專利名稱：：產(chǎn)生脂肪醛的方法和組合物的制作方法產(chǎn)生脂肪醛的方法和組合物相關(guān)申請(qǐng)的交叉引用本申請(qǐng)要求2008年10月7日提交的美國臨時(shí)申請(qǐng)第61/103，447號(hào)的優(yōu)先權(quán)，通過弓丨用將其全部內(nèi)容全部并入本文。
背景技術(shù)：
：石油是地球上發(fā)現(xiàn)的、液體、氣體或固體形式的有限的天然資源。石油主要由碳?xì)浠衔锝M成，碳?xì)浠衔镏饕商己蜌浣M成。石油還含有大量的處于不同形式的其他元素，例如氮、氧或硫。石油是寶貴資源，但是以相當(dāng)大的金融和環(huán)境代價(jià)對(duì)石油產(chǎn)品進(jìn)行開發(fā)。首先，必須發(fā)現(xiàn)石油資源。石油勘探是耗資并有風(fēng)險(xiǎn)的投資?？碧缴钏馁M(fèi)用可以超過1億美元。此外，不能保證這些井會(huì)含有石油。據(jù)估計(jì)，僅40%的鉆井成為產(chǎn)生商業(yè)碳?xì)浠衔锏纳a(chǎn)井。除經(jīng)濟(jì)費(fèi)用外，石油勘探存在嚴(yán)重的環(huán)境代價(jià)。例如近?？碧綌_亂周圍海洋環(huán)境。發(fā)現(xiàn)生產(chǎn)井后，必須以巨大代價(jià)從地球開采石油。在初次采收(primaryrecovery)中，地下的自然壓力足以開采約20%的井中石油。當(dāng)該自然壓力降低時(shí)，如果經(jīng)濟(jì)上合算，則使用二次采收(secondrecovery)。通常，二次采收涉及通過例如水注射、天然氣注射或氣舉等增加井壓。使用二次采油，采收到另外5%至15%的石油。一旦二次采收方法不起作用，如果經(jīng)濟(jì)上合算，可以使用三次采收方法。三次方法涉及降低石油的粘度以使其更易開采。使用三次采收方法，采收到另外5%至15%的石油。因此，即使在最佳條件下，僅可以開采50%的井中石油。石油開采也存在環(huán)境代價(jià)。例如，石油開采可以導(dǎo)致大量石油滲漏上升至表面。此外，近海鉆井涉及挖掘河床，這擾亂或破壞周圍海洋環(huán)境。因?yàn)槭偷V藏不是在地球各處均勻發(fā)現(xiàn)的，所以石油必須從石油產(chǎn)生區(qū)長距離運(yùn)輸?shù)绞拖膮^(qū)。除運(yùn)輸費(fèi)用外，還存在大規(guī)模油泄漏的環(huán)境風(fēng)險(xiǎn)。從地球開采的原油在天然形式時(shí)具有少數(shù)商業(yè)用途。其是具有不同長度和復(fù)雜性的碳?xì)浠衔?例如，石蠟(或烷)、烯烴(或烯)、炔、環(huán)烷(napthenes)(或環(huán)烷(cylcoalkanes))、脂肪族化合物、芳香族化合物等)的混合物。此外，原油含有其他有機(jī)化合物(例如含有氮、氧、硫等的有機(jī)化合物)和雜質(zhì)(例如硫磺、鹽、酸、金屬等)。因此，在商業(yè)上可以使用前，必須提煉并純化原油。由于其高能量密度及其便利的可運(yùn)輸性，大部分石油被提煉為燃料，例如運(yùn)輸燃料(例如汽油、柴油、航空燃料等)、燃用油、液化石油氣等。原油還是用于產(chǎn)生石化產(chǎn)品的原材料的主要來源。兩類主要的來自石油的原材料是短鏈烯烴(例如乙烯和丙烯)和芳香族化合物(例如苯和二甲苯異構(gòu)體)。這些原材料來源于原油中較長鏈的碳?xì)浠衔?，這是通過以相當(dāng)大的費(fèi)用使用各種方法，例如催化裂化、蒸汽裂化或催化重整，裂化原油。這些原材料用于制造不能直接從原油提煉的石化產(chǎn)品，例如單體、溶劑、去垢劑或粘合劑。來源于原油的原材料的一個(gè)實(shí)例是乙烯。乙烯被用于生產(chǎn)石化產(chǎn)品，例如聚乙烯、乙醇、氧化乙烯、乙二醇、聚酯、乙二醇醚、乙氧基化物、乙酸乙烯酯、1，2-二氯乙烷、三氯乙烯、四氯乙烯、氯乙烯和聚氯乙烯。原材料的其他實(shí)例是丙烯，丙烯用于生產(chǎn)異丙醇、丙烯腈、聚丙烯、氧化丙烯、丙烯二醇、乙二醇醚、丁烯、異丁烯、1，3_丁二烯、合成橡膠、聚烯烴、α-烯烴、脂肪醇、丙烯酸、丙烯聚合物、氯化丙烯、環(huán)氧氯丙烷和環(huán)氧樹脂。然后，這些石化產(chǎn)品可以用于制造特種化學(xué)品，例如塑料、樹脂、纖維、橡膠、藥品、潤滑劑或凝膠?？梢援a(chǎn)自石化原材料的具體特種化學(xué)品為脂肪酸、碳?xì)浠衔?例如長鏈、支鏈、飽和的、不飽和的等)、脂肪醇、酯、脂肪醛、酮、潤滑劑等。醛用于生產(chǎn)很多特種化學(xué)品。例如，醛用于生產(chǎn)聚合物、樹脂(例如膠木(Bakelite))、染料、調(diào)味劑、增塑劑、香水、藥品和其他化學(xué)品。一些被用作溶劑、防腐劑或消毒劑。一些天然和合成的化合物，例如維生素和激素是醛。此外，很多糖含有醛基。從原油獲得這些特種化學(xué)品需要大量的金融投資以及大量的能量。因?yàn)槌３Ａ鸦椭械拈L鏈碳?xì)浠衔镆援a(chǎn)生較小的單體，其也是低效的過程。這些單體然后被用作生產(chǎn)更復(fù)雜的特種化學(xué)品的原材料。除勘探、開采、運(yùn)輸和提煉石油的問題外，石油是有限的并逐漸減少的資源。估計(jì)世界石油消耗為每年300億桶。據(jù)估計(jì)，以現(xiàn)有生產(chǎn)水平，世界石油儲(chǔ)量預(yù)計(jì)在2050年前會(huì)耗竭。最后，基于石油的燃料的燃燒釋放溫室氣體(例如二氧化碳)和其他形式的空氣污染(例如一氧化碳、二氧化硫等)。隨著世界對(duì)燃料需求的增加，溫室氣體的排放和其他形式的空氣污染也增加。大氣中溫室氣體的累積可以導(dǎo)致增加全球變暖。因此，除局部破壞環(huán)境外(例如油泄漏、海洋環(huán)境的挖掘等)，燃燒石油還破壞全球環(huán)境。由于石油所引起的內(nèi)在挑戰(zhàn)，存在對(duì)于不需要像石油一樣被勘探、開采、長距離運(yùn)輸或大量提煉的可再生石油資源的需要。還存在對(duì)于可以經(jīng)濟(jì)地生產(chǎn)而不會(huì)產(chǎn)生石油工業(yè)和基于石油的燃料的燃燒所產(chǎn)生的類型的環(huán)境破壞的可再生石油資源的需要。基于相似原因，還存在對(duì)于通常來自石油的化學(xué)品的可再生資源的需要。產(chǎn)生可再生石油的一種方法是通過工程化微生物以產(chǎn)生可再生石油產(chǎn)物。某些微生物具有產(chǎn)生化學(xué)品的天然能力。例如，酵母已被使用數(shù)世紀(jì)以產(chǎn)生乙醇(例如，啤酒、葡萄酒等)。近年，通過先進(jìn)的生物技術(shù)的發(fā)展，可能新陳代謝地工程化有機(jī)體以產(chǎn)生之前從未產(chǎn)生過的生物產(chǎn)物。來源于這些細(xì)胞活性的諸如化學(xué)品的產(chǎn)物被稱為生物產(chǎn)物。由這些細(xì)胞活性產(chǎn)生的燃料被稱為生物燃料。生物燃料是基于石油的燃料的可再生的替代選項(xiàng)。生物燃料可以代替任何基于石油的燃料(例如，汽油、柴油、航空燃料、燃用油等)。生物燃料可以來源于可再生的來源，例如植物物質(zhì)、動(dòng)物物質(zhì)或甚至廢品。這些可再生的來統(tǒng)稱為生物量。生物燃料相比基于石油的燃料的一個(gè)優(yōu)勢(shì)在于，它們不需要耗資和有風(fēng)險(xiǎn)的的勘探或開采。另外，生物燃料可以在本地生產(chǎn)。因此，它們不需要長距離運(yùn)輸。此外，生物燃料可以直接地制備而不需要耗資和能量密集的提煉，而這在提煉原油時(shí)是需要的。在其他條件下，生物燃料可以需要有限的和經(jīng)濟(jì)有效的提煉水平。此外，使用生物燃料通過減少燃燒期間釋放的環(huán)境有害的排放(例如，溫室氣體，氣體污染等)的量改善環(huán)境。例如，由于生物燃料是從可再生的天然資源——生物量生產(chǎn)的，它維持平衡的碳循環(huán)。盡管生物燃料的燃燒會(huì)釋放碳(例如，以二氧化碳)，但該碳會(huì)在生物量的產(chǎn)生期間在循環(huán)(例如，作物的栽培)，從而平衡碳循環(huán)，這與基于石油的燃料不同。基于類似的理由，生物來源的化學(xué)品提供了與生物燃料相同的優(yōu)于基于石油的燃料的優(yōu)點(diǎn)。生物來源的化學(xué)品是石化產(chǎn)品的可再生的替代選項(xiàng)。生物來源的化學(xué)品，例如碳?xì)浠衔?例如，烷烴、烯烴、或炔烴)、脂肪醇、酯、脂肪酸、脂肪醛和酮，比石化產(chǎn)品更優(yōu)質(zhì)，因?yàn)樗鼈兪侵苯赢a(chǎn)生的而不需要大量的提煉。與石化產(chǎn)品不同，生物來源的化學(xué)品不需要像原油那樣提煉以提取隨后必須進(jìn)一步加工以制備更復(fù)雜的石化產(chǎn)品的原材料。生物來源的化學(xué)品是從生物量直接地轉(zhuǎn)變?yōu)樗杌瘜W(xué)產(chǎn)品。發(fā)明_既述本發(fā)明至少部分基于編碼脂肪醛生物合成多肽的基因的鑒定。因此，在一方面，本發(fā)明特征為制備脂肪醛的方法。所述方法包括在宿主細(xì)胞中表達(dá)編碼包含SEQIDNO18,20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、114、116、118、120或122的氨基酸序列的脂肪醛生物合成多肽或其變體的基因。在一些實(shí)施方案中，該方法還包括從所述宿主細(xì)胞分離所述脂肪醛。在某些實(shí)施方案中，所述脂肪醛存在于細(xì)胞外環(huán)境。在一些實(shí)施方案中，所述脂肪醛分離自所述宿主細(xì)胞的細(xì)胞外環(huán)境。在一些實(shí)施方案中，所述脂肪醛分泌自所述宿主細(xì)胞。在可選擇的實(shí)施方案中，將所述脂肪醛運(yùn)輸進(jìn)細(xì)胞外環(huán)境。在其他實(shí)施方案中，將脂肪醛被動(dòng)運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞外環(huán)境中。在一些實(shí)施方案中，脂肪醛生物合成多肽包含具有一個(gè)或多個(gè)氨基酸取代、添加、插入或缺失的SEQIDNO:18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、114、116、118、120或122的氨基酸序列，并且所述多肽具有羧酸還原酶活性。在一些實(shí)施方案中，所述多肽具有脂肪酸還原酶活性。在一些實(shí)施方案中，所述多肽包含一個(gè)或多個(gè)以下保守型氨基酸取代例如丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸和異亮氨酸的脂肪族氨基酸被另一脂肪族氨基酸替換；絲氨酸被蘇氨酸替換；蘇氨酸被絲氨酸替換；例如天冬氨酸和谷氨酸的酸性殘基被另一酸性殘基替換；諸如天冬酰胺和谷氨酰胺的攜帶酰胺的殘基被另一攜帶酰胺的殘基替換；諸如賴氨酸和精氨酸的堿性殘基被另一堿性殘基交換；以及諸如苯丙氨酸和酪氨酸的芳香族殘基被另一芳香族殘基替換。在一些實(shí)施方案中，所述多肽具有約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、30、40、50、60、70、80、90、100或更多個(gè)氨基酸取代、添加、插入或缺失。在一些實(shí)施方案中，所述多肽具有脂肪酸酸還原酶活性。在一些實(shí)施方案中，所述方法還包括在脂肪醛生物合成多肽的至少一種生物底物的存在下培養(yǎng)所述宿主細(xì)胞。在一些實(shí)施方案中，所述方法還包括修飾宿主細(xì)胞中編碼脂肪酸合酶的基因的表達(dá)。在某些實(shí)施方案中，修飾編碼脂肪酸合酶的基因的表達(dá)包括在宿主細(xì)胞中表達(dá)編碼脂肪酸合酶的基因和/或增加宿主細(xì)胞中內(nèi)源脂肪酸合酶的表達(dá)或活性。在可選擇的實(shí)施方案中，修飾編碼脂肪酸合酶的基因的表達(dá)包括減弱宿主細(xì)胞中編碼脂肪酸合酶的基因和/或降低宿主細(xì)胞中內(nèi)源脂肪酸合酶的表達(dá)或活性。在一些實(shí)施方案中，所述脂肪酸合酶是硫酯酶。在具體實(shí)施方案中，所述硫酯酶是由tesA、缺乏前導(dǎo)序列的tesA、tesB、fatB、fatB2、fatB3、fatA或fatAl編碼的。在其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以相對(duì)于野生型宿主細(xì)胞表達(dá)減弱水平的脂肪酸降解酶。在一些實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以相對(duì)于野生型宿主細(xì)胞表達(dá)減弱水平的?；鵆oA合酶。在具體實(shí)施方案中，所述宿主細(xì)胞表達(dá)減弱水平的?；鵆oA合酶，所述酰基CoA合酶由fadD、fadK、BH3103、yhfL、Pfl-4354、EAV15023、fadDl、fadD2、RPC_4074、fadDD35、fadDD22、faa3p或編碼蛋白ZP_01644857的基因編碼。在一些實(shí)施方案中，遺傳工程化的宿主細(xì)胞包含一個(gè)或多個(gè)編碼脂肪酸降解酶的基因的敲除，例如上述的?；鵆oA合酶基因。在仍然其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)減弱水平的脫水酶/異構(gòu)酶，例如由fabA或圖6中列出的基因編碼的酶。在一些實(shí)施方案中，該宿主細(xì)胞包含fabA或圖6中列出的基因的敲除。在其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)減弱水平的酮脂酰-ACP合酶，例如由fabB或圖7中列出的基因編碼的酶。在其他實(shí)施方案中，該宿主細(xì)胞包含fabB或圖7中列出的基因的敲除。在仍然其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)修飾水平的編碼去飽和酶的基因，例如desA。在一些實(shí)施方案中，所述多肽來自細(xì)菌、植物、昆蟲、酵母、真菌或哺乳動(dòng)物。在一些實(shí)施方案中，所述多肽來自哺乳動(dòng)物細(xì)胞、植物細(xì)胞、昆蟲細(xì)胞、酵母細(xì)胞、真菌細(xì)胞、絲狀真菌細(xì)胞、細(xì)菌細(xì)胞或任何其他本文所述的有機(jī)體。在一些實(shí)施方案中，細(xì)菌是選自恥垢分枝桿菌(Mycobacteriumsmegmatis)、膿腫分支桿菌(Mycobacteriumabscessus)、鳥分支桿菌(Mycobacteriumavium)、牛分支桿菌(Mycobacteriumbovis)、結(jié)核分枝桿菌(Mycobacteriumtuberculosis)、麻風(fēng)分枝桿菌(Mycobacteriumleprae)、海分枝桿菌(Mycobacteriummarinum)禾口饋蕩分枝桿菌(Mycobacteriumulcerans)的分支桿菌。在其他實(shí)施方案中，細(xì)菌是諾卡氏菌(Nocardiasp.)、NRRL5646、皮疽諾卡氏菌(Nocardiafarcinica)、灰色鏈霉菌(Streptomycesgriseus)、砂嗜鹽產(chǎn)孢菌(Salinisporaarenicola)5^^(Clavibactermichiganenesis)。在一些實(shí)施方案中，該方法還包括在脂肪醛生物合成多肽的至少一種生物底物的存在下培養(yǎng)所述宿主細(xì)胞。在另一方面，本發(fā)明特征為產(chǎn)生脂肪醛的方法。該方法包括在宿主細(xì)胞中表達(dá)編碼脂肪醛生物合成多肽的基因，所述生物合成多肽包含與SEQIDNO:18,20,22,24,26,28,30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、114、116、118、120或122的氨基酸序列具有至少約70%、至少約75%、至少約80%、至少約85%、至少約90%、至少約91%、至少約92%、至少約93%、至少約94%、至少約95%、至少約96%、至少約97%、至少約98%或至少約99%序列同一性的氨基酸序列。在一些實(shí)施方案中，所述氨基酸序列是SEQIDN0:18、20、22、24J6、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、114、116、118、120或122的氨基酸序列。在一些實(shí)施方案中，該方法還包括從宿主細(xì)胞分離脂肪醛。在一些實(shí)施方案中，脂肪醛存在于細(xì)胞外環(huán)境中。在某些實(shí)施方案中，從宿主細(xì)胞的細(xì)胞外環(huán)境分離脂肪醛。在一些實(shí)施方案中，脂肪醛由宿主細(xì)胞分泌。在可選的實(shí)施方案中，將脂肪醛運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞外環(huán)境。在其他實(shí)施方案中，脂肪醛被動(dòng)運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞外環(huán)境。在一些實(shí)施方案中，所述方法還包括在所述宿主細(xì)胞中修飾編碼脂肪酸合酶的基因的表達(dá)。在某些實(shí)施方案中，修飾編碼脂肪酸合酶的基因的表達(dá)包括在宿主細(xì)胞中表達(dá)編碼脂肪酸合酶的基因和/或增加宿主細(xì)胞中內(nèi)源脂肪酸合酶的表達(dá)或活性。