一種慢性阻塞性肺病急性加重基因表達(dá)診斷芯片的制作方法
【專(zhuān)利摘要】本發(fā)明提供了一種慢性阻塞性肺病急性加重基因表達(dá)診斷芯片，其特征在于，包括載體，所述載體上設(shè)有FOS基因探針、IFI27基因探針、CYR61基因探針、CTGF基因探針、GPRC5A基因探針、FOSB基因探針、DCN基因探針、C11orf96基因探針、KIR2DS2基因探針、SH2D1B基因探針、CD8B基因探針、OR2W5基因探針、FGFBP2基因探針和TCF7基因探針。與現(xiàn)有技術(shù)相比，本發(fā)明為診斷慢性阻塞性肺病急性加重提供了生物學(xué)依據(jù)，能快速、準(zhǔn)確地檢測(cè)出慢性阻塞性肺病急性加重，對(duì)于慢性阻塞性肺病急性加重的診斷和治療具有重要的意義。
【專(zhuān)利說(shuō)明】一種慢性阻塞性肺病急性加重基因表達(dá)診斷芯片

【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001]本發(fā)明屬于生物醫(yī)學(xué)檢測(cè)領(lǐng)域，涉及一種診斷芯片，特別涉及一種慢性阻塞性肺病急性加重基因表達(dá)診斷芯片。

【背景技術(shù)】
[0002]慢性阻塞性肺病(COPD)是一種以不完全可逆且持續(xù)進(jìn)展的氣流受限和慢性氣道炎癥為特征的肺部疾病(綜述參見(jiàn)Fabbri等,2006, Am.J.Respir.Crit.CareMed.173:1056-1065)。其主要的臨床表現(xiàn)為咳嗽，咳痰以及呼吸困難。隨著病程的進(jìn)展，可發(fā)展到呼吸衰竭，嚴(yán)重影響生活質(zhì)量。由于COPD患病人數(shù)多，死亡率高，社會(huì)經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)重，已成為一個(gè)重要的公共衛(wèi)生問(wèn)題。COPD目前居全球死亡原因的第4位，據(jù)世界衛(wèi)生組織估計(jì)，至2020年將位居世界疾病經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)第5位。在我國(guó)，慢性阻塞性肺病同樣是嚴(yán)重危害人民身體健康的重要慢性呼吸系統(tǒng)疾病，居城市死因第4位和農(nóng)村死因第3位。
[0003]慢性阻塞性肺病急性加重(AECOPD)，定義為咳嗽、咳痰或氣促加重，需要及時(shí)關(guān)注，改變平時(shí)的治療方案。CCffD患者通常診斷于疾病的嚴(yán)重階段，即患者發(fā)生明顯的肺功能損害時(shí)。隨著COPD病情進(jìn)展，AECOPD的發(fā)生會(huì)越來(lái)越頻繁且越來(lái)越重。AECOPD不僅癥狀加重，而且容易出現(xiàn)呼吸衰竭、肺性腦病、心律失常和心力衰竭等各器官并發(fā)癥，使再次急性發(fā)作的風(fēng)險(xiǎn)升高，肺功能進(jìn)一步惡化，死亡率升高。
[0004]COPD的診斷除了依據(jù)危險(xiǎn)因素和癥狀體征外，金標(biāo)準(zhǔn)診斷參數(shù)是FEV1/FVC(1秒鐘用力呼氣容積/用力肺活量)< 70%，該參數(shù)通過(guò)肺功能檢查來(lái)測(cè)量(Rennard，1998，Chest 113:235S-241S)。而目前診斷AECOPD主要是依據(jù)癥狀和治療的改變，具有很大的主觀性，且難以與其它臨床情況如肺部感染和心功能不全等鑒別。因此，如何更加準(zhǔn)確地診斷慢性阻塞性肺病以及急性加重期，以及如何優(yōu)化現(xiàn)有預(yù)測(cè)指標(biāo)指導(dǎo)該疾病的治療等問(wèn)題顯得尤為緊迫。
[0005]基因芯片技術(shù)以高通量平行篩選疾病相關(guān)基因的技術(shù)優(yōu)勢(shì)，為研究CCffD發(fā)生發(fā)展中多基因改變的分子機(jī)制提供了有力的工具，特別在CCffD加重相關(guān)基因群的篩選中具有特殊優(yōu)勢(shì)。


