專利名稱：一種卵巢癌相關(guān)基因及其編碼的蛋白質(zhì)的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
本發(fā)明涉及一種與癌癥相關(guān)的基因及其編碼的蛋白質(zhì)，特別是涉及一種與卵巢癌相關(guān)的基因及其編碼的蛋白質(zhì)。
據(jù)估計(jì)在人類基因組中大約有5000個(gè)潛在的藥物靶點(diǎn)，迄今為止成功應(yīng)用于藥物開發(fā)的人類藥物靶標(biāo)約有500種，僅占潛在藥物靶點(diǎn)的十分之一，因此該領(lǐng)域具有巨大的開發(fā)潛力。重要疾病相關(guān)基因的研究和成功開發(fā)將有助于這一巨大潛在市場(chǎng)的開發(fā)和利用。
一種與卵巢癌相關(guān)的基因，它是下列核苷酸序列之一1)序列表中序列1的DNA序列；2)與序列表中序列1限定的DNA序列具有90％以上同源性，且編碼相同功能蛋白質(zhì)的DNA序列。
所述與卵巢癌相關(guān)基因的完整開放讀碼框?yàn)樾蛄斜碇行蛄?的第236至949共714個(gè)堿基。
一種與卵巢癌相關(guān)的蛋白質(zhì)，它具有序列表中序列2的氨基酸序列或?qū)⑿蛄?的氨基酸序列經(jīng)過(guò)一個(gè)或幾個(gè)氨基酸殘基的取代、缺失或添加且具有與序列2的氨基酸序列相同活性的由序列2衍生的蛋白質(zhì)。
利用NCBI的Genbank數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)本發(fā)明基因進(jìn)行檢索，結(jié)果表明數(shù)據(jù)庫(kù)中沒(méi)有基因與此基因序列完全相同。進(jìn)一步利用STS數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)所獲得的基因序列進(jìn)行比較分析，結(jié)果表明本發(fā)明基因中含有一個(gè)編號(hào)為WI-13139的STS，應(yīng)用GDB的數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行進(jìn)一步的檢索，結(jié)果表明，本發(fā)明基因應(yīng)定位于9號(hào)染色體的長(zhǎng)臂2區(qū)2帶1至3亞帶(9q22.1-22.3)。
由于本發(fā)明所提供的基因在包括卵巢在內(nèi)的人體正常組織中均無(wú)表達(dá)，而在上皮性的卵巢癌組織中表達(dá)陽(yáng)性率高達(dá)53％，因此本發(fā)明的基因及其編碼的蛋白質(zhì)有望為臨床卵巢癌的診斷和治療提供有意義的生物學(xué)指標(biāo)，并為抗腫瘤藥物的設(shè)計(jì)提供新的作用靶點(diǎn)和新思路，將會(huì)帶來(lái)巨大的社會(huì)效益及經(jīng)濟(jì)效益，而且，對(duì)于基因不同研究階段所開發(fā)的不同產(chǎn)品，包括新抗體、生物芯片的靶基因、篩選出的新藥等，也將促進(jìn)形成新興的人類基因產(chǎn)業(yè)。
圖2為本發(fā)明基因在正常卵巢組織中的原位雜交結(jié)果。
圖3為本發(fā)明基因在卵巢癌組織中的原位雜交結(jié)果。
圖4為本發(fā)明基因在卵巢癌細(xì)胞OVC3中的原位雜交結(jié)果。
圖5為本發(fā)明基因在胚胎發(fā)育組織中的反轉(zhuǎn)錄結(jié)果。
實(shí)施例2、Northern Blot鑒定隨機(jī)引物方法用地高辛標(biāo)記所得基因(DIG DNA Labeling and Detection Kit，Boehringer Mannheim公司，德國(guó))，與來(lái)源于OVC3的總RNA進(jìn)行Northern Blot雜交，雜交結(jié)果如

圖1所示，從圖中可以看出在4300個(gè)堿基對(duì)左右處具有一條明顯的譜帶。
實(shí)施例3、用原位雜交方法檢測(cè)本發(fā)明基因在人體卵巢組織中的表達(dá)利用原位雜交法檢測(cè)本發(fā)明的基因在正常人體卵巢組織中的表達(dá)，結(jié)果如圖2所示，從圖中可以看出，本發(fā)明的基因在正常人體卵巢組織中沒(méi)有表達(dá)。
實(shí)施例4、用原位雜交方法檢測(cè)本發(fā)明基因在腫瘤組織中的表達(dá)利用原位雜交法檢測(cè)本發(fā)明基因在腫瘤組織中的表達(dá)，實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明，本發(fā)明基因在子宮癌、胃癌、腎癌、腎上腺癌、腦癌、肝癌、腸癌組織中均無(wú)表達(dá)，但在上皮性的卵巢癌組織中表達(dá)陽(yáng)性率高達(dá)53％(76/144)，圖3、圖4顯示出，本發(fā)明基因在卵巢癌組織及卵巢癌細(xì)胞OVC3中明顯擴(kuò)增，呈顯著的陽(yáng)性反應(yīng)。
實(shí)施例5、用反轉(zhuǎn)錄-PCR檢測(cè)本發(fā)明基因在胚胎發(fā)育中的表達(dá)用反轉(zhuǎn)錄-PCR方法檢測(cè)人14周胎齡組織和人32周胎齡組織中本發(fā)明基因的表達(dá)，以β-肌動(dòng)蛋白(β-actin1)為對(duì)照，檢測(cè)結(jié)果如圖5所示，其中A1組為14周胎齡組織中本發(fā)明基因的表達(dá)；B1組為14周胎齡組織中β-actin1的表達(dá)；A2組為32周胎齡組織中本發(fā)明基因的表達(dá)；B2組為32周胎齡組織中β-actin1的表達(dá)；1為卵巢癌細(xì)胞系OVC3；2為卵巢；3為胃；4為子宮；5為脾；6為胸腺；7為腎；8為腎上腺；9為腦；10為肝；11為小腸；從圖中的結(jié)果可以看出，本發(fā)明基因在14周胎齡早期胚胎的卵巢組織和腎上腺組織中有表達(dá)，但是隨著胚胎發(fā)育的成熟，本發(fā)明基因的表達(dá)消失。因此說(shuō)明本發(fā)明基因應(yīng)該是胚胎早期表達(dá)基因家族的成員。