在可選的實(shí)施方案中，修飾編碼脂肪酸合酶的基因的表達(dá)包括在宿主細(xì)胞中減弱編碼脂肪酸合酶的基因和/或降低宿主細(xì)胞中內(nèi)源脂肪酸合酶的表達(dá)或活性。在一些實(shí)施方案中，該脂肪酸合酶是硫酯酶。在具體實(shí)施方案中，硫酯酶由tesA、無前導(dǎo)序列的tesA、tesB、fatB、fatB2、fatB3、fatA或fatAl編碼。在其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以相對(duì)于野生型宿主細(xì)胞表達(dá)減弱水平的脂肪酸降解酶。在一些實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以相對(duì)于野生型宿主細(xì)胞表達(dá)減弱水平的?；鵆oA合酶。在具體實(shí)施方案中，所述宿主細(xì)胞表達(dá)減弱水平的?；鵆oA合酶，所述?；鵆oA合酶由fadD、fadK、BH3103、yhfL、Pfl-4354,EAV15023、fadDl、fadD2、RPC_4074、fadDD35、fadDD22、faa3p或編碼蛋白ZP_01644857的基因編碼。在一些實(shí)施方案中，遺傳工程化的宿主細(xì)胞包含一個(gè)或多個(gè)編碼脂肪酸降解酶的基因的敲除，例如上述的?；鵆oA合酶基因。在仍然其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)減弱水平的脫水酶/異構(gòu)酶，例如由fabA或圖6中列出的基因編碼的酶。在一些實(shí)施方案中，該宿主細(xì)胞包含fabA或圖6中列出的基因的敲除。在其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)減弱水平的酮脂酰-ACP合酶，例如由fabB或圖7中列出的基因編碼的酶。在其他實(shí)施方案中，該宿主細(xì)胞包含fabB或圖7中列出的基因的敲除。在仍然其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)修飾水平的編碼去飽和酶的基因，例如desA。在一些實(shí)施方案中，所述多肽來自細(xì)菌、植物、昆蟲、酵母、真菌或哺乳動(dòng)物。在一些實(shí)施方案中，所述多肽來自哺乳動(dòng)物細(xì)胞、植物細(xì)胞、昆蟲細(xì)胞、酵母細(xì)胞、真菌細(xì)胞、絲狀真菌細(xì)胞、細(xì)菌細(xì)胞或任何其他本文所述的有機(jī)體。在一些實(shí)施方案中，細(xì)菌是選自恥垢分枝桿菌、膿腫分支桿菌、鳥分支桿菌、牛分支桿菌、結(jié)核分枝桿菌、麻風(fēng)分枝桿菌、海分枝桿菌和潰瘍分枝桿菌的分支桿菌。在其他實(shí)施方案中，細(xì)菌是諾卡氏菌(Nocardiasp.)、NRRL5646、皮疽諾卡氏菌、灰色鏈霉菌、砂嗜鹽產(chǎn)孢菌或番茄潰瘍病菌。在一些實(shí)施方案中，該方法還包括在脂肪醛生物合成多肽的至少一種生物底物的存在下培養(yǎng)所述宿主細(xì)胞。在另一方面，本發(fā)明特征為產(chǎn)生脂肪醛的方法。該方法包括在宿主細(xì)胞中表達(dá)與SEQIDNO:17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、113、115、117、119或121的核苷酸序列的互補(bǔ)序列或其片段雜交的多核苷酸，其中所述多核苷酸編碼具有羧酸還原酶活性的多肽。在一些實(shí)施方案中，所述多肽具有脂肪酸還原酶活性。在一些實(shí)施方案中，該方法還包括從宿主細(xì)胞分離脂肪醛。在一些實(shí)施方案中，脂肪醛存在于細(xì)胞外環(huán)境中。在某些實(shí)施方案中，從宿主細(xì)胞的細(xì)胞外環(huán)境分離脂肪醛。在一些實(shí)施方案中，脂肪醛由宿主細(xì)胞分泌。在可選的實(shí)施方案中，將脂肪醛運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞外環(huán)境。在其他實(shí)施方案中，脂肪醛被動(dòng)運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞外環(huán)境。在一些實(shí)施方案中，所述多核苷酸與SEQIDNO:17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、113、115、117、119或121的核苷酸序列的互補(bǔ)序列，或其片段，在低嚴(yán)緊性、中嚴(yán)緊性、高嚴(yán)緊性或非常高的嚴(yán)緊性條件下雜交。在一些實(shí)施方案中，所述方法還包括在所述宿主細(xì)胞中修飾編碼脂肪酸合酶的基因的表達(dá)。在某些實(shí)施方案中，修飾編碼脂肪酸合酶的基因的表達(dá)包括在宿主細(xì)胞中表達(dá)編碼脂肪酸合酶的基因和/或增加宿主細(xì)胞中內(nèi)源脂肪酸合酶的表達(dá)或活性。在可選的實(shí)施方案中，修飾編碼脂肪酸合酶的基因的表達(dá)包括在宿主細(xì)胞中減弱編碼脂肪酸合酶的基因和/或降低宿主細(xì)胞中內(nèi)源脂肪酸合酶的表達(dá)或活性。在一些實(shí)施方案中，該脂肪酸合酶是硫酯酶。在具體實(shí)施方案中，硫酯酶由tesA、無前導(dǎo)序列的tesA、tesB、fatB、fatB2、fatB3、fatA或fatAl編碼。在其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以相對(duì)于野生型宿主細(xì)胞表達(dá)減弱水平的脂肪酸降解酶。在一些實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以相對(duì)于野生型宿主細(xì)胞表達(dá)減弱水平的?；鵆oA合酶。在具體實(shí)施方案中，所述宿主細(xì)胞表達(dá)減弱水平的?；鵆oA合酶，所述?；鵆oA合酶由fadD、fadK、BH3103、yhfL、Pfl-4354,EAV15023、fadDl、fadD2、RPC_4074、fadDD35、fadDD22、faa3p或編碼蛋白ZP_01644857的基因編碼。在一些實(shí)施方案中，遺傳工程化的宿主細(xì)胞包含一個(gè)或多個(gè)編碼脂肪酸降解酶的基因的敲除，例如上述的酰基CoA合酶基因。在仍然其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)減弱水平的脫水酶/異構(gòu)酶，例如由fabA或圖6中列出的基因編碼的酶。在一些實(shí)施方案中，該宿主細(xì)胞包含fabA或圖6中列出的基因的敲除。在其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)減弱水平的酮脂酰-ACP合酶，例如由fabB或圖7中列出的基因編碼的酶。在其他實(shí)施方案中，該宿主細(xì)胞包含fabB或圖7中列出的基因的敲除。在仍然其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)修飾水平的編碼去飽和酶的基因，例如desA。在一些實(shí)施方案中，所述多核苷酸來自細(xì)菌、植物、昆蟲、酵母、真菌或哺乳動(dòng)物。在一些實(shí)施方案中，所述多肽來自哺乳動(dòng)物細(xì)胞、植物細(xì)胞、昆蟲細(xì)胞、酵母細(xì)胞、真菌細(xì)胞、絲狀真菌細(xì)胞、細(xì)菌細(xì)胞或任何其他本文所述有機(jī)體。在一些實(shí)施方案中，細(xì)菌是選自恥垢分枝桿菌、膿腫分支桿菌、鳥分支桿菌、牛分支桿菌、結(jié)核分枝桿菌、麻風(fēng)分枝桿菌、海分枝桿菌和潰瘍分枝桿菌的分支桿菌。在其他實(shí)施方案中，細(xì)菌是諾卡氏菌(Nocardiasp.)、NRRL5646、皮疽諾卡氏菌、灰色鏈霉菌、砂嗜鹽產(chǎn)孢菌或番茄潰瘍病菌。在一些實(shí)施方案中，該方法還包括在脂肪醛生物合成多肽的至少一種生物底物的存在下培養(yǎng)所述宿主細(xì)胞。在另一方面，本發(fā)明特征為產(chǎn)生脂肪醛的方法。該方法包括(i)在宿主細(xì)胞中表達(dá)編碼脂肪醛生物合成多肽的基因，所述脂肪醛生物合成多肽包含SEQIDN0:16的氨基酸或其變體，和(ii)修飾編碼脂肪酸合酶的基因的表達(dá)，包括在宿主細(xì)胞中表達(dá)編碼脂肪酸合酶的基因和/或增加宿主細(xì)胞中內(nèi)源脂肪酸合酶的表達(dá)或活性。在某些實(shí)施方案中，修飾編碼脂肪酸合酶的基因的表達(dá)包括在宿主細(xì)胞中表達(dá)編碼脂肪酸合酶的基因和/或增加宿主細(xì)胞中內(nèi)源脂肪酸合酶的表達(dá)或活性。在可選的實(shí)施方案中，修飾編碼脂肪酸合酶的基因的表達(dá)包括在宿主細(xì)胞中減弱編碼脂肪酸合酶的基因和/或降低宿主細(xì)胞中內(nèi)源脂肪酸合酶的表達(dá)或活性。在一些實(shí)施方案中，該脂肪酸合酶是硫酯酶。在具體實(shí)施方案中，硫酯酶由tesA、無前導(dǎo)序列的tesA、tesB、fatB、fatB2、fatB3、fatA或fatAl編碼。在一些實(shí)施方案中，該方法還包括從宿主細(xì)胞分離脂肪醛。在一些實(shí)施方案中，脂肪醛存在于細(xì)胞外環(huán)境中。在某些實(shí)施方案中，從宿主細(xì)胞的細(xì)胞外環(huán)境分離脂肪醛。在一些實(shí)施方案中，脂肪醛由宿主細(xì)胞分泌。在可選的實(shí)施方案中，將脂肪醛運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞外環(huán)境。在其他實(shí)施方案中，脂肪醛被動(dòng)運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞外環(huán)境。在一些實(shí)施方案中，多肽包含具有一個(gè)或多個(gè)氨基酸取代、添加、插入或缺失的SEQIDNO:16的氨基酸序列，其中所述多肽具有羧酸還原酶活性。在一些實(shí)施方案中，所述多肽具有脂肪酸還原酶活性。在一些實(shí)施方案中，所述多肽包含一個(gè)或多個(gè)以下保守型氨基酸取代諸如丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸和異亮氨酸的脂肪族氨基酸被另一脂肪族氨基酸替換；絲氨酸被蘇氨酸替換；蘇氨酸被絲氨酸替換；諸如天冬氨酸和谷氨酸的酸性殘基被另一酸性殘基替換；諸如天冬酰胺和谷氨酰胺的攜帶酰胺的殘基被另一攜帶酰胺的殘基替換；諸如賴氨酸和精氨酸的堿性殘基被另一堿性殘基交換；以及諸如苯丙氨酸和酪氨酸的芳香族殘基被另一芳香族殘基替換。在一些實(shí)施方案中，所述多肽具有約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、30、40、50、60、70、80、90、100或更多個(gè)氨基酸取代、添加、插入或缺失。在一些實(shí)施方案中，所述多肽具有羧酸還原酶活性。在一些實(shí)施方案中，所述多肽具有脂肪酸還原酶活性。在一些實(shí)施方案中，該方法還包括在脂肪醛生物合成多肽的至少一種生物底物的存在下培養(yǎng)所述宿主細(xì)胞。在仍然其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)減弱水平的脫水酶/異構(gòu)酶，例如由fabA或圖6中列出的基因編碼的酶。在一些實(shí)施方案中，該宿主細(xì)胞包含fabA或圖6中列出的基因的敲除。在其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)減弱水平的酮脂酰-ACP合酶，例如由fabB或圖7中列出的基因編碼的酶。在其他實(shí)施方案中，該宿主細(xì)胞包含fabB或圖7中列出的基因的敲除。在仍然其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)修飾水平的編碼去飽和酶的基因，例如desA。在另一方面，本發(fā)明特征為產(chǎn)生脂肪醛的方法。該方法包括(i)在宿主細(xì)胞中表達(dá)編碼脂肪醛生物合成多肽的基因，所述脂肪醛生物合成多肽包含與SEQIDN0:16的氨基酸序列具有至少約70%序列同一性的氨基酸序列，和(ii)修飾編碼脂肪酸合酶的基因的表達(dá)，包括在宿主細(xì)胞中表達(dá)編碼脂肪酸合酶的基因和/或增加宿主細(xì)胞中內(nèi)源脂肪酸合酶的表達(dá)或活性。在某些實(shí)施方案中，修飾編碼脂肪酸合酶的基因的表達(dá)包括在宿主細(xì)胞中表達(dá)編碼脂肪酸合酶的基因和/或增加宿主細(xì)胞中內(nèi)源脂肪酸合酶的表達(dá)或活性。在可選的實(shí)施方案中，修飾編碼脂肪酸合酶的基因的表達(dá)包括在宿主細(xì)胞中減弱編碼脂肪酸合酶的基因和/或降低宿主細(xì)胞中內(nèi)源脂肪酸合酶的表達(dá)或活性。在一些實(shí)施方案中，該脂肪酸合酶是硫酯酶。在具體實(shí)施方案中，硫酯酶由tesA、無前導(dǎo)序列的tesA、tesB、fatB、fatB2、fatB3、fatA或fatAl編碼。在一些實(shí)施方案中，該方法還包括從宿主細(xì)胞分離脂肪醛。在一些實(shí)施方案中，脂肪醛存在于細(xì)胞外環(huán)境中。在某些實(shí)施方案中，從宿主細(xì)胞的細(xì)胞外環(huán)境分離脂肪醛。在一些實(shí)施方案中，脂肪醛由宿主細(xì)胞分泌。在可選的實(shí)施方案中，將脂肪醛運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞外環(huán)境。在其他實(shí)施方案中，脂肪醛被動(dòng)運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞外環(huán)境。在一些實(shí)施方案中，所述氨基酸序列與SEQIDNO16的氨基酸序列具有至少約75%、至少約80%、至少約85%、至少約90%、至少約91%、至少約92%、至少約93%、至少約94%、至少約95%、至少約96%、至少約97%、至少約98%或至少約99%的序列同一性。在一些實(shí)施方案中，所述氨基酸序列是SEQIDN0:16。在一些實(shí)施方案中，該方法還包括在脂肪醛生物合成多肽的至少一種生物底物的存在下培養(yǎng)所述宿主細(xì)胞。在仍然其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)減弱水平的脫水酶/異構(gòu)酶，例如由fabA或圖6中列出的基因編碼的酶。在一些實(shí)施方案中，該宿主細(xì)胞包含fabA或圖6中列出的基因的敲除。在其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)減弱水平的酮脂酰-ACP合酶，例如由fabB或圖7中列出的基因編碼的酶。在其他實(shí)施方案中，該宿主細(xì)胞包含fabB或圖7中列出的基因的敲除。在仍然其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)修飾水平的編碼去飽和酶的基因，例如desA。在另一方面，本發(fā)明特征為產(chǎn)生脂肪醛的方法。該方法包括(i)在宿主細(xì)胞中表達(dá)與SEQIDNO:15的核苷酸序列的互補(bǔ)序列或其片段雜交的多核苷酸，其中所述多核苷酸編碼具有羧酸還原酶活性的多肽；和(ii)修飾編碼脂肪酸合酶的基因的表達(dá)，包括在宿主細(xì)胞中表達(dá)編碼脂肪酸合酶的基因和/或增加宿主細(xì)胞中內(nèi)源脂肪酸合酶的表達(dá)或活性。在某些實(shí)施方案中，修飾編碼脂肪酸合酶的基因的表達(dá)包括在宿主細(xì)胞中表達(dá)編碼脂肪酸合酶的基因和/或增加宿主細(xì)胞中內(nèi)源脂肪酸合酶的表達(dá)或活性。在可選的實(shí)施方案中，修飾編碼脂肪酸合酶的基因的表達(dá)包括在宿主細(xì)胞中減弱編碼脂肪酸合酶的基因和/或降低宿主細(xì)胞中內(nèi)源脂肪酸合酶的表達(dá)或活性。在一些實(shí)施方案中，該脂肪酸合酶是硫酯酶。在具體實(shí)施方案中，硫酯酶由tesA、無前導(dǎo)序列的tesA、tesB、fatB、fatB2、fatB3、fatA或fatAl編碼。在一些實(shí)施方案中，所述多肽具有脂肪酸還原酶活性。在一些實(shí)施方案中，該方法還包括從宿主細(xì)胞分離脂肪醛。在一些實(shí)施方案中，脂肪醛存在于細(xì)胞外環(huán)境中。在某些實(shí)施方案中，從宿主細(xì)胞的細(xì)胞外環(huán)境分離脂肪醛。在一些實(shí)施方案中，脂肪醛由宿主細(xì)胞分泌。在可選的實(shí)施方案中，將脂肪醛運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞外環(huán)境。在其他實(shí)施方案中，脂肪醛被動(dòng)運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞外環(huán)境。在一些實(shí)施方案中，所述多核苷酸與SEQIDNO:15的核苷酸序列的互補(bǔ)序列或其片段在低嚴(yán)緊性、中嚴(yán)緊性、高嚴(yán)緊性或非常高的嚴(yán)緊性條件下雜交。