
在用戶進行標準數(shù)據(jù)元映射時,需要對組進行定義,并利用術(shù)語系統(tǒng)進行語義定義,例如 術(shù)后信息,人工將這個詞拆成術(shù)后(sc003)和信息(sc005)兩個詞,并在術(shù)語系統(tǒng)中查找 這兩個術(shù)語,如果沒有將申請?zhí)砑有碌男g(shù)語條目,并記錄此基本數(shù)據(jù)元的來源數(shù)據(jù)庫、xpath 以及對應(yīng)的標準數(shù)據(jù)元。并將這連兩個術(shù)語拼接作為語義的唯一值(sc003sc005)。并在基本 數(shù)據(jù)元注冊系統(tǒng)中查詢(group表),如果在標準數(shù)據(jù)集中沒有,則申請新的group值。同時, 組的類型,也將稱為語義的一部分。
在定義基本數(shù)據(jù)元的過程中, 一般組包括多選組的定義,與group組相同。兩外單選在增 加值的時候需要引用術(shù)語系統(tǒng)的定義。例如性別(sc008),男(s001),女(sc002)等等。
難度最大的是動態(tài)組數(shù)據(jù)的定義,例如隨訪。在査詢的時候需要能夠查詢出患者每次隨訪的日期?那么在數(shù)據(jù)定義的時候,可以獲得動態(tài)組的定義,并在這個組下定義了隨訪日期的 這個基本數(shù)據(jù)元。由于定義了動態(tài)組信息,所以可以將這個屬性付給這個基本數(shù)據(jù)源。在査 詢的時候可以對這樣的基本數(shù)據(jù)源獲得多個信息。
6) 數(shù)據(jù)安全訪問問題
目前,eXist數(shù)據(jù)庫提供了數(shù)據(jù)庫訪問權(quán)限,在數(shù)據(jù)collection以及元素級別上沒有訪 問權(quán)限。
通過限制網(wǎng)格查詢對數(shù)據(jù)元素名査詢的限制,也就可以保證數(shù)據(jù)的安全。 一方面,用戶的 元素名是本地名稱,很難為外界知曉,另一方面,網(wǎng)格查詢只能通過元素的remote屬性來査 詢,這使得數(shù)據(jù)擁有者在數(shù)據(jù)共享方面游刃有余。可以靈活的指定權(quán)限以及共享數(shù)據(jù)。
7) 患者注冊系統(tǒng)
對于異構(gòu)醫(yī)療數(shù)據(jù)最大的挑戰(zhàn)之一就是,基于患者的醫(yī)療數(shù)據(jù)的整合。例如,在疾病控制 中心,每天會處理非常多的數(shù)據(jù),而這些數(shù)據(jù)是來自于多個醫(yī)院,如何將這些數(shù)據(jù)與己有數(shù) 據(jù)的患者識別是非常頭痛的一件事情。但是,只要能夠識同一個患者,那么所有關(guān)于這個人 的數(shù)據(jù)就可以匯總在一起。
例如院內(nèi)醫(yī)療信息的共享。院內(nèi)醫(yī)療信息的共享, 一方面是信息的互查。由于在不同科室, 檢測與關(guān)注的內(nèi)容不同,但是在語義上患者的基本信息是一致的??梢酝ㄟ^這些信息進行査 詢。但是,在某些特殊情形下,不同的醫(yī)療信息系統(tǒng)均有自己的患者唯一編號,在這種情形 下,構(gòu)建一個患者注冊系統(tǒng),將非常有利于信息的互查。
信息安全性的考慮。由于這些信息將涉及患者的隱私信息,因此能夠進行患者信息mapping 的人,必須是患者的主治醫(yī)生,或其上級醫(yī)師。系統(tǒng)中將給患者一個臨時號碼,這個號碼有 一個審核狀態(tài),如果通過設(shè)定算法能夠100%確定為為患者本人,那么這些信息將被進行關(guān)聯(lián), 多個號碼及其系統(tǒng)將進行組合映射。
識別患者身份的算法。取患者的姓名/身份證號碼/…信息,每一個項賦予相當?shù)臋?quán)重, 通過進行簡單的加減操作來。
8) 集中式醫(yī)療圖像存儲系統(tǒng)
本發(fā)明將采用caBIG的NCIA系統(tǒng)來集中存儲患者的醫(yī)療圖像數(shù)據(jù)。這些數(shù)據(jù)將由用戶自 行管理,訪問需要權(quán)限控制,通過這種方式來訪問數(shù)據(jù)。