【發(fā)明內(nèi)容】

[0006]本發(fā)明的目的在于提供一種慢性阻塞性肺病急性加重基因表達(dá)診斷芯片。
[0007]為了達(dá)到上述目的，本發(fā)明提供了一種慢性阻塞性肺病急性加重基因表達(dá)診斷芯片，其特征在于，包括載體，所述載體上設(shè)有FOS基因探針、IFI27基因探針、CYR61基因探針、CTGF基因探針、GPRC5A基因探針、FOSB基因探針、DCN基因探針、Cllorf96基因探針、KIR2DS2基因探針、SH2D1B基因探針、CD8B基因探針、0R2W5基因探針、FGFBP2基因探針和TCF7基因探針。
[0008]優(yōu)選地，所述的載體上還設(shè)有ACTB基因探針作為陽(yáng)性?xún)?nèi)參。
[0009]優(yōu)選地，所述的載體上還設(shè)有空白對(duì)照探針。
[0010]本發(fā)明通過(guò)收集10例慢性阻塞性肺病急性加重患者(AECOPD)外周血、10例慢性阻塞性肺病穩(wěn)定患者(StCOPD)外周血，以及10例健康人(Control)外周血。應(yīng)用基因表達(dá)譜芯片技術(shù)檢測(cè)外周血單個(gè)核細(xì)胞(PBMC)超過(guò)45000個(gè)基因的表達(dá)，分別篩選急性加重不同時(shí)期(發(fā)病第Id、第3d和第1d)較穩(wěn)定期和正常對(duì)照共同上調(diào)或下調(diào)的基因，隨后再次篩選急性加重不同時(shí)期共同差異的基因，同時(shí)與臨床嚴(yán)重度評(píng)分(DESS)進(jìn)行匹配，最終篩選出有臨床意義的差異表達(dá)基因。最終確定慢性阻塞性肺病急性加重期患者PBMC基因表達(dá)譜中有8個(gè)上調(diào)基因；另有6個(gè)下調(diào)基因。
[0011]本發(fā)明以獲得的14個(gè)基因加上一個(gè)內(nèi)參基因作為分類(lèi)器(參見(jiàn)表1)，設(shè)計(jì)針對(duì)這些基因的探針，最后確定用于設(shè)計(jì)診斷芯片的15個(gè)基因探針。
[0012]表1
[0013]

【權(quán)利要求】
1.一種慢性阻塞性肺病急性加重基因表達(dá)診斷芯片，其特征在于，包括載體，所述載體上設(shè)有FOS基因探針、IFI27基因探針、CYR61基因探針、CTGF基因探針、GPRC5A基因探針、FOSB基因探針、DCN基因探針、Cllorf96基因探針、KIR2DS2基因探針、SH2D1B基因探針、⑶8B基因探針、0R2W5基因探針、FGFBP2基因探針和TCF7基因探針。
2.如權(quán)利要求1所述的慢性阻塞性肺病急性加重基因表達(dá)診斷芯片，其特征在于，所述的載體上還設(shè)有ACTB基因探針作為陽(yáng)性?xún)?nèi)參。
3.如權(quán)利要 求1所述的慢性阻塞性肺病急性加重基因表達(dá)診斷芯片，其特征在于，所述的載體上還設(shè)有空白對(duì)照探針。
【文檔編號(hào)】C12Q1/68GK104131073SQ201410269884
【公開(kāi)日】2014年11月5日 申請(qǐng)日期:2014年6月17日 優(yōu)先權(quán)日:2014年6月17日
【發(fā)明者】王向東, 吳曉丹, 眭飛 申請(qǐng)人:復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院