在一些實(shí)施方案中，該方法還包括在脂肪醛生物合成多肽的至少一種生物底物的存在下培養(yǎng)所述宿主細(xì)胞。在仍然其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)減弱水平的脫水酶/異構(gòu)酶，例如由fabA或圖6中列出的基因編碼的酶。在一些實(shí)施方案中，該宿主細(xì)胞包含fabA或圖6中列出的基因的敲除。在其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)減弱水平的酮脂酰-ACP合酶，例如由fabB或圖7中列出的基因編碼的酶。在其他實(shí)施方案中，該宿主細(xì)胞包含fabB或圖7中列出的基因的敲除。在仍然其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)修飾水平的編碼去飽和酶的基因，例如desA。在另一方面，本發(fā)明特征為產(chǎn)生脂肪醛的方法。該方法包括在宿主細(xì)胞中表達(dá)編碼脂肪醛生物合成多肽的基因，所述脂肪醛生物合成多肽包含SEQIDN0:16的氨基酸或其變體，其中遺傳工程化宿主細(xì)胞以相對(duì)于野生型宿主細(xì)胞表達(dá)減弱水平的脂肪酸降解酶。在一些實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以相對(duì)于野生型宿主細(xì)胞表達(dá)減弱水平的?；鵆oA合酶。在具體實(shí)施方案中，所述宿主細(xì)胞表達(dá)減弱水平的?；鵆oA合酶，所述?；鵆oA合酶由fadD、fadK、BH3103、yhfL、Pfl-4354、EAV15023、fadDl、fadD2、RPC_4074、fadDD35、fadDD22,faa3p或編碼蛋白ZP_01644857的基因編碼。在一些實(shí)施方案中，遺傳工程化的宿主細(xì)胞包含一個(gè)或多個(gè)編碼脂肪酸降解酶的基因的敲除，例如上述的?；鵆oA合酶基因。在一些實(shí)施方案中，該方法還包括從宿主細(xì)胞分離脂肪醛。在一些實(shí)施方案中，脂肪醛存在于細(xì)胞外環(huán)境中。在某些實(shí)施方案中，從宿主細(xì)胞的細(xì)胞外環(huán)境分離脂肪醛。在一些實(shí)施方案中，脂肪醛由宿主細(xì)胞分泌。在可選的實(shí)施方案中，將脂肪醛運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞外環(huán)境。在其他實(shí)施方案中，脂肪醛被動(dòng)運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞外環(huán)境。在一些實(shí)施方案中，多肽包含具有一個(gè)或多個(gè)氨基酸取代、添加、插入或缺失的SEQIDNO:16的氨基酸序列，其中所述多肽具有羧酸還原酶活性。在一些實(shí)施方案中，所述多肽具有脂肪酸還原酶活性。在一些實(shí)施方案中，所述多肽包含一個(gè)或多個(gè)以下保守型氨基酸取代諸如丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸和異亮氨酸的脂肪族氨基酸被另一脂肪族氨基酸替換；絲氨酸被蘇氨酸替換；蘇氨酸被絲氨酸替換；諸如天冬氨酸和谷氨酸的酸性殘基被另一酸性殘基替換；諸如天冬酰胺和谷氨酰胺的攜帶酰胺的殘基被另一攜帶酰胺的殘基替換；諸如賴氨酸和精氨酸的堿性殘基被另一堿性殘基交換；以及諸如苯丙氨酸和酪氨酸的芳香族殘基被另一芳香族殘基替換。在一些實(shí)施方案中，所述多肽具有約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、30、40、50、60、70、80、90、100或更多個(gè)氨基酸取代、添加、插入或缺失。在仍然其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)減弱水平的脫水酶/異構(gòu)酶，例如由fabA或圖6中列出的基因編碼的酶。在一些實(shí)施方案中，該宿主細(xì)胞包含fabA或圖6中列出的基因的敲除。在其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)減弱水平的酮脂酰-ACP合酶，例如由fabB或圖7中列出的基因編碼的酶。在其他實(shí)施方案中，該宿主細(xì)胞包含fabB或圖7中列出的基因的敲除。在仍然其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)修飾水平的編碼去飽和酶的基因，例如desA。在一些實(shí)施方案中，該方法還包括在脂肪醛生物合成多肽的至少一種生物底物的存在下培養(yǎng)所述宿主細(xì)胞。在另一方面，本發(fā)明特征為產(chǎn)生脂肪醛的方法。該方法包括在宿主細(xì)胞中表達(dá)編碼脂肪醛生物合成多肽的基因，所述脂肪醛生物合成多肽包含與SEQIDN0:16的氨基酸序列具有至少約70%序列同一性的氨基酸序列，其中遺傳工程化宿主細(xì)胞以相對(duì)于野生型宿主細(xì)胞表達(dá)減弱水平的脂肪酸降解酶。在一些實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以相對(duì)于野生型宿主細(xì)胞表達(dá)減弱水平的酰基CoA合酶。在具體實(shí)施方案中，所述宿主細(xì)胞表達(dá)減弱水平的?；鵆oA合酶，所述酰基CoA合酶由fadD、fadK、BH3103、yhfL、Pfl-4354,EAV15023、fadDUfadD2、RPC_4074、fadDD35、fadDD22、faa3p或編碼蛋白ZP_01644857的基因編碼。在一些實(shí)施方案中，遺傳工程化的宿主細(xì)胞包含一個(gè)或多個(gè)編碼脂肪酸降解酶的基因的敲除，例如上述的?；鵆oA合酶基因。在一些實(shí)施方案中，該方法還包括從宿主細(xì)胞分離脂肪醛。在一些實(shí)施方案中，脂肪醛存在于細(xì)胞外環(huán)境中。在某些實(shí)施方案中，從宿主細(xì)胞的細(xì)胞外環(huán)境分離脂肪醛。在一些實(shí)施方案中，脂肪醛由宿主細(xì)胞分泌。在可選的實(shí)施方案中，將脂肪醛運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞外環(huán)境。在其他實(shí)施方案中，脂肪醛被動(dòng)運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞外環(huán)境。在一些實(shí)施方案中，所述氨基酸序列與SEQIDNO16的氨基酸序列具有至少約75%、至少約80%、至少約85%、至少約90%、至少約91%、至少約92%、至少約93%、至少約94%、至少約95%、至少約96%、至少約97%、至少約98%或至少約99%的序列同一性。在一些實(shí)施方案中，所述氨基酸序列是SEQIDN0:16。在仍然其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)減弱水平的脫水酶/異構(gòu)酶，例如由fabA或圖6中列出的基因編碼的酶。在一些實(shí)施方案中，該宿主細(xì)胞包含fabA或圖6中列出的基因的敲除。在其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)減弱水平的酮脂酰-ACP合酶，例如由fal^B或圖7中列出的基因編碼的酶。在其他實(shí)施方案中，該宿主細(xì)胞包含fabB或圖7中列出的基因的敲除。在仍然其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)修飾水平的編碼去飽和酶的基因，例如desA。在一些實(shí)施方案中，該方法還包括在脂肪醛生物合成多肽的至少一種生物底物的存在下培養(yǎng)所述宿主細(xì)胞。在另一方面，本發(fā)明特征為產(chǎn)生脂肪醛的方法。該方法包括在宿主細(xì)胞中表達(dá)與SEQIDNO:15的核苷酸序列的互補(bǔ)序列或其片段雜交的多核苷酸，其中所述多核苷酸編碼具有羧酸還原酶活性的多肽，并且其中遺傳工程化宿主細(xì)胞以相對(duì)于野生型宿主細(xì)胞表達(dá)減弱水平的脂肪酸降解酶。在一些實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以相對(duì)于野生型宿主細(xì)胞表達(dá)減弱水平的酰基CoA合酶。在具體實(shí)施方案中，所述宿主細(xì)胞表達(dá)減弱水平的?；鵆oA合酶，所述?；鵆oA合酶由fadD、fadK、BH3103、yhfL、Pfl-4354、EAV15023、fadDl、fadD2、RPC_4074、fadDD35、fadDD22、faa3p或編碼蛋白ZP_01644857的基因編碼。在一些實(shí)施方案中，遺傳工程化的宿主細(xì)胞包含一個(gè)或多個(gè)編碼脂肪酸降解酶的基因的敲除，例如上述的酰基CoA合酶基因。在一些實(shí)施方案中，該方法還包括從宿主細(xì)胞分離脂肪醛。在一些實(shí)施方案中，脂肪醛存在于細(xì)胞外環(huán)境中。在某些實(shí)施方案中，從宿主細(xì)胞的細(xì)胞外環(huán)境分離脂肪醛。在一些實(shí)施方案中，脂肪醛由宿主細(xì)胞分泌。在可選的實(shí)施方案中，將脂肪醛運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞外環(huán)境。在其他實(shí)施方案中，脂肪醛被動(dòng)運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞外環(huán)境。在一些實(shí)施方案中，所述多核苷酸與SEQIDNO15的核苷酸序列的互補(bǔ)序列或其片段在低嚴(yán)緊性、中嚴(yán)緊性、高嚴(yán)緊性或非常高的嚴(yán)緊性條件下雜交。在仍然其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)減弱水平的脫水酶/異構(gòu)酶，例如由fabA或圖6中列出的基因編碼的酶。在一些實(shí)施方案中，該宿主細(xì)胞包含fabA或圖6中列出的基因的敲除。在其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)減弱水平的酮脂酰-ACP合酶，例如由fabB或圖7中列出的基因編碼的酶。在其他實(shí)施方案中，該宿主細(xì)胞包含fabB或圖7中列出的基因的敲除。在仍然其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)修飾水平的編碼去飽和酶的基因，例如desA。在一些實(shí)施方案中，該方法還包括在脂肪醛生物合成多肽的至少一種生物底物的存在下培養(yǎng)所述宿主細(xì)胞。在另一方面，本發(fā)明特征為產(chǎn)生脂肪醛的方法。該方法包括在宿主細(xì)胞中表達(dá)包含脂肪醛生物合成核苷酸序列的重組載體，所述脂肪醛生物合成核苷酸序列與SEQIDNO:17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、113、115、117、119或121的核苷酸序列具有至少約70%的序列同一性。在一些實(shí)施方案中，所述核苷酸序列與SEQIDNO:17,19,21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、113、115、117、119或121的核苷酸序列具有至少約75%、至少約80%、至少約85%、至少約90%、至少約91%、至少約92%、至少約93%、至少約94%、至少約95%、至少約96%、至少約97%、至少約98%或至少約99%序列同一性。在一些實(shí)施方案中，所述核苷酸序列是SEQIDNO:17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、113、115、117、119或121的核苷酸序列。在一些實(shí)施方案中，該方法還包括從宿主細(xì)胞分離脂肪醛。在一些實(shí)施方案中，脂肪醛存在于細(xì)胞外環(huán)境中。在某些實(shí)施方案中，從宿主細(xì)胞的細(xì)胞外環(huán)境分離脂肪醛。在一些實(shí)施方案中，脂肪醛由宿主細(xì)胞分泌。在可選的實(shí)施方案中，將脂肪醛運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞外環(huán)境。在其他實(shí)施方案中，脂肪醛被動(dòng)運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞外環(huán)境。在一些實(shí)施方案中，重組載體還包含可操作地連接到所述核苷酸序列的啟動(dòng)子。在一些實(shí)施方案中，所述啟動(dòng)子是發(fā)育調(diào)節(jié)型、細(xì)胞器特異性、組織特異性、誘導(dǎo)型、組成型或細(xì)胞特異性啟動(dòng)子。在其他實(shí)施方案中，所述重組載體包含至少一個(gè)選自以下的序列(a)可操作地偶聯(lián)到所述核苷酸序列的調(diào)節(jié)序列；(b)可操作地偶聯(lián)到所述核苷酸序列的選擇標(biāo)記；(C)可操作地偶聯(lián)到所述核苷酸序列的標(biāo)記序列；(d)可操作地偶聯(lián)到所述核苷酸序列的純化部分；(e)可操作地偶聯(lián)到所述核苷酸序列的分泌序列；和(f)可操作地偶聯(lián)到所述核苷酸序列的弓I導(dǎo)序列(targetingsequence)。在一些實(shí)施方案中，重組載體是質(zhì)粒。在一些實(shí)施方案中，宿主細(xì)胞表達(dá)由重組載體編碼的多肽。在一些實(shí)施方案中，所述核苷酸序列被穩(wěn)定并入所述宿主細(xì)胞的基因組DNA，并且所述核苷酸序列的表達(dá)受可調(diào)型啟動(dòng)子區(qū)的控制。在一些實(shí)施方案中，所述方法還包括在所述宿主細(xì)胞中修飾編碼脂肪酸合酶的基因的表達(dá)。在某些實(shí)施方案中，修飾編碼脂肪酸合酶的基因的表達(dá)包括在宿主細(xì)胞中表達(dá)編碼脂肪酸合酶的基因和/或增加宿主細(xì)胞中內(nèi)源脂肪酸合酶的表達(dá)或活性。在可選的實(shí)施方案中，修飾編碼脂肪酸合酶的基因的表達(dá)包括在宿主細(xì)胞中減弱編碼脂肪酸合酶的基因和/或降低宿主細(xì)胞中內(nèi)源脂肪酸合酶的表達(dá)或活性。在一些實(shí)施方案中，該脂肪酸合酶是硫酯酶。在具體實(shí)施方案中，硫酯酶由tesA、無前導(dǎo)序列的tesA、tesB、fatB、fatB2、fatB3、fatA或fatAl編碼。在其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以相對(duì)于野生型宿主細(xì)胞表達(dá)減弱水平的脂肪酸降解酶。在一些實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以相對(duì)于野生型宿主細(xì)胞表達(dá)減弱水平的?；鵆oA合酶。在具體實(shí)施方案中，所述宿主細(xì)胞表達(dá)減弱水平的?；鵆oA合酶，所述?；鵆oA合酶由fadD、fadK、BH3103、yhfL、Pfl-4354,EAV15023、fadDl、fadD2、RPC_4074、fadDD35、fadDD22、faa3p或編碼蛋白ZP_01644857的基因編碼。在一些實(shí)施方案中，遺傳工程化的宿主細(xì)胞包含一個(gè)或多個(gè)編碼脂肪酸降解酶的基因的敲除，例如上述的?；鵆oA合酶基因。在仍然其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)減弱水平的脫水酶/異構(gòu)酶，例如由fab或圖6中列出的基因編碼的酶。在一些實(shí)施方案中，該宿主細(xì)胞包含fabA或圖6中列出的基因的敲除。在其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)減弱水平的酮脂酰-ACP合酶，例如由fabB或圖7中列出的基因編碼的酶。在其他實(shí)施方案中，該宿主細(xì)胞包含fabB或圖7中列出的基因的敲除。在仍然其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)修飾水平的編碼去飽和酶的基因，例如desA。在一些實(shí)施方案中，該方法還包括在脂肪醛生物合成多肽的至少一種生物底物的存在下培養(yǎng)所述宿主細(xì)胞。在另一方面，本發(fā)明特征為產(chǎn)生脂肪醛的方法。該方法包括(i)在宿主細(xì)胞中表達(dá)包含脂肪醛生物合成核苷酸序列的重組載體，所述脂肪醛生物合成核苷酸序列與SEQIDNO:15的核苷酸序列具有至少約70%的序列同一性，和(ii)修飾宿主細(xì)胞中編碼脂肪酸合酶的基因的表達(dá)。在某些實(shí)施方案中，修飾編碼脂肪酸合酶的基因的表達(dá)包括在宿主細(xì)胞中表達(dá)編碼脂肪酸合酶的基因和/或增加宿主細(xì)胞中內(nèi)源脂肪酸合酶的表達(dá)或活性。在可選的實(shí)施方案中，修飾編碼脂肪酸合酶的基因的表達(dá)包括在宿主細(xì)胞中減弱編碼脂肪酸合酶的基因和/或降低宿主細(xì)胞中內(nèi)源脂肪酸合酶的表達(dá)或活性。