綜上所述,本發(fā)明通過各臨床術(shù)語集合的整合和映射,及用戶方言術(shù)語的補充,擴大臨 床術(shù)語集合的覆蓋范圍,增加術(shù)語描述的靈活性,使得臨床實體的描述更加貼近真實情況。通過臨床數(shù)據(jù)字典、標準文檔生成裝置,實現(xiàn)標準臨床文檔的自動生成,最終通過映射,建 立完善的臨床文檔數(shù)據(jù)庫,對標準臨床文檔進行管理。當用戶定義數(shù)據(jù)字典后,系統(tǒng)可以自 動生成語義完整的可用于臨床文檔傳輸和共享的標準臨床文檔,實現(xiàn)臨床信息的無縫連接和 有效共享。
實施例二
請參閱圖3,圖3是本發(fā)明系統(tǒng)的優(yōu)選實施例。在本實施例中,用戶通過OID注冊中心 301提交方言術(shù)語,0ID注冊中心301為每個用戶設(shè)置的方言術(shù)語分配一個唯一的標識符;此 時系統(tǒng)允許用戶在定義文檔時使用方言。詞匯集302是一個包括用戶方言集在內(nèi)的術(shù)語集合, 其可以包括任何標準化的術(shù)語標準和規(guī)范,可以為圖2所示的術(shù)語集優(yōu)選實施例。在該實施 例中,用戶定義的臨床文檔模板被成為數(shù)據(jù)字典,記錄了臨床文檔的元素和個元素間的關(guān)系, 通過數(shù)據(jù)字典生成303產(chǎn)生數(shù)據(jù)字典。在本實施例中,所使用的文檔標記標準為CDA文檔標 準,所有的臨床文檔均按照CDA文檔的格式要求進行定義,所有的CDA文檔均為XML文 檔形式,用戶通過CDA文檔管理界面304對文檔進行管理。所有的文檔將按照HL7標準的 RIM模型進行存儲,因此存儲CDA文檔的數(shù)據(jù)庫在本實施例為RIM數(shù)據(jù)庫305。應(yīng)該注意這 里的RIM數(shù)據(jù)庫可以是任何能夠很好的支持RIM數(shù)據(jù)模型的數(shù)據(jù)庫類型,它可以是XML數(shù) 據(jù)庫,也可以是關(guān)系型數(shù)據(jù)庫。如果為關(guān)系型數(shù)據(jù)庫,可以使用映射機制,將XML格式的 CDA文檔轉(zhuǎn)換為相對應(yīng)的關(guān)系型數(shù)據(jù)庫存儲表格。
圖4是上述優(yōu)選實施例的工作流程圖。如果在用戶定義數(shù)據(jù)字典時,需要按照習(xí)慣使用 某些自定義術(shù)語,則用戶向OID注冊中心提出注冊申請,OID注冊中心接受申請,給予每個 術(shù)語唯一的標識號,用戶生成自己的方言術(shù)語集合,方言術(shù)語集合404和已有術(shù)語集合403 共同組成了用戶定義數(shù)據(jù)字典的術(shù)語集404。用戶使用新的術(shù)語集405根據(jù)臨床記錄的需求, 使用數(shù)據(jù)字典生成裝置制定CDA文檔模板406,然后生成CDA文檔407,最后通過管理界面 對這些標準化的文檔進行管理408。當文檔需要進行傳輸和共享時,由于用戶定義的方言可能 在另一個用戶中并不存在,此時可以使用系統(tǒng)的術(shù)語映射機制將方言映射到標準術(shù)語集,實 現(xiàn)了術(shù)語的同一。
因為在CDA文檔制定過程中均使用標準化的術(shù)語,同時CDA文檔格式是標準化的,因 此通過整個流程所產(chǎn)生的文檔是標準化的可以用于交換、傳輸?shù)呐R床文檔,從而實現(xiàn)了臨床 文檔的真正共享408。
23實施例三——數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)
請參閱圖5,圖5是本系統(tǒng)的一個實施例中數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)的表示方法,在該實施例中每個文
檔模板稱為一個數(shù)據(jù)字典501,數(shù)據(jù)字典501記錄了一份標準臨床文檔的結(jié)構(gòu)。數(shù)據(jù)字典由元 素502和分組503組成,分組和元素結(jié)合,進行層次組合,形成了文檔結(jié)構(gòu)樹,體現(xiàn)文檔中 各種數(shù)據(jù)之間的關(guān)系。