序列表<160>2<210>1<211>4375<212>DNA<213>人屬人種(Homo sapiens)<400>1agagtgcttg tgatttcacg tatttttgct gaactcgtaa aagagacact 50tggatggtgg attaaccaga acactaacat tctgtgaaaa gtttcaaatt 100ggagaatatt gaattttcac cctagtccag cagctccgct gctcacttaa 150atacagatga atgaagaccc cattcggaaa gacacctggc cagcggtcca 200gagctgatgc aggccatgct ggagtatctg ccaacatgat gaaaaagagg 250acgtcccaca agaagcatcg gagcagtgtg ggtccgagca aacctgtttc 300ccagccccgg cggaacatcg taggctgcag gattcagcat gggtggaaag 350aggggaatgg ccctgttacc cagtggaaag gaaccgttct ggaccaggtg 400cctgtaaatc cttctttgta tcttataaaa tacgatggat ttgactgtgt 450ttatggacta gaacttaata aagatgaaag agtttctgcg cttgaagtcc 500tccctgatag agttgcgaca tctcgaatca gcgatgcaca cttggcagac 550acaatgattg gcaaagcagt ggaacatatg tttgagacag aggatggttc 600taaagatgag tggaggggaa tggtcttagc acgtgcacct gtcatgaaca 650catggtttta cattacctat gagaaagacc ctgtcttgta catgtaccaa 700ctcttagatg attacaaaga aggcgacctt cgcattatgc ctgattccaa 750tgattcacct ccagcagaaa gggaaccagg agaagttgtg gacagcctgg 800taggcaaaca 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Asp Tyr Lys Glu Gly Asp Leu
155 160 165Arg Ile Met Pro Asp Ser Asn Asp Ser Pro Pro Ala Glu Arg Glu170 175 180Pro Gly Glu Val Val Asp Ser Leu Val Gly Lys Gln Val Glu Tyr185 190 195Ala Lys Glu Asp Gly Ser Lys Arg Thr Gly Met Val Ile His Gln200 205 210Val Glu Ala Lys Pro Ser Val Tyr Phe Ile Lys Phe Asp Asp Asp215 220 225Phe His Ile Tyr Val Tyr Asp Leu Val Lys Thr Ser230 235 23權(quán)利要求
1.一種與卵巢癌相關(guān)的基因，它是下列核苷酸序列之一1)序列表中序列1的DNA序列；2)與序列表中序列1限定的DNA序列具有90％以上同源性，且編碼相同功能蛋白質(zhì)的DNA序列。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基因，其特征在于所述與卵巢癌相關(guān)的基因是序列表中序列1的DNA序列。
3.根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的基因，其特征在于所述與卵巢癌相關(guān)基因的完整開放讀碼框?yàn)樾蛄斜碇行蛄?的第236至949共714個(gè)堿基。
4.一種與卵巢癌相關(guān)的蛋白質(zhì)，它具有序列表中序列2的氨基酸序列或?qū)⑿蛄?的氨基酸序列經(jīng)過(guò)一個(gè)或幾個(gè)氨基酸殘基的取代、缺失或添加且具有與序列2的氨基酸序列相同活性的由序列2衍生的蛋白質(zhì)。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的蛋白質(zhì)，其特征在于所述蛋白質(zhì)具有序列表中序列2的氨基酸序列。
全文摘要
本發(fā)明公開了一種卵巢癌相關(guān)基因及其編碼的蛋白質(zhì)。本發(fā)明涉及一種與癌癥相關(guān)的基因及其編碼的蛋白質(zhì)，特別是涉及一種與卵巢癌相關(guān)的基因及其編碼的蛋白質(zhì)。本發(fā)明的目的是提供一種與卵巢癌發(fā)生發(fā)展進(jìn)程相關(guān)的基因及其編碼的蛋白質(zhì)。本發(fā)明所提供的與卵巢癌相關(guān)的基因是序列表中序列1的DNA序列；本發(fā)明所提供的蛋白質(zhì)具有序列表中序列2的氨基酸序列。本發(fā)明的基因及其編碼的蛋白質(zhì)有望為臨床卵巢癌的診斷和治療提供有意義的生物學(xué)指標(biāo)，并為抗腫瘤藥物的設(shè)計(jì)提供新的作用靶點(diǎn)和新思路，將會(huì)帶來(lái)巨大的社會(huì)效益及經(jīng)濟(jì)效益。
文檔編號(hào)C12N15/11GK1463978SQ02120838
公開日2003年12月31日 申請(qǐng)日期2002年6月5日 優(yōu)先權(quán)日2002年6月5日
發(fā)明者岳 文, 李春海, 孫麗亞, 裴雪濤, 張立新, 李海民 申請(qǐng)人:中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院野戰(zhàn)輸血研究所