在一些實(shí)施方案中，該脂肪酸合酶是硫酯酶。在具體實(shí)施方案中，硫酯酶由tesA、無前導(dǎo)序列的tesA、tesB、fatB、fatB2、fatB3、fatA或fatAl編碼。在一些實(shí)施方案中，該方法還包括從宿主細(xì)胞分離脂肪醛。在一些實(shí)施方案中，脂肪醛存在于細(xì)胞外環(huán)境中。在某些實(shí)施方案中，從宿主細(xì)胞的細(xì)胞外環(huán)境分離脂肪醛。在一些實(shí)施方案中，脂肪醛由宿主細(xì)胞分泌。在可選的實(shí)施方案中，將脂肪醛運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞外環(huán)境。在其他實(shí)施方案中，脂肪醛被動(dòng)運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞外環(huán)境。在一些實(shí)施方案中，所述核苷酸序列與SEQIDNO:15的核苷酸序列具有至少約75%、至少約80%、至少約85%、至少約90%、至少約91%、至少約92%、至少約93%、至少約94%、至少約95%、至少約96%、至少約97%、至少約98%或至少約99%的序列同一性。在一些實(shí)施方案中，所述核苷酸序列是SEQIDNO:15的核苷酸序列。在一些實(shí)施方案中，重組載體還包含可操作地連接到所述核苷酸序列的啟動(dòng)子。在一些實(shí)施方案中，所述啟動(dòng)子是發(fā)育調(diào)節(jié)型、細(xì)胞器特異性、組織特異性、誘導(dǎo)型、組成型或細(xì)胞特異性啟動(dòng)子。在其他實(shí)施方案中，所述重組載體包含至少一個(gè)選自以下的序列(a)可操作地偶聯(lián)到所述核苷酸序列的調(diào)節(jié)序列；(b)可操作地偶聯(lián)到所述核苷酸序列的選擇標(biāo)記；(C)可操作地偶聯(lián)到所述核苷酸序列的標(biāo)記序列；(d)可操作地偶聯(lián)到所述核苷酸序列的純化部分；(e)可操作地連接到所述核苷酸序列的分泌序列；和(f)可操作地連接到所述核苷酸序列的引導(dǎo)序列。在一些實(shí)施方案中，重組載體是質(zhì)粒。在一些實(shí)施方案中，宿主細(xì)胞表達(dá)由重組載體編碼的多肽。在一些實(shí)施方案中，所述核苷酸序列被穩(wěn)定并入所述宿主細(xì)胞的基因組DNA，并且所述核苷酸序列的表達(dá)受可調(diào)型啟動(dòng)子區(qū)的控制。在仍然其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)減弱水平的脫水酶/異構(gòu)酶，例如由fabA或圖6中列出的基因編碼的酶。在一些實(shí)施方案中，該宿主細(xì)胞包含fabA或圖6中列出的基因的敲除。在其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)減弱水平的酮脂酰-ACP合酶，例如由fabB或圖7中列出的基因編碼的酶。在其他實(shí)施方案中，該宿主細(xì)胞包含fabB或圖7中列出的基因的敲除。在仍然其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)修飾水平的編碼去飽和酶的基因，例如desA。在一些實(shí)施方案中，該方法還包括在脂肪醛生物合成多肽的至少一種生物底物的存在下培養(yǎng)所述宿主細(xì)胞。在另一方面，本發(fā)明特征為產(chǎn)生脂肪醛的方法。該方法包括在宿主細(xì)胞中表達(dá)包含脂肪醛生物合成核苷酸序列的重組載體，所述脂肪醛生物合成核苷酸序列與SEQIDNO15的核苷酸序列具有至少約70%的序列同一性，其中遺傳工程化宿主細(xì)胞以相對(duì)于野生型宿主細(xì)胞表達(dá)減弱水平的脂肪酸降解酶。在一些實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以相對(duì)于野生型宿主細(xì)胞表達(dá)減弱水平的?；鵆oA合酶。在具體實(shí)施方案中，所述宿主細(xì)胞表達(dá)減弱水平的?；鵆oA合酶，所述?；鵆oA合酶由fadD、fadK、BH3103、yhfL、Pfl-4354,EAV15023、fadDUfadD2、RPC_4074、fadDD35、fadDD22、faa3p或編碼蛋白ZP_01644857的基因編碼。在一些實(shí)施方案中，遺傳工程化的宿主細(xì)胞包含編碼脂肪酸降解酶的一個(gè)或多個(gè)基因的敲除，例如上述的酰基CoA合酶基因。在一些實(shí)施方案中，該方法還包括從宿主細(xì)胞分離脂肪醛。在一些實(shí)施方案中，脂肪醛存在于細(xì)胞外環(huán)境中。在某些實(shí)施方案中，從宿主細(xì)胞的細(xì)胞外環(huán)境分離脂肪醛。在一些實(shí)施方案中，脂肪醛由宿主細(xì)胞分泌。在可選的實(shí)施方案中，將脂肪醛運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞外環(huán)境。在其他實(shí)施方案中，脂肪醛被動(dòng)運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞外環(huán)境。在一些實(shí)施方案中，所述核苷酸序列與SEQIDNO:15的核苷酸序列具有至少約75%、至少約80%、至少約85%、至少約90%、至少約91%、至少約92%、至少約93%、至少約94%、至少約95%、至少約96%、至少約97%、至少約98%或至少約99%的序列同一性。在一些實(shí)施方案中，所述核苷酸序列是SEQIDNO:15的核苷酸序列。在一些實(shí)施方案中，重組載體還包含可操作地連接到所述核苷酸序列的啟動(dòng)子。在一些實(shí)施方案中，所述啟動(dòng)子是發(fā)育調(diào)節(jié)型、細(xì)胞器特異性、組織特異性、誘導(dǎo)型、組成型或細(xì)胞特異性啟動(dòng)子。在其他實(shí)施方案中，所述重組載體包含至少一個(gè)選自以下的序列(a)可操作地偶聯(lián)到所述核苷酸序列的調(diào)節(jié)序列；(b)可操作地偶聯(lián)到所述核苷酸序列的選擇標(biāo)記；(C)可操作地偶聯(lián)到所述核苷酸序列的標(biāo)記序列；(d)可操作地偶聯(lián)到所述核苷酸序列的純化部分；(e)可操作地偶聯(lián)到所述核苷酸序列的分泌序列；和(f)可操作地偶聯(lián)到所述核苷酸序列的引導(dǎo)序列。在一些實(shí)施方案中，重組載體是質(zhì)粒。在一些實(shí)施方案中，宿主細(xì)胞表達(dá)由重組載體編碼的多肽。在一些實(shí)施方案中，所述核苷酸序列被穩(wěn)定并入所述宿主細(xì)胞的基因組DNA，并且所述核苷酸序列的表達(dá)受可調(diào)型啟動(dòng)子區(qū)的控制。在仍然其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)減弱水平的脫水酶/異構(gòu)酶，例如由fabA或圖6中列出的基因編碼的酶。在一些實(shí)施方案中，該宿主細(xì)胞包含fabA或圖6中列出的基因的敲除。在其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)減弱水平的酮脂酰-ACP合酶，例如由fabB或圖7中列出的基因編碼的酶。在其他實(shí)施方案中，該宿主細(xì)胞包含fabB或圖7中列出的基因的敲除。在仍然其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)修飾水平的編碼去飽和酶的基因，例如desA。在一些實(shí)施方案中，該方法還包括在脂肪醛生物合成多肽的至少一種生物底物的存在下培養(yǎng)所述宿主細(xì)胞。在另一方面，本發(fā)明特征為產(chǎn)生脂肪醛的方法。該方法包括在宿主細(xì)胞中表達(dá)編碼脂肪醛生物合成多肽的基因，所述脂肪醛生物合成多肽包含(i)SEQIDNO:7,SEQIDNO:8、SEQIDNO9和SEQIDNO10；(ii)SEQIDNO:11、SEQIDNO:12、SEQIDNO13或SEQIDNO14；和/或(iii)SEQIDNO:7、SEQIDNO:9、SEQIDNO:10和SEQIDNO11；其中所述多肽具有羧酸還原酶活性。在一些實(shí)施方案中，所述多肽具有脂肪酸還原酶活性。在一些實(shí)施方案中，該方法還包括從宿主細(xì)胞分離脂肪醛。在一些實(shí)施方案中，脂肪醛存在于細(xì)胞外環(huán)境中。在某些實(shí)施方案中，從宿主細(xì)胞的細(xì)胞外環(huán)境分離脂肪醛。在一些實(shí)施方案中，脂肪醛由宿主細(xì)胞分泌。在可選的實(shí)施方案中，將脂肪醛運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞外環(huán)境。在其他實(shí)施方案中，脂肪醛被動(dòng)運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞外環(huán)境。在一些實(shí)施方案中，所述多肽的長度為約1000個(gè)氨基酸至約2000個(gè)氨基酸。在某些實(shí)施方案中，所述多肽的長度為約1000個(gè)氨基酸、長度為約1050個(gè)氨基酸、長度為約1100個(gè)氨基酸、長度為約1150個(gè)氨基酸、長度為約1200個(gè)氨基酸、長度為約1250個(gè)氨基酸、長度為約1300個(gè)氨基酸、長度為約1400個(gè)氨基酸、長度為約1500個(gè)氨基酸、長度為約1600個(gè)氨基酸、長度為約1700個(gè)氨基酸、長度為約1800個(gè)氨基酸、長度為約1900個(gè)氨基酸或長度為約2000個(gè)氨基酸。在其他實(shí)施方案中，所述多肽的長度為高達(dá)約1500個(gè)氨基酸、長度為高達(dá)約1400個(gè)氨基酸、長度為高達(dá)約1300個(gè)氨基酸、長度為高達(dá)約1250個(gè)氨基酸、長度為高達(dá)約1200個(gè)氨基酸、長度為高達(dá)約1150個(gè)氨基酸、長度為高達(dá)約1100個(gè)氨基酸、長度為高達(dá)約1050個(gè)氨基酸或長度為高達(dá)約1000個(gè)氨基酸。在一些實(shí)施方案中，所述方法還包括在所述宿主細(xì)胞中修飾編碼脂肪酸合酶的基因的表達(dá)。在某些實(shí)施方案中，修飾編碼脂肪酸合酶的基因的表達(dá)包括在宿主細(xì)胞中表達(dá)編碼脂肪酸合酶的基因和/或增加宿主細(xì)胞中內(nèi)源脂肪酸合酶的表達(dá)或活性。在可選的實(shí)施方案中，修飾編碼脂肪酸合酶的基因的表達(dá)包括在宿主細(xì)胞中減弱編碼脂肪酸合酶的基因和/或降低宿主細(xì)胞中內(nèi)源脂肪酸合酶的表達(dá)或活性。在一些實(shí)施方案中，該脂肪酸合酶是硫酯酶。在具體實(shí)施方案中，硫酯酶由tesA、無前導(dǎo)序列的tesA、tesB、fatB、fatB2、fatB3、fatA或fatAl編碼。在其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以相對(duì)于野生型宿主細(xì)胞表達(dá)減弱水平的脂肪酸降解酶。在一些實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以相對(duì)于野生型宿主細(xì)胞表達(dá)減弱水平的酰基CoA合酶。在具體實(shí)施方案中，所述宿主細(xì)胞表達(dá)減弱水平的?；鵆oA合酶，所述?；鵆oA合酶由fadD、fadK、BH3103、yhfL、Pfl-4354,EAV15023、fadDl、fadD2、RPC_4074、fadDD35、fadDD22、faa3p或編碼蛋白ZP_01644857的基因編碼。在一些實(shí)施方案中，遺傳工程化的宿主細(xì)胞包含編碼脂肪酸降解酶的一個(gè)或多個(gè)基因的敲除，例如上述的酰基CoA合酶基因。在仍然其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)減弱水平的脫水酶/異構(gòu)酶，例如由fabA或圖6中列出的基因編碼的酶。在一些實(shí)施方案中，該宿主細(xì)胞包含fabA或圖6中列出的基因的敲除。在其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)減弱水平的酮脂酰-ACP合酶，例如由fabB或圖7中列出的基因編碼的酶。在其他實(shí)施方案中，該宿主細(xì)胞包含fabB或圖7中列出的基因的敲除。在仍然其他實(shí)施方案中，遺傳工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)修飾水平的編碼去飽和酶的基因，例如desA。在一些實(shí)施方案中，該方法還包括在脂肪醛生物合成多肽的至少一種生物底物的存在下培養(yǎng)所述宿主細(xì)胞。在本文所述的本發(fā)明的任何方面中，所述宿主細(xì)胞可以選自哺乳動(dòng)物細(xì)胞、植物細(xì)胞、昆蟲細(xì)胞、酵母細(xì)胞、真菌細(xì)胞、絲狀真菌細(xì)胞和細(xì)菌細(xì)胞。在一些實(shí)施方案中，所述宿主細(xì)胞是革蘭氏陽性細(xì)菌細(xì)胞。在其他實(shí)施方案中，所述宿主細(xì)胞是革蘭氏陰性細(xì)菌細(xì)胞。在一些實(shí)施方案中，所述宿主細(xì)胞選自以下的屬埃希氏菌屬(Escherichia)、芽孢桿菌屬(Bacillus)、乳酸桿菌屬(Lactobacillus)、紅球菌屬(Rhodococcus)、假單胞菌屬(Pseudomonas)、曲霉屬(Aspergillus)、木霉屬(Trichoderma)、鏈孢霉屬(Neurospora)、鍵刀菌屬(Fusarium)、腐質(zhì)霉屬(Humicola)、根毛霉屬(Rhizomucor)、克魯維酵母菌屬(Kluyveromyces)、畢赤酵母屬(Pichia)、毛霉菌屬(Mucor)、蝕絲霉屬(Myceliophtora)、青霉屬(Penicillium)、平革菌屬(Phanerochaete)、側(cè)耳屬(Pleurotus)、栓菌屬(Trametes)、金黃孢子菌屬(Chrysosporium)>酵母屬(Saccharomyces)、寡養(yǎng)單胞菌屬(Stenotrophamonas)、裂殖酵母屬(Schizosaccharomyces)、耳口氏酵母屬(Yarrowia)或鏈霉菌屬(Streptomyces)0在具體實(shí)施方案中，所述宿主細(xì)胞為遲緩芽孢桿菌(Bacilluslentus)細(xì)胞、短芽孢桿菌(Bacillusbrevis)細(xì)胞、嗜熱脂肪芽孢桿菌(Bacillusstearothermophilus)細(xì)胞、地衣芽孢桿菌(Bacilluslicheniformis)細(xì)胞、嗜堿芽孢桿菌(Bacillusalkalophilus)細(xì)胞、凝結(jié)芽孢桿菌(Bacilluscoagulans)細(xì)胞、環(huán)狀芽孢桿菌(Bacilluscirculans)細(xì)胞、短小芽孢桿菌(Bacilluspumilis)細(xì)胞、蘇云金芽孢桿菌(Bacillusthuringiensis)細(xì)胞、克勞氏芽孢桿菌(Bacillusclausii)細(xì)胞、巨大芽孢桿菌(Bacillusmegaterium)細(xì)胞、枯草芽孢桿菌(Bacillussubtilis)細(xì)胞或解淀粉芽孢桿菌(BacillusamyIoliquefaciens)細(xì)胞。在其他實(shí)施方案中，宿主細(xì)胞為康氏木霉(Trichodermakoningii)細(xì)胞、綠色木霉(Trichodermaviride)細(xì)胞、里氏木霉(Trichodermareesei)細(xì)胞、長枝木霉(Trichodermalongibrachiatum)細(xì)胞、泡盛曲霉(Aspergillusawamori)細(xì)胞、煙曲霉(Aspergillusfumigates)細(xì)胞、臭曲霉(Aspergillusfoetidus)細(xì)胞、構(gòu)巢曲霉(Aspergillusnidulans)(Aspergillusniger)(Aspergillusoryzae)細(xì)胞、特異腐質(zhì)霉(Humicolainsolens)細(xì)胞、棉毛狀腐質(zhì)霉(Humicolalanuginose)細(xì)胞、混濁紅球菌(Rhodococcusopacus)細(xì)胞、米黑根毛霉(Rhizomucormiehei)細(xì)胞或米黑毛酶(Mucormichei)細(xì)胞。在其他實(shí)施方案中，所述宿主細(xì)胞是淺青紫鏈霉菌(Sti^ptomyceslividans)細(xì)胞或鼠灰鏈霉菌(Streptomycesmurinus)細(xì)胞。在仍然其他實(shí)施方案中，宿主細(xì)胞是放線菌(Actinomycetes)細(xì)胞。在一些實(shí)施方案中，宿主細(xì)胞是釀酒酵母(Saccharomycescerevisiae)細(xì)胞。在具體實(shí)施方案中，宿主細(xì)胞是來自真核植物、藻類、藍(lán)藻(cyanolacterium)、綠色硫細(xì)菌、綠色非硫細(xì)菌、紫色硫細(xì)菌、紫色非硫細(xì)菌、嗜極生物、酵母、真菌、其工程化的有機(jī)體或合成的有機(jī)體的細(xì)胞。