元素即文檔的基本數(shù)據(jù)元(common data element, CDE),是文檔系統(tǒng)中最基本的數(shù)據(jù)單元。 每一個元素具有一個唯一的名字,且具有一定的屬性,在整個數(shù)據(jù)字典中處在一定的層次關(guān) 系中。數(shù)據(jù)元素可以是字符串、整數(shù)、常數(shù)、日期、布爾變量和單選分類。單選分類中提供 至少兩個選項,在這些選項中用戶只能選擇其中一個,臨床文檔中的單選題目即可設(shè)置成單 選分類。
分組是多個元素的集合,這些元素共同描述某一語意。分組下可以再設(shè)置分組。每個分 組有一個唯一的分組名,并具有一定的屬性。
系統(tǒng)建議使用的分組有三種,分別為常規(guī)組、動態(tài)組和多選組。
常規(guī)組只作為元素的歸類和數(shù)據(jù)組織方式,其他的組系此組的派生類。在常規(guī)組下可以 創(chuàng)建任意類型組和元素。
多選組是為了組織用戶希望用多選形式展現(xiàn)的一組數(shù)據(jù)。這些數(shù)據(jù)具有特殊性,在后期 的査詢和導(dǎo)出過程中均按照布爾類型基本數(shù)據(jù)元對待。此組下的數(shù)據(jù)均為布爾變量數(shù)據(jù),不 能添加其他類型的數(shù)據(jù)。
動態(tài)組(dynamic group)在進行數(shù)據(jù)收集時,有些信息可能需要多次重復(fù),而每次重復(fù) 的信息可能會很多,因此需要用"組"來組織。在一個對象的某種屬性對應(yīng)多個屬性值的時 候可以使用動態(tài)組,動態(tài)組實現(xiàn)了一對多的功能。
實施例四——架構(gòu)實現(xiàn)方式
圖6a采用客戶端/服務(wù)器形式完成醫(yī)療文檔共享。用戶通過客戶端的模板生成裝置,生 成臨床標準文檔模板,將文檔模板通過模板轉(zhuǎn)換裝置轉(zhuǎn)換成可用于客戶端輸入的格式,并通 過網(wǎng)絡(luò)將模板上傳到服務(wù)器端。用戶通過客戶端的數(shù)據(jù)管理程序?qū)Ψ?wù)其上的數(shù)據(jù)進行操作。 從而實現(xiàn)了醫(yī)療文檔的集中存儲和分布式管理,進而實現(xiàn)醫(yī)療文檔的共享。
圖6b采用本地服務(wù)形式的形式完成了醫(yī)療文檔的共享。文檔模板的生成,文檔的管理和 文檔的存儲均在本地計算機完成。此種形式需要本地計算機提供網(wǎng)絡(luò)接口,當需要進行數(shù)據(jù) 傳輸和共享時,本地計算機通過網(wǎng)絡(luò)接口,將本地數(shù)據(jù)傳遞給其他用戶,完成醫(yī)療數(shù)據(jù)的共
24享。
圖6C采用瀏覽器/服務(wù)器形式實現(xiàn)醫(yī)療文檔數(shù)據(jù)的共享,此時用戶本地計算機上只需要 安裝有可以瀏覽網(wǎng)頁的瀏覽器,標準文檔生成裝置和文檔管理裝置均安裝在服務(wù)器端,本地 用戶通過網(wǎng)絡(luò)連接到服務(wù)器并使用網(wǎng)絡(luò)瀏覽器調(diào)用安裝于服務(wù)器上的文檔模板生成裝置和文 檔管理裝置,創(chuàng)建新的文檔模板,填寫錄入新的數(shù)據(jù),實現(xiàn)對數(shù)據(jù)的遠程操作。
圖6僅提出了本系統(tǒng)可能的實現(xiàn)形式,在具體實施過程中,根據(jù)實際情況,系統(tǒng)可以是
以上三種方法的任何一種,也可能是這三種實現(xiàn)形式的綜合。