在一些實(shí)施方案中，宿主細(xì)胞為光依賴性或固定碳。在一些實(shí)施方案中，宿主細(xì)胞輕度依賴或固定碳。在一些實(shí)施方案中，宿主細(xì)胞具有自養(yǎng)活性。在一些實(shí)施方案中，宿主細(xì)胞具有光合自養(yǎng)活性，例如在光的存在下。在一些實(shí)施方案中，在缺乏光時(shí)，宿主細(xì)胞時(shí)異養(yǎng)的或兼養(yǎng)的。在某些實(shí)施方案中，宿主細(xì)胞是來自擬南芥(Avabidopsisthaliana)、柳枝稷(Panicumvirgatum)、巨芒(Miscanthusgiganteus)、玉米(Zeamays)、葡萄藻(Botryococcusebraunii)、萊菌^藻(Chlamydomonasreinhardtii)、杜氏鹽藻(Dunalielasalina)、聚球藍(lán)細(xì)菌(SynechococcusSp.)PCC7002、聚球藍(lán)細(xì)菌(SynechococcusSp.)PCC7940、聚球藍(lán)細(xì)菌(SynechococcusSp.)PCC6803、長嗜熱聚球藍(lán)細(xì)菌(Thermosynechococcuselongates)BP-1、綠硫菌(Chlorobiumtepidum)、莢膜iLMM(Rhodobactercapsulatus)>^Xfix-^-Ifilii(Rhodopseudomonaspalusris)達(dá)梭菌(Clostridium1jungdahlii)、熱纖梭菌(Clostridiuthermocellum)、產(chǎn)黃青霉菌(Penicilliumchrysogenum)、巴斯德畢赤酵母(Pichiapastoris)、釀酒酵母、粟酒裂殖酵母(Schizosaccharomycespombe)、焚光假單胞菌(Pseudomonasfluorescens)或運(yùn)動(dòng)發(fā)酵單胞菌(Zymomonasmobilis)的細(xì)胞。在其他實(shí)施方案中，所述宿主細(xì)胞是CHO細(xì)胞、COS細(xì)胞、VERO細(xì)胞、BHK細(xì)胞、HeLa細(xì)胞、Cvl細(xì)胞、MDCK細(xì)胞、293細(xì)胞、3T3細(xì)胞或PC12細(xì)胞。在仍然其他實(shí)施方案中，所述宿主細(xì)胞是大腸桿菌(E.coli)細(xì)胞。在某些實(shí)施方案中，所述大腸桿菌細(xì)胞是菌株B、菌株C、菌株K或菌株W大腸桿菌細(xì)胞。在另一方面，本發(fā)明特征為產(chǎn)生脂肪醛的方法。該方法包括將底物與(i)包含SEQIDNO:18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、114、116、118、120或122的氨基酸序列或其變體的脂肪醛生物合成多肽或()由與SEQIDNO:17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、113、115、117、119或121的核苷酸序列或其變體具有至少約70%同一性的核苷酸序列編碼的脂肪醛生物合成多肽接觸。在一些實(shí)施方案中，該方法還包括純化脂肪醛。在一些實(shí)施方案中，脂肪醛生物合成多肽包含具有一個(gè)或多個(gè)氨基酸取代、添加、插入或缺失的SEQIDNO:18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、114、116、118、120或122的氨基酸序列，其中所述多肽具有羧酸還原酶活性。在一些實(shí)施方案中，所述多肽具有脂肪酸還原酶活性。在一些實(shí)施方案中，所述多肽包含一個(gè)或多個(gè)以下保守型氨基酸取代諸如丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸和異亮氨酸的脂肪族氨基酸被另一脂肪族氨基酸替換；絲氨酸被蘇氨酸替換；蘇氨酸被絲氨酸替換；諸如天冬氨酸和谷氨酸的酸性殘基被另一酸性殘基替換；諸如天冬酰胺和谷氨酰胺的攜帶酰胺的殘基被另一攜帶酰胺的殘基替換；諸如賴氨酸和精氨酸的堿性殘基被另一堿性殘基交換；以及諸如苯丙氨酸和酪氨酸的芳香族殘基被另一芳香族殘基替換。在一些實(shí)施方案中，所述多肽具有約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、30、40、50、60、70、80、90、100或更多個(gè)氨基酸取代、添加、插入或缺失。在一些實(shí)施方案中，所述多肽具有羧酸還原酶活性。在一些實(shí)施方案中，所述多肽具有脂肪酸還原酶活性。在一些實(shí)施方案中，所述多肽具有與SEQIDNO18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、114、116、118、120或122的氨基酸序列至少約75%、至少約80%、至少約85%、至少約90%、至少約91%、至少約92%、至少約93%、至少約94%、至少約95%、至少約96%、至少約97%、至少約98%或至少約99%—致的氨基酸序列。在一些實(shí)施方案中，所述多肽具有SEQIDNO:18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、114、116、118、120或122的氨基酸序列。在一些實(shí)施方案中，所述核苷酸序列與SEQIDNO:17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、113、115、117、119或121的核苷酸序列具有至少約75%、至少約80%、至少約85%、至少約90%、至少約91%、至少約92%、至少約93%、至少約94%、至少約95%、至少約96%、至少約97%、至少約98%或至少約99%序列同一性。在一些實(shí)施方案中，所述核苷酸序列是SEQIDNO:17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、113、115、117、119或121。在另一方面，本發(fā)明特征為產(chǎn)生脂肪醛的方法。該方法包括將底物與脂肪醛生物合成多肽接觸，所述脂肪醛生物合成多肽包含(i)SEQIDNO:7,SEQIDN0:8、SEQIDNO:9和SEQIDNO10；(ii)SEQIDNO:11、SEQIDNO:12、SEQIDNO:13或SEQIDNO:14；和/或(iii)SEQIDNO:7、SEQIDNO:9、SEQIDNO:10禾口SEQIDNO:11;其中所述多肽具有羧酸還原酶活性。在一些實(shí)施方案中，所述多肽具有脂肪酸還原酶活性。在一些實(shí)施方案中，所述多肽的長度為約1000氨基酸至約2000氨基酸。在某些實(shí)施方案中，所述多肽的長度為約1000個(gè)氨基酸、長度為約1050個(gè)氨基酸、長度為約1100個(gè)氨基酸、長度為約1150個(gè)氨基酸、長度為約1200個(gè)氨基酸、長度為約1250個(gè)氨基酸、長度為約1300個(gè)氨基酸、長度為約1400個(gè)氨基酸、長度為約1500個(gè)氨基酸、長度為約1600個(gè)氨基酸、長度為約1700個(gè)氨基酸、長度為約1800個(gè)氨基酸、長度為約1900個(gè)氨基酸或長度為約2000個(gè)氨基酸。在其他實(shí)施方案中，所述多肽的長度為高達(dá)約1500個(gè)氨基酸、長度為高達(dá)約1400個(gè)氨基酸、長度為高達(dá)約1300個(gè)氨基酸、長度為高達(dá)約1250個(gè)氨基酸、長度為高達(dá)約1200個(gè)氨基酸、長度為高達(dá)約1150個(gè)氨基酸、長度為高達(dá)約1100個(gè)氨基酸、長度為高達(dá)約1050個(gè)氨基酸或長度為高達(dá)約1000個(gè)氨基酸。在本文所述的本發(fā)明的任何方面中，所述方法可以產(chǎn)生包含C6-C26脂肪醛的脂肪醛。在一些實(shí)施方案中，所述脂肪醛包含c6、C7、C8、C9、C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19、C20,C21,C22,C23,C24,C25或C26脂肪醛。在具體實(shí)施方案中，所述脂肪醛為癸醛、十二醛、十四醛或十六醛。在其他實(shí)施方案中，所述脂肪醛包含直鏈脂肪醛。在其他實(shí)施方案中，所述脂肪醛包含支鏈脂肪醛。在其他實(shí)施方案中，所述脂肪醛包含環(huán)狀部分。在一些實(shí)施方案中，所述脂肪醛是不飽和脂肪醛。在其他實(shí)施方案中，所述脂肪醛是單不飽和脂肪醛。在其他實(shí)施方案中，所述脂肪醛是飽和脂肪醛。在本文所述的發(fā)明的任何方面，脂肪醛生物合成多肽的底物可以是脂肪酸。在一些實(shí)施方案中，所述脂肪酸包括C6-C26脂肪酸。在一些實(shí)施方案中，所述脂肪酸包含c6、c7、C8、C9λC10ΛCn、C12ΛCi3、C14ΛCi5、C16ΛCn、C18ΛC19、C20、C21ΛC22、C23ΛC24ΛC25或C26月曰肪在具體實(shí)施方案中，所述脂肪酸是c6、C8、C10,C12,C13、C14,C15,C16,C17或C18脂肪酸。在其他實(shí)施方案中，所述脂肪酸包含直鏈脂肪酸。在其他實(shí)施方案中，所述脂肪酸包含支鏈脂肪酸。在仍然其他實(shí)施方案中，所述脂肪酸包含環(huán)狀部分。在一些實(shí)施方案中，所述脂肪醛是不飽和脂肪醛。在其他實(shí)施方案中，所述脂肪醛是單不飽和脂肪醛。在某些實(shí)施方案中，所述不飽和脂肪醛是C61、C71、C81、C91、C10:l、Cll:l、C12:l、C13:l、C14:l、C15:l、C16:l、C17:l、C18:l、C19:l、C20:l、C21:l、C22:1、C23:1、C24:1、C25:1或C26:1不飽和脂肪醛。在仍然其他實(shí)施方案中，所述脂肪醛在Ω-7位置是不飽和的。在某些實(shí)施方案中，所述不飽和脂肪醛包含順式雙鍵。在另一方面，本發(fā)明特征為遺傳工程化的微生物，所述微生物包含穩(wěn)定并入所述微生物的基因組DNA中位于多核苷酸的上游的外源控制序列，所述多核苷酸包含與SEQIDNO:17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、113、115、117、119或121的核苷酸序列具有至少70%序列同一性的核苷酸序列，其中所述微生物相對(duì)于野生型微生物產(chǎn)生增高水平的脂肪醛。在一些實(shí)施方案中，所述核苷酸序列與SEQIDNO:17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、113、115、117、119或121的核苷酸序列具有至少約75%、至少約80%、至少約85%、至少約90%、至少約91%、至少約92%、至少約93%、至少約94%、至少約95%、至少約96%、至少約97%、至少約98%或至少約99%序列同一性。在一些實(shí)施方案中，所述核苷酸序列是SEQIDNO:17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、113、115、117、119或121。在一些實(shí)施方案中，所述多核苷酸對(duì)于所述微生物來說是內(nèi)源的。在其他實(shí)施方案中，遺傳工程化所述微生物以在宿主細(xì)胞中表達(dá)修飾水平的編碼脂肪酸合酶的基因。在某些實(shí)施方案中，所述微生物表達(dá)編碼脂肪酸合酶的基因和/或具有增強(qiáng)表達(dá)或活性的內(nèi)源脂肪酸合酶。在可選的實(shí)施方案中，所述微生物具有減弱表達(dá)的在宿主中編碼脂肪酸合酶的基因和/或具有降低表達(dá)或活性的內(nèi)源脂肪酸合酶。在一些實(shí)施方案中，該脂肪酸合酶是硫酯酶。在具體實(shí)施方案中，硫酯酶由tesA、無前導(dǎo)序列的tesA、tesB、fatB、fatB2、fatB3、fatA或fatAl編碼。在其他實(shí)施方案中，遺傳工程化微生物以相對(duì)于野生型微生物表達(dá)減弱水平的脂肪酸降解酶。在一些實(shí)施方案中，所述微生物相對(duì)于野生型微生物表達(dá)減弱水平的?；鵆oA合酶。在具體實(shí)施方案中，所述微生物表達(dá)減弱水平的?；鵆oA合酶，所述酰基CoA合酶由fadD、fadK、BH3103、yhfL、Pfl-4354、EAV15023、fadDl、fadD2、RPC_4074、fadDD35、fadDD22、faa3p或編碼蛋白ZP_01644857的基因編碼。在一些實(shí)施方案中，遺傳工程化的微生物包含一個(gè)或多個(gè)編碼脂肪酸降解酶的基因的敲除，例如上述的?；鵆oA合酶基因。在仍然其他實(shí)施方案中，遺傳工程化微生物以表達(dá)減弱水平的脫水酶/異構(gòu)酶，例如由fabA或圖6中列出的基因編碼的酶。在一些實(shí)施方案中，該微生物包含fabA或圖6中列出的基因的敲除。在其他實(shí)施方案中，遺傳工程化微生物以表達(dá)減弱水平的酮脂酰-ACP合酶，例如由fabB或圖7中列出的基因編碼的酶。在其他實(shí)施方案中，該微生物包含fabB或圖7中列出的基因的敲除。在仍然其他實(shí)施方案中，遺傳工程化微生物以表達(dá)修飾水平的編碼去飽和酶的基因，例如desA。在一些實(shí)施方案中，所述微生物是細(xì)菌。在某些實(shí)施方案中，所述細(xì)菌是革蘭氏陰性菌或革蘭氏陽性菌。在一些實(shí)施方案中，所述微生物是選自恥垢分枝桿菌、膿腫分支桿菌、鳥分支桿菌、牛分支桿菌、結(jié)核分枝桿菌、麻風(fēng)分枝桿菌、海分枝桿菌和潰瘍分枝桿菌的分支桿菌。在其他實(shí)施方案中，所述微生物是諾卡氏菌(Nocardiasp.)、NRRL5646、皮疽諾卡氏菌、灰色鏈霉菌、砂嗜鹽產(chǎn)孢菌或番茄潰瘍病菌。在另一方面，本發(fā)明特征為由本文所述的任何方法或任何微生物所產(chǎn)生的脂肪在一些實(shí)施方案中，所述脂肪醛的δ1V為約-15.4或更高。在某些實(shí)施方案中，所述脂肪醛的δ13C為約-15.4至約-10.9，或δ13C為約-13.92至約-13.84。在一些實(shí)施方案中，所述脂肪醛的fM14C為至少約1.003。在某些實(shí)施方案中，所述脂肪醛的f/c為至少約1.01或至少約1.5。在一些實(shí)施方案中，所述脂肪醛的fMMC為約1.111至約1.124。在本文所述的任何方面，所產(chǎn)生的脂肪醛的產(chǎn)量為約25mg/L、約50mg/L、約75mg/L、約100mg/L、約125mg/L、約150mg/L、約175mg/L、約200mg/L、約225mg/L、約250mg/L、約275mg/L、約300mg/L、約325mg/L、約350mg/L、約375mg/L、約400mg/L、約425mg/L、約450mg/L、約475mg/L、約500mg/L、約525mg/L、約550mg/L、約575mg/L、約600mg/L、約625mg/L、約650mg/L、約675mg/L、約700mg/L、約725mg/L、約750mg/L、約775mg/L、約800mg/L、約825mg/L、約850mg/L、約875mg/L、約900mg/L、約925mg/L、約950mg/L、約975mg/L、約1000g/L、約1050mg/L、約1075mg/L、約1100mg/L、約1125mg/L、約1150mg/L、約1175mg/L、約1200mg/L、約1225mg/L、約1250mg/L、約1275mg/L、約1300mg/L、約1325mg/L、約1350mg/L、約1375mg/L、約1400mg/L、約1425mg/L、約1450mg/L、約1475mg/L、約1500mg/L、約1525mg/L、約1550mg/L、約1575mg/L、約1600mg/L、約1625mg/L、約1650mg/L、約1675mg/L、約1700mg/L、約1725mg/L、約1750mg/L、約1775mg/L、約1800mg/L、約1825mg/L、約1850mg/L、約1875mg/L、約1900mg/L、約1925mg/L、約1950mg/L、約1975mg/L、約2000mg/L或更高。在本文所述的任何方面，脂肪醛在本文所述的宿主細(xì)胞或微生物中由碳源產(chǎn)生。下述附圖僅以示例的目的呈現(xiàn)而不意圖限制。附圖簡述圖1為脂肪醛產(chǎn)生的新途徑的示意圖。圖2為諾卡氏菌(Nocardiasp.)NRRL5646car基因的核苷酸序列和相應(yīng)氨基酸序列的列表。圖3為CAR同系物的氨基酸序列基序的列表。圖4為car同系物基因的核苷酸和氨基酸序列的列表。圖5為鑒定可以被表達(dá)、超表達(dá)或減弱以增加特定底物產(chǎn)生的示例性基因的表格。圖6為fabA相關(guān)基因的核苷酸和氨基酸序列的表格。圖7為fabB相關(guān)基因的核苷酸和氨基酸序列的表格。發(fā)明詳述除非另有限定，本文使用的所有技術(shù)和科學(xué)術(shù)語與本發(fā)明所屬領(lǐng)域技術(shù)人員通常理解的具有相同的意義。盡管與本文所述的那些方法和材料相似或等同的方法和材料可以用于本發(fā)明的實(shí)踐或測(cè)試，仍然在下文描述了合適的方法和材料。本文提及的所有出版物、專利申請(qǐng)、專利和其他參考資料，包括GenBank數(shù)據(jù)庫序列，通過引用全文并入。如有沖突，以包括定義在內(nèi)的本說明書為準(zhǔn)。此外，材料、方法和實(shí)施例僅是舉例說明并不意圖限制。根據(jù)下文的詳細(xì)描述和權(quán)利要求，本發(fā)明的其他特征和優(yōu)勢(shì)會(huì)清晰。在整個(gè)本說明書中，可以使用縮寫基因名稱或多肽名稱進(jìn)行引用，但是應(yīng)當(dāng)理解到，該縮寫基因或多肽名稱表示基因或多肽的種類。這些基因名稱包括編碼相同多肽和具有相同生理功能的同源多肽的所有基因。多肽名稱包括具有相同活性(例如催化相同基礎(chǔ)化學(xué)反應(yīng)活性)的所有多肽。除非另作說明，本文引用的登錄號(hào)來自美國國立衛(wèi)生研究院(NationalInstituteofHealth,U.S.Α)所維護(hù)的NCBI數(shù)據(jù)庫(國家生物技術(shù)信息中心(NationalCenterforBiotechnology^formation))。登錄號(hào)按照截止到2008年十月的數(shù)據(jù)庫中提供的。EC號(hào)由國際生物化學(xué)和分子生物學(xué)聯(lián)盟命名委員會(huì)(NomenclatureCommitteeoftheInternationalUnionofBiochemistryandMolecularBiology(NC-IUBMR))(可獲取自http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/)制定。本文引用的EC號(hào)來自由東京大學(xué)部分資助的京都基因與基因組百科全書(KyotoEncyclopediaofGenesandGenomics)所維護(hù)的KEGG配體數(shù)據(jù)庫。除非另作說明，EC號(hào)按照截止到2008年十月的數(shù)據(jù)庫中提供的。本文所用冠詞“a(—個(gè))”和“an(—個(gè))”是指該冠詞的一個(gè)或多于一個(gè)(即至少一個(gè))語法對(duì)象。作為實(shí)例，“元件(anelement)"表示一個(gè)元件或多于一個(gè)元件。本文所用術(shù)語“約”表示給定數(shù)值的士20%的值。因此，“約60%”表示在60%士(60的20%)之間的值(即48-70)。如本文所用的術(shù)語“減弱”表示削弱、降低或縮小。例如，可以通過修飾多肽來減弱多肽以降低其活性(例如，通過修飾編碼所述多肽的核苷酸序列)。如本文使用，術(shù)語“生物量”是指任何生物材料，其中碳源來源于所述生物材料。在一些實(shí)例中，將生物量處理成適用于生物轉(zhuǎn)化的碳源。在其他實(shí)例中，生物量不需要進(jìn)一步處理成碳源。碳源可以轉(zhuǎn)化成生物燃料。生物量的一個(gè)示例性來源是植物物質(zhì)或植被。例如，玉米、甘蔗或柳枝稷可以用作生物量。生物量的另一非限制性實(shí)例是代謝廢物，例如動(dòng)物物質(zhì)，例如牛糞。另外，生物量可以包括藻類或其他海洋植物。生物量還包括來自工業(yè)、農(nóng)業(yè)、林業(yè)和家庭的廢品。可以用作生物量的這些廢品的實(shí)例是發(fā)酵廢渣、青貯飼料、秸稈、無用雜物、污水、垃圾、纖維質(zhì)城市廢物和剩余食物。生物量還包括例如碳水化合物(例如單糖、二糖或多糖)的碳源。如本文所用的短語“碳源”是指適于用作原核細(xì)胞或簡單真核細(xì)胞生長的碳源的底物或化合物。碳源可以具有不同形式，包括但不限于聚合物、碳水化合物、酸、醇、醛、酮、氨基酸、肽和氣體(例如CO和co2)。這些包括，例如，多種單糖，例如葡萄糖、果糖、甘露糖和半乳糖；寡糖，例如低聚果糖和低聚半乳糖；多糖，例如木糖和阿拉伯糖；二糖，例如蔗糖、麥芽糖和松二糖；纖維素原料，例如甲基纖維素和羧甲基纖維素鈉；飽和或不飽和脂肪酸酯，例如琥珀酸酯、乳酸酯和醋酸酯；醇，例如乙醇、甲醇或丙三醇或其混合物。碳源還可以是光合作用的產(chǎn)物，包括但不限于葡萄糖。優(yōu)選的碳源是生物量。另一優(yōu)選的碳源是葡萄糖。如果兩個(gè)序列的每個(gè)堿基都匹配(即能夠形成WatsonCrick堿基對(duì))，則核苷酸序列與另一核苷酸序列是“互補(bǔ)的”。術(shù)語“互補(bǔ)鏈”在本文中與術(shù)語“互補(bǔ)序列”互換使用。核酸鏈的互補(bǔ)序列可以是編碼鏈的互補(bǔ)序列或非編碼鏈的互補(bǔ)序列。如本文所用的術(shù)語“足以允許表達(dá)的條件”表示允許宿主細(xì)胞產(chǎn)生諸如本文所述的多肽或脂肪醛的所需產(chǎn)物的任何條件。合適的條件包括，例如發(fā)酵條件。發(fā)酵條件可以包含很多參數(shù)，例如溫度范圍、通氣水平和培養(yǎng)基組分。這些條件中每一個(gè)單獨(dú)地并聯(lián)合地允許宿主細(xì)胞生長。示例性培養(yǎng)基包括培養(yǎng)液或凝膠。通常，所述培養(yǎng)基包括諸如葡萄糖、果糖、纖維素等的碳源，該碳源可以直接被宿主細(xì)胞代謝。此外，培養(yǎng)基中可以使用酶以便于促進(jìn)動(dòng)員(例如淀粉或纖維素的解聚為可發(fā)酵的糖)和隨后碳源的代謝。為了確定條件是否足以允許表達(dá)，可以將宿主細(xì)胞培養(yǎng)例如約4、8、12、24、36或48小時(shí)。培養(yǎng)中和/或培養(yǎng)后，可以獲取樣品并分析樣品以確定該條件是否允許表達(dá)。例如，可以測(cè)試樣品或宿主細(xì)胞在其中生長的培養(yǎng)基中的宿主細(xì)胞的所需產(chǎn)物的存在。當(dāng)測(cè)試產(chǎn)物的存在時(shí)，可以使用的檢測(cè)諸如但不限于TLC、HPLC,GC/FID、GC/MS、LC/MS、MS。應(yīng)當(dāng)理解到，本文所述的多肽可以具有另外的對(duì)于多肽功能沒有本質(zhì)影響的保守型或非必需氨基酸取代。特定取代是否會(huì)被允許(即不會(huì)不利地影響例如脫羧酶活性的所需生物性質(zhì))，可以按照Bowieetal.Science(1990)247:13061310中所述進(jìn)行測(cè)定?！氨Ｊ匦桶被崛〈笔前被釟埢痪哂邢嗨苽?cè)鏈的氨基酸殘基所替代的取代。具有相似氨基酸側(cè)鏈的氨基酸殘基家族，在本領(lǐng)域中已有定義。這些家族包括具有以下側(cè)鏈的氨基酸堿性側(cè)鏈(例如賴氨酸、精氨酸、組氨酸)、酸性側(cè)鏈(例如天冬氨酸、谷氨酸)、不帶電荷的極性側(cè)鏈(例如甘氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、絲氨酸、蘇氨酸、酪氨酸、半胱氨酸)、非極性側(cè)鏈(例如丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、甲硫氨酸、色氨酸)、β分枝側(cè)鏈(例如蘇氨酸、纈氨酸、異亮氨酸)和芳香族側(cè)鏈(例如酪氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、組氨酸)。如本文所用的“控制元件”表示轉(zhuǎn)錄控制元件?？刂圃▎?dòng)子和增強(qiáng)子。術(shù)語“啟動(dòng)子元件”、“啟動(dòng)子”或“啟動(dòng)子序列”是指作為激活基因表達(dá)的開關(guān)發(fā)揮功能的DNA序列。如果基因被激活，認(rèn)為其被轉(zhuǎn)錄或參與轉(zhuǎn)錄。轉(zhuǎn)錄涉及由基因合成mRNA。因此，啟動(dòng)子充當(dāng)轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)元件并且還提供基因轉(zhuǎn)錄為mRNA的起始位點(diǎn)?？刂圃c參與轉(zhuǎn)錄的細(xì)胞蛋白特異性相互作用(Maniatisetal,Science236:1237,1987)。如本文使用，術(shù)語“脂肪酸”表示具有通式RCOOH的羧酸。R表示脂肪族基團(tuán)，優(yōu)選地表示烷基。R可以包含約4到約22個(gè)碳原子。脂肪酸可以為飽和的、單不飽和的或多不飽和的。在優(yōu)選的實(shí)施方案中，所述脂肪酸由脂肪酸生物合成途徑產(chǎn)生。如本文所用的術(shù)語“脂肪酸生物合成途徑”表示產(chǎn)生脂肪酸的生物合成途徑。所述脂肪酸生物合成途徑包括脂肪酸酶，所述脂肪酸酶可以按照本文所述經(jīng)工程化產(chǎn)生脂肪酸，并且在一些實(shí)施方案中可以與其他酶一起表達(dá)以產(chǎn)生具有所需碳鏈特征的脂肪酸。如本文所用的術(shù)語“脂肪酸降解酶”表示涉及將脂肪酸或脂肪酸衍生物分解或轉(zhuǎn)化成另一產(chǎn)物的酶。脂肪酸降解酶的非限制性實(shí)例是?；鵆oA合酶。本文描述了脂肪酸降解酶的其他實(shí)例。如本文所用的術(shù)語“脂肪酸衍生物”表示部分地產(chǎn)生于生產(chǎn)宿主生物體的脂肪酸生物合成途徑的產(chǎn)物?！爸舅嵫苌铩边€包括部分地產(chǎn)生于酰基ACP或?；鵄CP衍生物的產(chǎn)物。所述脂肪酸生物合成途徑包括脂肪酸合酶酶類，所述脂肪酸合酶酶類可以按照本文所述經(jīng)工程化產(chǎn)生脂肪酸衍生物，并且在一些實(shí)施例中可以與其他酶一起表達(dá)以產(chǎn)生具有所需碳鏈特征的脂肪酸衍生物。示例性的脂肪酸衍生物包括，例如脂肪酸、?；鵆oA、脂肪醛、短和長鏈醇、碳?xì)浠衔?、脂肪醇和?例如蠟、脂肪酸酯或脂肪酯)。如本文所用的術(shù)語“脂肪酸衍生酶”表示在脂肪酸衍生物的產(chǎn)生中可以被表達(dá)或超表達(dá)的任何酶。這些酶可以是脂肪酸生物合成途徑的一部分。脂肪酸衍生酶的非限制性實(shí)例包括脂肪酸合酶、硫酯酶、?；鵆oA合酶、?；鵆oA還原酶、醇脫氫酶、醇酰基轉(zhuǎn)移酶、形成脂肪醇的?；鵆oA還原酶、脂肪酸(羧酸)還原酶、醛還原酶、?；鵄CP還原酶、脂肪酸羥化酶、?；鵆oA去飽和酶、?；鵄CP去飽和酶、?；鵆oA氧化酶、酰基CoA脫氫酶、酯合酶和烷生物合成多肽等。脂肪酸衍生酶可以將底物轉(zhuǎn)化為脂肪酸衍生物。在一些實(shí)施例中，所述底物可以是被脂肪酸衍生酶轉(zhuǎn)化為不同的脂肪酸衍生物的脂肪酸衍生物。如本文所用的“脂肪酸酶”表示參與脂肪酸生物合成的任何酶。脂肪酸酶可以在宿主細(xì)胞中被修飾以產(chǎn)生脂肪酸。脂肪酸酶的非限制性實(shí)例包括脂肪酸合酶和硫酯酶。本文描述了脂肪酸酶的其他實(shí)例。如本文所用的“脂肪酸合酶”表示參與脂肪酸生物合成的任何酶。脂肪酸合酶可以在宿主細(xì)胞中表達(dá)或超表達(dá)以產(chǎn)生脂肪酸。脂肪酸合酶的非限制性實(shí)例是硫酯酶。本文描述了脂肪酸合酶的其他實(shí)例。如本文所用術(shù)語“脂肪醛”表示具有通式RCHO的醛，所述RCHO特征為不飽和羰基(c=0)。在優(yōu)選的實(shí)施方案中，所述脂肪醛是產(chǎn)生自脂肪酸或脂肪酸衍生物的任何醛。在一個(gè)實(shí)施方案中，R基長度為至少約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20個(gè)碳。R可以是直鏈或支鏈。支鏈可以具有一個(gè)或多個(gè)分支點(diǎn)。此外，支鏈可以包括環(huán)狀分支。另外，R可以是飽和的或不飽和的。如果是不飽和的，R可以具有一個(gè)或多個(gè)不飽和點(diǎn)。在一個(gè)實(shí)施方案中，脂肪醛是生物合成產(chǎn)生的。脂肪醛具有很多用途。例如，脂肪醛可被用于產(chǎn)生多種特種化學(xué)品。例如，脂肪醛用于生產(chǎn)聚合物、樹脂、染料、調(diào)味劑、增塑劑、香水、藥品和其他化學(xué)品。一些被用作溶劑、防腐劑或消毒劑。一些天然和合成的化合物，例如維生素和激素是醛。術(shù)語“脂肪醛生物合成多肽”、“羧酸還原酶”和“CAR”在本文可交換地使用。如本文所用的“現(xiàn)代碳比例(fractionofmoderncarbon)”或“fM”與分別由稱為草酸標(biāo)準(zhǔn)HOxI和HOxII的國家標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)研究院(NationalInstituteofStandardsandTechnology(NIST))標(biāo)準(zhǔn)參考物(SRMs)4990B和4990C所定義的具有相同意義?；径x涉及0.95倍的14Cz^C同位素比例HOxI(參考AD1950)。這粗略地等于衰變校正的工業(yè)革命前樹木(decay-correctedpre-IndustrialRevolutionwood)。對(duì)于現(xiàn)今生命生物圈(植物物質(zhì))而言，fM約為1.1。本文所用的“基因敲除”是指修飾或失活編碼靶蛋白的基因以降低或消除該完整蛋白的功能的方法?；虻氖Щ羁梢酝ㄟ^常規(guī)方法進(jìn)行，例如，通過UV照射或用N-甲基-N'-硝基-N-亞硝基胍處理的誘變，定點(diǎn)誘變、同源重組、插入-缺失誘變、或“Red-drivenintegration，，(Datsenkoetah,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,97:6640-45,2000)。例如，在一實(shí)施方案中，將構(gòu)建體引入宿主細(xì)胞從而可能在宿主細(xì)胞中選擇同源重組事件。本領(lǐng)域技術(shù)人員會(huì)容易地設(shè)計(jì)包含陽性或陰性選擇基因的敲除構(gòu)建體，所述選擇基因有效地選擇經(jīng)歷了同源重組事件、具有構(gòu)建體的轉(zhuǎn)染的細(xì)胞。例如，宿主細(xì)胞中的改變可以通過用包含改變的DNA序列置換野生型DNA序列獲得，所述置換通過單或雙交叉重組。例如，為了方便地選擇轉(zhuǎn)化體，所述改變可以是編碼抗生素抗性標(biāo)記的DNA序列或與宿主的可能的營養(yǎng)缺陷型互補(bǔ)的基因。突變包括但不限于，缺失-插入突變。這類改變的實(shí)例包括基因中斷，即基因干擾使得從該基因正常產(chǎn)生的產(chǎn)物沒有以功能形式產(chǎn)生。這可以是由于完全缺失、選擇性標(biāo)記的缺失或插入、選擇性標(biāo)記的插入、移碼突變、框內(nèi)缺失或?qū)е绿崆敖K止的定點(diǎn)突變。在一些實(shí)例中，該基因的完整mRNA是不存在的。在其他情況下，產(chǎn)生的mRNA的量發(fā)生變化?？梢园凑找韵掠?jì)算兩個(gè)序列之間“同源性”。序列以最佳比較目的進(jìn)行比對(duì)(例如，可以在第一和第二氨基酸或核酸序列之一或兩者中引入空位用于最佳比對(duì)，并且為了比較目的可以忽略非同源序列)。在優(yōu)選的實(shí)施方案中，用于比較目的的而比對(duì)的參考序列長度，為參考序列長度的至少約30%、優(yōu)選地至少約40%、更優(yōu)選地至少約50%、更優(yōu)選地至少約60%并且更優(yōu)選地至少約70%、至少約80%、至少約90%或約100%。然后比較位于相應(yīng)氨基酸位置或核苷酸位置的氨基酸殘基或核苷酸。當(dāng)?shù)谝恍蛄兄械奈恢帽慌c第二序列中相應(yīng)位置相同的氨基酸殘基或核苷酸占據(jù)時(shí)，則分子在該位置是相同的(如本文所用的，氨基酸或核酸“同一性”等同于氨基酸或核酸“同源性”)。兩個(gè)序列之間的同一性百分比是所述序列所共享的相同位置數(shù)的函數(shù)，這考慮到空位數(shù)和每個(gè)空位的長度，為了兩個(gè)序列的最佳比對(duì)需要弓丨入空位。可以使用數(shù)學(xué)算法完成序列的比較和兩個(gè)序列之間同源性百分比的測(cè)定。在優(yōu)選的實(shí)施方案中，使用以下測(cè)定兩個(gè)氨基酸序列之間的同源性百分比=NeedlemanandWunsch(1970),J.Mol.Biol.48:444453的算法，其被并入GCG軟件包中的GAP程序中，使用Blossum62矩陣或PAM250矩陣，以及16、14、12、10、8、6或4的空位權(quán)重和1、2、3、4、5或6的長度權(quán)重。在另一優(yōu)選的實(shí)施方案中，使用以下測(cè)定兩個(gè)核苷酸序列之間的同源性百分比GCG軟件包中的GAP程序，使用NWSgapdna.CMP矩陣以及40、50、60、70或80的空位權(quán)重和1、2、3、4、5或6的長度權(quán)重。特別優(yōu)選的參數(shù)組(和如果操作者不確定應(yīng)當(dāng)應(yīng)用哪些參數(shù)確定分子是否在要求的同源性限制內(nèi)而應(yīng)該使用的參數(shù)組)是具有12的空位罰分、4的空位延伸罰分和5的移碼空位罰分的Blossum62評(píng)分矩陣。如本文所用的“宿主細(xì)胞”是用于產(chǎn)生本文所述產(chǎn)物(例如本文所述的脂肪醛)的細(xì)胞?？梢怨こ袒拗骷?xì)胞以表達(dá)或超表達(dá)所選擇的基因或具有所選擇的基因的減弱的表達(dá)。宿主細(xì)胞的非限制性實(shí)例包括植物、動(dòng)物、人、細(xì)菌、酵母或絲狀真菌細(xì)胞。如本文所用的術(shù)語在“低嚴(yán)緊性、中嚴(yán)緊性、高嚴(yán)緊性或非常高的嚴(yán)緊性條件下雜交”，描述用于雜交和洗滌的條件。進(jìn)行雜交反應(yīng)的指導(dǎo)可以見于CurrentProtocolsinMolecularBiology(現(xiàn)代分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù))，JohnWiley&Sons,N.Y.