圖7是本系統(tǒng)使用客戶端/服務(wù)器架抅及瀏覽器/服務(wù)器架構(gòu)所構(gòu)建的優(yōu)選實施例。在該實 施例中,數(shù)據(jù)字典生成裝置702、方言術(shù)語注冊裝置703作為客戶端的服務(wù)軟件安裝在客戶端 的計算機上。用戶在本地,調(diào)用數(shù)據(jù)字典生成裝置創(chuàng)建臨床文檔的模板。該模板可以是根據(jù) 科室、臨床試驗的特點自定義的任何結(jié)構(gòu),字典中各個元素及不同的分組之間形成一種樹形 的層次結(jié)構(gòu),這種結(jié)構(gòu)記錄了文檔中各個組成部分的邏輯關(guān)系。當用戶需要使用方言數(shù)據(jù)來 描述臨床對象時,調(diào)用本地的方言術(shù)語注冊裝置703,為每一個方言生成唯一的識別碼。當用 戶完成數(shù)據(jù)字典的定義時,使用數(shù)據(jù)字典上傳裝置,將定義好的數(shù)據(jù)字典上傳到服務(wù)其上。 數(shù)據(jù)字典上傳裝置可以集成到數(shù)據(jù)字典生成裝置702中,也可以單獨形成一個模塊,在此實 施例中,數(shù)據(jù)字典生成裝置集成了數(shù)據(jù)字典的生成,數(shù)據(jù)字典的上傳,數(shù)據(jù)字典的展示功能。 當數(shù)據(jù)字典上傳成功后,服務(wù)器端會根據(jù)用戶定義的數(shù)據(jù)字典自動生成適合瀏覽器顯示的文 檔結(jié)構(gòu),次功能可以整合到醫(yī)療信息數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)705中。用戶通過瀏覽器701訪問位于服 務(wù)器704上的醫(yī)療信息數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)705,對醫(yī)療文檔數(shù)據(jù)庫706中的數(shù)據(jù)進行査找、添加、 修改等操作。
實施例五——數(shù)據(jù)共享
圖8是基于基本數(shù)據(jù)元數(shù)據(jù)共享的整體架構(gòu)圖。在該實施例中,網(wǎng)格服務(wù)器801由四個 主要模塊組成,它們分別是患者注冊802、組織機構(gòu)注冊803、元數(shù)據(jù)注冊804以及數(shù)據(jù)服務(wù) 注冊805組成,也就是說中心服務(wù)器只是存儲元數(shù)據(jù)信息和數(shù)據(jù)服務(wù)信息,所有的數(shù)據(jù)都在 數(shù)據(jù)擁有者。另外,網(wǎng)格服務(wù)器將提供數(shù)據(jù)査詢功能。同時,網(wǎng)格服務(wù)器通過患者注冊802 模塊,可以與個人醫(yī)療信息檔案807交互;通過組織機構(gòu)注冊803與醫(yī)院信息系統(tǒng)交互806; 通過元數(shù)據(jù)注冊804與其他網(wǎng)格系統(tǒng)交互;通過服務(wù)注冊805訪問所有的數(shù)據(jù)源。
圖8中結(jié)直腸癌809、骨質(zhì)疏松810和肝癌811代表了各種研究人員需要研究的疾病,不 同疾病的研究人員會共享某些基本數(shù)據(jù)元,并會擁有自己特殊的數(shù)據(jù)元。通過這種方式,數(shù)
25據(jù)擁有者可以在自治數(shù)據(jù)與共享數(shù)據(jù)之間進行自由地選擇。
這里本發(fā)明的描述和應(yīng)用是說明性的,并非想將本發(fā)明的范圍限制在上述實施例中。這 里所披露的實施例的變形和改變是可能的,對于那些本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員來說實施例的替 換和等效的各種部件是公知的。本領(lǐng)域技術(shù)人員應(yīng)該清楚的是,在不脫離本發(fā)明的精神或本 質(zhì)特征的情況下,本發(fā)明可以以其他形式、結(jié)構(gòu)、布置、比例,以及用其他元件、材料和部 件來實現(xiàn)。在不脫離本發(fā)明范圍和精神的情況下,可以對這里所披露的實施例進行其他變形 和改變。
如,術(shù)語集模塊可以使用其他詞匯集或數(shù)據(jù)集標準。
權(quán)利要求
1、一種異構(gòu)臨床醫(yī)療信息共享系統(tǒng),其特征在于,該系統(tǒng)包括術(shù)語集模塊,用于規(guī)范共享文檔中所使用的術(shù)語;文檔模板生成模塊,用于定義標準臨床數(shù)據(jù)文檔的組成元素及個元素之間的關(guān)系并自動生成文檔模板,收集管理元數(shù)據(jù);文檔管理模塊,用于文檔管理,用戶通過該文檔管理模塊對醫(yī)療文檔進行管理,進行錄入、修改、查詢操作、及文檔的傳輸和共享;以及存儲臨床數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)庫;所述術(shù)語集模塊、文檔模板生成模塊、文檔管理模塊、數(shù)據(jù)庫依次連接。
2、 根據(jù)權(quán)利要求1所述的異構(gòu)臨床醫(yī)療信息共享系統(tǒng),其特征在于所述系統(tǒng)還包括連接所 述術(shù)語集模塊的方言術(shù)語注冊模塊,用于用戶在制定臨床文檔時根據(jù)需要使用自定義術(shù) 語,并方言術(shù)語集映射到標準數(shù)據(jù)集;所述方言術(shù)語注冊模塊對用戶的請求給予應(yīng)答,使 用特定的算法為每個用戶分配一個唯一的標識符,注冊裝置根據(jù)用戶的唯一標識符為該用 戶的方言進行注冊;只有通過注冊的方言才可出現(xiàn)在術(shù)語集合中,數(shù)據(jù)擁有者及可自由地 在自治與共享之間轉(zhuǎn)換;通過網(wǎng)格査詢系統(tǒng),利用本地數(shù)據(jù)元査詢多個數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)。
3、 根據(jù)權(quán)利要求1所述的異構(gòu)臨床醫(yī)療信息共享系統(tǒng),其特征在于所述文檔模板生成模塊 包括一模板自動生成單元,將系統(tǒng)圖形用戶界面上的部件生成底層的模板文檔;所述文檔 模板生成模塊為用戶提供了自動生成文檔模板的功能;對文檔模板的制定有進一步限定, 自動生成的文檔模板的基本結(jié)構(gòu)是參照國際標準制定的,每個模塊下的內(nèi)容可根據(jù)用戶需 求個性化定制;所述文檔模板生成模塊產(chǎn)生的文檔模板具有通用性、可讀性。
4、 根據(jù)權(quán)利要求1所述的異構(gòu)臨床醫(yī)療信息共享系統(tǒng),其特征在于文檔模板生成模塊生成 的不同文檔部分所使用的標準術(shù)語集合的子集不同所述文檔模板生成模塊可以對已經(jīng)存 在的模板進行簡單的覆蓋修改。
5、 根據(jù)權(quán)利要求1所述的異構(gòu)臨床醫(yī)療信息共享系統(tǒng),其特征在于所述文檔管理模塊可以 進行文檔的錄入、修改、查詢;文檔管理模塊可將數(shù)據(jù)庫中的文檔導(dǎo)出成適合數(shù)據(jù)挖掘的 文檔形式;通過文檔管理模塊錄入的文檔,必然符合臨床信息共享系統(tǒng)所對定的文檔結(jié)構(gòu) 標準,該模板為通過文檔生成裝置生成的文檔模板,或為符合存貯、機構(gòu)標準的任何模板; 對文檔管理模塊管理的文檔有進一步要求,文檔必須符合臨床信息共享系統(tǒng)所規(guī)定的文檔 結(jié)構(gòu)的;通過文檔管理模塊對文檔數(shù)據(jù)庫中的文檔進行管理;所述文檔管理模塊具有權(quán)限 分配功能,用戶只能操作特定的文檔。
6、 一種異構(gòu)臨床醫(yī)療信息共享方法,其特征在于所述方法包括基于元數(shù)據(jù)的文檔結(jié)構(gòu)的定義和表述步驟; 依據(jù)臨床醫(yī)學(xué)常用的13種數(shù)據(jù)類型對數(shù)據(jù)進行定義; 為數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)化預(yù)留醫(yī)學(xué)自然語言處理接口 ;文檔模板生成步驟,用于定義臨床數(shù)據(jù)標準文檔的組成元素及個元素之間的關(guān)系并自 動生成文檔模板。
7、 根據(jù)權(quán)利要求6所述的異構(gòu)臨床醫(yī)療信息共享方法,其特征在于所述方法還包括術(shù)語注 冊步驟,用戶在制定臨床文檔時根據(jù)需要使用自定義術(shù)語。
8、 根據(jù)權(quán)利要求6所述的異構(gòu)臨床醫(yī)療信息共享方法,其特征在于所述方法還包括使用文檔模板創(chuàng)建標準文檔步驟,自動解析文檔模板結(jié)構(gòu)的步驟,根據(jù)文檔模板的結(jié)構(gòu)自動生成 文檔錄入的界面。