(1989)，6.3.1-6.3.6。該參考資料中描述了水性和非水性方法并且可以使用任一方法。本文涉及的具體雜交條件如下1)低嚴(yán)緊性雜交條件在約45°C下、在6X氯化鈉/檸檬酸鈉(SSC)中，然后是在至少50°C下、在0.2XSSC、0.1%SDS中洗滌兩次(對(duì)于低嚴(yán)緊性條件，洗滌溫度可以升至；2)中嚴(yán)緊性雜交條件在約45°C下在、在6XSSC中，然后是在60°C的0.2XSSC、0.SDS中洗滌一次或多次；3)高嚴(yán)緊性雜交條件在約45°C的6XSSC中，然后是在65°C下、在0.2XSSC、0.1%SDS中洗滌一次或多次；以及優(yōu)選地4)非常高嚴(yán)緊性雜交條件為65°C的0.5M磷酸鈉、7%SDS，然后是在65°C下、在0.2XSSCU%SDS中洗滌一次或多次。除非另作規(guī)定，非常高的嚴(yán)緊性條件(4)是優(yōu)選的條件。本文中涉及諸如DNA或RNA的核酸所用的術(shù)語“分離的”是指分別從所述核酸的天然來源中存在的其他DNA或RNA中隔離的分子。此外，“分離的核酸”包括核酸片段，所述核酸片段不是以片段天然存在的并不會(huì)在天然狀態(tài)中發(fā)現(xiàn)。本文所用的術(shù)語“分離的”還指從其他細(xì)胞蛋白分離的多肽，并且還指包括純化的和重組的多肽兩者。當(dāng)核酸或多肽是通過重組DNA技術(shù)產(chǎn)生時(shí)，本文使用的術(shù)語“分離的”還指基本上不含細(xì)胞物質(zhì)、病毒物質(zhì)或培養(yǎng)基的核酸或肽。當(dāng)核酸或多肽是化學(xué)合成時(shí)，本文所用的術(shù)語“分離的”還指基本上不含化學(xué)前體或其他化學(xué)品的核酸或肽。本文所用的術(shù)語“分離的”，對(duì)于諸如脂肪醛的產(chǎn)品而言，是指從細(xì)胞組分、細(xì)胞培養(yǎng)基或化學(xué)或合成前體分離的產(chǎn)物。如本文所用的“細(xì)胞中的基因表達(dá)水平”是指由所述細(xì)胞中基因編碼的mRNA、前體mRNA新生轉(zhuǎn)錄物、轉(zhuǎn)錄加工中間體、成熟mRNA和降解產(chǎn)物的水平。如本文所用的術(shù)語“微生物”表示來自古菌域、細(xì)菌域和真核域的原核和真核微生物種類，后者包括酵母和絲狀真菌、原生動(dòng)物、藻類或高等原生生物。術(shù)語“微生物細(xì)胞”(即，來自微生物的細(xì)胞)和“微生物”是可交換使用的并且表示僅借助于顯微鏡可見的細(xì)胞或小有機(jī)體。如本文所用的術(shù)語“核酸”是指多核苷酸，例如脫氧核糖核酸(DNA)以及適當(dāng)情況下，指核糖核酸(RNA)。該術(shù)語應(yīng)理解為還包括作為等同物的產(chǎn)生自核苷酸類似物的RNA或DNA的類似物，以及適用于所述實(shí)施方案的單鏈(有義或反義)和雙鏈多核苷酸、EST、染色體、cDNA、mRNA和rRNA。如本文所用的術(shù)語“可操作地連接”表示所選擇的核苷酸序列(例如編碼本文所述的多肽)與啟動(dòng)子接近以允許所述啟動(dòng)子調(diào)節(jié)該選擇的DNA的表達(dá)。此外，按照轉(zhuǎn)錄和翻譯的方向，所述啟動(dòng)子位于所述選擇的核苷酸序列的上游?！翱刹僮鞯剡B接”表示將核苷酸序列和調(diào)節(jié)序列連接以便當(dāng)合適的分子(例如轉(zhuǎn)錄激活蛋白)與調(diào)節(jié)序列結(jié)合時(shí)允許基因表達(dá)。本文所用術(shù)語“或”表示術(shù)語“和/或”并且與術(shù)語“和/或”交換使用，除非上下文明確表示并非如此。如本文所用的“超表達(dá)”表示在細(xì)胞中以高于相應(yīng)野生型細(xì)胞中正常表達(dá)濃度的濃度表達(dá)核酸、多肽或碳?xì)浠衔锘蚴怪磉_(dá)。例如，當(dāng)在重組宿主細(xì)胞中多肽以與其在相同種類的非重組宿主細(xì)胞中的濃度相比更高的濃度存在時(shí)，所述多肽在所述重組宿主細(xì)胞中能夠“超表達(dá)”。如本文所用的“分配系數(shù)”或“P”定義為化合物在有機(jī)相中的平衡濃度除以在水相中(例如發(fā)酵液)平衡時(shí)的濃度。在本文所述的兩相系統(tǒng)的一個(gè)實(shí)施方案中，生產(chǎn)過程中所述有機(jī)相是由脂肪醛形成的。但是，在一些實(shí)施例中，可以例如通過提供辛烷層來提供有機(jī)相以便促進(jìn)產(chǎn)物分離。當(dāng)描述兩相系統(tǒng)時(shí)，化合物的分配特性可以描述為logP。例如，IogP為1的化合物會(huì)101分配到有機(jī)相。IogP為-1的化合物會(huì)110分配到有機(jī)相。通過選擇合適的發(fā)酵液和有機(jī)相，具有高IogP值的脂肪醛在發(fā)酵容器中也會(huì)分離到有機(jī)相中，即使處于很低的濃度。如本文所用的術(shù)語“純化(purify)”、“純化的(purified)”或“純化(purification)”表示通過例如分離或隔離從分子的環(huán)境中移除或分離所述分子?！盎旧霞兓摹狈肿訛橹辽偌s60%、優(yōu)選地至少約75%以及更優(yōu)選地至少約90%游離于與其相關(guān)的其他組分。如本文所用的這些術(shù)語還指從樣品中去除污染物。例如，污染物的去除可以導(dǎo)致樣品中脂肪醛的百分比增加。例如，當(dāng)脂肪醛在宿主細(xì)胞中產(chǎn)生時(shí)，可以通過去除宿主細(xì)胞蛋白純化脂肪醛。純化后，樣品中脂肪醛的百分比增加。術(shù)語“純化(purify)”、“純化的(purified)”或“純化(purification)，，不需要絕對(duì)純。它們是相對(duì)的術(shù)語。因此，例如當(dāng)脂肪醛在宿主細(xì)胞中產(chǎn)生時(shí)、純化的脂肪醛是基本與其他細(xì)胞組分(例如核酸、多肽、脂質(zhì)、碳水化合物或其他碳?xì)浠衔?隔離的脂肪醛。在另一實(shí)施例中，純化的脂肪醛制劑是這樣的制劑，在該制劑中，所述脂肪醛基本不含例如發(fā)酵后可能存在的那些污染物。在一些實(shí)施方案中，當(dāng)樣品重量的至少約50%是由脂肪醛組成時(shí)，所述脂肪醛是純化的。在其他實(shí)施方案中，當(dāng)樣品重量的至少約eo^jo^jo^、85%、90%、92%、95%、98%或99%或更多是由脂肪醛組成時(shí)，所述脂肪醛是純化的。如本文所用，術(shù)語“重組多肽”是指通過重組DNA技術(shù)產(chǎn)生的多肽，其中通常將編碼所表達(dá)的多肽或RNA的DNA插入合適的表達(dá)載體，并且所述表達(dá)載體接下來用于轉(zhuǎn)化宿主細(xì)胞以產(chǎn)生所述肽或RNA。如本文所用的術(shù)語“基本相同”(或“基本同源”)是用于指含有足夠數(shù)量的與第二氨基酸或核苷酸序列相同或等同的(例如具有相似側(cè)鏈，例如保守氨基酸取代)氨基酸殘基或核苷酸的第一氨基酸或核苷酸序列，這樣所述第一和第二氨基酸或核苷酸序列具有相似活性。如本文所用的術(shù)語“合酶”表示催化合成過程的酶。如本文所用的術(shù)語合酶包括合酶、合成酶和連接酶。如本文所用的術(shù)語“轉(zhuǎn)染”表示將核酸(例如通過表達(dá)載體)通過核酸介導(dǎo)的基因轉(zhuǎn)移引入到受體細(xì)胞。如本文所用的“轉(zhuǎn)化”是指這樣的過程，在該過程中，細(xì)胞的基因型由于細(xì)胞攝入外源核酸而改變。這可以導(dǎo)致表達(dá)重組形式的RNA或多肽的轉(zhuǎn)化的細(xì)胞。在由轉(zhuǎn)移的基因反義表達(dá)的情況下，天然存在形式的多肽的表達(dá)遭到破壞。如本文所用，“轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白”是促進(jìn)一種或多種化合物移入和/或移出細(xì)胞器和/或細(xì)胞的多肽。如本文所用，多肽X的“變體”是指具有肽X的氨基酸序列的多肽，其中一個(gè)或多個(gè)氨基酸殘基發(fā)生改變。所述變體可以具有保守型改變或非保守型改變。使用本領(lǐng)域熟知的計(jì)算機(jī)程序，例如LASERGENE軟件(DNASTAR)，可以找到確定哪些氨基酸殘基可以被取代、插入或缺失而不影響生物活性的指導(dǎo)。在用于多核苷酸序列的情況下，術(shù)語“變體”可以包括與基因或其編碼序列的多核苷酸序列相關(guān)的多核苷酸序列。該定義還可以包括，例如“等位基因”變體、“剪接”變體、“物種”變體或“多態(tài)性”變體。剪接變體可以與參考多核苷酸具有顯著的同一性，但是由于在mRNA加工中的可選的外顯子剪接，會(huì)通常具有更多或更少的多核苷酸數(shù)。相應(yīng)的多肽可以具有另外的功能結(jié)構(gòu)域或結(jié)構(gòu)域缺失。物種變體是在物種之間彼此不同的多核苷酸序列。得到的多肽通常會(huì)具有顯著的相對(duì)于彼此的氨基酸同一性。多態(tài)性變體是在給定物種的個(gè)體之間特定基因的多核苷酸序列中的變異。如本文所用，術(shù)語“載體”是指能夠轉(zhuǎn)運(yùn)另一核酸的核酸分子，所述核酸分子連接到所述另一核酸。一種有用的載體是附加體(即能夠染色體外的復(fù)制的核酸)。有用的載體是能夠自主復(fù)制和/或表達(dá)與其連接的核酸的那些載體。能夠指導(dǎo)基因的表達(dá)的載體在本文被稱為“表達(dá)載體”，所述載體被可操作地連接到所述基因。通常，在重組DNA技術(shù)中有用的表達(dá)載體經(jīng)常是“質(zhì)粒”的形式，所述“質(zhì)?！蓖ǔＪ侵冈谄漭d體形式時(shí)不與染色體結(jié)合的環(huán)狀雙鏈DNA環(huán)。在本說明書中，因?yàn)橘|(zhì)粒是最通常使用的載體形式，所以“質(zhì)?！焙汀拜d體”是交換使用的。但是，還包括發(fā)揮等同功能并隨后至今成為本領(lǐng)域已知的表達(dá)載體的這些其他形式。本發(fā)明至少部分基于大腸桿菌中脂肪醛合成新途徑的發(fā)現(xiàn)和編碼脂肪醛生物合成多肽的基因的鑒定。所述脂肪醛生物合成多肽參與圖1中所示的生物合成途徑。在該途徑中，首先用ATP活化脂肪酸，然后用羧酸還原酶(CAR)樣酶還原以產(chǎn)生脂肪醛。因此，本文所述的脂肪醛生物合成核苷酸和多肽可以用于產(chǎn)生脂肪醛。脂肪醛生物合成基因和變體例如，本文所述的方法和組合物包括脂肪醛生物合成基因，例如具有圖2和圖4中所列核苷酸序列的羧酸還原酶基因(car基因)，以及其多核苷酸變體。在一些實(shí)例中，所述脂肪醛生物合成基因編碼圖3所示的一個(gè)或多個(gè)氨基酸基序。例如，該基因可以編碼包含SEQIDNO7,SEQIDNO:8、SEQIDNO:9和SEQIDNO10；SEQIDNO11；SEQIDNO12；SEQIDNO13；SEQIDNO14；和/或SEQIDNO:7、SEQIDNO:9、SEQIDNO10和SEQIDN0:11的多肽。SEQIDNO:7包括還原酶結(jié)構(gòu)域；SEQIDNO8禾口SEQIDNO14包括NADP結(jié)合結(jié)構(gòu)域；SEQIDNO:9包括磷酸泛酰巰基乙胺附著位點(diǎn)；并且SEQIDNO10包括AMP結(jié)合結(jié)構(gòu)域。變體可以是天然存在的或體外產(chǎn)生的。特別是，可以使用基因工程技術(shù)產(chǎn)生這些變體，例如定點(diǎn)誘變、隨機(jī)化學(xué)誘變、外切核酸酶III缺失操作或標(biāo)準(zhǔn)克隆技術(shù)?？蛇x地，可以使用化學(xué)合成或修飾操作產(chǎn)生這些變體、片段、類似物或衍生物。制備變體的方法是本領(lǐng)域熟知的。這些方法包括這樣的操作，在該操作中，修飾獲得自天然分離物的核酸序列以生成編碼多肽的核酸，所述多肽具有增強(qiáng)其在工業(yè)或?qū)嶒?yàn)室應(yīng)用中的價(jià)值的特征。在這些操作中，生成并表征了相對(duì)于獲得自天然分離物的序列具有一個(gè)或多個(gè)核苷酸差異的大量變體序列。通常，這些核苷酸差異導(dǎo)致相對(duì)于來自天然分離物的核酸所編碼的多肽的氨基酸改變。例如，可以使用易錯(cuò)PCR(參見，例如Leungetal.，Technique1:11-15,1989；和Caldwelletal.，PCRMethodsApplic.2:28_33，1992)產(chǎn)生變體。在易錯(cuò)PCR中，在DNA聚合酶的復(fù)制保真度低的條件下進(jìn)行PCR，這樣沿著PCR產(chǎn)物的整個(gè)長度獲得了高效點(diǎn)突變。簡單地說，在這些操作中，將待誘變的核酸(例如脂肪醛生物合成多核苷酸序列)與PCR引物、反應(yīng)緩沖液、MgCl2,MnCl2,Taq聚合酶和適當(dāng)濃度的dNIPs混合，以實(shí)現(xiàn)沿著PCR產(chǎn)物的整個(gè)長度的高效點(diǎn)突變。例如，可以使用20fmoles的待誘變的核酸(例如脂肪醛生物合成多核苷酸序列)，30pmole的每種PCR引物，包含50mMKClUOmMTrisHCl(pH8.3)和0.01%明膠的反應(yīng)緩沖液，7mMMgCl2,0.5mMMnCl2,5單位的Taq聚合酶，0.2mMdGTP,0.2mMdATP,ImMdCTP和ImMdTTP進(jìn)行反應(yīng)。PCR可以進(jìn)行30個(gè)以下循環(huán)94°C持續(xù)1分鐘、45°C持續(xù)1分鐘和72°C持續(xù)1分鐘。但是，應(yīng)當(dāng)理解到這些參數(shù)可以視情況變化。然后，將誘變后的核酸克隆到合適的載體中并且評(píng)價(jià)所述誘變后的核酸編碼的多肽的活性。還可以使用寡核苷酸定向誘變以在任何克隆的目的DNA中產(chǎn)生位點(diǎn)特異性突變來產(chǎn)生變體。寡核苷酸誘變描述于，例如Reidhaar-Olsonetal.，Science241:53-57，1988。簡單地說，在這些操作中，合成大量帶有一個(gè)或多個(gè)待被引入克隆DNA中的突變的雙鏈寡核苷酸并且將其插入待誘變的克隆DNA(例如脂肪醛生物合成多核苷酸序列)。重獲含有誘變后的DNA的克隆并且評(píng)價(jià)其編碼的多肽的活性。產(chǎn)生變體的另一方法是組合PCR(assemblyPCR)。組合PCR涉及由小DNA片段的混合物組合PCR產(chǎn)物。大量的不同PCR反應(yīng)在相同小管中平行發(fā)生，伴隨一個(gè)反應(yīng)的產(chǎn)物引發(fā)另一反應(yīng)的產(chǎn)物。組合PCR描述于例如美國專利第5，965，408號(hào)。生成變體的又一方法是有性PCR誘變。在有性PCR誘變中，作為基于序列同源性的DNA分子隨機(jī)破碎的結(jié)果，體外發(fā)生了不同但高度相關(guān)的DNA序列的DNA分子之間的被迫的同源重組。然后是通過在PCR反應(yīng)中的引物延伸固定交換。有性PCR誘變描述于例如Stemmer,PNAS,USA91:10747_10751，1994。還可以通過體內(nèi)誘變產(chǎn)生變體。在一些實(shí)施方案中，核酸序列中的隨機(jī)突變通過在攜帶一個(gè)或多個(gè)DNA修復(fù)途徑中的突變的例如大腸桿菌菌株的細(xì)菌菌株中增殖所述序列來生成。這些“致突變(mutator)”菌株具有比野生型菌株更高的隨機(jī)突變率。在這些菌株的一個(gè)菌株中增殖DNA序列(例如脂肪醛生物合成多核苷酸序列)會(huì)最終在所述DNA中產(chǎn)生隨機(jī)突變。適用于體內(nèi)誘變的致突變菌株描述于例如PCT公布第WO91/16427號(hào)。還可以使用盒誘變產(chǎn)生變體。在盒誘變中，雙鏈DNA分子的小的區(qū)被不同于天然序列的合成的寡核苷酸“盒”替換。該寡核苷酸經(jīng)常含有完全和/或部分隨機(jī)化的天然序列?；貧w整體誘變(Recursiveensemblemutagenesis)也可以用于產(chǎn)生變體?；貧w整體誘變是開發(fā)用以產(chǎn)生表型相關(guān)的突變體的多樣性群體的蛋白工程(即蛋白誘變)的運(yùn)算法則，所述群體成員的氨基酸序列是不同的。該方法使用反饋機(jī)制來控制連續(xù)輪的組合盒誘變。回歸整體誘變描述于例如Arkinetal.，PNAS，USA89:7811-7815,1992。在一些實(shí)施方案中，使用指數(shù)整體誘變(exponentialensemblemutagenesis)產(chǎn)生變體。指數(shù)整體誘變是產(chǎn)生具有高百分比的獨(dú)特并且有功能的變體的組合文庫的過程，其中小群殘基被平行隨機(jī)化以鑒定每個(gè)改變的位置上導(dǎo)致功能性蛋白的氨基酸。指數(shù)整體誘變描述于例如Delegraveetal.，Biotech.Res.111548-1552，1993。隨機(jī)誘變和定點(diǎn)誘變描述于例如Arnold,Curr.Opin.Biotech.4:450-455,1993。在一些實(shí)施方案中，如例如美國專利第5，965，408號(hào)和第5，939，250號(hào)中所述，使用改組操作產(chǎn)生變體，其中許多編碼不同多肽的核酸中的部分融合在一起以產(chǎn)生編碼嵌合多肽的嵌合核酸序列。多核苷酸變體還包括核酸類似物。