9、 根據(jù)權(quán)利要求6所述的異構(gòu)臨床醫(yī)療信息共享方法,其特征在于所述方法還包括文檔管 理步驟,用戶對醫(yī)療文檔進行管理,進行錄入、修改、查詢操作、及文檔的傳輸和共享。
10、 根據(jù)權(quán)利要求6所述的異構(gòu)臨床醫(yī)療信息共享方法,其特征在于所述文檔模板生成 步驟包括用戶根據(jù)實際需要,通過一模板自動生成單元,將圖形用戶界面上的部件生成 底層的模板文檔。
11、 根據(jù)權(quán)利要求6所述的異構(gòu)臨床醫(yī)療信息共享方法,其特征在于所述每個文檔模板 成為一個數(shù)據(jù)字典;每個數(shù)據(jù)字典包括元素和元素分組;所述元素為數(shù)據(jù)字典中最小的結(jié)構(gòu)單位,可為多種數(shù)據(jù)類型;所述元素分組為共同描述某一臨床概念的多個元素或元素組的集合;元素組包含元 素、或元素分組、或元素和元素分組的組合。
12、 根據(jù)權(quán)利要求6所述的異構(gòu)臨床醫(yī)療信息共享方法,其特征在于對臨床上常見的一 對多數(shù)據(jù),使用了動態(tài)組的概念;動態(tài)組的數(shù)量可動態(tài)添加,組內(nèi)組織了經(jīng)常在一起使用 的元素和分組。
13、 根據(jù)權(quán)利要求6所述的異構(gòu)臨床醫(yī)療信息共享方法,其特征在于對臨床上多選的數(shù) 據(jù),使用了多選組的概念,以組織用戶希望用多選形式展現(xiàn)的數(shù)據(jù);所述多選的數(shù)據(jù)在后 期的査詢和導(dǎo)出過程中均按照布爾類型基本數(shù)據(jù)元對待。
14、 根據(jù)權(quán)利要求6所述的異構(gòu)臨床醫(yī)療信息共享方法,其特征在于所述術(shù)語注冊步驟 中,用戶向術(shù)語注冊中心提交注冊請求,注冊中心給予應(yīng)答;機構(gòu)和用戶方言術(shù)語的注冊代號由設(shè)定的編碼機制實現(xiàn); 每個機構(gòu)會得到一個唯一的標識該機構(gòu)的標識符;每個用戶術(shù)語會根據(jù)機構(gòu)代碼、術(shù)語特征得到一個唯一的標識符。
15、 根據(jù)權(quán)利要求6所述的異構(gòu)臨床醫(yī)療信息共享方法,其特征在于所述標準文檔是可 以用于臨床文檔共享傳輸?shù)男畔⒌募希蛘呒尤朐O(shè)定信息后、可以用于傳輸和共享的信息的集合。
全文摘要
本發(fā)明揭示一種異構(gòu)臨床醫(yī)療信息共享系統(tǒng)及方法,所述系統(tǒng)包括術(shù)語集模塊、文檔模板生成模塊、文檔管理模塊、存儲臨床數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)庫;所述術(shù)語集模塊、文檔模板生成模塊、文檔管理模塊、數(shù)據(jù)庫依次連接。術(shù)語集模塊,用于規(guī)范共享文檔中所使用的術(shù)語;文檔模板生成模塊,用于定義標準臨床數(shù)據(jù)文檔的組成元素及個元素之間的關(guān)系并自動生成文檔模板,收集管理元數(shù)據(jù);文檔管理模塊,用于文檔管理,用戶通過該文檔管理模塊對醫(yī)療文檔進行管理,進行錄入、修改、查詢操作、及文檔的傳輸和共享。本發(fā)明通過臨床數(shù)據(jù)字典、標準文檔生成裝置,實現(xiàn)標準臨床文檔的自動生成;最終通過映射,建立完善的臨床文檔數(shù)據(jù)庫,對標準臨床文檔進行管理和共享。
文檔編號G06F19/00GK101452503SQ20081020372
公開日2009年6月10日 申請日期2008年11月28日 優(yōu)先權(quán)日2008年11月28日
發(fā)明者李作峰 申請人:上海生物信息技術(shù)研究中心
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