核酸類似物可以在堿基部分、糖部分或磷酸主鏈處進(jìn)行修飾以改善例如核酸的穩(wěn)定性、雜交或溶解性。堿基部分的修飾包括將脫氧胸苷修飾為脫氧尿苷和將脫氧胞苷修飾為5-甲基-2'-脫氧胞苷或5-溴-2'-脫氧胞苷。糖部分的修飾包括修飾核糖的2'羥基以形成2'-0-甲基糖或'-0-烯丙基糖。可以修飾脫氧核糖磷酸主鏈以產(chǎn)生嗎啉代核酸，其中每個(gè)堿基部分連接到六元嗎啉代環(huán)，或產(chǎn)生肽核酸，其中脫氧磷酸主鏈被假肽主鏈代替并保留4個(gè)堿基(參見，例如Summertonetal.,AntisenseNucleicAcidDrugDev.(1997)7187-195；禾口Hyrupetal.,Bioorgan.Med.Chem.(1996)4:5-23.)0此外，脫氧磷酸主鏈可以被例如硫代磷酸酯或二硫代磷酸酯主鏈、亞磷酰胺、或烷基磷酸三酯主鏈所代替。編碼圖2和圖4中列出的同系物或其變體的任何多核苷酸序列可以被用作本文所述方法中的脂肪醛生物合成多核苷酸。脂肪酵牛物合成多肽和變體本文所述的方法和組合物還包括具有圖2和圖4列出的氨基酸序列的脂肪醛生物合成多肽及其多肽變體。在一些實(shí)例中，所述脂肪醛生物合成多肽是包括圖3所示的一個(gè)或多個(gè)氨基酸基序的多肽。例如，該多肽可以包含SEQIDNO7,SEQIDNO:8、SEQIDNO:9和SEQIDNO:10的氨基酸序列。在其他情況下，該多肽包含SEQIDNO=IUSEQIDNO:12,SEQIDNO:13和SEQIDNO:14中的一個(gè)或多個(gè)。在仍然其他實(shí)例中，該多肽包含SEQIDNO:7、SEQIDNO:9、SEQIDNO10和SEQIDNO11的氨基酸序列。SEQIDNO7包括還原酶結(jié)構(gòu)域；SEQIDNO:8和SEQIDNO14包括NADP結(jié)合結(jié)構(gòu)域；SEQIDN0:9包括磷酸泛酰巰基乙胺附著位點(diǎn)；并且SEQIDNO10包括AMP結(jié)合結(jié)構(gòu)域。脂肪醛生物合成多肽變體可以是其中一個(gè)或多個(gè)氨基酸殘基被保守或非保守氨基酸殘基(優(yōu)選保守氨基酸殘基)所取代的變體。這些取代的氨基酸殘基可以是或可以不是遺傳密碼所編碼的殘基。保守型取代為由相似性質(zhì)的另一氨基酸取代多肽中給定氨基酸的那些取代。典型的保守型取代是以下替換諸如丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸和異亮氨酸的脂肪族氨基酸被另一脂肪族氨基酸替換；絲氨酸被蘇氨酸替換，或反之亦然；諸如天冬氨酸和谷氨酸的酸性殘基被另一酸性殘基替換；諸如天冬酰胺和谷氨酰胺的攜帶酰胺的殘基被另一攜帶酰胺基的殘?zhí)鎿Q；諸如賴氨酸和精氨酸的堿性殘基被另一堿性殘基交換；以及諸如苯丙氨酸和酪氨酸的芳香族殘基被另一芳香族殘基替換。其他多肽變體是那些其中一個(gè)或多個(gè)氨基酸殘基包括取代基的變體。還有其他多肽變體是那些其中所述多肽與另一化合物結(jié)合的變體，如增加多肽的半衰期的化合物(例如聚乙二醇)。另外的多肽變體是那些其中其他氨基酸被融合到所述多肽的變體，所述其他氨基酸例如前導(dǎo)序列、分泌序列、前蛋白序列或促進(jìn)所述多肽的純化、富集或穩(wěn)定的序列。在一些情況下，所述多肽變體保留了與具有圖2和圖4列出的氨基酸序列的多肽相同的生物學(xué)功能(例如，保留脂肪醛生物合成活性，例如羧酸或脂肪酸還原酶活性)并且具有與其基本相同的氨基酸序列。在其他情況下，所述多肽變體與圖2和圖4列出的氨基酸序列具有至少約50%、至少約55%、至少約60%、至少約65%、至少約70%、至少約75%、至少約80%、至少約85%、至少約90%、至少約95%或多于約95%的同源性。在另一實(shí)施方案中，所述多肽變體包括片段，所述片段包含圖2和圖4列出的氨基酸序列的至少約5、10、15、20、25、30、35、40、50、75、100或150個(gè)連續(xù)氨基酸。所述多肽變體或其片段可以通過使用本文所述的技術(shù)分離編碼它們的核酸或通過超表達(dá)編碼它們的合成的核酸來獲得?？蛇x地，多肽變體或其片段可以通過生物化學(xué)富集或純化操作來獲得。多肽變體或片段的序列可以通過蛋白水解消化、凝膠電泳和/或微測(cè)序來確定。然后使用本文所述的任何程序，可以將所述多肽變體或片段的序列與圖2和圖4列出的氨基酸序列進(jìn)行比較。使用常規(guī)方法，可以檢測(cè)所述多肽變體及其片段的產(chǎn)生脂肪醛醛的活性。例如，在允許所述多肽變體發(fā)揮功能的條件下，可以使所述多肽變體或片段與底物(例如，脂肪酸底物、脂肪酸衍生物底物或本文所述的其他底物)接觸?？梢詼y(cè)量底物水平的下降或脂肪醛水平的升高以測(cè)定產(chǎn)生脂肪醛的活性?？怪窘团Ｎ锖铣啥嚯目贵w本文所述的脂肪醛生物合成多肽還可以用于產(chǎn)生針對(duì)脂肪醛生物合成多肽的抗體。這些抗體可以用于，例如利用本領(lǐng)域已知的方法檢測(cè)脂肪醛生物合成多肽的表達(dá)。所述抗體可以是，例如多克隆抗體；單克隆抗體或其抗原結(jié)合片段；例如嵌合抗體、重構(gòu)抗體(reshapedantibody)、人源化抗體的修飾的抗體或其片段(例如Fab'、Fab、F(ab')2)；或例如單鏈抗體、單結(jié)構(gòu)域抗體(DAB)、Fv、單鏈Fv(SCFV)等的生物合成抗體。制備和使用多克隆和單克隆抗體的方法描述于，例如Harlowetal.,UsingAntibodies:ALaboratoryManualportableProtocolI(用抗.體實(shí)騎室才旨南操作手冊(cè)I).ColdSpringHarborLaboratory(1998年12月1日)。制備修飾的抗體和抗體片段(例如嵌合抗體、重構(gòu)抗體、人源化抗體或其片段，所述片段例如Fab'、Fab、F(ab')2片段)或生物合成抗體(例如單鏈抗體、單結(jié)構(gòu)域抗體(DABs)、Fv、單鏈Fv(SCFV)等)的方法是本領(lǐng)域已知的并且可以見于，例如Zola,MonoclonalAntibodiespreparationandUseofMonoclonalAntibodiesandEngineeredAntibodyDerivatives(單克隆抗體單克隆抗體和工程化抗體衍生物的制備和使用)，施普林格(SpringerVerlag)(2000年12月15;第一版)。本文所述的組合物和方法可以用于由合適的底物產(chǎn)生脂肪醛。盡管不希望被理論所約束，還是認(rèn)為本文所述的多肽通過還原機(jī)制由底物產(chǎn)生脂肪醛。在一些情況下，所述底物是脂肪酸衍生物(例如脂肪酸)，并且具有特定分支模式和碳鏈長度的脂肪醛可以由具有那些會(huì)導(dǎo)致所需脂肪醛的特定特征的脂肪酸衍生物產(chǎn)生。因此，可以修飾導(dǎo)致脂肪酸衍生物底物的產(chǎn)生的生物合成途徑中的每一個(gè)步驟以產(chǎn)生或過量產(chǎn)生目的底物。例如，可以在宿主細(xì)胞中表達(dá)、超表達(dá)或減弱參與脂肪酸生物合成途徑或脂肪醛途徑的已知基因，以產(chǎn)生所需底物(參見，例如PCT/US08/058788)。示例性基因提供于圖5中。底物的合成脂肪酸合酶(FAQ是一組催化?；湹钠鹗己脱娱L的多肽(Marrakchietal.，BiochemicalSociety，301050-1055，2002)。?；d體蛋白(ACP)以及FAS途徑中的酶控制所產(chǎn)生的脂肪酸衍生物的長度、飽和度和分支。脂肪酸生物合成途徑涉及前體乙酰CoA和丙二酰CoA。該途徑中的步驟由脂肪酸生物合成(fab)和乙酰CoA羧化酶(acc)基因家族的酶催化(參見，例如Heathetal.,Prog.LipidRes.40(6):467-97(2001))可以通過重組表達(dá)或超表達(dá)一種或多種脂肪酸合酶基因，例如乙酰CoA和/或丙二酰CoA合酶基因，工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)脂肪酸衍生物底物。例如，為了增加乙酰CoA產(chǎn)生，可以在宿主細(xì)胞中表達(dá)一個(gè)或多個(gè)以下基因pdh(包含aceEF(編碼丙酮酸和2_酮戊二酸脫氫酶復(fù)合物的Elp脫氫酶組分和E2p二氫硫辛酰胺?；D(zhuǎn)移酶組分，和Ipd)的多酶復(fù)合物)、panK、fabH、fabD、fabG、acpP和fabF。這些基因的示例性GenBank登錄號(hào)為pdh(BAB34380、AAC73227、AAC73226)、panK(也稱為CoA、AAC76952)、aceEF(AAC73227、AAC73226)、fabH(AAC74175)、fabB(P0A953)、fabD(AAC74176)、fabG(AAC74177)、acpP(AAC74178)、fabF(AAC74179)。此外，可以通過用含有相應(yīng)基因的無效或缺失突變的條件復(fù)制或非復(fù)制質(zhì)粒進(jìn)行轉(zhuǎn)化或通過取代啟動(dòng)子或增強(qiáng)子序列，在工程化的宿主細(xì)胞中減弱或敲除fadE、gpsA、ldhA、pflb、adhE、pta、poxB、ackA和/或ackB的表達(dá)水平。這些基因的示例性GenBank登錄號(hào)為fadE(AAC73325)、gspA(AAC76632)、IdhA(AAC74462)、pflb(AAC73989)、adhE(AAC74323)、pta(AAC75357)、poxB(AAC73958)、ackA(AAC75356)和ackB(BAB81430)。得到的宿主細(xì)胞當(dāng)在合適的環(huán)境中生長時(shí)，會(huì)具有增加的乙酰CoA產(chǎn)生水平?？梢酝ㄟ^將accABCD(例如登錄號(hào)AAC73296、EC6.4.1.2)引入宿主細(xì)胞影響丙二酰CoA的超表達(dá)?？梢酝ㄟ^將編碼脂肪酶的DNA序列(例如，登錄號(hào)CAA89087、CAA98876)引入宿主細(xì)胞，在宿主細(xì)胞中進(jìn)一步超表達(dá)脂肪酸。此外，抑制PlsB可以導(dǎo)致長鏈?；鵄CP的水平增加，這會(huì)抑制途徑中的早期步驟(例如，accABCD、fabH和fabl)。pisB(例如，登錄號(hào)AAC77011)D31IE突變可以用于增加可用的脂肪酸的量。此外，可以工程化宿主細(xì)胞以超表達(dá)sfa基因(fabA的抑制基因，例如，登錄號(hào)AAN79592)，從而增加單不飽和脂肪酸的產(chǎn)生(Rocketal.，J.Bacteriology1785382-5387，1996)。通過修飾所選擇的硫酯酶的表達(dá)，可以選擇脂肪酸衍生物底物的鏈長度。硫酯酶影響產(chǎn)生的脂肪酸的鏈長度。因此，可以工程化宿主細(xì)胞以表達(dá)、超表達(dá)、具有減弱表達(dá)或不表達(dá)一種或多種選擇的硫酯酶以增加優(yōu)選的脂肪酸衍生物底物的產(chǎn)生。例如，Cltl脂肪酸可以通過表達(dá)具有產(chǎn)生Cltl脂肪酸偏向性的硫酯酶并減弱具有產(chǎn)生除了Cltl脂肪酸外的脂肪酸的偏向性的硫酯酶(例如，優(yōu)選產(chǎn)生C14脂肪酸的硫酯酶)來產(chǎn)生。這會(huì)導(dǎo)致碳鏈長度為10的脂肪酸的相對(duì)同種群體。在仍然其他情況下，C14脂肪酸可以通過減弱產(chǎn)生非C14脂肪酸的內(nèi)源硫酯酶并且表達(dá)使用C14-ACP的硫酯酶來產(chǎn)生。在一些情況下，C12脂肪酸可以通過表達(dá)使用C12-ACP的硫酯酶并且減弱產(chǎn)生非C12脂肪酸的硫酯酶來產(chǎn)生。使用本領(lǐng)域已知的方法可以證實(shí)乙酰CoA、丙二酰CoA和脂肪酸的過量產(chǎn)生，例如，通過在細(xì)胞裂解后使用放射性操作、HPLC或GC-MS?？梢杂糜诒疚乃龅姆椒ㄖ械牧蝓ッ傅姆窍拗菩詫?shí)例在表1中列出。表1硫酯酶權(quán)利要求1.產(chǎn)生脂肪醛的方法，所述方法包括在宿主細(xì)胞中表達(dá)編碼多肽的基因和從所述宿主細(xì)胞分離所述脂肪醛，其中所述多肽包含與SEQIDNO:18、20、22、24、沈、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、114、116、118、120或122的氨基酸序列具有至少約80%的序列同一性的氨基酸序列。2.如權(quán)利要求1所述的方法，其還包括修飾所述宿主細(xì)胞中編碼脂肪酸合酶的基因的表達(dá)。3.如權(quán)利要求2所述的方法，其中修飾脂肪酸合酶的基因的表達(dá)包括在宿主細(xì)胞中表達(dá)編碼硫酯酶的基因。4.如權(quán)利要求1所述的方法，其中遺傳工程化所述宿主細(xì)胞以相對(duì)于野生型宿主細(xì)胞表達(dá)減弱水平的脂肪酸降解酶。5.產(chǎn)生脂肪醛的方法，所述方法包括在宿主細(xì)胞中表達(dá)(i)編碼包含與SEQIDNO16的氨基酸序列具有至少約80%的序列同一性的氨基酸序列的多肽的基因和(ii)編碼重組脂肪酸合酶的基因；并從所述宿主細(xì)胞分離所述脂肪醛。6.產(chǎn)生脂肪醛的方法，所述方法包括在宿主細(xì)胞中表達(dá)編碼包含SEQIDN0:16的氨基酸序列的多肽或其變體的基因，和從所述宿主細(xì)胞分離所述脂肪醛，其中遺傳工程化所述宿主細(xì)胞以相對(duì)于野生型宿主細(xì)胞表達(dá)減弱水平的脂肪酸降解酶。7.產(chǎn)生脂肪醛的方法，所述方法包括在宿主細(xì)胞中表達(dá)重組載體和從所述宿主細(xì)胞分離所述脂肪醛，其中所述重組載體包含與SEQIDNO:17、19、21、23、25、27、29、31、33、；35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、113、115、117、119或121的核苷酸序列具有至少約80%的序列同一性的核苷酸序列。8.如權(quán)利要求7所述的方法，其還包括修飾宿主細(xì)胞中編碼脂肪酸合酶的基因的表達(dá)。9.如權(quán)利要求8所述的方法，其中修飾脂肪酸合酶的基因的表達(dá)包括在宿主細(xì)胞中表達(dá)編碼硫酯酶的基因。10.如權(quán)利要求7所述的方法，其中遺傳工程化所述宿主細(xì)胞以相對(duì)于野生型宿主細(xì)胞表達(dá)減弱水平的脂肪酸降解酶。11.產(chǎn)生脂肪醛的方法，所述方法包括在宿主細(xì)胞中表達(dá)(i)包含與SEQIDN0:15的核苷酸序列具有至少約80%的序列同一性的核苷酸序列的重組載體和(ii)重組脂肪酸合酶；并從所述宿主細(xì)胞分離所述脂肪醛。12.產(chǎn)生脂肪醛的方法，所述方法包括在宿主細(xì)胞中表達(dá)包含與SEQIDN0:15的核苷酸序列具有至少約80%序列同一性的核苷酸序列的重組載體，和從所述宿主細(xì)胞分離所述脂肪醛，其中所述宿主細(xì)胞相對(duì)于野生型宿主細(xì)胞表達(dá)減弱水平的脂肪酸降解酶。13.如權(quán)利要求1所述的方法，其中所述宿主細(xì)胞選自哺乳動(dòng)物細(xì)胞、植物細(xì)胞、昆蟲細(xì)胞、酵母細(xì)胞、真菌細(xì)胞、絲狀真菌細(xì)胞和細(xì)菌細(xì)胞。14.如權(quán)利要求13所述的方法，其中從所述宿主細(xì)胞的細(xì)胞外環(huán)境分離所述脂肪醛。15.如權(quán)利要求13所述的方法，其中所述脂肪醛包含C6-C26脂肪醛。16.如權(quán)利要求15所述的方法，其中所述脂肪醛是癸醛、十二醛、十四醛或十六醛。17.如權(quán)利要求13所述的方法，其中所述脂肪醛是不飽和脂肪醛。18.如權(quán)利要求13所述的方法，其中所述脂肪醛是飽和脂肪醛。19.如權(quán)利要求1所述的方法，其還包括在所述多肽或所述核苷酸序列編碼的多肽的至少一種生物底物的存在下，培養(yǎng)所述宿主細(xì)胞。20.如權(quán)利要求19所述的方法，其中所述底物是脂肪酸。21.如權(quán)利要求20所述的方法，其中所述脂肪酸包括C6-C26脂肪酸。22.如權(quán)利要求21所述的方法，其中所述脂肪酸是癸酸、十二酸、十四酸或十六酸。23.如權(quán)利要求20所述的方法，其中所述脂肪酸是不飽和脂肪酸。24.如權(quán)利要求20所述的方法，其中所述脂肪酸是飽和脂肪酸。25.遺傳工程化的微生物，所述微生物包含穩(wěn)定并入所述微生物的基因組DNA中位于多核苷酸的上游的外源控制序列，所述多核苷酸包含與SEQIDN0:17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、113、115、117、119或121的核苷酸序列具有至少70%序列同一性的核苷酸序列，其中所述微生物相對(duì)于野生型微生物產(chǎn)生增高水平的脂肪醛。26.通過權(quán)利要求1的方法所產(chǎn)生的脂肪醛。27.如權(quán)利要求沈所述的脂肪醛，其中所述脂肪醛的δ"C為約-15.4或更大。28.如權(quán)利要求沈所述的脂肪醛，其中所述脂肪醛的fMMC為至少約1.003。全文摘要描述了用于產(chǎn)生脂肪醛的方法和組合物，包括核苷酸序列、氨基酸序列和宿主細(xì)胞。文檔編號(hào)C12P1/00GK102232110SQ200980148338公開日2011年11月2日申請(qǐng)日期2009年10月7日優(yōu)先權(quán)日2008年10月7日發(fā)明者穆爾塔扎·F·阿里比海,胡志浩申請(qǐng)人:Ls9公司